R语言作为一门统计计算和数据可视化为核心特色的工具性语言,其在可视化领域或者说数据呈现方面有着非常成熟和系统的解决方案。
Rmarkdown扩展了markdown的语法,所以markdown能写的,Rmarkdown能写,后者还提供了一些新的特性,特别是图表,很nice。
R的bookdown扩展包是继knitr和rmarkdown扩展包之后, markdown格式的另一种扩展, 使得Rmd格式可以支持公式、定理、图表自动编号和引用、链接, 文献引用和链接等适用于编写书籍的功能。
在 YAML 文件中用 number_sections: TRUE 参数设置自动编号:
最新的 Pycharm 大量更新了对 R 的功能支持,在 IntelliJ 的大名加持下,拥有自动补全代码(最新加入了机器学习的新特性),自动格式化代码,版本控制,以及大量的插件支持。
你是不是特别想创建一个自己的私人博客?以及为什么要使用 blogdown 搭建博客?难度是不是很大,和其他搭建博客而言有什么优点?
资源背后的机构和开发者,都可以看看,他们的网站,个人Twitter之类的,寻宝哦。
目前对于两者的介绍网上一大堆,而且本身语法简单,上手很快,这里不会过多介绍。**本文的核心在于让读者了解这些工具以及根据需要去学习和利用它们。**这里主要为初学者提供比较有参考价值的资料:
点击下方公众号,回复资料分享,收获惊喜 简介 最近电脑电池坏了,拿到店里维修了,自己也没有备用机。要不是有 ddl,小编就会以此为借口放个小长假 ?。玩笑可以开,但是活还是要干的。 所以就打算用图书馆
本文主要是基于:R沟通|使用 Blogdown 构建个人博客写的。所以一定要先把前面这一篇做好,项目创建好,网站部署好后,再做接下来的创建 rmd 文件,保存,github 提交,之后过几分钟网站就会自动同步你的最新博客啦!
Markdown大家都比较熟悉了,特别是在写程序文档和写数学公式时,拥有着无与伦比的便利性。同时在前面的一篇博客中我们介绍了使用RMarkdown去写Latex Beamer演示文档的方法,RMarkdown是由谢益辉等大神对Markdown、Latex和R语言等常用高级编程语言的结合,使得我们可以同时用这几种语言去构造一个Beamer风格的演示文档。本文主要介绍一些比较偏门的、但是经常可能用到的RMarkdown进阶操作。
上一期已经对使用 latex 模板构建 cv 做了较为详细的说明:R沟通|使用latex模板构建个人履历。但是存在一个问题:Latex 最后输出的是 pdf 版本,如果你想把他部署到自己的个人网站上,可能就比较费劲了(害,是我不会)。所以请教了李康国学弟之后,我又尝试了下使用 Rmarkdown 构建 cv 并将其部署到 gitee中,这样所有人都可以通过网址访问我的 cv 了。
rticles包提供了适用于各类场景的rmd模板,安装以后便可以选择支持中文的模板,在rstudio菜单栏中依次选择file->new file->R Markdown,然后选择下图所示的模板。
我在简书和公众号上已经分享了很多之前学习的数据分析笔记和文章,覆盖了各方面的内容,数据分析方面以后不会再个人分享特别基础的东西了。接下来我会让师弟师妹们定期分享自己的学习过程。
想必熟悉小洁老师的学员们都有看过小洁老师发的如何做好你的R语言笔记,这也是马拉松课程的课前准备工作的一项——学习如何记录笔记。
今天小编在做线性回归的时候,突然想 R 能不能把结果以表格的形式输出呢?这样就不需要自己复制粘贴画表格啦。小编搜了一下果然有相关的 R 包—— stargazer ,现将自己关于该包的一些学习笔记分享给大家。
R语言是主要在学术界用的编程语言,写作是其内涵之义,于是有了 RMarkdown。基于RMarkdown语法yihui进一步扩张了RMarkdown的应用,于是有了bookdown及其plus,以及blogdown。字面意思,前者是用来写书的后者是用来写博客的。每一个喜欢R语言不巧又同时喜欢写作的人,遇到这两个包都会有抑制不住的好奇心。余,概莫能外。
沟通文档系列第一期为:如何使用Rmarkdown制作Rbeamer。今天来介绍下另一种文档沟通形式:如何使用Rmarkdown制作私人定制版ppt!
