遇到这个问题是在使用ggtree可视化展示进化树的时候，我想给进化树的枝分组映射颜色，对应的推文是跟着Nature Genetics学画图：R语言ggtree给进化树的枝分组映射颜色 第一步是准备进化树文件...image.png 加载需要用到的R包 library(treeio) library(ggtree) library(ggplot2) 读取树文件和分组信息 tree<-read.tree("practice.tree...image.png 这个结果右侧的图例最下方式有一个NA的，如果不想要那个NA加一行代码 scale_color_discrete(na.translate=FALSE) 参考链接是 https://stackoverflow.com...geom_tiplab(offset = 0.1)+ scale_color_manual(values=colors, na.translate=FALSE) 将图例的线更改的粗一点...image.png 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 需要示例数据和代码 点赞 点击在看 然后在后台留言 20210605 就可以了 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python
image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现，这个是箱线图和热图的拼接，右侧的热图可以借助geom_point()函数实现，将点的形状改为正方块，数值按照正负来映射颜色，按照一定的数值来映射大小...基本的思路有了。今天的推文记录一个小知识点是 如何将图例远离主图并且给放到右上角去 首先是构造一份数据 df<-data.frame(x=LETTERS[1:4],y=1:4) df ?...image.png 拉大图例与主图的距离 使用theme()函数中的legend.box.margin参数来调节 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes...image.png 还有另外两个知识点是调节图例的标题和图例的距离以及图例的文本和图例的距离 分别需要用到legend.spacing.y和legend.spacing.x参数 ggplot(data=...image.png 欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记
目 正文 自定义ggplot2图的图例。这里我们要修改非数据组件，通常通过theme（）命令来完成。 此页面受到ggplot2（？theme）帮助页面的强烈启发。...image.png 删除图例中的一类 basic + guides(shape=FALSE) ?...image.png 修改图例位置 要删除图例，请在theme（）中使用legend.position =“none”。 要更改其位置，但在图表外使用bottom，left，right或top。...或者使用0和1之间的相对坐标放置在图中。 #1: no legend basic + theme(legend.position = "none") ?...一些自定义图例的测试 # 图例被红框包裹 basic + theme( legend.box.background = element_rect(color="red", size=2),
今天的GEO数据挖掘课程，有一个学员问到在向量的任何位置插入任何元素有没有什么简介的方法，因为她做的很麻烦，如下： 有一个向量，是100个元素，要在第34位加上一个数是56 a=1:100 c(a[1:...image-20191102220329369 然后学员有任意需求，任意位置添加任意数字，这样写会比较麻烦，每次都有手动判断向量长度，范围等等，因为她是初学者，所以不可能会无限R包和函数，我这里简单演示一下
在运行 RNN 或 LSTM 时，隐藏状态保留单词在句子中的相对位置信息。...然而，在 Transformer 网络中，如果编码器包含一个前馈网络，那么只传递词嵌入就等于为您的模型增加了不必要的混乱，因为在词嵌入中没有捕获有关句子的顺序信息。...为了处理单词相对位置的问题，位置编码的想法出现了。 在从嵌入层提取词嵌入后，位置编码被添加到这个嵌入向量中。 解释位置编码最简单的方法是为每个单词分配一个唯一的数字 ∈ ℕ 。...表示时域信号的最佳方式是通过正弦方程 sin(ωt)。如果我们巧妙地使用这个波动方程，我们可以在一次拍摄中捕获词嵌入的时间和维度信息。 让我们看一下这个等式，在接下来的步骤中，我们将尝试把它形象化。...这是我对注意力机制中使用的位置编码的看法。在接下来的系列中，我将尝试撰写有关编码器-解码器部分的内容，并将注意力应用于现实世界的规模问题。
expression)} printLine <- function () { print("--------------------------------------------"); } #函数的调用...sd']] <- sd(column); #s #直接写个s也可以替代下面的语句 return (s); } summaryEx(data[, 3]) 通过定义函数，实现了summary函数的加强版功能...更多自编函数，参见Erin的自编函数整理，直接调用帮助你的数据分析工作事半功倍哦！
