你现在能构建一个实用的shiny app，但是如何分享给别人呢？此篇将展示几个分享app的方法
在R for data science这本书中，作者提出数据分析的一个流程，在数据转换、可视化以及建模之后，来到数据分析的新阶段：与别人分享我们的数据。之前我们分享了许多单细胞数据分析的教程cellranger拆库定量、seurat质控分析，monocle轨迹推断，R语言给单细胞数据分析带来更多可能。那么，在数据分析进入下游之后，如何给自己的研究增加更多可交付的内容呢？Shiny会是一个不错的选择。
R语言的确提供了很全面的统计分析的软件包，比如CRAN，Bioconductor，Neuroconductor，以及ROpenSci；并且提供了优秀的包管理功能。
在实际工作中，每个数据科学项目各不相同，但基本都遵循一定的通用流程。具体如下： 数据科学工作流程： 1.数据导入 2.数据整理 3.反复理解数据 数据可视化 数据转换 统计建模 4.作出推断（比如
在实际工作中，每个数据科学项目各不相同，但基本都遵循一定的通用流程。具体如下： 数据科学工作流程 数据导入 数据整理 反复理解数据 数据可视化 数据转换 统计建模 作出推断（比如预测） 沟通交流 自动化分析 程序开发 下面列出每个步骤最有用的一些R包： 数据导入 以下R包主要用于数据导入和保存数据 feather：一种快速，轻量级的文件格式。在R和python上都可使用 readr：实现表格数据的快速导入。中文介绍可参考这里 readxl：读取Microsoft Excel电子表
PivotalR：用于读取Pivitol（Greenplum）和HAWQ数据库中的数据
Inputs 是与用户交互的组件，用户获取用户输入。Outputs 是 Shiny 通过响应用户输入而在指定区域展示的输出，一般为图表。每个输入组件都有唯一标识符，需要展示的标签名作为参数，其他一些参数则应不同组件提供的不同功能而不同。每个输出组件也有它的唯一标识符。当在 UI 插入一个输出组件后，会自动分配一块空间用于展示，但展示的生成和逻辑都在服务端完成。
今天为大家分享一篇2019年12月发表在Lung Cancer（中科院分区二区， IF=4.6）上的基于SEER数据库的nomogram文章。文中利用自己医院的数据进行外部验证，套路简单易模仿，逻辑清晰，当然也有自己的一些特点，最后根据预测结果建立了一个在线的nomogram分析（动态nomogram），便于临床应用，接下来小编详细讲解一下。
https://bioquest.shinyapps.io/cesa/ 可以访问了
在开始教程前，我们先来了解一个由加拿大 IVADO（Institute for Data Valorization）资助的项目：COVID-19 Data Hub（新型冠状病毒肺炎数据中心），它是一个致力于开发一个统一的数据集，有助于更好地理解新型冠状病毒肺炎数据。
根据我们的整理，差异分析是基础，生存分析和相关性分析是表型，免疫浸润分析是对表型的阐释，兼有表型和机制两种作用，但并不是真正意义上的机制探究。通常意义上的机制一般涉及信号通路，是一系列分子的级联反应。
生存分析是非常常见的表型分析。与生存分析相比，相关性分析是另外一个常见的表型分析。相关性包括表达与病理分期、治疗手段、年龄、种族、吸烟、突变、性别、共表达等因素的相关情况，通常用相关系数R表示，其差异也是用p值判断。
资源背后的机构和开发者，都可以看看，他们的网站，个人Twitter之类的，寻宝哦。
我检查了很多不同的工具，但没有一个能满足要求。许多人没有 DFD 和攻击树的元素，Microsoft 威胁建模工具只能在 Windows 上运行，Threat Modeler是基于 Web 的，Threat Dragon使用起来很尴尬，而Dia又旧又笨重而且有问题。
视觉内容的重要性 随着移动互联网的高速发展，人们往往被各类各样的信息与数量庞大的内容所淹没。因此，人们的注意力也变得极难捕捉起来，但是可以确认的是，视觉内容广告比书面内容广告更重要。为什么呢?因为它可
我时常在想，软件开发人员在某些方面和喜鹊——一种臭名昭著地喜欢偷发亮的物品来装饰它们巢穴的鸟类非常类似。像喜鹊，从定义上说明软件开发人员是一种异常聪明，又有好奇心的动物。但是，我们非常非常容易因为闪亮的新玩具而分心。
本文旨在探讨人工智能（Artificial Intelligence，AI）和机器学习（Machine Learning，ML）在治疗药物监测（Therapeutic Drug Monitoring，TDM）和模型引导的精准用药（Model-Informed Precision Dosing，MIPD）中的应用。
翻译自 Bare Metal Is Reliable, But Doesn’t Have to Be Boring 。
大家好，我叫圆满，大家都叫我小满。中间件的世界很精彩，我接受召唤，去探寻在中间件世界中的大放异彩的王者秘境-Netty，netty的线程模型采用了Reactor模式，今天我们就开篇谈一谈网络IO编程的一些小事，还有Reactor模式的解读。
