Conda安装软件 Day 1提到如果想装 samtools Conda install samtools 就可以了，不光是生信类，R 语言python语言软件包，都可以 。...Conda install bedtools # 生信软件 Conda install hisat2 # RNA seq 比对软件 Conda install pandas # python packages...但是A软件依赖于hisat软件的2.1.0版本，B软件依赖于C软件的2.2.0版本，无论我装hisat的哪个版本我都无法同时使用A和B）。...如果想切换，简单的通过 Conda activate 环境名 就可以在两个软件版本之间切换了。...而这个行业的进步又很快，每周都有新的方法和软件出来，为了避免被后浪早早拍死，凉透了，我发起这个和大家一起进步的自我挑战。
虚拟环境 一、为什么要使用虚拟环境 二、安装 Virtualenv 可以完成虚拟环境的所有功能，但是命令复杂不好用 Virtualenvwrapper 是一个扩展包命令更好用，两个都需要安装 Pip...需要配置环境变量 此电脑=》属性=》高级系统设置=》高级=》环境变量=》系统变量=》新建=》 WORKON_HOME = F:\WEBENV 其中F:\WEBENV 为F盘的 WEBENV文件夹 三、虚拟环境命令...创建=》mkvirtualenv 虚拟环境名字 删除=》rmvirtualenv 虚拟环境名字 切换=》workon 虚拟环境名字 退出=》需要已经处于虚拟环境下方 使用命令 deactivate...（这样方便一个git仓库管理多个django项目） 结果应该是pycharm的 .idea 目录和.git, 和新建的demo1文件夹在同级目录 八、指定Pycharm使用上述创建的env1虚拟环境...File=》settings=》Project=》Project Interpreter=》 选择虚拟环境的python.exe 最终结果确保项目的Project Interpreter为env1
版本的语句，那么要先使用exit()方法先退出） pip3 install virtualenv 3.创建虚拟环境 通过上面的步骤安装成功之后，我们就可以创建虚拟环境了：virtualenv 虚拟环境名...这个命令创建虚拟环境，会在当前所在目录进行创建，如C:\Users\Smalu(电脑管理者路径) virtualenv envname 4.进入虚拟环境 先要进入cd到虚拟环境的位置（目录）的Scripts...中，然后在激活（activate.bat）虚拟环境，则进入新建的虚拟环境中了。...cd scrapy3env\Scripts activate.bat 5.退出虚拟环境 deactivate.bat deactivate.bat 四 虚拟环境的配置 通过上面的步骤其实我们就已经完成虚拟环境...：workon 新建虚拟环境：mkvirtualenv [虚拟环境名称] ->应该就是make的简写方便理解 启动/切换虚拟环境：workon [虚拟环境名称] 离开虚拟环境：deactivate
溯源 起初，Python没有便利的方式来安装软件包。 后来，Easy Install 安装方便，但卸载不需要的软件包并不容易。...不能将软件包彼此隔离。 随着虚拟环境的发展，出现了很多管理虚拟环境的工具：virtualenv，venv，pyenv，pyenv-virtualenv等。...pipenv install的时候有三种逻辑： 如果目录下没有Pipfile和Pipfile.lock文件，表示创建一个新的虚拟环境； 如果有，表示使用已有的Pipfile和Pipfile.lock文件中的配置创建一个虚拟环境...； 如果后面带诸如django这一类库名，表示为当前虚拟环境安装第三方库。...运行python命令 pipenv run python toutiao.py 这将使用当前虚拟环境关联的Python解释器，执行命令。
