而这其中“.today”、“.world”域名在这个复杂、多样且特殊的今天，让人们格外关注。 .today，专注为你 今天是崭新的一天，会有很多新鲜和期待。....today域名，可以用于与生活密切相关的行业。因为每一个访问.today网站的人都能知道，它会满足你当下的需求，提供今日所需的资讯、商品和服务。正是这些诉求，让众多大牌企业选择了.today域名。...IKEA.today告诉了我们宜家婴儿床是如何诞生的。...LANY是成立于2014年的美国独立摇滚乐队，乐队由主唱时尚模特Paul Klein、鼓手Jake Goss和吉他手Les Priest三人组成。2017年发布的同名专辑大获成功。...DNSPod推出.today和.world域名暑期闪促活动，仅限7月1日~7月10日！点击下方图片，即可直达活动现场：） ?
2022年9月13日，哈尔滨医科大学药物基因组信息学教研室陈秀杰教授、哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院解洪波副教授团队在期刊Drug Discovery Today上发表论文“Concepts and...传统和最先进分子指纹的8种类型和应用概述如图1所示。 图1 分子指纹的常见类型和应用概览。...化合物的片段(或子结构)和物理化学性质是分类和预测生物活性的重要基础。...因此，基于分子指纹的机器学习算法允许简单和通用的结构解释和有效的数据处理。...Drug Discovery Today, 2022: 103356. --------- End ---------
2021年6月，来自AI药物发现公司BenevolentAI的Joshua Meyers等人在Drug Discovery Today发表文章，对分子从头设计和生成模型方面的进展、挑战以及未来的机会进行了综述...基于文本的方法得益于自然语言处理（NLP）的大量活跃研究，而基于图形的方法则体现了对分子结构更自然的表述。...进一步的延展，是对反应进行编码，即目标分子被认为是反应物和反应条件的产物。在实践中，基于原子、基于片段和基于反应的方法都有明显的优势和劣势，许多方法模糊了这些分类之间的界限。...3D分子从头设计 考虑分子的三维环境可能是有益的，并且可以通过在优化目标中包括三维评分器来轻松实现，如形状相似性、分子对接、量子力学计算或自由能扰动（FEP）计算。...另一个有趣的方向是开发专门的生成模型，在生成过程中纳入额外的环境，如三维环境、三维蛋白结合点、或基因表达特征。
2021年9月30日，辉瑞Medicine Design部门的多位专家在Drug Discovery Today杂志发表文章，从多个角度分析了如何成功的设计小分子药物。 以下是全文主要内容。...在这种环境下，改善first-in-class药物特性的best-in-class设计策略为患者带来了价值。...具体来说，PK和PK/PD模型通过预测临床相关的终点（如来自化学结构和体外数据的有效浓度曲线和剂量），为推动药物设计提供了越来越强大的转化背景。...，这些位点可能提供活性位点所不能提供的"可药性"机会；在细胞、裂解液或蛋白质复合物中筛选化合物，比传统的生化试验更能反映其原始环境；以及筛选不同于大多数传统HTS筛选集的化合物，如能够发生共价反应的化合物...Drug Discov Today. 2021 Sep 30:S1359-6446(21)00424-4. doi: 10.1016/j.drudis.2021.09.017. --------- End
2022年9月24日，浙江大学药学院侯廷军教授团队在Drug Discovery Today上发表文章”Machine learning methods for pKa prediction of small...2 介绍 pKa是一个基本的物理化学参数，广泛应用于药物化学、有机合成、生物化学、环境科学和材料科学。...对于pKa预测，原子描述符(atomic descriptors)和根指纹(rooted fingerprints)被广泛用于表示电离中心周围的局部环境。...作者在文中回顾并总结了相关方法，分析了它们的优缺点以及当前的挑战。 3.2 根指纹 根指纹是基于二进制或计数的特征向量，用于描述指定根原子周围的局部结构环境。这里，根原子是指电离原子。...Machine learning methods for pKa prediction of small molecules: Advances and challenges, Drug Discovery Today
