在这之前，提起数据可视化，我都是能用echarts尽量用echarts，特效很棒而且用起来简单，粘贴一个option改个data就能生成很酷炫的报表，但是真正走向数据可视化领域之后，还是会发现echarts有些不足，而且做大数据分析的企业全都依靠使用echarts的话，那么你们的系统在表现上就已经输了。 现在来看的话，大数据分析是互联网发展必然的产物，所以掌握数据可视化工具的前端工程师在未来会是最基本的要求，然而在那个时候你还仅仅会使用某chart，那么你自身的竞争力在哪。 最终实现效果：https://yzbaoo.github.io/cyto...
写在前面，这个教程真的有点长，是我早期翻译的，如果你完全不懂Cytoscape，那么你读这些，应该会做出非常漂亮的各种基于cytoscape及插件的图，因为这个教程真的很白。 原文地址
我们之前也有过一个专辑：《cytoscape十大插件》，详见：cytoscape十大插件之九 - 转录调控王者 iRegulon，而且在b站有配套视频操作演示，可以任意快进快退的学习它。
1.小程序向后台请求接口必须使用https，包括web-view里的网页，如果项目中有用到web socket，那么也必须使用wss协议。https证书一般会用第三方的。比如阿里云的。 2.在微信小程序管理后台，还需要配置合法域名。当然，在后台还没有部署https之前，我们也可以进行开发调试，只需要设置不校验合法域名，https证书等即可。步骤 : 工具--项目详情--不校验合法域名、web-view（业务域名）、TLS 版本以及 HTTPS 证书
富集分析是了解一个基因集功能倾向性的一个方式，在组学研究领域应用广泛。常见的有基于差异基因的Over-representation分析，也就是常说的GO、KEGG富集分析和Functional class scoring分析，如GSEA。这两种富集分析算法不同，但可以都支持同样的注释集，如GO、KEGG或其他类型的注释。基本原则只有一个：基因集的基因名字与注释集的基因名字能匹配。剩下的就是了解下原理去操作了。
知识图谱（关系网络）可以用简单的形状和线条显示复杂的系统，帮助我们理解数据之间的联系。我们今天将介绍15个很好用的免费工具，可以帮助我们绘制网络图。
Cytoscape 简介 Cytoscape是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。软件的核心部分提供了网络显示、布局、查询等方面的基本功能。软件的核心可以通过插件架构进行扩展，这样就能快速地开发出新的功能。 Cytoscape 源自系统生物学，用于将生物分子交互网络与高通量基因表达数据和其他的分子状态信息整合在一起。虽然Cytoscape也能适用于其他分子构件和相互作用，但其最强大的功能还是用于大规模蛋白质輭蛋白质相互作用、蛋白质-DNA和遗传交互作用的分析。各种物种（包括人类）的这方面的实验数据都在迅速
之前搜集免费生物AI插图时简单提到了通路数据库Reactome（https://reactome.org/）， 那些精美的生物插图只能算是该数据库附赠的小礼品，他的主要功能还是作为一个开源的通路数据库，为相关领域的研究者提供直观的可视化生物信息学工具。在一定程度上，可以替代收费的KEGG数据库，而且拓展出很多新的通路。（小广告，我们新一期的AI插图绘制课程马上要开班了，而且我们也对外提供插图绘制服务，欢迎联系train@ehbio.com获取更多信息。）
之前小编为大家推送了利用DAVID网站进行差异基因的GO和KEGG分析，而基因功能注释后就可以寻找蛋白表达之间的关系了，在生信分析中，常常会使用STRING网站+Cytoscape软件来制作蛋白互作网络图(PPI)。今天小编奉上一部PPI制作教程，让我们一起细细咀嚼吧！
在上一篇《用于查看配置的存储过程 | 全方位认识 sys 系统库》中，我们介绍了sys 系统库中用于查看performance_schema配置信息的快捷存储过程，本期给大家介绍sys 系统库中不太好归类的一些存储过程，这也是本系列最后一个篇幅介绍存储过程。
知识图谱项目是一个强视觉交互性的关系图可视化分析系统，很多模块都会涉及到对节点和关系的增删改查操作，常规的列表展示类数据通过表格展示，表单新增或编辑，而图谱类项目通常需要关系图（力导向图：又叫力学图、力导向布局图，是绘图的一种算法，关系图一般采用这种布局方式）去展示，节点和关系的新增编辑也需要前端去做一些复杂的交互设计。除此之外还有节点和关系的各种布局算法，大量数据展示的性能优化，节点动态展开时的局部布局渲染，画布的可扩展性，样式的自定义等等诸多技术难点。目前国内使用最多的两个已开源的前端可视化框架：阿里的AntV、百度的Echarts对于关系图的支持都比较弱，不能完全满足项目中的需求。
Cytoscape可以读取一下格式的文件，这些文件实际是提供了cytoscape和其他一些工具的接口。
