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数据框、矩阵和列表20230202

一、向量、矩阵、数据框和列表的区别 1)向量:一维 2)矩阵:二维,只允许一种数据类型 3)数据框:二维,每列只允许一种数据类型 4)列表:容纳各种数据类型 ps:数据类型的判断:clss()...数据类型的转化:as.data.frame/ as.matrix 二、数据框 (1)数据框的来源: a 新建 b as.data.frame转化 c 读取表格文件 read.csv() d 内置数据集如...(3)数据框的属性 获得行数 nrow() 获得列数 ncol() 获得行名 rownames() 获得列名 colnames() (4)数据框取子集 >数据框名称 $ 列名 eg. df1$...) 4、修改行名和列名 行名修改:rownames(数据框的名称)<-c() #重新赋值 名列名修改:colnames(数据框的名称)<-c() 改一个行名或列名: colnames(数据框名称)[列数...7 8 9 (3)矩阵和数据框的转化 as.data.frame() as.matrix() 最后用class() 明确一下数据类型 (4)矩阵画热图 图片 四、列表 (1)列表的新建

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R语言-03数据框、矩阵和列表

“向量”——一维 “表格”——二维 matrix 矩阵-二维,只允许一种数据类型 data.frame 数据框-二维,每列只允许一种数据类型 list列表:可装万物 1.数据框来源 (1)用代码新建 (...#读取"gene.csv"文件,赋值df2 3.数据框属性 4.数据框取子集 df1$gene #"$"前是数据框名称 后是列名;提取该列的向量 #按名字取子集 df1 行,列 图片 5.数据框修改...取子集,赋值 #改行名和列名 rownames(df1) <- c("r1","r2","r3","r4") #修改全部行名 #只修改某一行/列的名 colnames(df1){2} <- "CHANGE..." #修改一个列名 6.两个数据框的连接 按照共同的列名取交集,后连接 两个数据框列中有交集时既可以使用,自动连接 矩阵新建和取子集 矩阵画热图 pheatmap::pheatmap(m) #热图结果默认聚类...pheatmap::pheatmap(m,cluster_cols = F,cluster_rows = F) #修改默认聚类 列表新建和取子集(列表可装万物) x[1] x$m1 #列表取子集 元素的

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    基因集合的数据框,列表和对象形式

    ,基于通路、文献等: C3: motif gene sets:模式基因集合,主要包括microRNA和转录因子靶基因两部分 C4: computational gene sets:计算基因集合,通过挖掘癌症相关芯片数据定义的基因集合...可以看到,GO/KEGG是最出名的,但不是唯一的,起码和kegg数据库并列的就有Reactome数据库。...,因为数据框不能是不整齐的,所以没办法是宽的,每个基因集合里面的基因个数不一样,大概率都是不整齐的。...(glist)) 这样的列表如果想转换成为前面的数据框也很容易: TERM2GENE = do.call(rbind, lapply(names(genes_to_check), function(...x){ data.frame(gs_name=x,gene_symbol=glist[[x]]) })) 对象(遵循MSigDB的gmt文件标准) 前面的数据框或者列表,要弄成对象就比较麻烦了,需要做一些转换

    1.6K10

    seaborn可视化数据框中的多个列元素

    seaborn提供了一个快速展示数据库中列元素分布和相互关系的函数,即pairplot函数,该函数会自动选取数据框中值为数字的列元素,通过方阵的形式展现其分布和关系,其中对角线用于展示各个列元素的分布情况...函数自动选了数据框中的3列元素进行可视化,对角线上,以直方图的形式展示每列元素的分布,而关于对角线堆成的上,下半角则用于可视化两列之间的关系,默认的可视化形式是散点图,该函数常用的参数有以下几个 ###...# 1. corner 上下三角矩阵区域的元素实际上是重复的,通过corner参数,可以控制只显示图形的一半,避免重复,用法如下 >>> sns.pairplot(df, corner=True) >>...#### 3、 x_vars和y_vars 默认情况下,程序会对数据框中所有的数值列进行可视化,通过x_vars和y_vars可以用列名称来指定我们需要可视化的列,用法如下 >>> sns.pairplot...通过pairpplot函数,可以同时展示数据框中的多个数值型列元素的关系,在快速探究一组数据的分布时,非常的好用。

