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这个错误是由于缺少zlib库导致的。zlib是一个用于数据压缩和解压缩的开源库,bedtools在编译过程中需要使用到该库。
要解决这个问题,可以按照以下步骤进行操作:
apt-cyg install zlib-devel
这个命令会自动下载并安装zlib库及其开发文件。
如果还有其他问题或者需要更详细的帮助,请提供更多的错误信息和操作环境的详细信息,以便我们能够更准确地帮助你解决问题。
工具中的SFTP协议,具体方法如图: 注意:上传的文件会在登录用户的home目录下,可以通过lpwd查看本地目录,pwd查看远端目录 3、对文件解压:tar xzvf git-2.19.0.tar.gz...4、进入解压后的git目录后,安装方式参考:https://github.com/git/git/blob/master/INSTALL或目录下的INSTALL,这里采用建议步骤: # make configure...[configure] 错误 127 通过yum provides autoconf查询到没有安装autoconf,yum -y install autoconf安装包及对应的依赖。...:1:0: cache.h:20:18: 致命错误:zlib.h:没有那个文件或目录 #include ^ 编译中断。...make: *** [credential-store.o] 错误 1 错误指出没有zlib,yum -y install zlib安装,发现已经安装,zlib.h应该是对应的开发包没有,yum -y
下面这个错误是因为zlib包没有安装,安装后问题即可解决。...但有一点请注意安装命令是:sudo apt-get install zlib1g-dev,而非sudo apt-get install zlib ..../file_util.cpp:19:18: 致命错误: zlib.h:没有那个文件或目录 编译中断。
主要是因为 Cygwin目前设计的还不是很人性化。如果我们安装好Cygwin后,如果缺少了某个包想安装的话就特别麻烦。还需要重新安装 Cygwin才能解决,有没有更好的方式呢?...编译安装 ffmpeg 先别高兴的太早,虽然有了apt-cyg这个神器,但它目前只能安装Linux下的一些常用命令,像我们编译时需要的 x264, x265这些库它是无法找到的。...将 lame目录下的 config.guess文件替换为 /usr/share/automake-version下的config.guess 文件。 此时,再执行....问题二: make时出现 "error: '_O_BINARY' undeclared (first use in this function)"的错误,解决办法如下: 打开出错文件 vi ....问题一:找不到 fdk-aac库 在编译ffmpeg时,有可能会报找不到fdk_aac库的错误。
永久修改编码方式需要修改注册表 cmd命令行访问国外网站出现ssl验证错误 当我们在命令行下载文件时,经常需要代理以加快下载速度,但代理后又会报错。...\Cygwin\Versions\2.0.a9.oga.1\i686\grads.exe这个程序为例 注:dos中输入路径时,最好用“”括起来,防止路径中的空格特殊字符等导致命令执行失败 第一种 先进入程序文件夹...,然后在命令行中输入grads或grads.exe 注:输入graads会自动在当前变量与环境变量中寻找同名.exe或.bat文件,所以输入的时候最好加上后缀。...\i686\grads.exe" CD命令 cd命令只能逐级进入目录,或者输入完整路径,但注意,切换不同盘符路径时要先转到对应的盘符再到输入完整路径 比如转到E:\grads\file中 C:\Users...hexo但是依旧报这个错误,可能是没有加入环境变量 解决: 找到自己安装hexo的位置,将其加入环境变量中 例如我的位置是:C:\Users\32649\AppData\Roaming\npm\node_modules
