因此, 文件中具有给定名称的所有残基都具有相同的残基类型, 相同的结构. 每个特定残基在PDB文件中出现时都应具有相同的原子和连接性....PDB格式文件中的常见错误 如果一个PDB文件无法正常展示, 在其成百上千行数据中找到错误位置有时很困难. 这里给出PDB文件中一些最常见的错误....11.156 20.058 5.187 1.00 0.00 取决于所用的可视化程序, 可能无法正确显示残基的连接, 或者只有当标记残基才会给出缺少CB原子的错误....确定这种错误的一种方式是, 使用大写字母表示文件中的数据, 然后使用文本编辑器查找所有的小写字母l....氢原子约定 PDB文件中的氢原子约定如下: 出现在ATOM记录中的氢原子, 处于特定残基所有其他原子的后面.
但是对于蛋白受体来说，一般不会出错的，要出错的情况最可能的原因就是你蛋白受体含有特殊原子，而这些离子在AutoDockTools的离子参数配置文件中没有，所以会报错，这种怎么解决？？...我们接着讲蛋白设置为受体，准备输出为pdbqt文件时，认真的会发现，和前面有所不同，会提示一些原子有0个电荷，这种提示在前面是没有出现的。 ?...我们按照前面的操作流程，导入受体分子pdbqt文件时，还是会有类似的提示。 ? 我们继续用前面的配体往下对接。...将需要的参数复制到AD4_parameter.dat文件中。(将值对齐到正确的行) 然后你需要把修改过的bat文件放到autodock和autogrid exe文件所在的文件夹中。...将上面的原子参数复制到AD4_parameter.dat文件中相应的位置。
，我们把数据库、表的创建和样例数据都分别准备了sql文件，只需要导入数据库即可。...如果不是全新部署的Apollo配置中心，比如已经使用了一段时间，这时在Apollo配置中心已经创建了不少项目以及namespace等，那么在新环境中的ApolloConfigDB中需要从其它正常运行的环境中导入必要的项目数据...用程序员专用编辑器（如vim，notepad++，sublime等）打开config目录下的application-github.properties文件 填写正确的ApolloConfigDB数据库连接串信息...中config目录下的apollo-env.properties文件。...注：初次编译会从Maven中央仓库下载不少依赖，如果网络情况不佳时很容易出错，建议使用国内的Maven仓库源 .
Only syntax errors will be reported; 产生原因：当打开一个独立的java文件，不属于任何项目VS code的Java扩展将无法计算出正确的类路径，因而报告错误：“Classpath...#解决方法 修改用户空间 .settings.json 与 "java.errors.incompleteClasspath.severity": "info" #2.导入一个真正的项目(包含pom.xml...用PyCharm创建一个Python文件或者向工程添加一个.py文件时，为了更好的使所编写的代码在各操作环境更好的运行，我们往往需要在.py文件中添加头文件标注相关信息。...WeiyiGeek.rainglow (3)pycharm中连接数据库sqlite 菜单中的 view > tool windows 选项 > 下拉下一级菜单选中为 database > 选择具体的数据库...是idea的一个插件，可以直接对数据库中的表(指定字段)生成 entity,controller,service,dao,mapper 无需任何编码简单而强大;\ #启动时在dao层加上@mapper注解
web ide相生相融，与我的想法颇为迎合的是，elmlang的官方发布了一个ellie:el-li-e，elmlang live editor的意思，它模拟了atom这样的本地编辑器方案，该项目托管在...&& cp -r /tmp/elm_bin/* /tmp2/priv/bin \ && mkdir -p /tmp2/priv/elm_home \ # 安装elixir相关的所有扩展并生成项目的数据库文件...run.sh是分离postgresql所在容器和ellie所在容器的entrypoint，所有连接数据库初始化的工作都要在这里完成，因为它继承了ENV关于prod的预埋参数所以运行时不会出错，否则比如在非...docker image中的，而你无法预知要将这个docker image放哪个IP的主机上)，故要放在docker-compose.yml中ellie段下在实际开启ellie container时指定...只是它使用的aus联合文件系统我一直都不太喜欢，因为会带来污染问题和以上说到的编排dockerfile时的理解不便，突然想到联合文件系统会不会是客户端的安卓应用缓存清理的技术，其存储中，系统/应用双清的技术会不会也与它有关
Atom特性 Web本地应用程序 Atom是一款基于Web技术的桌面应用程序，和其他桌面应用程序一样，它也拥有自己的图标、本地菜单、对话框以及访问整个文件系统的权限。...Node.js集成 Node.js的支持使得访问文件系统、派生子进程、甚至直接从你的编辑器中启动服务都变的轻而易举。...模块化设计 由一个极简的核心和超过50个开源包构成，如果用户不喜欢某些软件包，他们可以自行替换。...功能全面、开箱即用 Atom在一个现代化的文本编辑器中预装了一些开发者可能期望/需要的功能，例如下面这些： 文件系统浏览器 用于快速打开文件的模糊查找器...在项目里快速的搜索和替换 多种光标选择 多个窗格 代码片段 代码折叠 干净个性化的UI 导入TextMate语法和主题