    5.2K31

    R语言 数据框、矩阵、列表的创建、修改、导出

    ,data.frame数据框允许不同列不同的数据类型,但同一列只允许一种数据类型*数据框中括号内行在列前df1 的元素赋值修改数据框的连接merge函数可连接两个数据框,通过指定公共列使具有相同元素的行的列合并*merge函数可支持更复杂的连接,但通过inner_join等更为简便,后述test1 的向量出现在环境内,本身有名称,无需赋值矩阵和列表矩阵矩阵内所有元素数据类型必须相同*警惕因数据类型不同导致矩阵强制转换引起报错...m 的数据框行名和列名为[1,]等colnames(m) 数据框t(m) #转置行与列,数据框转置后为矩阵as.data.frame(m) #将矩阵转换为数据框列表列表内有多个数据框或矩阵,可通过list函数将其组成一个列表l <- list(m1

    7.9K00

    【Python】基于某些列删除数据框中的重复值

    subset:用来指定特定的列,根据指定的列对数据框去重。默认值为None,即DataFrame中一行元素全部相同时才去除。...结果和按照某一列去重(参数为默认值)是一样的。 如果想保留原始数据框直接用默认值即可,如果想直接在原始数据框删重可设置参数inplace=True。...四、按照多列去重 对多列去重和一列去重类似,只是原来根据一列是否重复删重。现在要根据指定的列判断是否存在重复(顺序也要一致才算重复)删重。...原始数据中只有第二行和最后一行存在重复,默认保留第一条,故删除最后一条得到新数据框。 想要根据更多列数去重,可以在subset中添加列。...如需处理这种类型的数据去重问题,参见本公众号中的文章【Python】基于多列组合删除数据框中的重复值。 -end-

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    R语言第二章数据处理⑤数据框列的转化和计算目录正文

    正文 本篇描述了如何计算R中的数据框并将其添加到数据框中。一般使用dplyr R包中以下R函数: Mutate():计算新变量并将其添加到数据表中。 它保留了现有的变量。...同时还有mutate()和transmutate()的三个变体来一次修改多个列: Mutate_all()/ transmutate_all():将函数应用于数据框中的每个列。...Mutate_at()/ transmutate_at():将函数应用于使用字符向量选择的特定列 Mutate_if()/ transmutate_if():将函数应用于使用返回TRUE的谓词函数选择的列...tbl:一个tbl数据框 funs:由funs()生成的函数调用列表,或函数名称的字符向量,或简称为函数。predicate:要应用于列或逻辑向量的谓词函数。...funs(cm = ./2.54) ) mutate_if():转换由谓词函数选择的特定列。

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    【Python】基于多列组合删除数据框中的重复值

    最近公司在做关联图谱的项目,想挖掘团伙犯罪。在准备关系数据时需要根据两列组合删除数据框中的重复值,两列中元素的顺序可能是相反的。...本文介绍一句语句解决多列组合删除数据框中重复值的问题。 一、举一个小例子 在Python中有一个包含3列的数据框,希望根据列name1和name2组合(在两行中顺序不一样)消除重复项。...由于原始数据是从hive sql中跑出来,表示商户号之间关系的数据,merchant_r和merchant_l中存在组合重复的现象。现希望根据这两列组合消除重复项。...打印原始数据行数: print(df.shape) 得到结果: (130, 3) 由于每两行中有一行是重复的,希望数据处理后得到一个65行3列的去重数据框。...从上图可以看出用set替换frozense会报不可哈希的错误。 三、把代码推广到多列 解决多列组合删除数据框中重复值的问题,只要把代码中取两列的代码变成多列即可。