总之,安装过程中很容易失败,而且失败原因是无法得知的。因为就算出错了,你也很少有机会可以搜索得到相关资料。...这里的建议是到官网下载一个离线安装包(tinyos-cygwin-1.1.zip)。这是一个压缩文件,解压之后运行install.bat文件,就可以完成Cygwin的安装。 ...(3)安装graphviz-1.10.exe,TinyViz需要这个工具提供可视化绘图 (4)打开Cygwin shell,进入到工具安装包所在目录,运行命令: ...本人在Cygwin下安装TinyOS 1.x的时候,配置好环境后toscheck检查无错误无警告。...编译的时候需要这个东西,以便让TinyOS的make系统搜索相关的库文件。 (3)可能由Python.h头文件带来的错误,网上都可以搜得到。
1、安装JDK1.6或更高版本 官网下载JDK,安装时注意,最好不要安装到带有空格的路径名下,例如:Programe Files,否则在配置Hadoop的配置文件时会找不到JDK(按相关说法,配置文件中的路径加引号即可解决...32位或64的安装文件。 ...另外如果是Win8操作系统,启动Cygwin时,需要以管理员身份运行(右键图标,选择以管理员身份运行),否则会因为权限问题,提示“发生系统错误5”。...执行此命令后,在你的Cygwin\home\用户名 路径下面会生成.ssh文件夹,可以通过命令ls -a /home/用户名 查看,ssh -version命令查看版本。 ...把hadoop压缩包解压到/home/用户名 目录下,文件夹名称更改为hadoop,可以不修改,但后边在执行命令时稍显麻烦。
R默认内含了一些包(或库),比如MASS包,可以通过命令行R,然后输入library(MASS)查看是否已安装;官网上还有许多他人写好的包可供使用,较为方便。...安装 R的安装需要一些系统库及其头文件(如libicudata.so, liblzma.so, zlib.h, bzlib.h等),为避免系统上缺失某些库/头文件,亦或去手动一个个检查、安装,笔者采取一劳永逸的办法...安装时若缺包会有提示应该先装哪个包。笔者展示的安装顺序是经过测试、不会有前后依赖问题的。 3....zlib.h头文件,bzlib.h头文件和lzma.h头文件及其对应的库。...解决方法:例如对于zlib.h,可去官网或其他镜像 https://www.zlib.net/zlib-1.2.11.tar.gz 下载。安装过程是标准的.
做php开发经常需要用到gd库,但是也遇到几次部署环境默认没有安装gd的情况,遂在此做下总结,以备不时之需....通过yum,apt-get等包式管理安装方式安装的php直接运行对应命令即可,故不在此赘述。本文主要记录在linux环境下编译gd扩展及其所需依赖。...libpng和gd(因为我编译png时提示找不到zlib.h,所以加上了这个) export LDFLAGS="-L/user/local/zlib/lib" export CPPFLAGS="-I/user...如果一切顺利的话,我们就可以开始安装gd扩展了,php-gd的源码貌似在pecl上找不到,所以我直接在php的源码包里面找了一份,拷贝到临时目录,使用phpize生成configure文件 然后进行配置和编译...php后生成的一个配置工具,主要用于扩展的编译配置 其他的参数对应指向先前安装依赖的位置 没有出错的话,编译器会提示生成的gd.so已经拷贝到php的扩展目录,我们只需要在php.ini中加入一行 extension
不设置在安装ssh-host-config时也是需要输入的) 5、建议修改.sh文件时,使用vi命令修改。 ? ?...,则将d:/develop/cygwin/bin添加到系统变量PATH中(最好加在windows前面,这样的话,有些相同的命令的话,是先执行cygwin的命令,而不是windows命令,比如find)...现在到刚才的快捷方式上:右键–>属性–>更改图标–>浏览–>找到Cygwin.ico–>确定 5、命令 --help查看该命令的帮助 文件/目录权限设置命令:chmod 这是linux系统管理员最常用到的命令之一..., 它用于改变文件或目录的访问权限。...该命令有两种用法:用包含字母和操作符表达式的文字设定法 其语法格式为:chmod [who] [opt] [mode] 文件/目录名 其中who表示对象,是以下字母中的一个或组合:u:表示文件所有者 g