php文件用什么软件打开 在php开发过程中，我们需要打开和编辑各种类型的php文件。不同的编程工具和编辑器可以帮助开发人员更高效地完成工作。...在这篇文章中，我们将介绍一些常用的php编程工具和编辑器，包括VSCode、PHPStorm和其他一些选项。...PHPStorm是一个流行的php开发工具，可以在Windows和Mac平台上运行。PHPStorm具有内置的Git支持、代码片段、调试器、自动完成等功能，可以帮助开发人员更轻松地完成工作。...其他一些常用的php编程工具和编辑器包括： Eclipse：这是一个流行的Java开发环境，也可以用于php开发。...: /usr/local/lib/libcurl.so.4: no version information available (required by php) how to improve the
创建virtualenv虚拟环境之前，系统中必须要安装有对应版本的python，并且卸载之后当前虚拟环境就无效了。...venv虚拟环境 linux下virtualenv其它命令 列出虚拟环境列表 workon 也可以使用lsvirtualenv 新建虚拟环境 mkvirtualenv [虚拟环境名称] 启动/切换虚拟环境...workon [虚拟环境名称] 删除虚拟环境 rmvirtualenv [虚拟环境名称] 虚拟环境迁移 当需要将虚拟环境env转移到同一台电脑的另一个目录下时 或者当需要将虚拟环境env1迁移或复制到另一个虚拟环境...专业的，可以使用第三方的软件包来搭建一个完整的pypi镜像服务器，参考http://www.worldhello.net/2011/03/14/2357.html。...注意，虚拟环境中安装python拓展包需要先如上进入虚拟环境，不然就安装在系统的python路径下了。
对此，解决之道就是创建虚拟环境。 一个项目创建一个虚拟环境，在每个虚拟环境之中，就相当于一个“裸机”，里面所需要的东西任你根据当前的需要自由配置，并且不会影响到其他项目。...激活虚拟环境 要使用虚拟环境，必须先激活。 注意，虚拟环境激活前后，shell的提示符会发生变化。...Versions/3.6/lib/python3.6/lib-dynload', '/Users/james/python3venv/lib/python3.6/site-packages'] 用pip安装软件包...激活虚拟环境后，使用pip会将模块或者第三方包直接安装到虚拟环境。...重现虚拟环境配置 前面，曾经创建了一个Python2的虚拟环境，现在要将刚才在Python3的虚拟环境中安装的各个模块（即配置），移植到Python2的虚拟环境中——注意，这种做法并不提倡，但是，这里纯粹是为演示虚拟环境的重现移植
生物信息学习的正确姿势 2.4 Conda安装配置生物信息软件 2.4.1 Conda安装和配置 2.4.2 Conda基本使用 2.4.3 Conda的channel 2.4.4 创建不同的软件运行环境...conda list # 列出安装的软件包 # conda所有软件名都是小写 conda search # 搜索需要安装的软件包，获取其完成名字 以搜索...Conda中包含的软件越来越多，而且软件的不同版本都保留了下来，软件的索引文件越来越大，安装一个新软件时搜索满足环境中所有软件依赖的软件的搜索空间也会越来越大，导致solving environment...创建一个新环境 (conda env create -n env_name)再安装软件，这样就不用考虑与已有的软件的兼容问题了，也可以大大降低搜索空间和提高解析软件依赖的速度。...如果安装的软件提供了environment.yaml那么用起来，文件中对应的软件版本都很明确，解析依赖关系时更快。
[virtual-environment.jpeg] 一 什么是虚拟环境 Python applications will often use packages and modules that don...引用自Virtual Environments and Packages Python 虚拟环境与docker容器的概念有点类似，也和操作系统的沙箱有点类似。...用户可以创建独立的虚拟环境，然后在虚拟环境安装指定的外部包，每个虚拟环境之间不会相互影响。 所以，独立的虚拟环境可以方便制作不同的application runtime，也是用来制作测试环境。...二 python虚拟环境使用场景 同一个服务器上，不同的程序依赖同一个包不同的版本 创建测试环境，安装一些特殊的包 创建测试环境，测试同一个包不同的版本 防止影响os原来安装的包，创建独立的环境运行程序...三 如何创建 Python 虚拟环境 python3 -m venv tutorial-env # start source tutorial-env/bin/activate # stop deactivate
