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酶促切割是否存在正则表达式?

酶促切割是一种生物学技术,用于将DNA或RNA分解成较小的片段。在这种技术中,酶是用于切割分子链的。正则表达式是一种用于描述字符串模式的工具,因此它不能直接应用于生物学技术。

酶促切割是一种常用的生物学技术,可以用于研究基因组、蛋白质和其他生物分子的结构和功能。它可以用于研究基因疾病、药物开发和其他生物学研究。

酶促切割的优势在于它可以快速、准确地切割DNA和RNA分子链,并且可以在不同的条件下进行操作。它可以用于研究基因组的结构和功能,以及药物开发和其他生物学研究。

酶促切割的应用场景包括基因组学、蛋白质组学、药物开发和其他生物学研究。

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作者试图更好地了解Reaxys数据集中的反应模板捕获了BKMS数据集中的反应部分,以及在逆合成搜索中包括反应是否有可能扩大可访问的化学空间。...为了确定 BKMS 的哪些反应包含“独特”化学性质,作者评估了Reaxys的任何合成反应模板是否可以在给定产物分子的情况下再现相同的反应物。...多模型搜索算法直接比较模板优先级模型的分数,以决定是否探索合成步骤或步骤。为了识别混合通路,该策略依赖于正确缩放的两个模型的分数(概率)。...示出的任何反应都不存在于模型的约束数据中,这意味着模型能够概括到未见产物和中间体。芳基溴化模板可回溯至属于EC类1.14.19.55、1.14.19.58和1.97.1的反应数据库中的8种反应。...然而,如果存在已知的期望结果,可以引入平衡参数来手动调整模型的相对分数。

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Nat. Rev. Chem. | 用DNA作为计算和数据存储的通用化学基质

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Nat. Rev. Chem. | 小分子与RNA的碰撞

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分子生物学研究软件 SnapGene 6.02下载,附安装激活教程功能讲解

独特功能二:多种限制性的预测和切割模拟限制性是一类可以切割DNA链的,它在DNA分子杂交和重组的实验中被广泛使用。...SnapGene提供了多种限制性的预测和切割模拟功能,可以模拟切后DNA的片段大小、序列等信息。...例如,在一项实验中,研究人员需要将两个DNA片段进行连接,他们使用了SnapGene软件进行切模拟,并找到了最佳的限制性切割序列。...通过软件的模拟,他们成功地将两个DNA片段粘接在一起,并进一步验证了该连接是否有效。独特功能三:PCR模拟和引物设计聚合链式反应(PCR)是一种常用的生物实验技术,可以扩增DNA序列。...经过实验验证,他们发现该设计的导向RNA成功地切割了目标DNA序列,并实现了更加高效的基因编辑,从而为生物学领域的基因编辑技术研究提供了新的思路和方法。

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基因日签【20210325】Alu家族具有许多广泛分布的散在重复序列成员

关键概念 哺乳动物基因组中重复DNA的绝大部分是由组织形式上像转座子、来源于RNA聚合Ⅲ转录物的单一家族的重复序列所构成。...在人类基因组中,存在大量的长约300bp的中度重复序列,它广泛分布在非重复DNA序列之间,至少一半退火的双链体DNA能被限制性内切核酸Alu Ⅰ切割切割位置在序列的170bp附近。...所有被切割的序列都是这一家族的成员,因其能被Alu Ⅰ切割而得名Alu家族。...在人类基因组中约存在100万个成员(相当于每3kbDNA就有一个),其单个成员广泛分布;在小鼠中,与Alu序列相关的序列称为B1家族(约有35万个);在中国仓鼠中,它被称为Alu样家族(Alu-equivalent...family);它也存在于其他哺乳动物中。

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最硬核回击!国际著名病毒进化学家preprint发文反驳新冠病毒“人工合成”阴谋论

其次,新冠病毒第2个明显的特征是在S蛋白的2个亚基S1/S2交界处Furin蛋白切割位点(RRAR),除了两个碱性精氨酸和一个切割位点的丙氨酸之外,还插入了一个脯氨酸。...脯氨酸插入产生的转角结构导致Furin蛋白切割位点侧翼的S673、T678、S686发生添加O末端糖基化,而以前的β冠状病毒均无Furin蛋白切割位点。...但新冠病毒在体外培养体系中连续传代极难同时获得Furin蛋白切割位点和O末端糖基化。 第三个论据是病毒的宿主。新冠病毒与蝙蝠冠状病毒RaTG13非常相似,所以蝙蝠是新冠病毒的宿主可能性很大。...马来穿山甲的冠状病毒在6个关键RBD残基上都与新冠病毒相同,但不同的是,马来穿山甲的冠状病毒不具有Furin蛋白切割位点,这意味着新冠病毒可能存在其他中间宿主,病毒在这些宿主身上形成了Furin蛋白切割位点...该论文将新冠病毒与引发“非典”疫情的类似冠状病毒的基因组进行了对比,分析了二者存在差异的地方,然而发现了与艾滋病毒的关联。

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【Cell】R-Loop 从生理到病理(三)

