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按照筛选数据不容易那么按照就容易吗

前面我出过一个考题,是对GEO数据样本临床信息,根据进行筛选,比如: rm(list=ls()) options(stringsAsFactors = F) library(GEOquery)...eset=getGEO('GSE102349',getGPL = F) pd=pData(eset[[1]]) 就会下载一个表达矩阵,有113个病人(),记录了57个临床信息(),很明显,有一些临床信息是后续数据分析里面...(主要是分组)没有意义,病人总共时间日期,所有的病人可能都是一样。...那么就需要去除,一个简单按照进行循环判断即可!...就是仍然是需要去除无效,就是去掉临床信息为N/A、Unknown、Not evaluated,需要检查全部哦~ 给一个参考答案 pd=pd[apply( apply(pd,2,function

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表头日期转成一,怎么搞?

小勤:我这堆表表头上有个日期,是表示每张表更新时间,我想将这个日期变成这个表,然后再和其他表数据汇总到一起,怎么弄?...大海:这个问题本身并不复杂,但要求对Power Query数据结构和引用方式比较了解。 小勤:感觉是,我就是在操作时候碰到一个情况,然后操作不下去了。...数据下载链接:https://t.zsxq.com/05UrZzjm2 大海:列名里有日期,导致不同表这一列名不一样,结果无法统一修改列名,导致数据无法合并? 小勤:正是呢! 大海:嗯。...看来熟练掌握Power Query数据结构,并且学好怎么跨步骤调用,真的太重要了。...(免费系列视频) 不理解PQ数据结构,再怎么努力也学不好M函数!(上3集) (免费系列视频) 不理解PQ数据结构,再怎么努力也学不好M函数!(下3集)

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数据方向 - vs

lang=en 英文原文链接:http://ibmsystemsmag.blogs.com/you_and_i/db2/ 数据方向 - vs 如果你是一位数据库专家的话,这篇博客可能帮不了你什么...为了方便我们讨论,我们假设每一都包含一个用户信息,每个用户所有属性都整块儿存储在硬盘上。如下图所示,虚拟表(或者数组)中用来存储每个属性。 ? 在硬盘上,大量页面用来存储所有的数据。...(这只是一个示例,事实上,操作系统会带来不止一页数据,稍后详细说明) 另一方面,如果你数据库是基于,但是你要想得到所有数据中,某一数据来做一些操作,这就意味着你将花费时间去访问每一,可你用到数据仅是一小部分数据...一般而言,这些应用程序在使用行数据库时会有更好表现,因为其工作负载趋向于单一实体多个属性(存储在很多中)。由于这些应用程序都是基于工作,所以在使用时,从硬盘中获取页面数量是最小。...即使整个数据库都存放在内存里,也需要消耗大量CPU资源,来将一所有拼接起来。 下面总结这一课关键内容。

1.1K40

【R语言】数据按两排序

我相信大家经常会使用Excel对数据进行排序。有时候我们会按照两个条件来对数据排序。假设我们手上有下面这套数据,9个人,第二(score)为他们考试成绩,第三(code)为对应评级。...主要用是R中order这个函数。...#读入文件,data.txt中存放数据为以上表格中展示数据 file=read.table(file="data.txt",header=T,sep="\t") #先按照code升序,再按照Score...,只需要前面加个负号就可以了 View(file[order(file$Code,-file$Score),]) 下面是按照code升序,然后再按score降序排列结果,是不是跟Excel处理结果一样...在R里面我们还可以指定code按照一定顺序来排列 #按照指定因子顺序排序,先good,在excellent,最后poor file$Code <- factor(file$Code , levels

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seaborn可视化数据多个元素

seaborn提供了一个快速展示数据库中元素分布和相互关系函数,即pairplot函数,该函数会自动选取数据中值为数字元素,通过方阵形式展现其分布和关系,其中对角线用于展示各个元素分布情况...,剩余空间则展示每两个元素之间关系,基本用法如下 >>> df = pd.read_csv("penguins.csv") >>> sns.pairplot(df) >>> plt.show()...函数自动选了数据3元素进行可视化,对角线上,以直方图形式展示每元素分布,而关于对角线堆成上,下半角则用于可视化两之间关系,默认可视化形式是散点图,该函数常用参数有以下几个 ###...#### 3、 x_vars和y_vars 默认情况下,程序会对数据中所有的数值进行可视化,通过x_vars和y_vars可以用列名称来指定我们需要可视化,用法如下 >>> sns.pairplot...通过pairpplot函数,可以同时展示数据多个数值型元素关系,在快速探究一组数据分布时,非常好用。

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【Python】基于某些删除数据重复值

subset:用来指定特定,根据指定数据去重。默认值为None,即DataFrame中一元素全部相同时才去除。...导入数据处理库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多组合删除数据重复值') #把路径改为数据存放路径 name = pd.read_csv('name.csv...结果和按照某一去重(参数为默认值)是一样。 如果想保留原始数据直接用默认值即可,如果想直接在原始数据删重可设置参数inplace=True。...原始数据中只有第二和最后一存在重复,默认保留第一条,故删除最后一条得到新数据。 想要根据更多数去重,可以在subset中添加。...但是对于两中元素顺序相反数据去重,drop_duplicates函数无能为力。 如需处理这种类型数据去重问题,参见本公众号中文章【Python】基于多组合删除数据重复值。 -end-