必须在cygwin下编译.原因就是lib/c_glib下的源码网络通讯部分调用的接口都是基于unix接口开发的,没有针对MSVC或MinGW编译器做适应性修改,所以代码中全部都是如下这样的include...: #include #include #include 而MSVC,MinGW编译器都没有这些头文件,编译时自然无法通过...安装依赖库 有了apt-cyg,安装依赖库和工具就方便多了,在cygwin命令行窗口执行下面的命令就可以完成所有依赖库及工具安装,如果安装过程中提示没有wget或lynx,请执行cygwin的setup-x86...(apt-cyg需要调用wget或lynx来下载文件) # 安装编译所需的工具的依赖库 # 注意这里的编译器是gcc-g++,不是mingw64-x86_64-gcc-g++也不是mingw64-x86.../configure的命令行有--enable-tests=no参数时,不编译test文件夹。 改好后,重新执行上面的configure的命令,再make 就正常了。
通过它,你就可以在不安装linux的情况下使用NDK来编译C、C++代码了。下面我们一步一步的安装cygwin吧。...3)Install from Local Directory:不下载安装文件,直接从本地某个含有安装文件的目录进行安装。...3、选择第一项,然后点击下一步: 4、选择要安装的目录,注意,最好不要放到有中文和空格的目录里,似乎会造成安装出问题,其它选项不用变,之后点下一步: 5、上一步是选择安装cygwin的目录,这个是选择你下载的安装包所在的目录...运行cygwin,在弹出的命令行窗口输入:cygcheck -c cygwin命令,会打印出当前cygwin的版本和运行状态,如果status是ok的话,则cygwin运行正常。 ...注意:我安装的时候我的home文件夹下面神马都没有,解决 的办法:首先打开环境变量,把里面的用户变量中的HOME变量删掉,在E:\cygwin\home文件夹下建立名为Administrator的文件夹
注意: 虽然安装Cygwin后也带了“sh.exe”,但是在Jenkins中设置为“C:\cygwin64\bin\sh.exe”时依然不能执行命令,所以设置为Git客户端自带的sh.exe。...但遗憾的是通过Cygwin并不能安装scp命令,而微软PowerShell团队提供的Win32-OpenSSH项目正好带了scp命令。....pub >> ~/.ssh/authorized_keys 完成上述设置之后,在主机L1上通过scp命令向主机L2传输文件时就可以不用每次都输入密码了,这大大简化了主机之间文件传输的流程,也是在Jenkins...经过一番搜索后知道:在Windows环境要实现类似于scp命令的功能,还可以通过一个叫做pscp的命令实现,并且pscp命令有一个-pw选项参数可以指定远程主机的登录密码,这样就可以实现不用手动输入密码的效果了...第一,在Windows环境中执行Unix/Linux命令可以通过安装工具集Cygwin或Gow来实现,当然,也有可能还需要安装OpenSSH。
cygwin时,64位版本安装失败,后来32位的反倒安装成功了。...依然没有找到error 很费解,于是,把命令窗口的日志复制到文本中,全文搜索error, 见证神奇的时刻来了!...顺便还学到了怎么验证当前版本的命令 一路cd到这个文件的目录下:..../lib/Native file libhadoop.so 就可以看到,果然,我机子上装的就是64位。...系统下,不认识呢,隐约记的前两天看到过一个文章说路径要这样来配置: Cygwin/d/tools/Cygwin/bin......开始换个方向: 1、学习下Linux系统,不需要太深入,先了解下基本的操作使用,这样对大部分命令就有个初步的认识了。
所以解决办法是: 1.安装cygwin,并安装以下包: gcc、gcc-g++、gcc-gfortran、make、libopenblas、liblapack-devel、libarpack-devel...2.将源码包parsec解压到cygwin中的home目录下. ? ? 3.打开cygwin,并解压 ? 4.进入源码下的src文件夹 ? 5.打开config/make.ices文件 ?...7.保存并退出该文件,并输入make命令则开始编译(-j2是使用两个进程同时编译) ? 8.编译完成后,找到parsec.ser这个文件,这是一个可执行文件 ?...这样的文件正常人能够看的懂吗?How do?我们要进行重新编码,对其可视化。可视化这部分涉及到python和matlab的使用,你既不会python也不会matlab那还玩毛线?回家洗洗睡吧!...2.运行程序导入parsec.out、wfn.dat文件 ? 3.如果没有出错的话,你应该会看到这幅图: ? 4.但实际过冷水大半个月看到的都是: ? Why?