2021年9月1日，来自德国维滕/赫德克大学的Jonathan Koss等人在Drug Discovery Today合作发表综述，对使用社交媒体数据促进药物开发的基础方法和案例进行了介绍。...必须遵守法律限制，如数据隐私法和主机平台政策。 数据预处理 社交媒体内容主要包括非结构化文本，因此在预处理过程中使用自然语言处理(NLP) 技术对于降低噪音和构建数据以促进有见地的分析至关重要。...这种方法的基本假设是，社交媒体用户的行为受其遗传和环境影响。数字表型允许对传统的表型下结论，而传统表型也由基因和环境决定。此外，数字表型可以作为观察信息的来源，提供对不同健康状况个体的见解。...总体而言，SMM 有助于使制药公司的药物开发流程与患者需求保持一致，并有助于使这些开发流程能够响应不断变化的商业环境。...Bohnet-Joschko, Social media mining in drug development—Fundamentals and use cases, Drug Discovery Today
2022年11月11日，波兰Jagiellonian大学的Tomasz Danel等人在Drug Discovery Today上发表综述Docking-based generative approaches...它已经被用于开发QSAR模型，在虚拟筛选中用于改进基于对接的库的评分，预测配体-蛋白质结合活性，计算评估化合物的物理化学性质和吸收、分布、代谢、排泄和毒性（ADMET）特性等等。...在这种方法中，分子是从一个连续的潜在向量空间解码的，这是一个通过数据枚举和模型训练构建的分子表征。...对于一些模型来说，形状和药理约束是用Imrie等人提出的形状和颜色相似度得分等指标来检查的。...为了从生成的网格中获得有效的分子，使用结合束搜索和梯度下降的算法来返回一组原子类型和坐标，它们与给定的原子密度网格最匹配，通过各自的键分配结合成有效的分子。
介绍iOS8扩展与Today插件的专题见如下博客： iOS8中扩展与Today插件：http://my.oschina.net/u/2340880/blog/485533。 ...上述博客中只是简单的介绍扩展的应用场景与创建Today扩展插件的方法，在实际开发中，由于扩展是寄附于某个应用程序之上的，因此其通常需要和宿主APP进行数据交互。...Xcode扩展模板创建的ViewController会自动遵守NSWidgetProviding这个协议，这个协议中的方法和意义如下，开发者可以根据需求选择实现： //数据更新时调用的方法 系统会定期更新扩展...实际上，扩展和原宿主APP共享数据的应用场景十分广泛，例如电商类宿主APP中拉取到一批商品信息，Today扩展中也需要这些信息进行展示，如果数据不共享，同样的数据将在宿主APP内部和扩展都都请求一次，十分浪费...系统还提供了另一种方式来使宿主APP和Today扩展可以共享一块存储空间，这需要使用App Group技术来实现。
最近，曹东升教授课题组和曾湘祥课题组在Drug Discovery Today上发表了一篇综述“The Present State and Challenges of Active Learning in...，以实现开采和探索之间的平衡，比如选择一半探索性数据和一半探索性数据。...，这点已经被Graff 和Gusev等专家的研究所证明。...分子的生成和优化 分子的生成和优化过程主要包括两个关键步骤：一是使用生成模型生成可能具有所需属性的分子；二是使用实验或精确计算方法评估这些生成的分子，识别出真正具有理想特性的分子。...Drug Discovery Today (2024): 103985.
