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R语言实现模型的评估

在R语言中构建模型，有很多包进行了模型的封装。那么模型的评估在R中也有对应的包ipred。此包利用了bagging和boosting算法进行对模型的的评估。...我们直接通过一个实例来看下间接分类模型的评估过程： data("Smoking",package = "ipred") classify <-function(data){ data <- data...formula,data = smoking, pFUN = list(list(model = lm, predict = mypredict.lm)),cFUN = classify) 最后是错误率评估功能...，可以通过预测误差估计值的重新抽样评估生存数据的误分类误差、均方根误差或Brier评分。...我们首先看下此功能最重要的参数estimator=c("cv","boot", "632plus")指的是进行评估的几种方法：cv交叉验证；boot基于bootstrap；632plus指的是632+

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Nguyen的评估代码复现

这一部分是笔者毕业论文中的对Nguyen的基因集分析方法评估的R语言复现。前面的准备过程可见其他的帖子。...此处以GSVA方法进行示例： library(parallel) library(doParallel) library(foreach) #并行计算所使用的R包 library(tibble)....RData") #文件目录需要根据实际情况进行更改 # gsva的方法评估 - - - - - -.../narcissus/Desktop/bioinfomatics/gsaMethod/gsva_method.R") # 引入具体的评估方法 cl <- makeCluster(4) registerDoParallel...值分布数据之后，进行偏性的评估。

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R语言与分类算法的绩效评估

我们就可以根据AUC的值与0.5相比，来评估一个分类模型的预测效果（我们这里logistic分类器训练集的auc约为0.78）。...上述过程听起来不是那么的明白，不妨阅读以下下列代码，就会发现一切是那么的一目了然。（以logistic模型考虑客户分类为例） [plain] view plaincopyprint?...运行下列代码还可以得到近似的AUC： [plain] view plaincopyprint?...这也就是为什么IR中很多算法的评估都用到Precision和Recall来评估好坏。我们来看看logistic回归在测试集上PR曲线的表现： ?...六、R实现 R提供了各种各样的函数来实现分类的绩效评估。我们为了保持行文的一贯性，我们使用鸢尾花数据（仅考虑后两种花的分类）SVM模型来说说R是如何实现绩效评估的。

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R语言入门之评估假设检验的条件

R包mvoutlier提供aq.plot(x)函数，通过计算稳健平方马氏距离和经验分布距离的差异来寻找多元样本里的异常值，并且以图片的形式展现出来，这里的x通常是一个矩阵或者数据框。...# 评估mtcars里的mpg数据的正态性 attach(mtcars) qqnorm(mpg) # 绘制Q-Q图 qqline(mpg) # 添加参照线 ?...多元正态性多元方差分析假定数据服从多元正态分布，R包mvnormtest提供了进行多元正态性检验的函数mshapiro.test()，这个函数也是基于Shapiro-Wilk检验的。...方差的同质性在R中，函数bartlett.test()提供了同方差性的参数检验方法，而flinger.test()则提供的是非参数检验方法。...R包biotools里的boxM()函数可以帮助实现。如何正确评估假设检验的条件是否成立是我们在进行统计分析时必须考虑的一件事，这点非常重要！

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用于修补代码和评估代码质量的抽象语法树

稍后，我们将介绍如何使用 AST 来评估代码质量。 1抽象语法树 (AST) 抽象语法树（Abstract Syntax Tree，或 AST）是源代码的一种树形展示。...在这 5 个脚本中，有一个脚本是独一无二的——一个代码清理器，而且不是一个传统的补丁。这一需求源于一个外部团体试图审查代码的大纲，而不用分享实际的逻辑和代码细节。...因此，AST 对于构建一个代码清理器也是一个有价值的工具。局限性使用 Python 的 ast 包修补代码的一个问题是，它丢失了原始源代码的所有格式和注释。这可以通过使补丁更智能一点来解决。...3代码质量评估现在我们已经知道 AST 在编写智能补丁脚本时非常有用，在本章节，我们将解释它如何用来评估代码质量。...下面是一些例子：示例 1: 非自解释变量名你想要你组织中的开发者在代码中使用良好的自解释的变量名。你在代码中看到的最常见的问题是使用单字符变量名，例如 i、j 等。