在macOS上编译JDK是非常简单的,在开始编译前需要安装Xcode Command Line Tools(下文简称XCLT,如果是从App Store安装的Xcode则默认会携带XCLT): 如果未安装通过以下的命令进行安装...cygwin的终端,除了通过桌面快捷方式,还可以通过以下的DOS命令来打开cygwin终端: @echo off setlocal enableextensions set TERM= cd...\bash --login -i 其中的C:\cygwin64为第二步中指定的目录位置,这个目录下存放了Cygwin.bat的启动程序也可以通过它来打开cygwin终端 在cygwin环境下通过git(...或在Windows中克隆完成后复制到C:\cygwin64\home的用户目录中 如果使用的是国行的Windows系统则需要此步,否则在后期编译过程中会发生如下的错误: OpenJDK17:Target...编译时需要的JDK,值得注意的是这个JDK必须是Windows环境中的JDK,通过cygwin的/cygdrive/c可以定位到Windows环境中的C盘目录下(为什么需要boot-jdk会在后面几期中解释
2.1 FFmpeg Windows平台编译 FFmpeg在Windows平台中编译时使用的cygwin来进行编译,首先需要安装cygwin环境,然后才可以编译,如果不希望使用cygwin而使用Visual...Configure之后,可以通过make;make install安装源码编译的ffmpeg,在cygwin平台下make编译ffmpeg是一个比较漫长的过程。...当编译安装完成后,即可使用ffmpeg命令,但是这个编译出来的ffmpeg仅仅为最简易的ffmpeg,并没有支持h264、h265、加字幕等编码支持,如果需要支持更多模块和参数,还需要进行更加详细的定制...如果需要去掉这些错误,可以通过安装yasm汇编器来解决: ?...下载yasm汇编器后,configure过后,可以通过make编译,make install安装即可; 然后再回到ffmpeg源代码目录中进行之前的configure操作,就会消失。
然后又在 cygwin 下安装时同样的问题,这下 cygwin 源码编译也不行了,因为会调用很多 linux 特有的类库。 虽然最后解决了 import 的问题,但是又报了其它错。...只有换方法:从cygwin开源镜像上下载好 cygwin binary 版本的 python 2.7.3, 然后覆盖到相应的目录即可。...py文件放到 site_packages 目录下: 下面命令显示了 site-packages 目录: python -c "from distutils.sysconfig import get_python_lib...注意,也不创建子文件夹,再将自己的模块放到子文件夹解决问题,这会导致使用import 语句时错误。...安装Pip Pip的安装可以通过源代码包,easy_install或者脚本。
使用通配符匹配大量文件名时,常会遇到“Argument list too long”的错误信息。(这种情况下换用 find 或 xargs 通常可以解决。)...例如: >>> 2+3 5 文件及数据处理 在当前目录下通过文件名查找一个文件,使用类似于这样的命令:find . -iname '*something*'。...在所有路径下通过文件名查找文件,使用 locate something (但注意到 updatedb 可能没有对最近新建的文件建立索引,所以你可能无法定位到这些未被索引的文件)。...在 Winodws 下获取 Unix 工具 可以安装 Cygwin 允许你在 Microsoft Windows 中体验 Unix shell 的威力。这样的话,本文中介绍的大多数内容都将适用。...Cygwin 技巧 通过 Cygwin 的包管理器来安装额外的 Unix 程序。 使用 mintty 作为你的命令行窗口。 要访问 Windows 剪贴板,可以通过 /dev/clipboard。
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