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    R 茶话会(七:高效的处理数据框的列)

    前言 这个笔记的起因是在学习DataExplorer 包的时候,发现: 这我乍一看,牛批啊。这语法还挺长见识的。 转念思考了一下,其实目的也就是将数据框中的指定列转换为因子。...换句话说,就是如何可以批量的对数据框的指定行或者列进行某种操作。...R 数据整理(六:根据分类新增列的种种方法 1.0) 其实按照我的思路,还是惯用的循环了,对数据框的列名判断一下,如果所取的列在数据框中,就修改一下其格式,重新赋值: data(cancer, package...如果需要批量计算统计数据,需要借助summarise 函数。 比较粗暴的就是,一行一行的手动写。...批量处理 组合一般的运算 逻辑判断方便获得指定列(通过& ) 无缝结合tidyverse 中的其他函数 image.png

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    学徒讨论-在数据框里面使用每列的平均值替换NA

    最近学徒群在讨论一个需求,就是用数据框的每一列的平均数替换每一列的NA值。但是问题的提出者自己的代码是错的,如下: ? 他认为替换不干净,应该是循环有问题。...#我好像试着写出来了,上面的这个将每一列的NA替换成每一列的平均值。 #代码如下,请各位老师瞅瞅有没有毛病。...:我是这么想的,也不知道对不对,希望各位老师能指正一下:因为tmp数据框中,NA个数不唯一,我还想获取他们的横坐标的话,输出的结果就为一个list而不是一个数据框了。...(x)]=mean(x,na.rm = T) return(x) }) 大家可以对比一下,看看自己的R语言水平停留在哪一个答案的水平 学徒作业 把 melt 和dcast函数,自己写一遍自定义函数实现同样的功能...,就数据框的长-宽转换!

    3.6K20

    R编程(二:基本数据类型及其操作之因子、矩阵、数据框和列表)

    数据框dataframe 一个合适表格就和问卷一样,是包含不同类型的数据的。但需要注意的是,数据框的每一列只 包含一种数据类型 ,也就是说每一列如果单独提取出来,都是一个向量。...数据框的来源 image.png as.data.frame(matrix),可以将矩阵数据转为数据框。 查看数据框 通过head()与tail()快速查看,默认提取前六行。...修改数据框 和向量是一样的,也就是选择+赋值。...当通过名称对数据框进行选择的子集不存在时,R会帮我们创建一个新的内容。 排序 order() 会将其中的元素按照大小顺序排列,并按照大小顺序返回元素所在的位置数据。...列表的提取也可以按照类似数据框的方式提取。、 需要注意的是,列表用一个中括号提取内容,会返回一个列表,列表中包含提取的内容,只有用两个中括号,才会返回该内容本来的格式。

    2.8K20

    tibble 和传统数据框:哪个更适合网页爬取的数据存储

    概述在网页爬取过程中,选择合适的数据存储结构至关重要。R 语言中有两种常用的数据存储结构:传统数据框(data.frame)和现代的 tibble(来自 tibble 包)。...两者在性能、灵活性和兼容性方面各有优劣。同时,百度搜索作为中国最受欢迎的搜索引擎,其关键词排名数据可以精准反映用户的搜索意图和当前的网络热点。...本文将探讨传统数据框与 tibble 的差异,并通过从百度搜索获取排名前十的关键词链接为例,分析两者在网页爬取数据存储中的表现。...数据框与 tibble 的对比属性传统数据框tibble性能操作速度较慢,特别是大规模数据处理时表现较差。优化性能,适合大数据集的存储与处理。灵活性不支持嵌套列表或复杂结构,列名需遵循规则。...在网页爬取数据存储方面,传统数据框和 tibble 各具优势:小型项目:传统数据框更适合简单的、无需复杂存储结构的任务。

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    突破数据验证列表,使用VBA创建3层和4层级联组合框

