❝最近在进行绘图实战颇有感触，今天来介绍一下如何使用「ggplot2绘制组合热图」，有时我们如果只想对部分数据进行热图形式的展示可以用到这种类型的图表；绘图过程倒也简单主要是选择好合适的展示场所 library...sample=as.character(sample)) #定义因子 df$sample % unique()) 绘制文本热图...color="black",hjust=0.5,vjust=0.5)+ labs(x = NULL,y = NULL,color=NULL,fill=NULL)+ theme_niwot() 绘制组合热图...❝此处将数据数据拆分成两份进行图形绘制，本想借助「ggh4x」 的分面功能，但是此份数据不太适合，关于ggh4x后面再做介绍 ❞ p2 % filter(group=="A") %>%
介绍这个包扩展了ggplot2，提供了用于对齐和组织多个图的高级工具，特别是那些自动重新排序观察结果的工具，比如树形图。...它提供了对布局调整和情节注释的精细控制，使您能够创建复杂的、出版质量的可视化，同时仍然使用熟悉的ggplot2语法。...This package extends ggplot2 by providing advanced tools for aligning and organizing multiple plots,...install.packages("ggalign")install.packages("ggalign", repos = c("https://yunuuuu.r-universe.dev"..., "https://cloud.r-project.org"))# install.packages("remotes")remotes::install_github("Yunuuuu/ggalign
@TOC介绍R包regplot：这个包提供了一个函数，用于绘制回归模型的列线图（Nomogram）。这种图形是一种可视化工具，用于展示预测模型的结果，使得模型的预测过程更加直观和易于理解。...regplot函数可以处理多种类型的回归模型，包括线性回归、逻辑回归和Cox回归等。它允许用户自定义图形的各个方面，如协变量分布的展示方式、图形的标题、是否显示P值星号等。...加载R包library(regplot)library(survival)# Survival model for pbc data生存分析data(pbc) pbccox 绘制回归模型的列线图
今天尝试解决使用ggplot2画图时的一个问题，图例不按规矩出牌。 ggplot2的作者们在测试时发现更新版本也出这问题了，正好可以用于简单说明。 本来是一个这样的图形 ? 新版本变成了 ?...而我是画两个相似的图形时出现这问题，数据结构一样，然后画图后图例的顺序变了~ 根据文档，默认使用了某种“秘密魔法”？！...当然，如果你理解了上面的英文文档，怎么设定怎么排都是可以的。
最近公司在做关联图谱的项目，想挖掘团伙犯罪。在准备关系数据时需要根据两列组合删除数据框中的重复值，两列中元素的顺序可能是相反的。...本文介绍一句语句解决多列组合删除数据框中重复值的问题。 一、举一个小例子 在Python中有一个包含3列的数据框,希望根据列name1和name2组合(在两行中顺序不一样)消除重复项。...import numpy as np #导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 df =...由于原始数据是从hive sql中跑出来，表示商户号之间关系的数据，merchant_r和merchant_l中存在组合重复的现象。现希望根据这两列组合消除重复项。...从上图可以看出用set替换frozense会报不可哈希的错误。 三、把代码推广到多列 解决多列组合删除数据框中重复值的问题，只要把代码中取两列的代码变成多列即可。
之前分享过一篇推文介绍过这个内容 R语言ggplot2包画曼哈顿图的一个简单小例子，但是当时自己不太懂曼哈顿图，实现是直接借助ggplot2的geom_jitter()这个函数实现的。...这个函数并不会考虑每个变异位点的位置，而实际的曼哈顿图是需要根据变异位点的位置来画的。今天的推文重新介绍一下ggplot2绘制曼哈顿图的代码。...R语言中也有现成的包和函数可以直接画曼哈顿图，我这里选择用ggplot2来画是因为出图后可以非常方便的组合其他的图，比如可以叠加一个基因结构的图，然后再拼一个展示不同基因型表型差异的图。...这些如果是用ggplot2来做，都可以用代码实现，省去了手动拼图的过程。...，我这里的示例数据是每条染色体的长度多加了10M chr.lenR_4_1_0_working_directory/env001/data/20230912/at_gwas.xlsx