不过直到最近，作者仍然发现身边还有许多的小伙伴并不知道它的存在和便利。...，基本以平铺的icon和圆圈头像为主。...这一类Widget的设计语言不用太繁复，必须内容大于形式，用心吸引阅读和开启。 服务/订单跟踪类： 服务与订单跟踪是作者实际使用过并印象深刻的Widget，值得一说。...对于健康控和运动控来说，把健康数据展示在Today View上应该会有相当大的需求。 ?...至此，我们来总结一下Today Widget的设计奥义吧—— 1 不同属性和类型的Widget设计方式不同； 2 直接、快速、实用、信息清晰、简洁明了是基本要义； 3 内容有价值，用心运营，可以获得更多的关注与启动
2023年11月25日，印度国家药学教育与研究学院的Ayan Acharya等人在Drug Discovery Today发表文章，Molecular Medicinal Insights into Scaffold...得益于近年来有机合成方法学和计算机科学的快速发展，骨架跃迁类似物的合成和理性设计变得更加高效和可靠，这对于药物研发至关重要。...Levin课题组还开发了基于碳原子插入的杂环替换骨架跃迁策略，用于从吡唑和吲唑基化合物合成嘧啶和喹唑啉类似物（图5b）。...Today 2024, 29 (1), 103845. https://doi.org/10.1016/j.drudis.2023.103845. 2....Today 2012, 17 (7), 310–324. https://doi.org/10.1016/j.drudis.2011.10.024. --------- End ---------
2021年9月21日，Drug Discovery Today杂志在线发表文章，文章概述和讨论了配体-蛋白的分子对接中机器学习（尤其是深度学习）的应用。 以下是全文内容。...减少时间的另一种方法是使用集成对接方法，该方法集成实验数据来驱动模型构建。 最后，另一种加速计算的方法是使用高性能计算( HPC )环境。即使该途径独立于对接软件，也不应被撤销。...AMIDE基于AutoDock4及其默认SF，并包含一组允许在HPC环境上并行执行的脚本。 数据 数据对于分子对接方法的发展具有关键作用，尤其是基于ML的方法。...数据的数量和质量，以及模型如何表示它们对性能和准确性有重大影响。关于数据量，PDB数据库提供了一个广泛的分子复合物数据库。...Machine-learning methods for ligand-protein molecular docking.Drug Discov Today. 2021 Sep 21:S1359-6446
编·译作者 | 王建民 今天给大家介绍一篇由Abdul W.Basit等人2020年12月5日发表在Drug Discovery Today上的一篇综述文章” Advanced machine-learning...近年来，ML的一个子集--深度学习作为一种能够从大数据中实现高准确度的技术出现，同时处理结构化和非结构化数据。 先进机器学习技术 ML技术的一些批评包括需要大量的数据集和人为干预。...此外，还揭示了小分子和聚合物之间、无机化学和有机化学之间的潜在联系。...Rodriguez-Perez和Bajorath使用不同的策略来预测活性，开发了一种方法，该方法阐明了传统技术的预测过程以及集成和深度学习模型。他们的工作重点是消除ML模型的“黑匣子”性质。...Drug Discovery Today, 2020. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1359644620305213
2021年9月20日，来自法国制药公司施维雅(Servier)的Philippe Moingeon等人在Drug Discovery Today发表文章，对人工智能在药物设计和开发方面的四个主要应用进行了阐述...通过提供前所未有的关于病人特性和候选药物特性的知识水平，人工智能正在促进计算精准医学的出现，允许根据个体病人在生理学、疾病特征和环境风险方面的特殊性，来设计治疗或预防措施。...捕捉生物医学大数据的价值 新一代DNA、RNA和外显子组测序、多组学分子分析、高分辨率医学成像和电子捕获技术最近的快速发展，使我们有可能在一个前所未有的水平上，描述个人在生理学、病理生理学以及环境风险暴露方面的特性...(i) 可药性（即能够用小型合成药物或生物药物或任何其他治疗方式来调节靶点的功能的可能性）；(ii) 干扰该靶点时的潜在安全影响；(iii) 利用自然语言处理（NLP）技术从专利和文献中挖掘记录的创新性...研究人员通过调整通常应用于图像分析或语言翻译的方法，利用包含编码器和解码器网络的变异自动编码器，建立了第一个深度学习的新分子生成模型（图3b）。
2022年9月，安进药物产品技术部的Prashant Agarwal等人在Drug Discov Today发表文章Trends in small molecule drug properties: A...2011年至2020年期间Mw和cLogP的变化可能表明，由于遗传学、组合化学和HTS方面的关注和进步，新发现的分子的理化性质发生了系统性变化。 图3....从分子中去除HBD和HBA基团可能会对药效和靶点参与产生严重影响，因此，通过分子间和分子内的H键掩盖HBD和HBA可能是保持渗透性的一种可能策略。...与GPCR结合的分子应该是阳离子和柔性的。HBD是唯一保持不变的特性，这表明它是整个行业和长期以来被化学家保留的一个重要特性。Mw、RB、HBA和PSA的趋势在几十年间呈现出统一的增长。...Drug Discov Today. 2022 Sep 17;27(12):103366. doi: 10.1016/j.drudis.2022.103366.