简介 从公众号创建到如今快一年半了,坚持写了两年的推文(180多篇原创),从 0 粉丝到如今将近两万多粉丝,感谢各位读者分享和支持💪。 小编只是一个在读统计硕士,其实肚子里装多少水,我自己很清楚,以后大家叫我闪闪就好了🥲 别叫我老师了。但是既然走上这路了,就得坚持下去。坚持写作(输出),也逼自己花时间输入更加前沿,有用的知识。并结合自己的思考将其输出(简称:搬运工)。 再此,记录和分享一些自己写博文的软件和网站。 mdnice mdnice[1] :非常适合线上使用,当然最近也出了应用程序版本。以mark
相信大家学习生信的时候,都会或多或少使用 R 语言来处理生信问题。而几乎提到 R,就会用到 Rstudio 作为开发工具。
假设你已经安装了R[1](R Core Team 2020)和RStudio IDE[2]。
Rmarkdown 是 R 语言环境中提供的 markdown 编辑工具,运用 rmarkdown 撰写文章,既可以像一般的 markdown 编辑器一样编辑文本,也可以在 rmarkdown 中插入代码块,并将代码运行结果输出在 markdown 里。R Markdown 格式,简称为 Rmd 格式, 相应的源文件扩展名为.Rmd。输出格式可以是 HTML、docx、pdf、beamer 等。
Rmarkdown作为一种将R等编程语言和Markdown的简洁语法结合在一起的增强版Markdown语法,其在报告输出、数据分析、沟通交流中的易用性和便利性已得到了足够的体现。
Rmarkdown 是 R 语言环境中提供的 markdown 编辑工具,运用 rmarkdown 撰写文章,既可以像一般的 markdown 编辑器一样编辑文本,也可以在 rmarkdown 中插入代码块,并将代码运行结果输出在 markdown 里。
今年接了 5 本与贝叶斯近似计算包INLA相关的翻译书,将由高等教育出版社出版。在准备翻译的时候,我静下来思考了一下二个问题。一是互联网时代在兼顾图书质量的同时怎么充分考虑读者阅读体验?二是什么是当下最为成熟的图书写作工具?特别是与数据科学密切相关的统计类图书的写作与出版。书稿模板的选择成为首先要考虑的事。
关于RMarkdown使用时,小编日常会使用的一些有用技巧,当然我也是通过学习谢大大的Rmarkdown-cookbook[1]以及日常使用需求上网搜的解决方案,在此分享给大家。如果大家还有其他什么需求,可以在留言板留言。或者有其他实用技巧也欢迎分享!
参考:25 制作幻灯片 | R语言教程 (pku.edu.cn)[2]就已经介绍了很多格式了。R Markdown文件(.Rmd)文件支持多种输出, 如网页(html_document)、MS Word(word_document)、PDF(pdf_document, 需要LaTeX编译器支持)等, 还支持生成网页格式的幻灯片(slidy_presentation, ioslides_presentation), 以及LaTeX beamer格式的PDF幻灯片(beamer_presentation), 和Microsoft Office的PowerPoint幻灯片(powerpoint_presentation)格式。
对于Rmarkdown的学习,有很多老大佬都已经给出详细介绍了,我就不在这里班门弄斧了(具体学习途径可见文末)。Rmarkdown不仅可以用来写分析报告,也可以用来记笔记。当然我用它写日记、做学习笔记,真的很香!