# 列出所有虚拟环境 conda env list # 创建虚拟环境 conda create -n name python=3.6 # 删除虚拟环境 conda remove -n name #...进入虚拟环境 source activate name (或者 conda activate name) # 退出虚拟环境 source deactivate （或者 conda deactivate
准确地说，你希望如何管理依赖项可能会根据 你如何决定发布软件而发生变化。这里提供的指导最直接适用于网络服务 （包括 Web 应用程序）的开发和部署，但也非常适合管理任意项目的开发和测试环境。...要安装软件包时，请更改到您的项目目录（或只是本教程中的 一个空目录）并运行： ubuntu@youdi ~ mkdir pipenv ubuntu@youdi ~ cd pipenv...要删除一个虚拟环境，只需删除它的文件夹。（要这么做请执行 rm -rf my_project ） 然后一段时间后，你可能会有很多个虚拟环境散落在系统各处，你将有可能忘记它们的名字或者位置。...virtualenvwrapper virtualenvwrapper 提供了一系列命令使得和虚拟环境工作变得愉快许多。它把你所有的虚拟环境都放在一个地方。...2.在虚拟环境上工作： $ workon my_project 或者，你可以创建一个项目，它会创建虚拟环境，并在 $PROJECT_HOME 中创建一个项目目录。
如果要指定虚拟环境使用的python，需要加上参数p来指定虚拟环境使用的python，如图所示。 ?...最后的python27env只是虚拟环境的名字，创建虚拟环境的过程到此结束，然而，我们并没有使用虚拟环境，使用虚拟环境之前，首先应该激活虚拟环境，如图所示。 ?...然后就可以使用这个虚拟环境了，只不过要注意：虚拟环境默认情况下特别的纯净，没有一个第三方库，几乎都要自己装！还有就是一旦命令提示符关闭之后虚拟环境也会关闭，要想使用还得重新激活！...所以我不推荐大家使用这样的虚拟环境，要想使用虚拟环境，可以使用pycharm，在创建工程的时候指定好虚拟环境该工程就会一直使用那个虚拟环境（在后期可以修改这个环境），而不至于像上面那样进进出出！...下一行就是设置虚拟环境的路径。再下一行是选择解释器，这里一定要选对！创建的虚拟环境和所选择的解释器是对应的！
最近也在搞Vue，感觉挺吃力的~_~ =====================正文=========================== pycharn可以创建虚拟环境，把一些库放在里面，之前项目部署上线...，直接用虚拟环境里面的python库就可以了。...进入虚拟环境，退出虚拟环境可用以下命令： ? 哈哈，这篇博客有点水，先这样吧。
# 退出虚拟环境 $ deactivate 删除 删除虚拟环境，只需删除对应的文件夹就行了。...cd /home/wangbm/Envs $ rm -rf my_env01 注意： 创建的虚拟环境，不会包含原生全局环境的第三方包，其会保证新建虚拟环境的干净。...你会发现了，要进入虚拟环境，必须得牢记之前设置的虚拟环境目录，如果你每次按规矩来，都将环境安装在固定目录下也没啥事。...你可能也发现了，要进入虚拟环境，必须得牢记之前设置的虚拟环境目录，如果你每次按规矩来，都将环境安装在固定目录下也没啥事。...，两种方法 $ workon $ lsvirtualenv # 在虚拟环境内直接切换到其他环境 $ workon my_env02 # 删除虚拟环境 $ rmvirtualenv my_env01
、名字为your_env_name的虚拟环境。...激活虚拟环境 使用如下命令即可激活创建的虚拟环境 Linux: source activate your_env_name(虚拟环境名称) Windows: activate your_env_name...(虚拟环境名称) 此时使用python --version可以检查当前python版本是否为想要的（即虚拟环境的python版本）。...退出虚拟环境 使用如下命令即可退出创建的虚拟环境 Linux: source deactivate your_env_name(虚拟环境名称) Windows: deactivate env_name...find / -name '.condarc' conda install XXX 和 pip install XXX 的区别 conda是一种通用包管理系统，是想要构建和管理任何语言的任何类型的软件