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R语言ROC曲线下的面积-评估逻辑回归中的歧视

p=6310 在讨论ROC曲线之前，首先让我们在逻辑回归的背景下考虑校准和区分之间的区别。良好的校准是不够的对于模型协变量的给定值，我们可以获得预测的概率。...如果观察到的风险与预测的风险（概率）相匹配，则称该模型已被很好地校准。也就是说，如果我们要分配一组值的大量观察结果，这些观察结果的比例应该接近20％。...为了了解原因，假设我们为我们的结果拟合了一个模型但没有任何协变量，即模型：对数几率，使得预测值将与数据集中的观察的比例相同。这个（相当无用的）模型为每个观察分配相同的预测概率。...在R中绘制ROC曲线 set.seed（63126） n < - 1000 x < - rnorm（n） pr < - exp（x）/（1 + exp（x）） y 的模型具有更接近图的左上角的ROC曲线，而没有辨别能力的模型具有接近45度线的ROC曲线。因此，曲线下面积从1（对应于完美辨别）到0.5（对应于没有辨别能力的模型）。

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日常代码笔记，python的推导式&性能评估

写代码跟写作类似，需要不断地练习，不断地阅读，获得灵感，然后反复修改（重构）。写代码有代码补全工具，然后我们还是需要不断地练习、实验自己的新想法。...之前对python的推导式没有仔细去了解，今天抽空练习了下，顺路重构下以前代码里比较耗时的逻辑。以下为正文，分享给大家：推导式comprehensions（又称解析式）。...z=[i+3 for i in range(100000) if i%2==0] t2=time.time() print(t2-t1) 耗时0.008960962295532227 除了从耗时上评估性能之外...，还可以通过dis模块获取到对应的字节码指令来评估。...5 million developers. codepen 是一个完全免费的前端代码托管服务，上面有很多特效代码，也是我常逛的~

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PASCAL VOC的评估代码voc_eval.py解析

目录1、读检测的结果2、解析一幅图像中的目标数3、计算AP4、VOC的评估5、进行python评估6、voc的检测评估----1、读检测的结果def write_voc_results_file(all_boxes...test_imgid_list：测试的图像列表。det_save_path：检测保存的地址。...4、VOC的评估def voc_eval(detpath, annopath, test_imgid_list, cls_name, ovthresh=0.5, use_...= np.array([x['difficult'] for x in R]).astype(np.bool) det = [False] * len(R) num_pos = num_pos...# plt.show() # plt.savefig(cfgs.VERSION+'.jpg') print("mAP is : {}".format(np.mean(AP_list)))6、voc的检测评估

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R语言主题模型LDA文本挖掘评估公司面临的风险领域与可视化|附代码数据

我们在本文中重点关注的一个示例是评估公司面临的不同风险领域介绍为此，我们参考公司提交给证券交易委员会的年度报告，其中提供了公司财务业绩的全面摘要[1]，包括公司历史，组织结构，高管薪酬，股权，子公司和经审计的财务报表等信息...textdata = readRDS("data.Rds") 我们计算词频(term frequency,TF)和逆文档频率（IDF inverse document frequency）进行评估 stpw...我们评论了以下代码，因为这是一个交互式代码。...bernardi/Courses/DL/Slides_11_12/measures.pdf [8] http://leitang.net/presentation/LDA-Gibbs.pdf ---- 本文选自《R语言主题模型...LDA文本挖掘评估公司面临的风险领域与可视化》。

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R代码|dplyr包的使用示例

代码代码来自《r-data-science-quick-reference-master》的内容。 dplyr包的使用例子。...## 加载R包 library(tidyverse) iris_df <- as_tibble(iris) print(iris_df, n = 3) head(iris_df$Species)...%>% filter(str_starts(Species, "v")) %>% print(n = 3) iris_df %>% filter(str_ends(Species, "r"...mean_per_country, mean_income ) ) %>% spread(key = "year", value = "mean_income") 温馨提示：第一步：运行一边代码...，掌握相应的包和函数使用第二步：迁移到自己的数据集，进行应用

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R代码|基于特征重要性的特征排序代码

基于特征重要性的特征排序代码。这个代码可以用于指导特征选择，特征选择的策略： 1）Top-N策略；2）Top-percent策略。...# 导入R库 library(mlbench) library(caret) # 加载数据集 data(PimaIndiansDiabetes) # 设置训练的控制参数，利用10-折交叉验证的方法...train(diabetes~., data=PimaIndiansDiabetes, method="lvq", preProcess="scale", trControl=control) # 评估变量的变量重要性...代码源自： https://setscholars.net/2019/10/25/how-to-rank-feature-with-importance-in-r-feature-selection-in-r