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FPGA计算3数据之和

实验:FPGA计算3数据之和 实验要求:PC机通过串口发送3数据(一有56个数据,3共有56*3=168个数据)给FPGA,FPGA计算3同一数据和,并将结果通过串口返回给上位机。...实现方法:使用两个FIFO IP Core,将串口接收到数据进行缓存,当第一个FIFO1数据存满后,将FIFO1数据读出来给FIFO2,当FIFO2数据存满时,当前两个FIFO数据和串口正在接收数据就可以看做为三数据了...我们将3数据同时读出,进行求和,然后用串口发送到上位机,这里要注意是三个数据必须对齐,要不然是最终结果是不正确。我这里为了验证方便,只生成了一16个数据。 ? ?   ...本设计是为了基于FPGASobel边缘检测做基础,使用2/3个FIFO将图片数据缓存成3x3矩阵,不过偶然发现Xilinx也有shift_ram IP Core,这个IP简直是为生成3x3矩阵而生,...最后下载板子进行功能验证,发送3组00-0f数据,最后由串口返回上位机数据查看,三数据求和结果是完全正确。至此实验结束,下面进入基于FPGASobel边缘检测实验了。

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数据存储及存储详解

存储是在指定位置写入一次,存储是将磁盘定位到多个列上分别写入,这个过程仍是存储数倍。所以,数据修改也是以存储占优。...2.在数据读取上对比 1)数据读取时,存储通常将一数据完全读出,如果只需要其中几列数据情况,就会存在冗余,出于缩短处理时间考量,消除冗余过程通常是在内存中进行。...相比之下,存储则要复杂得多,因为在一记录中保存了多种类型数据数据解析需要在多种数据类型之间频繁转换,这个操作很消耗CPU,增加了解析时间。所以,存储解析过程更有利于分析大数据。...;因为各独立存储,且数据类型已知,可以针对该数据类型、数据量大小等因素动态选择压缩算法,以提高物理存储利用率;如果某一某一没有数据,那在存储时,就可以不存储该值,这将比式存储更节省空间...列式存储适用场景:   一般来说,一个OLAP类型查询可能需要访问几百万甚至几十亿个数据,且该查询往往只关心少数几个数据

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【说站】Python Pandas数据如何选择

Python Pandas数据如何选择 说明 1、布尔索引( df[df['col'] == value] ) 2、位置索引( df.iloc[...]) 3、标签索引( df.xs(...))...4、df.query(...)应用程序接口 下面将展示每个示例,以及何时使用某些技术建议。...假设我们标准是 column 'A'=='foo' (关于性能注意事项:对于每个基本类型,我们可以通过使用 Pandas API 来保持简单,或者我们可以在 API 之外冒险,通常进入 NumPy,...设置 我们需要做第一件事是确定一个条件,该条件将作为我们选择标准。我们将从 OP 案例开始column_name == some_value,并包括一些其他常见用例。... one three'.split(),                    'C': np.arange(8), 'D': np.arange(8) * 2}) 以上就是Python Pandas数据框选择方法

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【Python】基于多组合删除数据重复值

最近公司在做关联图谱项目,想挖掘团伙犯罪。在准备关系数据时需要根据两组合删除数据重复值,两中元素顺序可能是相反。...本文介绍一句语句解决多组合删除数据中重复值问题。 一、举一个小例子 在Python中有一个包含3数据,希望根据name1和name2组合(在两中顺序不一样)消除重复项。...原始数据如下: ? 希望得到结果: ? 这就是本文解决问题,接下来分享准备关系数据实例。...打印原始数据行数: print(df.shape) 得到结果: (130, 3) 由于每两中有一是重复,希望数据处理后得到一个653去重数据。...从上图可以看出用set替换frozense会报不可哈希错误。 三、把代码推广到多 解决多组合删除数据中重复值问题,只要把代码中取两代码变成多即可。

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聊一聊数据存与

数据读取上对比: 1)存储通常将一数据完全取出,如果只需要其中几列数据情况,就会存在冗余,出于缩短处理时间考量,消除冗余过程通常是在内存中进行。...相比之下,存储则要复杂得多,因为在一记录中保存了多种类型数据数据解析需要在多种数据类型之间频繁转换,这个操作很消耗 CPU,增加了解析时间。所以,存储解析过程更有利于分析大数据。...任何都能作为索引。 缺点 选择 (Selection) 时即使只涉及某几列,所有数据也都会被读取。 选择完成时,被选择重新组装。INSERT/UPDATE 比较麻烦。点查询不适合。...,存表稍微慢一点。...比如,存表不支持数组、不支持生成、不支持创建全局临时表、不支持外键,支持数据类型也会比少。使用时需要查看对应数据库文档。