因此,尚待确定的是NER内切是否协调DNA切割和DNA填充。...总的来说,这些数据加强了这样的观点,即在积极转录的区域,DNA切割有利于R环的形成。 一个正在浮现的问题是在DNA断裂处的DNA-RNA杂交体是否可能对其修复产生影响。...这是否被R环的存在所增强尚未确定。然而,最近已经表明转录抑制剂DRB在IR暴露后减少了RPA和Rad51焦点。...在DSB后形成的DNA-RNA杂交体是否能够促进DNA末端切割作为HR修复的第一步,尚不清楚。然而,DNA-RNA杂交体可能是需要被移除以允许修复的结构。...尽管研究提出CtIP/Sae2在切割R环上的内切核酸角色,不管它们在DSB末端切割上的已知功能(Makharashvili et al., 2018),看看CtIP在DSBs上的杂交体上的作用是否更突出将是有趣的

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基因编辑技术 CRISPRCas9,“魔剪”一文通~ | MedChemExpress

DNA 切割域的 FokI 核酸必须二聚化以切割 DNA。该技术已被用于修饰各种生物体内的内源性基因。...CRISPR/Cas 系统由一小段 RNA 和一种高效的 DNA 切割 (Cas 核酸) 组成的系统,该技术不像 TALENs 技术和 ZFNs 技术是依赖于蛋白与靶基因之间的识别,而是由 sgRNA...■ 第一步:捕获外源 DNA Cas9 蛋白包含两个核酸结构域:切割非互补 DNA 链的 RuvC 结构域和切割互补 DNA 链的 HNH 结构域 (如图 2a)。...CRISPR/Cas9 的小分子调控策略 CRISPR技术在疾病治疗、基因功能调控、药物研发等多个方面具有广阔的应用前景,但也存在脱靶、基因毒性等副作用问题。...案例 1:当内含肽插入 Cas9 蛋白的不同位点,Cas9 核酸失活;添加 4-HT (4-hydroxytamoxifen),通过构象变化和自切割反应去除内含肽,可重新激活 Cas9 蛋白(图 3a

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一种新的细胞程序性死亡——细胞焦亡

与细胞凋亡相比,细胞焦亡发生的更快,并伴有大量炎因子释放。那么,细胞焦亡发生的机制如何?研究细胞焦亡又会对生命科学领域带来怎样的意义呢?...研究发现GSDMD是所有炎性Caspases(包括:Caspase 1/4/5/11)的一个共有底物蛋白,这些炎性Caspases特异性的切割GSDMD两个结构域中间的连接区域,而凋亡相关的Caspases...在细胞中表达基因工程改造的GSDMD,可以使细胞在其它蛋白刺激下发生焦亡,甚至可以将细胞凋亡转化为焦亡。...这些结果证明GSDMD的N端结构域具有诱发细胞焦亡的活性,GSDMD在被炎性Caspases切割后释放出来的N端结构域就足以引发细胞焦亡,GSDMD蛋白的切割对于炎性Caspases激活引发的细胞焦亡是必要且充分条件...研究证实,炎性Caspases经激活后切割GSDMD释放出活性片段,即GSDMD-NT,GSDMD-NT在胞膜聚集形成电子显微镜可见的膜穿孔,从而快速杀死细胞,引发炎症性坏死(即细胞焦亡)并释放大量炎性因子

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基因日签【20210719】rRNA的产生需要切割反应与短序列RNA的参与(内含第21章RNA的剪接和加工小结)

2021 07/19基因日签 rRNA的产生需要切割反应与短序列RNA的参与 .壹. 关键概念 RNA聚合Ⅰ在18位碱基终止子序列处终止转录。 .贰....关键概念 亚基大小不同的rRNA都通过从共同的前RNA切割下来而释放,而5S rRNA是分开转录的。 .叁. 关键概念 C/D型的snoRNA是核糖C-2甲基化修饰所必需的。...剪接事件通常是分子内反应,但是在锥虫和线虫中也会存在反式(分子间)剪接反应。它包括了小SL RNA和前mRNA之间的反应。 RNA聚合Ⅱ的终止能力与mRNA的3’端形成紧密联系。...tRNA剪接涉及独立的两个内切核酸和连接反应。...rRNA加工发生在核仁中,U3 snRNA启动了一系列的内切核酸与外切核酸的活动,以此来切割与修整前rRNA中的多余部分,用于产生单一的核糖体RNA。

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靶向新冠状病毒(COVID-19)的药物靶点

新型冠状病毒易感器官分布图 病毒蛋白质根据其是否存在于毒粒中分为结构蛋白(strcture protein)和非结构蛋白(nonstructure protein)两类:前者系指构成一个形态成熟的有感染性病毒颗粒所必需的蛋白质...,包括壳体蛋白、包膜蛋白和存在于毒粒中的等;后者系指由病毒基因组编码的,在病毒复制过程中产生并具有一定功能,但不结合于毒粒中的蛋白质。...负责切割病毒基因组翻译的蛋白前体,得到多个非结构蛋白(nonstructural proteins, nsps),由这些非结构蛋白组装形成病毒的复制-转录复合体(replicase-transcriptase...3 木瓜样蛋白(Papain-like protease) PLpro蛋白参与SARS冠状病毒1a(1ab)复制多聚蛋白N端部分的切割加工,是SARS冠状病毒复制复合体(RC)形成的重要调节蛋白分子...RNA解旋酶是一类解开氢键的,而不是一种,由水解ATP供给能量来解开RNA的。它们常常依赖于单链的存在,并能识别复制单链结构。

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