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R问题｜如何查看函数的源代码

简介最近有读者问我，如何查看R语言某包中某函数的源代码呢？我第一时间给出了自己比较常用的方法（见方法一），今天打算做个这方面的推文，于是又查了些资料，才发现原来水好深！...还有更好的方法(见方法二)，并且和不同的面向对象系统有关。方法一打开查R包的相关网站，比如：https://rdrr.io/ ?...查R包的相关网站输入你的R包名称或者相应的函数，这里以nlme包中的lme()为例。 ? 找到对应位置进入会出现这样的界面，界面相应介绍可以下图： ?...界面介绍打开左上角的源代码（Source code）即可找到该包内部的所有函数了。 ? 源代码找到你对应的函数，进入即可，任务完成。 ?...nlme源代码方法二 Stack overflow[1]中给出了一些更加高效的方式，在R控制台输入相应函数，即可得到对应函数的源代码了。这里小编做个知识点整理，自己也学一波。

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R中稀奇古怪的代码报错

❝最近偶尔遇到个别朋友询问运行代码报错的情况，各种情况都有但是长久的情景几乎是一致。本节来解答一下遇到这些该如何执行。...，可通过网络检索该函数即可得知所对应的R包案例3 ❝一堆警告信息就是报错不出图，遇到这种情况多半是所使用的R包作者进行了更新，这种情况尤其是在「github」上发布的R包常出现，因此可去作者github...❞ 案例4 ❝毫无头绪的报错，数据处理后就是无结果反馈。这种情况就比较复杂了，有可能是R包之间函数冲突，有可能是版本问题，更甚者是电脑性能的问题。...下面举个实际例子来进行说明 ❞ 案例图此图为小编2023年9月25日公众号发布的一篇文档图，此次在原有代码的基础上做了简化，代码如下加载R包 library(tidyverse) library(ggtext...R代码的报错真是难以让人琢磨，「也许这就是提示该换电脑了」 ❞

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R tips：RMarkdown代码块的控制选项

I 代码 eval 是否运行代码块，有些代码块是不运行的，仅仅是为了展示使用。 RMarkdown的代码选项是接受R变量的，所以可以根据特定条件去控制一个代码块是否执行。...```{r,include = FASLE} isShow 0 ``` ```{r, eval = isShow} {eval some code} ``` echo 是否在结果中展示代码块...```{r, echo = FALSE}{eval some code}``` tidy 是否在显示代码的时候做格式化处理，如果为TRUE，那么会使用formatR格式化R代码：调整缩进、换行等等。...（###的正确渲染需要前后都是空行，因此还使用cat打印了两个空行） ```{r, result = "asis"}cat(" \n")cat("### 测试三级标记可以通过代码产生 \n") cat...include 如果为FALSE，会隐藏本代码块和代码块输出，但是会执行代码内容，可用于做初始化，比如在RMarkdown的开始位置： ```{r setup, include = FALSE} # 导入工具包

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用R语言构建神经网络模型评估银行客户信用的好坏

随着银行业务的扩展、P2P的出现、第三方支付提供个人贷、以及X宝等借贷平台的出现，使得个人信用评估在银行、第三方支付、商业借贷平台等上的应用越来越重要。...个人信用等级评估指标体系商业银行个人信用等级评估指标体系设立的目的简述为银行通过评估借款人的“3C”,即品德(Character)、能力(Capacity)以及抵押(Collateral),对借款人在债务期满时偿债能力...根据指标体系设立原则,参照国际标准、国内外银行经验和企业信用等级评估方法,综合考虑商业银行特点及所在地区情况,通过对以往借款人群的考察,以专家判断为基础,可选择4大类21个指标全面评价个人信用等级。...进行个人信用等级评估与预测时,有些因素带有模糊性,而BP人工神经网络的后天学习能力使之能够随环境的变化而不断学习,能够从未知模式的大量复杂数据中发现规律,与传统的评价方法相比,表现出更强的功能。...BP人工神经网络可以再现专家的经验、知识和直觉思维,较好地保证了评估与预测结果的客观性。模型建立 R语言AMORE包是个前馈神经网络工具包，类似的还有nnet，RSNNS等。