JS实现获取鼠标在画布中的位置 效果展示 概述 本文讲解如何实现我们平时用的画布软件中，怎么获取的我们鼠标时刻在画布中的位置。...// 首先得到鼠标在页面中的坐标（ e.pageX, e.pageY） // 其次得到盒子在页面中的距离(box.offsetLeft, box.offsetTop) /.../ 用鼠标距离页面的坐标减去盒子在页面中的距离， 得到 鼠标在盒子内的坐标 // 我们生活中常见的画布里面的那个获取鼠标的位置 就是这么实现的 var box = document.querySelector...// 首先得到鼠标在页面中的坐标（ e.pageX, e.pageY） // 其次得到盒子在页面中的距离(box.offsetLeft, box.offsetTop) /.../ 用鼠标距离页面的坐标减去盒子在页面中的距离， 得到 鼠标在盒子内的坐标 // 我们生活中常见的画布里面的那个获取鼠标的位置 就是这么实现的 var box = document.querySelector
1.独立样本的t检验 t.test调用格式1：其中是一个数值型变量，x为二分变量 t.test(y~x， data) t.test调用格式2：其中有y1,y2为数值型变量。...t.test(y1,y2) 例子：比较美国南方与非南方地区犯罪的监禁概率是否相同。...2.非独立样本的t检验 如，年长的男性与年轻的男性失业率概率是否相同，此时，年龄与失业率是有关的，所以是非独立的。 非独立样本的t检验假定组间差异呈正态分布。...3.卡方独立性检验 卡方检验可以使用chisq.test()函数对二维表的行变量或者列变量进行检验。...############################################################## 以下为在真实病例中的应用，检验两种不同的疾病与年龄，性别以及发病部位有无显著差异
ttt.png 一般： 知名的第三方依赖（如jQuery/AngularJS/Bootstrap），放在1——header里。...（尤其在使用那些知名库的公库url后，在特定地域内加载速度有保证） 自写的纯逻辑代码（没有引用可见标签的），放在2——body标签的顶部 界面逻辑相关代码，放在3——确保被引用标签已经被浏览器创建存在。...加载固定内容的脚本，可以前置到文档头部。 浏览器的dom按读取到标签顺序解析并执行，所以脚本引用前置使其尽早加载，有加速效果（尤其浏览器首次打开网页，且网页内容较大或者网速不佳时）
文件操作 引用打开的工作簿 使用索引号（从 1 开始） Workbooks(1) 使用工作簿名称 Workbooks("1.xlsx") 创建一个 EXCEL 工作簿对象 Dim wd As Excel.Application...ThisWorkBook.Path & "/old.xlsx" newfile = ThisWorkBook.Path & "/new.xlsx" FileCopy oldfile, newfile 删除文件夹下的所有文件...在 thisworkbook 中添加如下代码段： Private Sub Workbook_SheetSelectionChange(ByVal Sh As Object, ByVal Target...ActiveSheet.UsedRange.Interior.ColorIndex = 0 Target.Interior.ColorIndex = 6 End If End Sub 在单元格里回车...String arr() = Split(ws.Cells(a, b).Value, "-") alen = UBound(arr) - LBound(arr) + 1 判断单元格是否为空 判断单元格的
MongoEngine 是一个用于 Python 的 ODM（对象文档映射）库，可以让你方便地与 MongoDB 数据库进行交互。...它提供了面向对象的方式来定义模型，并对 MongoDB 的数据进行 CRUD（创建、读取、更新、删除）操作。...在 MongoEngine 中，定义一个文档模型通常是通过继承 Document 类来实现的。...User.objects(name="John Doe").first() if user: user.delete() 进阶用法 嵌入文档 MongoEngine 允许你将一个文档嵌入到另一个文档中...Main St", city="New York") user = User(name="Jane Doe", addresses=[address]) user.save() 索引和唯一性 可以在字段上设置索引和唯一性约束
尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...有时候在开发R包时为了保证正常运行，不得不将依赖包列入Depdens。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法，但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的...如果没有，则会将主题对象存储在编译后的包的字节码中，而该字节码可能与安装的ggplot2不一致！
如何查询某个表的所有key 背景：在使用 MongoEngine 时，查询某个集合中所有文档的所有键（字段）有些复杂，因为 MongoEngine 是基于文档的对象关系映射（ORM）库，不提供直接的功能来查询集合中所有的键...，keys() 方法返回文档中的所有键。...如果集合中的文档数量非常大，上述方法可能会比较慢。在这种情况下，可以考虑批量处理文档以提高效率。 这段代码仅获取顶级字段的键。...mongodb如何设置自动清理某个表60天前的数据 在 MongoDB 中，可以使用 TTL（Time-To-Live）索引来自动删除集合中过期的数据。...使用 with_id 方法查找文档 在使用 MongoEngine 时，通过 with_id 方法根据文档的 _id 字段查找单个文档是常见的操作。