在差异分析的前提下，表型分析成为重点内容，也是可以玩出花样的地方。生存分析是非常常见的表型分析。与生存分析相比，相关性分析是另外一个常见的表型分析。相关性包括表达与病理分期、治疗手段、年龄、种族、吸烟、突变、性别、共表达等因素的相关情况，通常用相关系数R表示，其差异也是用p值判断。严谨的生信论文还对分析结果做出ROC曲线，以提高数据的可信度和说服力。
新年伊始，有些人慢慢回到工作岗位，而另一些人决定继续在家编码。 无论是在您舒适的家中开发 – 还是在随便一家咖啡馆 – 它都没有阻止Github社区发布很棒的开源项目和更新。接下来让我们来看看一月份发布的GitHub精选顶级项目
翻译自 Analyst Report: What CTOs Must Know about Kubernetes and Containers 。查看原文可以看到更多的链接。
今天小编为大家分享的关于磁盘阵列恢复的案例，本次故障的设备是HP LH6000，其中一块硬盘红灯闪亮，机器还在正常运行，但没有多久，系统就不能正常运行，这时才发现另一块硬盘的红灯也在闪亮。
差异分析，无论是Oncomine，GEPIA，还是UALCAN、HPA数据库，都不需要R语言编写代码，容易上手，基本上一个星期甚至更短的时间就可以搞定，属于菜鸟级别生信操作。并没有想象中那么难。fold change＞2（起码1.5），p<0.05是差异分析的基本标准。但是表达的差异≠表型的差异，而这两者关系又密不可分。
云2.0成为主流 对于今天云中出现的所有令人难以置信的创新，我们所做的绝大多数东西仍然是基本的计算和存储。是的，在创建第一类虚拟机管理程序后逾16年，超过85%的虚拟化实际上只是更好的虚拟化——仍然全年侯地运行在别人的数据中心。 好消息是我们只是遵循所有颠覆性创新的重复模式。在面临颠覆时，消费者最初都试图像使用以前的技术那样使用它。还记得数码摄影的引进吧，当我们用数码相机来滥用这种技术时，其形式和功能看起来像胶片相机一样可疑。现在无论我们做什么都少不了数码相机，从我们的智能手机到笔记本电脑到眼镜，甚至到家庭
kafka，奥利奥，舔舔，扭扭，泡泡，真香。作为一个技术舔狗，怎么可能不去努力舔他呢？去深入浅出，去上下求索。
本文从网关角度讨论了从单体迁移到微服务的三种方式，主要方向是确保新老系统平滑过渡，这些模式和最佳实践值得一读： 在我的咨询工作中，我遇到了很多工程团队，他们正在从单体应用迁移到基于微服务的应用程序，虽然我明白迁移模式几乎成了陈词滥调，但是迁移的细节方面往往都会被遗忘。我现在热衷于讨论其中一个主题 - 边缘网关或API网关的角色。 迁移到微服务 一般情况下，在迁移开始时，下面这些明显的主题会得到了很多关注： 1. 通过领域驱动设计进行领域域建模，引入“ 有界的上下文 ”； 2. 创建了持续交付管道； 3.
关键的要点 Elixir已进入趋势报告的创新者采用阶段。它是运行在Erlang虚拟机上的一种函数式、并发的通用编程语言。 我们看到人们对基础设施或特定于云的语言、dsl和sdk(如Ballerina和Pulumi)的兴趣和创新有所增加。 我们相信Rust已经从革新者阶段过渡到早期采用者阶段，这主要是由于它在基础设施和网络数据平面空间(例如，Habitat和Linkerd 2.0)中的应用。 Python继续受到人们的欢迎，这主要归功于它在数据科学和教学中的作用。 由于iOS作为移动应用程序运行时的流行，iO
换句话说，交换metadata需要在点对点传输音频、视频或数据之前。这个过程称之为信令。
前言: FlutterUnit全家福 感谢大家关注FlutterUnit的发展~ , github地址: Star一下 平台类型 下载地址 项目分支地址 相关文章 Android版 toly1994.com/file/Flutte… flutter_unit 《FlutterUnit食用指南》 iOS版 暂未提供，可自己下载项目运行 flutter_unit 《FlutterUnit 食用指南》 MacOS版 toly1994.com/file/flutte… flutter_unit_mac 《m
大数据文摘作品，转载具体要求见文末 编译团队|Aileen 钱天培 JenniferZhu 作者|Julia Silge 前言 Stack Overflow的2017年程序员问卷调查[1]已在上周启动，我们（Stack Overflow的数据组）十分期待通过分析这次的调查结果来更好地了解我们的程序员群体。（译者注：Stack Overflow是一个IT技术问答网站，用户可在上面免费浏览、提交和回答问题。）我一直关注从事科技相关领域的女性群体，所以为了进一步地了解女程序员群体的现状，最近我特地去研究了去年（
云领域也发生了相同的事情，真正的颠覆性创新(我称之为云2.0)终于成为主流。云2.0关乎平台服务、无服务器和只有在需要时才运行异构云服务的可组合的应用程序(composable application)。这事关我们与存在30年之久的各种主从式架构(client-server model)所做的了断，此架构将永久服务器和操作系统置于所有应用程序的基础之上。 正当12月，是科技界的“预言季”。专家的预言总让人喜闻乐见，看这些预言能否挺过明年就更有意思了。 一年光景对云计算来说可谓天长日久(回想一下2017年的