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更现代的R代码编辑器----本地VSCode-R搭建

因此，虽然RStudio是一个很好的工具，但它也有一些缺点，这些缺点可能会对一些用户造成问题。所以为什么不来试试真正的"现代化代码编辑器"呢？比如，VSCode？...其次，VSCode具有出色的代码自动完成功能和强大的代码编辑工具，这些工具可以帮助您更快地编写和调试代码。您可以轻松地自定义代码片段、快捷键和扩展，以便更好地适应自己的编码风格和需求。...此外，VSCode还具有出色的Git集成，可以使您更轻松地管理代码版本控制。您可以使用VSCode内置的Git功能轻松查看代码差异、提交更改和解决冲突。...最后，VSCode是一个轻量级的编辑器，可以更快地启动和运行，这意味着您可以更快地开始编写代码。它也可以更好地适应低性能计算机，因为它不需要太多的系统资源。...因此，如果你正在寻找一个更灵活、更高效的R代码编辑器，那么VSCode是一个值得考虑的选择。

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R语言实现评估随机森林模型以及重要预测变量的显著性

“随机森林分类”以及“随机森林回归”在R语言中实现的例子，包括模型拟合、通过预测变量的值预测响应变量的值、以及评估哪些预测变量是“更重要的”等。...下文的测试数据，R代码等的百度盘链接（提取码，z8zb）： https://pan.baidu.com/s/1-L78HuRzZCvH2LCzys4wJQ 若百度盘失效，也可在GitHub的备份中获取：...（即，R2），但也没有对全模型的显著性进行评估。...例如这里R2=0.9614，用眼睛就能直接判断出来p的还是要计算一下。同样仿照Jiao等（2018）的方法，我们可以使用A3包评估全模型的显著性。...由于随机的因素在里面，这里的R2和上文的R2相比有很微小的差异，但是并无大碍，就默认为它们一致就可以了。至于结果中的其它值反映了什么信息，我没有过多关注，大家有兴趣可以自己研究下。

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机器学习中分类任务的常用评估指标和python代码实现

假设您的任务是训练ML模型，以将数据点分类为一定数量的预定义类。一旦完成分类模型的构建，下一个任务就是评估其性能。有许多指标可以帮助您根据用例进行操作。在此文章中，我们将尝试回答诸如何时使用？...F1分数 F1结合了Precision和Recall得分，得到一个单一的数字，可以帮助直接比较不同的模型。可以将其视为P和R的谐波均值。谐波均值是因为与其他方式不同，它对非常大的值不敏感。...(y, y_pred) return 2*p*r / (p+r) AUC-ROC AUC-ROC是用于二分类问题的非常常见的评估指标之一。...在代码中，w1和w2分别对应正类和负类的权重。...，每个数据科学家在根据手头问题的性质评估机器学习分类模型时都必须牢记这些评估指标。

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文本或代码中 n 和 r 的区别

\r\n"); 那你知道这些 \n 和 \r 的区别吗？一、关于 \n 和 \r 在 ASCII 码中，我们会看到有一类不可显示的字符，叫控制字符，其中就包含\r 和 \n 等控制字符。 ?...\r : 回车符（return），回到一行的开头，对应 ASCII 值 13（缩写：CR）。...这就是"换行"和"回车"的来历，从它们的英语名字上也可以看出一二。二、\n 和 \r 差异后来，计算机发明了，这两个概念也就被搬到了计算机上。...'\r'是回车，'\n'是换行，前者使光标到行首，后者使光标下移一格。通常用的 Enter 是两个加起来。有的编辑器只认\r\n，有的编辑器则两个都认。所以要想通用的话，最好用\r\n 换行。...Linux 保存的文件在 windows 上用记事本看的话会出现黑点。这个应该很多人都看到过，比如，Keil 代码中直接显示换行符： ?

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R 茶话会（四：R 代码的收纳工二弟）

R 茶话会（三：美化/格式化代码）之前看到新闻，收纳工还变成了热门职业：看来好好收拾也是一项厉害的技能。 R 一样啊，有时候乱七八糟的数据代码，看得让人头皮发麻。...有的时候，要是因为代码混乱，报错就更糟糕了：收拾外部复制粘贴的内容我们有的时候从网站或者paper中复制内容，粘贴到R中，还需要我们手动去分离，做成字符串。...这里可以直接使用R 包datapasta，将数据内容复制到R 中，会自动生成指定类型的转换代码，很容易就可以生成R 对象了。...", "Recommend Ctrl + Shift + v as shortcut") 收拾自己的代码包括两个选项，依旧是在快捷键中配置： Fiddle Selection 有两个用途，可以给空格间隔的字符加上向量符号和逗号间隔...通过二者的组合，我们可以非常方便（tou lan）的创建向量了。这里还有一段介绍视频，挺酷的！https://www.youtube.com/watch?

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