2022年3月29日，赛诺菲的NikhilPillai等人在Drug Discov Today杂志发表文章，分析和反思了机器学习在临床前小分子药物发现中的多种应用，并简要介绍了机器学习任务中的分子表征方法...在这篇综述中，我们试图分析和反思这些不断增长的工作，特别是关注机器学习在临床前环境中，对减少选择最佳临床候选药物的不确定性的作用。...我们将重点讨论在临床前环境中可以利用机器学习的小分子药物发现的各个方面，特别是侧重于分子筛选和优化以及候选药物的选择。...这里，我们以阿司匹林为例，说明 (a) 基于描述符的方法，(b) 基于自然语言的方法和 (c) 基于图的方法。 图2....其他深度学习方法是强化学习方法，这是一类不同于监督和无监督学习的模型。这些模型的目的是在给定的环境中使用试错法使奖励函数最大化，如在给定的设计空间中生成具有最佳特性的分子。
2021年6月，来自中科院上海药物所的蒋华良、郑明月等人在Drug Discovery Today发表综述，从分子打分、分子生成和优化、合成规划3个方面，介绍了GNN在从头药物设计中的应用，并探讨了该领域的当前挑战和未来方向...该领域早期的研究致力于产生和评估新的分子，例如基于原子-伸长率，基于片段的组合，和基于分子对接的方法。...以 MEGNet为例，与所有节点和边相连的全局状态属性以及原子和边属性共同构成了初始图的表示。更新初始图表示，在前2步中，应用来自全局状态和另一部分的信息来更新键和原子的属性。...分子生成和优化 分子的生成和优化是自动药物从头设计的核心。生成模型的方法通常分为2类：非自回归方式（图4a）和自回归方式（图4b）。...Drug Discovery Today, 2021, 26(6): 1382-93. https://doi.org/10.1016/j.drudis.2021.02.011. -----------
编译 | 周珍冉 审稿 | 杨慧丹 今天给大家带来发表在期刊 Drug Discovery Today的一篇综述，“A decade of machine learning-based predictive...如34，采用了集成的迁移学习和多任务学习方法，模型通用性和准确性更高。...但是这些模型都只使用了有限的描述符集。42的作者定义了区分低、高和非常高血浆蛋白结合物的标准和经验规则。...对药物特征和Fup值之间的关系取得了很好的研究成果，但该研究在药物分子和描述符的大小方面受到限制，这导致可能实验结果不足以得出任何确定的结论。...Drug Discovery Today, 2021. https://doi.org/10.1016/j.drudis.2021.09.013.
2024年2月14日，Biorelate首席执行官Daniel Jamieson在Drug Discov Today发表文章Gen AI's real opportunity in drug development...葛兰素史克在这方面取得了良好的进展，它通过自己的GenAI大型语言模型（LLM）来完成专业任务，并通过对话界面让用户无需了解公司的数据生态系统就能探索复杂的研究问题。...然而，比潜在应用更重要的是人工智能能力的稳健性和可靠性。除非团队能够绝对信任所返回结果的有效性，并将其追溯到源头，否则始终需要进行进一步的艰苦评估和分析。...重要的是，既要立足于细节，又要有超越单一GenAI用例的愿景。 生命科学是否可以信赖生成式人工智能？ 生成式人工智能的潜在价值直接取决于它所利用和训练的数据源的质量和可信度。...它可以确保生成式人工智能系统利用最准确和最新的信息，同时为用户（以及必要时的监管机构）提供发现过程和知识关联的透明度。
2022年9月24日，青岛大学计算机科学技术学院李臻教授团队在Drug Discovery Today上发表文章“Deep learning methods for molecular representation...3.1 基于序列的方法 SMILES是描述分子最直接、最简单的方法。它类似于自然语言，其中每个原子都是句子中的一个词。...鉴于自然语言处理（natural language processing, NLP）领域的快速发展，NLP方法可以应用于SMILES序列的嵌入。...(a) 基于transformer(BERT)的双向编码表示。SMILES序列被用作输入，并随机mask一些原子。然后训练语言模型来预测这些被mask的字符，进行表示学习。...Shugang Zhang, Deep learning methods for molecular representation and property prediction, Drug Discovery Today
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