library(ggplot2) ggplot(dat,mapping = aes(x=tSNE_1, y=tSNE_2,...这里可以看出，如果cluster是数值型，那么不转为因子的情况下用来分组就会出现大问题：R会把每一个数值都看成是一个分组，用深浅来代表不同分组。...如果cluster是一个字符串，就不会出现这个问题，得到的结果和因子是一样的。 回到正题，给cluster添加一个圆圈在ggplot2中通过stat_ellipse()实现。...最后再对图片进行一些微调：点的大小、圆圈实线改虚线、圆圈线的粗细、坐标轴的出戏以及主题等等。...这次练习所get到的几个新的知识点： 画图时按照因子/数值/字符分组产生的区别 ggplot2画点图时可以使用stat_ellipse()画圆圈 坐标系微调的一些细节，更多内容参考https://blog.csdn.net
同时，想想自己怎么解决这个问题，看看别人又是怎样解决的，从而快速提高Excel公式应用水平。 Q：有3列数据，每列有10个数值，从每列中取1个数值，这3个数值相加的和为20，有多少种组合。...图1 要求编写一个公式，返回其组合数。 规则：列A中的数值只能使用1次，其他两列数值可任意使用。 写下你的公式。 A：确实很具有挑战性。 公式1：数组公式。...上述两个数组作为SMALL函数的参数，由小到大依次取得列B与列C数值相加所有结果组成的数组，共100个值，然后，将列A中的值与之相加，得到一个100×10行的数组，这是3列所有数值组合相加的结果。...将这个结果与指定的数值20比较，得到一个由TRUE/FALSE值组成的数组，其中的TRUE值就是3列中数值相加和为20的值所在位置。...注意，公式通过将N函数生成的1/0数组与ROW函数生成的垂直数组相乘，巧妙地将每行中有多个20的结果转换成了1个，从而满足列A中的数值只能出现1次的要求。 公式2：数组公式。
如果是要去除包含缺失值的行，直接使用na.omit()函数就可以了，但是如果要去除含有缺失值的列呢？...image.png 实现目的需要借助dplyr这个R包 用到的是select_if()函数 这个具体的写法怎么解释我暂时还没有搞明白，先背下来再说吧 dfpra library(dplyr) dfpra...这个代码是保留带有缺少值的列 ?...image.png 如果是要删除带有缺失值的列在any函数前加一个感叹号就可以了 dfpra<-data.frame(A=1:5, B=c(1:4,NA),...判断数据集是否至少存在一个数据满足指定的条件，返回值是TRUE或者FALSE 比如判断一组数据中是否存在负数 代码 x1<-c(1,2,3,4,5) any(x1<0) x2<-c(-1,2,3) any
本期推文就介绍一篇关于使用ggplot2 绘制带有颜色映射的相关性散点图，本期涉及的知识点如下： stat_bin_2d()绘制密度颜色映射 geom_smooth() 绘制拟合线 颜色映射相关性散点图绘制...这里大部分和推文R-ggplot2 学术散点图绘制 中的绘图技巧一样，下面我直接给出代码,如下： #绘图 + 颜色 library(tidyverse) library(RColorBrewer) library...最终，得到的可视化结果如下： ? 这里提一下，由于绘制的数据较少，可能导致绘制的结果不太美观，当然，在数据足够多的情况下，你也可以绘制出如下的相关性散点图： ?...（图中colorbar的位置、字体都是可以自由设置的啊） 总结 使用R-ggplot2绘制学术图表确实可以避免Python-matplotlib需要自定义设置问题，提高绘图效率。...大家在绘制图表时，可以根据而自己喜好自由选取喜欢的绘图工具啊。