简介 Python 提供虚拟环境，虚拟环境是 Python 解释器的一个私有副本，在虚拟环境中可以安装私有包，而且不会影响到系统中安装的全局 Python 解释器，同时使用虚拟环境不需要管理员权限。...作用 虚拟环境用于解决不同项目所需的 Python 解释器版本不一致以及包的混乱等问题。...可以将系统全局 Python 解释器只作为创建虚拟环境的源，从而为每个程序单独创建虚拟环境，这样可以保证程序只能访问虚拟环境中的包，从而保证全局解释器的干净整洁。 3....virtualenv Windows Mac OS sudo apt install python-virtualenv 3.2 pyvenv 命令 Python 3.3 及后续版本通过 venv 模块原生支持虚拟环境...【注】Python 3.3 中使用 pyvenv 命令创建的虚拟环境不包含 pip，需要手动安装。Python 3.4 及后续版本则没有该缺陷，pyvenv 可以完全代替 virtualenv 。
应对这种情况我们就可以搭建多个虚拟环境来应对不同的环境需求，在虚拟环境中搭建一个Python项目运行所需要的那些包，将来根据运行的项目来切换不同环境即可 我们可以在当前用户的家目录中找到【.virtualenvs...】文件夹，查看当前所有的虚拟环境 ?...virtualenvs 创建虚拟环境 创建：mkvirtualenv [虚拟环境名称] mkvirtualenv lxfenv1 ? 安装成功 注：创建的过程需要联网 ?...lib目录 退出：deactivate 当我们安装好虚拟环境后默认就使用了该虚拟环境，如图标识处可以看出 ?...退出环境 进入：workon [虚拟环境名称] 使用指定的虚拟环境则使用如下命令： workon lxfenv1 ?
Centos的包资源管理器是yum，由于该管理器是由Python语言实现的，故依赖于系统安装Python2.7，上面我们修改了系统内置的Python软链接，会导...
什么是Pycharm中的虚拟环境 假如想要在Pycharm中建立两个项目，并且这两个项目需要用到同一个第三方库的不同版本，如果这两个项目共享一个运行环境，那么此时就会发生版本冲突问题。...为了解决这个问题，Pycharm提供了Virtualenv（即，虚拟环境）。Virtualenv可以创建一套独立运行的Python环境，从而做到不同项目之间的隔离。...当在Pycharm中新建一个工程时会弹出如下界面： New environment 代表新建一个虚拟环境，Existing interpreter代表不新建虚拟环境（选择现有的环境） Inherit...global site-packages代表该虚拟环境可以使用base interpreter中的第三方库 Make available to all projects代表可将此虚拟环境提供给其他项目使用
虚拟环境搭建 我们进行开发的时候虚拟环境搭建尤为重要，我们如果需要的python解释器模块版本不一样可以采用这个办法 pycharm中搭建 命令创建虚拟环境 比如centos没有图形化界面的话，没法装...## 虚拟环境命令 # 1、创建虚拟环境到配置的WORKON_HOME路径下 # 选取默认Python环境创建虚拟环境： -- mkvirtualenv 虚拟环境名称 # 基于某Python环境创建虚拟环境...,并进入到虚拟环境： -- mkvirtualenv -p python2.7 虚拟环境名称 -- mkvirtualenv -p python3.6 虚拟环境名称 # 2、查看已有的虚拟环境...-- workon # 3、使用某个虚拟环境 -- workon 虚拟环境名称 # 4、进入|退出 该虚拟环境的Python环境 -- python | exit() # 5、为虚拟环境安装模块...-- pip或pip3 install 模块名 # 6、退出当前虚拟环境 -- deactivate # 7、删除虚拟环境(删除当前虚拟环境要先退出) -- rmvirtualenv 虚拟环境名称
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
腾讯会议
云直播
对象存储