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R 茶话会(七:高效处理数据

前言 这个笔记起因是在学习DataExplorer 包时候,发现: 这我乍一看,牛批啊。这语法还挺长见识。 转念思考了一下,其实目的也就是将数据指定转换为因子。...换句话说,就是如何可以批量数据指定或者进行某种操作。...(这里更多强调是对原始数据直接操作,如果是统计计算直接找summarise 和它小伙伴们,其他玩意儿也各有不同,掉头左转: 34....R 数据整理(六:根据分类新增列种种方法 1.0) 其实按照我思路,还是惯用循环了,对数据列名判断一下,如果所取数据中,就修改一下其格式,重新赋值: data(cancer, package...如果需要批量计算统计数据,需要借助summarise 函数。 比较粗暴就是,一手动写。

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SQL中转列和转行

而在SQL面试中,一道出镜频率很高题目就是转列和转行问题,可以说这也是一道经典SQL题目,本文就这一问题做以介绍分享。 ? 给定如下模拟数据集,这也是SQL领域经典学生成绩表问题。...两张期望数据表分别如下: 1)长表: ? scoreLong 2)宽表: ?...其基本思路是这样: 在长表数据组织结构中,同一uid对应了多行,即每门课程一条记录,对应一组分数,而在宽表中需要将其变成同一uid下仅对应一 在长表中,仅有一记录了课程成绩,但在宽表中则每门课作为一记录成绩...由多行变一,那么直觉想到就是groupby聚合;由一变多,那么就涉及到衍生提取; 既然要用groupby聚合,那么就涉及到将多门课成绩汇总,但现在需要不是所有成绩汇总,而仍然是各门课独立成绩...02 转行:union 转行是上述过程逆过程,所以其思路也比较直观: 记录由一变为多行,字段由多变为单列; 一变多行需要复制,字段由多变单列相当于是堆积过程,其实也可以看做是复制;

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SQL 中转列和转行

转列,转行是我们在开发过程中经常碰到问题。转列一般通过CASE WHEN 语句来实现,也可以通过 SQL SERVER 运算符PIVOT来实现。用传统方法,比较好理解。...但是PIVOT 、UNPIVOT提供语法比一系列复杂SELECT…CASE 语句中所指定语法更简单、更具可读性。下面我们通过几个简单例子来介绍一下转行、转列问题。...,而且每个学生全部成绩排成一,这样方便我查看、统计,导出数据 SELECT UserName, MAX(CASE Subject WHEN '语文' THEN Score ELSE...这也是一个典型转列例子。...这个是因为:对升级到 SQL Server 2005 或更高版本数据库使用 PIVOT 和 UNPIVOT 时,必须将数据兼容级别设置为 90 或更高。

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用过Excel,就会获取pandas数据框架中值、

在Python中,数据存储在计算机内存中(即,用户不能直接看到),幸运是pandas库提供了获取值、简单方法。 先准备一个数据框架,这样我们就有一些处理东西了。...获取前三,可以执行以下操作: 图8 使用pandas获取单元格值 获取单个单元格值,我们需要使用交集。...图9 获得第2和第4,以及其中用户姓名、性别和年龄,可以将和列作为两个列表传递,如下图所示。 图10 记住,df[['用户姓名','年龄','性别']]返回一个只有三数据框架。...接着,.loc[[1,3]]返回该数据框架第1和第4。 .loc[]方法 正如前面所述,.loc语法是df.loc[],需要提醒(索引)和可能值是什么?...图11 试着获取第3Harry Poter国家名字。 图12 获得第2和第4,以及其中用户姓名、性别和年龄,可以将和列作为两个列表传递到参数“row”和“column”位置。

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如何删除数据中所有性状都缺失

删除上面数据第二和第四! 在数据分析中,有时候需要将缺失数据进行删除。...删除数据很有讲究,比如多性状模型分析时,个体ID1y1性状缺失,y2性状不缺失,评估y1时,不仅可以通过亲缘关系矩阵和固定因子进行评估,还可以根据y1和y2遗传相关进行评估,这时候,y1缺失就不需要删除...tidyversedrop_na函数,当面对多个时,它选择是“或”,即是只有有有一有缺失,都删掉。有时候我们想将两都为缺失删掉,如果只有一有缺失,保留。...: y1 缺失有:1,2,4 y2 缺失有:2,3,4 y1和y2都缺失有:2,4 1....主要分享R语言,Python,育种数据分析,生物统计,数量遗传学,混合线性模型,GWAS和GS相关知识。

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学徒讨论-在数据里面使用每平均值替换NA

最近学徒群在讨论一个需求,就是用数据每一平均数替换每一NA值。但是问题提出者自己代码是错,如下: ? 他认为替换不干净,应该是循环有问题。...#我好像试着写出来了,上面的这个将每一NA替换成每一平均值。 #代码如下,请各位老师瞅瞅有没有毛病。...:我是这么想,也不知道对不对,希望各位老师能指正一下:因为tmp数据中,NA个数不唯一,我还想获取他们横坐标的话,输出结果就为一个list而不是一个数据了。...a=1:1000 a[sample(a,100)]=NA dim(a)=c(20,50) a # 按照,替换每一NA值为该平均值 b=apply(a,2,function(x){ x[is.na...,就数据长-宽转换!

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