/zenodo.org/record/6332981#.YroV0nZBzic https://github.com/Jingning-Zhang/PlasmaProtein/tree/v1.2 今天的推文重复一下论文中的...Figure1，涉及到5个图，分别是折线图，韦恩图，散点图，频率分布直方图，最后一个知识点是如何将这5个图组合到一起 image.png 首先是定义作图主题的内容 library(ggplot2)...，如果按照他的主题来做出图没有横纵坐标轴 第一个折线图的代码 library(readxl) df.peer <- read_excel("data/20220627/Fig1.xlsx", sheet.../reference/label_number.html image.png 第二个韦恩图的代码 他这里的韦恩图是借助ggforce这个R包直接画了两个圆 df.venn <- read_excel...data/20220627/Fig1.xlsx", sheet = "1b") library(ggforce) p2 r
R语言ggplot2包用来画折线图的函数默认应该是带有棱角的，如果想要实现平滑的曲线好像不太容易，之前的推文介绍过 ggalt这个包 R语言的ggplot2做平滑的折线图简单小例子 R语言ggplot2...常规的折线图 library(ggplot2) df<-data.frame(x=1:10, y=sample(1:10,10)) ggplot(df) + geom_line...平滑的可以借助 geom_bump()函数 来自于ggbump这个R包 帮助文档 https://github.com/davidsjoberg/ggbump 这个链接还有很多漂亮的图 比如 ?...上面链接里有实现这两个图的代码，感兴趣的可以自己尝试重复一下 话说这个 Bump chart 对应的中文是啥意思呢？...) library(ggplot2) library(dplyr) df<-data.frame(x=1:10, y=sample(1:10,10)) ggplot(df
常见的热图看腻了，这节来介绍如何通过ggplot2绘制圆形热图，为了方便各位观众老爷观看，我制作了一个交互式文档，后台回复关键词2021-4-14获取本文代码及文档 （这个是我转载的推文，如果需要这个代码和数据...，需要到原公众号去留言） 加载R包 library(tidyverse) library(ggthemes) library(cowplot) 读入数据 accidents <- read.csv("...7 2007 170 7 8 2007 143 8 9 2007 146 9 10 2007 145 10 数据可视化 先画一张常见的热图
TRICONEX 3636R 服务器中聚合来自多个来源的数据图片在异构计算平台上节省资源和可普遍部署的应用程序在工业数据方面为工业4.0提供了新的世界。...容器应用程序是提供严格定义的功能的小软件模块，是自动化世界中聪明的数据管理的一个例子。Softing推出了一个新的产品系列，将容器技术用于西门子和Modbus控制器。...背后的想法如前所述，容器应用程序是具有精确定义的功能的软件模块，允许新的部署选项，为自动化技术带来许多好处。好处是运行在不同计算机平台上的低资源、通用的应用程序或软件的实际隔离、封装和可移植性。...这种方法的特别之处在于，容器像一种包含所有必需组件的虚拟机一样运行。这意味着它们可以独立于任何外部组件和现有环境运行。...下载后，容器应用程序可以在几秒钟内使用单个命令行进行部署，并且在生产级别提供了实现简单集中管理的优势。
然而，图形语法的翻译在ggplot2中没有对应关系（它的作用是由内置的R功能发挥的）。...因为即使我们使用了许多缺省值，ggplot2的显式语法语法也相当冗长，这使得快速尝试不同的绘图变得困难。它还模仿plot()函数的语法，使ggplot2对于熟悉Base R图形的用户更容易使用。...刻面是在一个图中绘制多个图形。faceting的功能类似于lattice包中的panel。它经常出现在微生物组学研究的出版物上。在ggplot2中，刻面可以通过两种主要方式执行：网格刻面和包裹刻面。...公式可以是x~y，这表示将绘图分割成变量x的每个值的一行和变量y的每个值的一列。实现facet_grid(x~y)函数将生成一个矩阵，其中的行和列由x和y的可能组合组成。公式可以是x~....使用facet_wrap(公式)将一大系列绘图分解为多个小绘图 wrap刻面将一系列大绘图生成单个类别的多个小绘图。此功能使包装分面特别适用于对多个级别的类别变量的分面组合进行分面。