如何快速查找指定基因的调控网络介绍了使用在线查询数据库 (http://evexdb.org/)对PubMed和PubMed Central中发表文章的摘要和全文为依据进行文本挖掘探寻基因直接可能的相互作用的工具。反响很好，但现在网站似乎出了点问题，获得的相互作用细节信息不能展开了(推测可能是使用的JS库无法加载)。有朋友留言推荐 Cytoscape literature search，一个存在历史挺久的Cytoscape插件，通过给定关键字搜索文献，并且基于搜索结果构建互作网络，帮助研究者快速搜索和提取基
在互联网探索到Seeing Theory开始，感受到了数据可视化对于知识展示的魅力，它能够把令人眼花缭乱的数据以舒服的交互以及视觉效果呈现给学习者。
SharedPreferences保存的数据主要是简单类型的key-value对。
小程序实际的运行环境是在托管平台（也称为托管环境）。托管平台可以是本机应用程序（类似于 Web 浏览器），也可以是（嵌入的引擎）操作系统。 小程序通常需要经过托管平台审核才能上线，而** Web 应用只需要拥有一个 Web 服务器（以及可选的域名）即可上线。 其中，小程序包含一个全局的 [[[#manifest]]] 文件和零个或多个页面清单文件**。*清单文件通常采用 JSON 格式。如下所示，这是一个典型的小程序目录结构：*
* 以 Text 的部分源码为例，说明 StatelessWidget 的构建过程。
最近的业余时间里，一直在研究图相关的领域，顺便构建出 feakin 图形引擎。在研究了 Mermaid、Cytoscape、Drawio/MxGraph/MaxGraph、Excalidraw 等图形库之后，大概写了两个 PoC（概念验证）： 数据的处理。即将文本转换为可渲染的数据模型。即结合语法解析、图算法来对数据进行处理。 图形的渲染。即基于 Konva.js 的 Canvas 方式来渲染图形。 在这个过程中，因为研究时间比较分散，一些概念相对比较模糊。所以，便想抽空重新梳理一下其中的思路，方便于后续继
集算表 （Table Sheet）是一个具备高性能渲染、数据绑定功能、公式计算能力的数据表格，通过全新构建的关系型数据管理器结合结构化公式，在高性能表格的基础上提供排序、筛选、样式、行列冻结、自动更新、单元格更新等功能。
Vue是一个MVVM（Model-View-ViewModel）模型的前端JS框架。Model本质上来说就是数据，View就是视图（即最终展现给客户的页面）。MV（从Model到View）是由数据驱动视图，而VM（从view到model）则是由视图通过事件更新数据。
连续两次求贤令：曾经我给你带来了十万用户，但现在祝你倒闭，以及 生信技能树知识整理实习生招募，让我走大运结识了几位优秀小伙伴！大家开始根据我的ngs组学视频进行一系列公共数据集分析实战，其中几个小伙伴让我非常惊喜，不需要怎么沟通和指导，就默默的完成了一个实战！
高中，读过几本 3D 图形编程相关的书。怎么说呢，自那以后，图形学相关的东西，都不在我的兴趣范围里了。直到最近，我重新燃起了一点兴趣： 架构治理工具 ArchGuard 依赖于「图即代码」，用于生成架构图，以更好的进行架构治理。 年初，开源的知识管理工具 Quake 中，需要支持「概念构建系统」这样一个理念。 需要管理多种不同的图形格式。 当然了，作为一个 Firefox 浏览器的忠实用户，Firefox 在 Feakin 里自然是支持最好的。开始之前，欢迎尝试在线 Demo：https://online.
之前我们介绍了一项整合多维组学通路分析的工作ActivePathways，能够在多个数据集中识别到显著富集的通路，包括那些在单个数据集中不明显的通路。今天来介绍一下这个R包的使用方法和使用输出文件进行Cytoscape绘制网络图。
前端表格控件SpreadJS 推出了新的功能集算表功能。集算表 （Table Sheet）是一个具备高性能渲染、数据绑定功能、公式计算能力的数据表格，通过全新构建的关系型数据管理器结合结构化公式，在高性能表格的基础上提供排序、筛选、样式、行列冻结、自动更新、单元格更新等功能。
从摘要可以看到这篇文章主要内容为：获取中药化学成分与成分作用靶点→疾病作用靶点→构建中药与疾病网络→GO和KEGG富集分析→解析中药作用机制。
每个子目录中保存着一个页面的相关文件 —— 通常是4种不同扩展名的文件， 分别是页面中的逻辑文件、页面结构文件、样式表文件、配置文件； 为了减少开发时的配置项，框架特别约定描述页面的这4个文件必须具备相同的路径和文件名；
在前面的3期中，我们给大家讲解了网络图的构造、 STRING数据库和Cytoscape软件的安装，链接如下：
Sping的容器可以分为两种类型 1. BeanFactory：（org.springframework.beans.factory.BeanFactory接口定义）是最简答的容器，提供了基本的DI支持。最常用的BeanFactory实现就是XmlBeanFactory类，它根据XML文件中的定义加载beans，该容器从XML文件读取配置元数据并用它去创建一个完全配置的系统或应用。 2. ApplicationContext应用上下文：（org.springframework.context.ApplicationContext）基于BeanFactory之上构建，并提供面向应用的服务。