Spring框架是一个开放源代码的J2EE应用程序框架，由Rod Johnson发起，是针对bean的生命周期进行管理的轻量级容器（lightweight container）。
Arthas 是Alibaba开源的Java诊断工具，深受开发者喜爱。当你遇到以下类似问题而束手无策时，Arthas可以帮助你解决：
容器改变了我们看待技术基础设施的方式。这是我们运行应用程序方式的一次巨大飞跃。容器编排和云服务一起为我们提供了一种近乎无限规模的无缝扩展能力。
RNA测序相信大家已经接触到不少了，它的样品通常来自研究某一组织细胞群。这些细胞被认为是同质的，也就是说每一个细胞内的表达水平被认为是相似的。但事实上细胞之间的异质性是很普遍的，RNA测序最终将表达量值算作所有细胞表达量的平均值，其实是掩盖了细胞间差异的信号。而单细胞RNA测序（scRNAseq）就可以去发现细胞亚群中不同基因型和表型，或者不同的功能细胞之间的异质性。
Journal: Frontiers in Ecology and the Environment (IF: 8.039)
"LangChain 系列" 是一系列全面的文章和教程，探索了 LangChain 库的各种功能和特性。LangChain 是由 SoosWeb3 开发的 Python 库，为自然语言处理（NLP）任务提供了一系列强大的工具和功能。
我知道微服务这个话题已经被讨论的太多太多，但我还是想以我在Web应用设计的经验出发，发表一些我的个人观点：
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Pages 功能一直以来呼声都非常之高，现在终于不负各位 OSCers 众望，码云 Pages 功能闪亮登场！ 码云 Pages 是一个免费的静态网页托管服务，您可以使用码云 Pages 托管博客、项目官网等静态网页。如果您使用过 Github Pages 那么您会很快上手使用码云的Pages服务。 码云Pages目前仅支持公有项目使用，私有项目会在下一版提供，敬请期待。 使用前须知 1、Pages 默认的根文件是 index.html 2、静态网页的样式可以自己写，也可以拿一些静态模版来修改，Page
在传统的RNA_seq测序中，每个样本取样后实际包含了成千上万个细胞，和单细胞测序的single cell相比，这样的样本称之为bulk samples。在bulk samples的这么多细胞中，可能包含来自多个细胞亚群。
作为一个生物学家(zha)，差异表达分析似乎是一项必备的技能。然鹅对于一个没有任何编程基础的生物学家，写代码是那么神秘莫测而又遥不可及，让人脑壳疼。那么今天小编就为大家介绍一款神器，不用写一行代码就可以轻松做差异表达分析，并且主流的差异表达算法DESeq,limma,edgeR任君挑选。
RStudio Server 使你能够在 Linux 服务器上运行你所熟悉和喜爱的 RStudio IDE，并通过 Web 浏览器进行访问，从而将 RStudio IDE 的强大功能和工作效率带到基于服务器的集中式环境中。
伦敦——Syntasso 的首席工程师 Abigail Bangser 在本周的 State of Open Con 上说，“应用程序开发人员希望快速行动，而运维工程师希望安全行动”，这就是 DevOps 模型的崛起之地。 DevOps 将发布所需的所有技能带入了一个团队，这减轻了开发人员的一些认知负担，他们不再需要——过多地——担心代码之上的安全性、支持和成本，因为他们团队中的运维工程师已经涵盖了。不可否认，DevOps 还提高了团队自主权和发布速度。
维护任何应用程序、框架或系统的一个重要部分是处理历史代码。无论一个系统的架构有多好，历史遗留问题总是会随着时间的推移而被建立起来——这可能是因为底层SDK的变化，因为功能集的扩展，或者仅仅是因为团队中没有人真正知道某个特定部分是如何工作的。
XIP：eXecute In Place，即芯片内执行，指应用程序可以直接在flash闪存内运行，不必再把代码读到系统RAM中。所谓片内执行并不是说程序在存储器内执行，CPU的基本功能是取指、译码、执行，存储器访问，写回。Nor Flash能在芯片内执行，指的是CPU能够直接从Nor flash中取指令，供后面的译码器和执行器来使用。
源代码是公开的，在：https://github.com/szenitha/Shiny-Seq 所以我想着把它安装在我们自己的服务器里面，方便国内的粉丝使用！ 所以大家给我了一个新的外号，宠粉狂魔！
云原生应用的崛起使得Kubernetes成为了不可或缺的一部分。本文将深入探讨如何将Spring Boot应用与Kubernetes相结合，以实现现代化、可伸缩、高可用的云部署。
Google 对 Flutter 的目标一直是提供一个可移植的工具包，以构建媲美本机速度运行的精美UI，无论您使用的是哪个平台。为了验证该功能，我们首先关注于Android和iOS移动平台，我们已经在Google Play上看到了8万多个快速，精美的Flutter应用程序。
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