我的思路是 先把5份数据的基因名取交集 用基因名给每份数据做行名 根据取交集的结果来提取数据 最后合并数据集 那期内容有人留言了简便方法，很短的代码就实现了这个目的。...我将代码记录在这篇推文里 因为5份数据集以csv格式存储，首先就是获得存储路径下所有的csv格式文件的文件名，用到的命令是 files的完整路径，如果设置的为FALSE则只返回文件名。...相对路径和绝对路径是很重要的概念，这个一定要搞明白 pattern参数指定文件的后缀名 接下来批量将5份数据读入 需要借助tidyverse这个包，用到的是map()函数 library(tidyverse...之前和一位同学讨论的时候他也提到了tidyverse整理数据，但是自己平时用到的数据格式还算整齐，基本上用数据框的一些基本操作就可以达到目的了。
做柱形图的时候如果要区分不同的类别 最直观的方式就是用不同的颜色，但是有的期刊如果要求黑白灰配色的话，用颜色可能就不太好区分，这个时候可以用添加底纹的形式。...R语言的ggplot2包没有提供直接绘制带有底纹的柱形图的函数，如果想要实现需要借助扩展包patternplot，参考链接 https://cran.r-project.org/web/packages...画图代码 library(patternplot) library(readxl) library(ggplot2) df1<-read_excel("patternplot/patternplot_example.xlsx...数据集 代表x轴的变量名 代表y轴的变量 density是底纹的密度 pattern.type是底纹的类型 通过 ?...暂时还不知道如何解决 今天的内容先到这里了
今天的推文来自于公众号读者的投稿，作者 RGzxs，编辑排版由 小明 完成。 下面是正文 前几天看了几篇闫大佬绘制的中国沿海地区的地图（公众号：R语言数据分析指南），然后试着自己画了一下。...山东地图及青岛地图下载 因为要画的区域是黄海和胶州湾的地图，所以需要下载一个山东省地图和青岛地图。...设置工作目录 getwd() setwd("C:/Users/zxs/Desktop") getwd() 加载R包 package.list=c("geoviz","tidyverse","sf","...image.png 绘制青岛地图 shp2<- sf::read_sf("qingdao.json") p2<-ggplot()+ geom_sf(data=shp2,aes(fill=NULL))...小明的数据分析笔记本 今天推文的示例数据和代码可以在公众号后台留言 20210901 获取（精确匹配开头结尾都不能有空格） 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子
引言 昨天有小伙伴在讨论群里提问"有没有关于绘制带比例尺和指北针的地图可视化教程"，我也进行了答复，没想到关注的人比较多，那就安排推文教程(最近在系统整理资料，所以这篇也是计划外的 ? )。...关注本公众号，后台回复"地图数据" 即可获取本推文所使用的数据。 02. tmap 简介 说起绘制空间数据相关的可视化作品，R语言还是比Python 要方便的多的 ? ? 。...值得注意的是，tmap 拥有类似于ggplot2 “图层” 语法绘图原理，熟悉ggplot2绘图的小伙伴肯定会快速上手的 ? ? 。...（注：由于转换投影出错,也就没绘制其他投影下的效果。以前还是可以的 ? ，查了github，作者也说过应该是版本更新导致。后面会继续跟进的。） 04....总结 本期推文介绍了大家比较关心的绘制空间数据 指北针 和 比例尺的添加方法。而基于ggplot2 以及拓展包 ggspatial 也是可以绘制的，由于不是很熟悉空间数据的处理，介绍难免不足。
引言 昨天有小伙伴在讨论群里提问"有没有关于绘制带比例尺和指北针的地图可视化教程"，我也进行了答复，没想到关注的人比较多，那就安排推文教程(最近在系统整理资料，所以这篇也是计划外的 ? )。...关注本公众号，后台回复"地图数据" 即可获取本推文所使用的数据。 02. tmap 简介 说起绘制空间数据相关的可视化作品，R语言还是比Python 要方便的多的 ? ? 。...值得注意的是，tmap 拥有类似于ggplot2 “图层” 语法绘图原理，熟悉ggplot2绘图的小伙伴肯定会快速上手的 ? ? 。...city) <- ~lng+lat proj4string(city) <- CRS("+proj=longlat +datum=WGS84") 接下来，我们就使用tmap 包 对以上几个元素进行可视化绘制展示...（注：由于转换投影出错,也就没绘制其他投影下的效果。以前还是可以的
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