我在最近的工作中开始使用 Vue 进行开发，但是我在上一家公司积累了三年以上 React 开发经验。虽然在两种不同的前端框架之间进行切换确实需要学习很多，但是二者之间在很多基础概念、设计思路上是相通的。其中之一就是组件设计，包括组件层次结构设计以及组件各自的职责划分。
原理是使用Graphviz(Graph Visualization Software)解析生成的dot脚本得到最终展示给我们的图信息。 dot是Graphviz用于画有向图和无向图语言，语法简单。 dot的抽象语法
在上一篇文章Widget，构建Flutter界面的基石中，我们深入理解了Widget是Flutter构建界面的基石，，也认识了Widget、Element、RenderObject是如何互相配合，实现图形渲染工作的。Flutter在底层做了大量的渲染优化工作，使得我们只需要通过组合、嵌套不同类型的Widget，就可以构建出任意功能、任意复杂度的界面。
本教程旨在告诉大家如何使用cytoscape根据Node信息表格制作带有barplot信息节点的网络图。以安装文件夹下的样例数据为例。
在使用Graphviz进行图形可视化时，有时候会遇到 graphviz.backend.ExecutableNotFound 错误。这个错误通常是由于找不到Graphviz的可执行文件导致的。本篇文章将介绍如何解决这个错误。
Cytoscape项目致力于为用户提供一个开源的网络显示和分析软件。软件的核心提供榴莲网络显示、布局、查询等方面的基本功能。软件的核心可以通过插件构架进行扩展，能快速地开发新的功能。
从零到壹：Cytoscape插件使用心得~MCODE篇 从零到壹：Cytoscape插件~wikipathway篇 生信干货~PPI蛋白网络~Cytoscape插件GeneMANIA
http://www.baderlab.org/Software/EnrichmentMap/UserManual#rnk
之前的教程提供了Cytoscape基础和视频、R igraph包的网络构建方法，那么在我们得到network图之后，还可以进行深一步分析，今天给大家带来基于Cytoscape软件下MCODE增强包的模块化分析。
在之前的文章中，我们提到利用网络聚类算法可以从复杂的蛋白质网络中挖掘蛋白复合体或者相应的功能模块，其中MCODE算法是最常用的挖掘蛋白复合体的算法。
4月12日，最新版的IDEA 2022.1正式发布，无论是从UI上，还是功能上，都有了很大的改进，完善；
首先得根据年月将本月的日历打印出来，使用util.formatDate("yyyy-MM-01", date)获取本月的1号的Data对象，然后计算他是本周的周几，使用Date.addDate()将日期转到1号所在的那周的周一，就是本月日历要打印的第一天，由于校历一般是周一作为一周的开始，所以需要稍微处理一下，不能直接减掉周次来将Date对象指向打印日历的第一天。 由于每月的日历最多是五个周，所以我们直接打印五个周的时间即可，使用Date.addDate()将日期一天一天累加，并将数据保存即可。 对于日期的样式，我是用了相对比较简单的办法，通过if判断日期来给予其特定的样式，我是将不同的class拼接为字符串赋值到unitObj上的，对于显示的颜色等，通过css的优先级控制，单元样式继承于容器，对于需要特定现实的样式提供一个detach字段保存。 跳转日期则直接获取时间来拼接月份然后调用日历月份处理方法即可。
随着越来越多的浏览器对CSS3支持的不断完善，设计师和开发者们有了更多的选择去实现一些炫酷特效。小师妹整理了最近项目中使用到的5个比较实用的CSS3动画演示。让我们一起看看CSS3是如何让页面秀起来的。
array_add() 如果给定的键不在数组中,会把给定的键值对加到数组中.否则则不加入 array_divide() 函数返回两个数组，一个包含原本数组的键，另一个包含原本数组的值。 array_dot() 函数把多维数组扁平化成一维数组，并用”.”符号表示深度 array_except() 从数组当中移除指定键值对 array_fetch() 函数返回包含被选择的嵌套元素的扁平化数组 array_first() 函数返回数组中第一个通过给定的测试为真的元素 array_last() 函数返回
angular 入坑记录的笔记第二篇，介绍组件中的相关概念，以及如何在 angular 中通过使用组件来完成系统功能的实现
真的很感谢随风的投稿，让我觉得不是一个人在战斗，也欢迎大家积极投稿。分享知识，分享快乐，分享正能量与幸福
先上一下效果图，这里的标题先用图片的url显示 本文写的效果是作用于Android的广告轮播控件，实现本地或网络图片播放和循环播放，线程控制避免引起过多线程不能及时回收的问题。 目前可以支持的功能有： 开启或关闭自动轮播功能(默认开启) 设置轮播延迟时间 自由开始或结束轮播 设置指示器或标题的位置 图片点击监听 多种banner样式
1、 新建一 word 文档，将 Windows 剪贴板上的内容粘贴到该 Word 文档中。
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