并且在1.21中完善了windows系统下的extension的bug。...整体看起来效果还是非常不错的，开发者在整体上还是保留了Rstudio和visual studio中对于View()这个函数的配置，还在此基础上添加了search功能，此外对Rshiny可视化的支持也非常棒...▶ pip install radian 四 在R中安装languageserver和jsonlite R LSP client需要借助languageserver实现函数的智能识别，R session...的配置 Path中添加R的执行文件的路径，当然也可以选择radian.exe的路径（该路径存在于python的scripts文件夹中）。...中运行的话，则会出现R session watcher不启用的状况，data和plot的review窗口则会自动调用自身gui所带的review窗口，以在windows中选择radian.exe路径为例
获取元素位置可以用 offset 或 getBoundingClientRect，使用 offset 因为兼容性不好，比较麻烦，offset获取位置会形成“回溯”。...2.在IE8及以下的浏览器中，返回值对象包含的属性值有： top:：元素上边缘距离文档顶部的距离； right： 元素右边缘距离文档左边的距离； bottom：元素下边缘距离文档顶部的距离； left：...元素左边缘距离文档左边的距离； 3.在IE9以上、谷歌、火狐等浏览器中，返回值对象包含的属性值有： top： 元素上边缘距离文档顶部的距离； right：元素右边缘距离文档左边的距离； bottom：元素下边缘距离文档顶部的距离...； left：元素左边缘距离文档左边的距离； width：元素的宽度（包含 padding 和 border） height：元素的高度（包含 padding 和 border） 4.在IE8及以下浏览器没有...width 和 height 属性的解决方法： 在IE8及以下浏览器中，可以通过计算得到元素的宽和高： 如： var dom = document.querySelector("#demo"), r
Power Pivot简称PP，可以理解为超级透视表，是Excel在数据透视表上的功能加持。和Power Query比，其主要是处于数据分析阶段。 ? PP中，基于函数来完成，其使用的是DAX语言。...大部分的操作都是在关联筛选后作出的计算和分析。 一、 PP在Excel中的位置 (一) 直接在开发工具加载项下加载，COM加载项里面。 ? (二) 在文件选项菜单里面加载 ?...(三) 在Excel菜单栏中的位置 ? (四) Power Pivot主界面的位置 ? PP中有3个主要点。 1. 添加列 作用：添加列主要是作为维度或者固定值进行分析。...例如切片器的使用，分类文本或者数字，严格绑定当前行的表达式。 位置：在数据表的最右侧。 2. 度量值 作用：度量值主要是作为值进行计算分析。 位置：在横向分隔符的下面区域。 3....表间关系 作用：在Excel中的Power Pivot主要有1对多，多对1关系。这种关系对于数据的计算有着非常重要的影响。 位置：在关系透视图菜单选项里可以查看。
这一特性在Linux虚拟化技术中占据了核心位置，它不仅为构建轻量级虚拟化解决方案（如容器）提供了基础支持，也在传统的虚拟机技术中发挥作用，实现资源隔离和网络虚拟化。1....在Linux虚拟化技术中的应用2.1. 容器化技术在容器化技术（如Docker、Kubernetes）中，网络名称空间是实现容器网络隔离的基石。...它可以用来实现虚拟机的网络隔离，或者在更复杂的网络拓扑中（例如，使用Linux Bridge或Open vSwitch）作为虚拟网络设备的一部分。2.3....网络功能虚拟化（NFV）网络名称空间在网络功能虚拟化（NFV）中也有其位置。NFV旨在利用虚拟化技术来构建网络服务，如虚拟私有网络（VPN）、防火墙、负载均衡等。...此外，围绕网络名称空间，开发了众多工具和库（如CNI、Netlink库等），为自定义网络解决方案的开发提供了便利。4. 结论 网络名称空间在Linux虚拟化技术中占据着不可或缺的位置。
概率函数为f(k;r,p)=choose(k+r-1,r-1)*p^r*(1-p)^k, 当r=1时这个特例分布是几何分布 rnbinom(n,size,prob,mu) 其中n是需要产生的随机数个数，...size是概率函数中的r，即连续成功的次数，prob是单词成功的概率，mu未知.....mean+3sd)几乎是在肯定的。...Gamma分布中的参数α，称为形状参数（shape parameter），即上式中的s，β称为尺度参数（scale parameter）上式中的a E(x)=s*a, Var(x)=s*a^2....相对湿度的值显然仅能出现于0到1之间（经常用百分比表示）。冬季塔里木盆地的日最大相对湿度和夏季日最小相对湿度。
前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子（factor） 今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。 我们还是以TCGA数据中的CHOL（胆管癌）这套数据为例。...关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper...☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 接下来我们先读入临床数据 #读取临床数据 clin=read.table("clinical.tsv...参考资料： ☞【R语言】R中的因子（factor） ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper ☞R生成临床信息统计表...☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 ☞肿瘤TNM分期 ☞R替换函数gsub
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
腾讯会议
云直播
对象存储