    标签:VBA,组合框 你是否曾想过管理级联数据验证(即“数据有效性”)列表,而不需要几十到数百个命名的单元格区域?...这里为你提供一个示例工作簿,其中运用的方法可以动态创建数据验证列表,允许管理垂直列表,向列表中添加新列,并无缝更新数据验证列表。 数据在电子表格中的排列如下图1所示。...一般前提是,根据选择的部门(Department),获取列表并为用户提供选项,并将类别(Category)限制为所选的单一部门。...因此,如果选择“Auto”,则第二个数据验证列表中只会显示“Cleaning”和“Accessories”。...然后,如果选择了“Cleaning”,则第三个组合框中将显示“Engine Wash”、“Oil Clean”、“Windows”和“Pumpit”。如下图2所示。

    1.4K20

    从零开始的异世界生信学习 R语言部分 02 数据结构之数据框、矩阵、列表

    数据框 data.frame 数据框 约等于表格:1.数据框不是一个具体文件,只是R语言内部的一个数据;2.数据框每一列只能有一种数据类型 图片 新建和读取数据框 #新建和读取数据框 df1 <- data.frame...df1) #输出行名 colnames(df1) #输出列名 数据框取子集 数据主要操作为按列取子集,取出来的为向量;按行去子集取出的仍为数据框。...#取第二列 df1[c(1,3),1:2] # 取第一行和第三行以及第一列和第二列,注意逗号前后不同的向量,分别表示取得行和列!!!...#如何取数据框的最后一列?...,sort = T) #左连接,即新合并的数据框中,保留test1中保留选中的name列中的所有元素,新的数据框中没有的数据显示NA,sort表示按列排序 merge(test1,test3,by.x

    1.8K20

    CListBox

    列表框显示项的列表,如用户可以见到和选择的文件名称。在单选列表框里,用户只可选择一个项。在多选列表框里,可选择许多项。当用户选择某项时,其高亮显示且列表框给父窗口发送一个通知消息。   ...如果要处理由列表框发送到其父亲(通常为从CDialog派生的类)的Windows通知消息,为每个消息添加消息映射入口和消息处理成员函数到父类。   ...拷贝某列表框项到缓冲区  GetTextLen 返回列表框的字节长  SetColumnWidth 设置多列列表框的列宽  SetTabStops 设置列表框制表键停止位置  GetLocale... SetSel 在多选列表框中选择或不选某个列表框项  GetCaretIndex 确定在多选列表框中有焦点矩形的项的索引  SetCaretIndex 设置焦点矩形到多选列表框中的指定的索引项 ...GetSelCount 返回多选列表框中当前选择的字符串的数目  GetSelItems 返回列表框中当前选择的字符串的索引  SelItemRange 选择/不选多选列表框中的一些字符串  SetAnchorIndex

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    R语言系列第一期(番外篇 ):R的6种对象—向量、矩阵、数组、因子、列表、数据框

    · 6.数据框 · 到最后一个对象了,在其他统计软件包中,数据框被称为“数据矩阵”或“数据集”,他是一系列等长度的向量和/或因子,交叉相关,很适合数据收集的类型。...,可以直接使用变量名如: > d$age [1] 42 38 26 #Tips:数据框的感觉就像每一行代表一个单位,每一列代表一项属性,因此每列内部数据类型一致,而列间数据类型可能不同。...同时也可以采用负索引,如果想把7和9从a中剔除掉的结果,可以: > a[c(-4,-5)] [1] 1 4 5 · 2.条件选择 · 当然有的时候我们并不知道我们想要的数据在一个向量中的位置,只需要部分满足条件的值...只有一个数字的索引在数据框中只会提取列数据,不会提取行数据,所以d[3, ]中的”,”省掉和不省结果是不同的。逗号前代表行,逗号后代表列。...同时,前面提到的条件选择在这里也同样适用,提取数据框d中年龄的单位。

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