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    【金猿案例展】某国家级研究所——组学大数据分析平台建设

    大数据时代下,科学大数据已经成为科技创新和社会经济发展的新动力。生物信息学经过近30年的发展,从最初的基因组数据的收集和存储,到利用数学建模和人工智能思想,挖掘数据背后的生物学意义、对样本数据进行合理分类、建立合理的二级和三级数据库,再到利用比较基因组学的方法,通过短读序列拼接、基因预测和功能注释,已有一定的能力用于处理庞大复杂的基因组数据。2019年,科技部、财政部对原有国家平台开展优化调整工作,通过部门推荐和专家咨询,经研究共形成20个国家科学数据中心,其中包括国家基因组科学数据中心、国家微生物科学数据中心、国家人口健康科学数据中心等。我国是生物数据生产大国,生命大数据是人口健康和国家安全的重要战略资源。然而我国生物数据面临因存储零散,缺乏系统监管而丢失和流失的问题,亟需建设我国自己的生命大数据保存和管理体系。

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    JCIM | 化学、生物和生物医学科学的信息学研究

    信息学正在跨学科发展,影响着化学、生物和生物医学的多个领域。除了成熟的生物信息学学科,其他以信息学为基础的跨学科领域也在不断发展,如化学信息学和生物医学信息学。其他相关的研究领域,如药物信息学、食品信息学、表观信息学、材料信息学和神经信息学等最近才出现,并作为独立的子学科继续发展。这些学科的目标和影响通常在文献中被单独回顾。因此,确定共同点和关键差异仍然具有挑战性。研究人员结合自然科学和生命科学中的三个主要信息学学科,包括生物信息学、化学信息学和生物医学信息学进行讨论,并对相关的子学科进行简要评论。重点讨论了生物信息学、化学信息学和生物医学信息学的定义、历史背景、实际影响、主要异同,并对生物信息学、化学信息学和生物医学信息学的传播和教学进行了评价。

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    如何成为顶级生物信息学家

    前几天去南京参加两年一度的全国大会CCBSB2014,今年是第六届,见到许多熟识的前辈和老朋友,也结识了不少新朋友。相比于两年前在哈尔滨开的第五届大会,参会人数又多了100多。连大会特邀报告算上,总共76位学者做口头报告,其中30位学者我之前并不认识,这个比例正好是40%。领域里的大会小会,无论何时、何地,总有约40~50%的学者我不认识,这个比例近年来恒定不变,咱生信领域发展速度之快,由此可见一斑。70多位学者的报告所涉及的研究方向,大概至少有60多个,两位或者多位学者从事一个小的研究方向的现象,非常少见。昨晚和有11年交情的好友一起吃饭,大家回忆十年前国内生信开大会的场景,想了半天庆华来一句:那会儿大家好像没啥可以做的,哪像现在这么多问题啊!所以咱生信领域现在真实的场景是:火打着,油门踩到底,档挂到顶,一望无际的荒原,使劲的狂奔,一往无前;有条件的开法拉利,没条件的开乐驰,实在没条件的蹬个三轮儿也行,反正地盘儿有的是,谁抢着算谁的。兄弟我对这一现象总结:圈地运动。讲这儿估计有人不高兴了:你们生信咋做的这么散呢?这个不是咱生信想做的散:问题实在太多,又不缺数据,自己感兴趣的问题都没解决,哪有时间管人家的东西啊?使劲儿的冲就得了。至于即将毕业,或者刚毕业的同行兄弟们,也别觉得没肉吃了,大家就算这么裸奔,也远没有涵盖生信所有的方向,并且一般一个小领域往少了说能容纳10位学者不算挤,那咱这领域的规模扩大10倍也照样容得下。所以咱在这儿说一句:欢迎加入圈地运动(要不改成“生信欢迎您”?)。

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