在本指南中,我们想向您展示如何使用现在提供的一些奇妙,免费的工具和软件包编写美观,可重复的报告。这些工具将帮助您交流科学知识,并希望您再也不会复制和粘贴R输出。
但它的前提是你安装过独立的包,有基础知识,才有可能hold住这个批量安装包的代码,这两天就碰到学生使用上面的简化代码失败了。
bookdown是著名R包作者谢益辉开发的,支持采用Rmarkdown (R代码可以运行)或普通markdown编写文档,然后编译成HTML, WORD, PDF, Epub等格式。 bookdown是个素颜版的 LaTeX ,满足了99%的需求,而使用难度大概只有 LaTeX 的1%,性价比极高。
Bookdown 是著名 R 包作者谢益辉开发的,主要服务于数据科学家和统计学家,但它的灵活性和易用性也使得其他领域的作者能够利用它来撰写、编译和发布不同格式的文档。
前段时间一直有读者问我能不能出一些关于Rmarkdown的教程,当时爽快的答应了。
第一步:安装R语言及Rstudio 首先根据操作系统来安装R语言软件 最好是安装最新版 Download R for Windows from CRAN Download R for macOS from CRAN Download R for Linux from CRAN Note for macOS: If you do not already have X11 installed in Applications > X11, download and install it. 这个很容易,就跟下载QQ
上次赵小编给大家介绍了如何使用 Echarts 进行图形可视化,可见:如何快速画出美观的图形?。但是有些小伙伴问到:我应该怎么选择图表来展示我的数据呢?
参见:https://www.math.pku.edu.cn/teachers/lidf/docs/Rbook/html/_Rbook/rmarkdown.html[1]
我实际做的事情就是写了两个R的函数,可以通过调用的方式创建Rmarkdown文档,并利用knitr包的knit函数将其转换为markdown文档。
今天学习了一些关于 R 爬虫的知识,后续会陆续写一些笔记,当然对于爬虫有更好的一些工具来进行爬取数据,作为入门小白,我自己先从 R 语言尝试开始吧。
前言 研一讨论班的时候,得做学术ppt,得知得学习latex。整蛊了好久才把latex装好(texlive花了3个多G,期间各种踩坑)。如今了解到可以使用Rmarkdown构建beamer主题的sli
Rmarkdowm作为可复用报告的优秀工具,除了提供文档编辑、图表输出外,还有许多主题格式供使用者选择。除了默认的主题外,还可以通过加载rticles、prettydoc、rmdformats、tufte等包获取更多主题格式。下面我们看看几类扩展包里的主题样式。
该课程由 2 个部分组成。这将引导您完成正常 ATACseq 分析工作流程的每个步骤。它涵盖比对、QC、peak calling、基因组富集测试、基序富集和差异可及性测试。
寒假期间花了大量时间(100h+)学习和制作了Rmarkdown入门教程,昨晚终于录制和剪辑完毕。
仪表盘在业务风格的报告中特别常见。它们可以用来突出报告的概要和关键内容。仪表盘的布局通常是基于网格搭建的,各个组件排列在各种大小的“盒子”中。
在实际工作中,每个数据科学项目各不相同,但基本都遵循一定的通用流程。具体如下: 数据科学工作流程: 1.数据导入 2.数据整理 3.反复理解数据 数据可视化 数据转换 统计建模 4.作出推断(比如
在实际工作中,每个数据科学项目各不相同,但基本都遵循一定的通用流程。具体如下: 数据科学工作流程 数据导入 数据整理 反复理解数据 数据可视化 数据转换 统计建模 作出推断(比如预测) 沟通交流 自动化分析 程序开发 下面列出每个步骤最有用的一些R包: 数据导入 以下R包主要用于数据导入和保存数据 feather:一种快速,轻量级的文件格式。在R和python上都可使用 readr:实现表格数据的快速导入。中文介绍可参考这里 readxl:读取Microsoft Excel电子表
PivotalR:用于读取Pivitol(Greenplum)和HAWQ数据库中的数据
目前一直使用的是Oracle的JDK,1.8的不断迭代版,挺稳定的。鉴于现在越来越多的Coder都从OracleJDK迁移到了OpenJDK,故将自己本地开发环境和云服务器上的环境统一迁移为OpenJDK 14发行版。
This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see http://rmarkdown.rstudio.com.
具体细节可参考:https://bookdown.org/yihui/rmarkdown-cookbook/update-date.html
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