Atom 是一个免费开源、易于安装且跨平台（支持 Window、Mac和Linux）的文本编辑器。内置支持 Java 文件。相比 IDE 的厚重，它比较轻量级，是学习本书的理想工具。...Atom 包含了许多方便的编辑功能，相信你一定会爱上它！更多关于 Atom 使用的细节问题可以到它的网站上寻找。 还有很多其他的编辑器。有一种亚文化的群体，他们热衷于争论哪个更好用！...Environment (build 1.8.0_112-b15) Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.112-b15, mixed mode) 如果提示命令找不到或者无法被识别.../gradlew run 第一次安装时 Gradle 需要安装自身和其他的相关的包，请稍等片刻。安装完成后，后续的安装将会快很多。 注意： 第一次运行 gradlew 命令时必须连接互联网。...Gradle 基础任务 本书构建的大量 Gradle 任务都可以自动运行。Gradle 使用约定大于配置的方式，简单设置即可具备高可用性。本书中“一起去骑行”的某些任务不适用于此或无法执行成功。
所以，必然在加载插件时，Atom 有某种自动转换的操作。...之所以把这个逻辑单独剥离出来，主要是我很羡慕 Atom 插件编写时，各种语法随心使用的舒爽！要是自己项目，也能这么随意，岂不是爽歪歪！！！...目前支持的操作有: 将指定目录的 babeljs/coffeescript/typescript 转为 es5 兼容的js文件，并输出到另一个目录。 忽略某些文件，不对其进行转换操作。...在某些特定情况下，如果你想解析或转换其他类型的文件，只需要修改这个类，新增一个 COMPILER 即可。...注意 使用 bable 的js文件,开头应是以下几种的其中一种,否则无法被识别: /** @babel */ "use babel" 'use babel' /* @flow */ 参考文章 smart-transform
此外，MDI Jade还支持各种文件格式的导入和输出，包括CIF、PDB、SHELX等。MDI Jade的界面包括菜单栏、工具栏、数据区和图形区等。...你可以找一些晶体学数据来练习，尝试使用不同的工具和功能来处理它们。当你遇到困难时，可以通过搜索引擎或者论坛来寻求帮助。...在新文档中，点击菜单栏中的“Tools”选项，选择“Crystal Structure”打开晶体结构编辑器。...在晶体结构编辑器中，选择“Atom”工具，点击画布上的位置添加原子，可以通过“Element”选项选择对应的元素。添加完所有原子后，可以选择“Bond”工具，连接原子之间的化学键。...在晶体结构编辑器中，还可以进行晶格参数的设置，如晶格常数、晶胞角度等。绘制完成后，可以选择“File”选项，选择“Save As”保存晶体结构文件。以上就是使用MDI Jade绘制晶体结构的基本步骤。
多用于数据库基准测试的命令行工具，经常出现在各种知名数据库的性能对比报告中。支持丰富的测试选项，比如表数量、数据条数、生成只读 SQL 等。...该项目致力于提供优秀的远程桌面管理体验，通过启动器可以快速地连接到远程服务器，目前已支持 RDP、SSH、SFTP、FTP 等多种远程连接方式。...地址：https://github.com/ossrs/srs Go 项目 10、env：用于解析环境变量的 Go 语言库。一般情况下项目启动时需要的配置参数，都是通过环境变量传递的。...该项目通过 PyMuPDF 库提取 PDF 文件中的数据，然后采用 python-docx 库解析内容的布局、段落、图片、表格等，最后自动生成 docx 文件。...完全免费、可离线使用的开源软件，支持截屏识别文字、批量导入图片、横/竖排文字，还可以自动忽略水印区域，适用于 Win10 操作系统。
换句话说，网页只能运行在浏览器中，无法直接运行在操作系统中，因此网页应用程序也就无法访问文件操作系统。...它们也无法执行非JavaScript编写的代码，他们无法调用桌面应用程序可以使用的众多操作系统接口。还有，当大多数网页应用程序没有可靠的互联网连接时，也就无法使用了。...这是一个由GitHub的工程师Cheng Zhao（又名zcbenz）发起的开源项目。以前称为Atom Shell，Electron作为构建Github上可编程的文本编辑器Atom的框架而被开发出来。...如前所述，它最初是作为GitHub的Atom文本编辑器的基础开发的。Atom需要访问文件系统来履行其作为文本编辑器的职责。同样，其他公司也将Electron技术作为文本编辑应用程序的基础。...总结 Electron是一个使用web技术构建桌面应用程序的运行时框架。 该项目开始于GitHub，作为Atom文本编辑器的基础。
gitignore 文件用于指定要忽略的文件和文件夹，这些文件和文件夹在使用 Git 进行版本控制时不会被跟踪和提交。 使用.ignore 插件非常简单。...你可以右键单击项目文件夹，选择"New"，然后选择".ignore file" ，即可生成一个新的.gitignore 文件。...它为编辑器的文件树、侧边栏和标签栏等部分提供了美观的图标，使用户能够更直观地识别和区分不同类型的文件和目录。...要安装 Atom Material Icons 主题，你可以打开 Atom 编辑器的设置界面，点击"Install"选项卡，然后在搜索框中输入"atom-material-icons" 。...使用 Atom Material Icons 主题可以为你的 Atom 编辑器增添一些视觉上的美感，并且提供更好的文件和目录识别体验。
EditorConfig项目包含一个用于定义编码样式的文件格式和一个文本编辑器插件集合，这些文本编辑器插件使编辑器可以读取文件格式并遵循定义的样式。...解读 依赖编辑器IDE的支持 某些编辑器已默认集成对EditorConfig的支持，比如常用的：Webstorm、IntelliJ IDEA等； 而另一些编辑器则需要借助安装对应的插件来支持：比如 Visual...支持多种文件格式 编辑器读取到文件格式会匹配并遵循配置文件定义的规则； 就近原则 打开文件时，EditorConfig插件会在打开的文件的目录中以及每个父目录中查找名为.editorconfig的文件。...当在编辑器里格式化未生效时，可以在.settings.json里检查对应文件格式指定的格式化程序并调整就可以： ?...； 减轻了开发者编写自定义规则的门槛； 四、ESLint解析时将源码先转换成AST ESLint 使用 Esprima 将源代码解析成 AST来分析代码中的模式，再通过匹配规则定义识别和报告搜集的代码信息
可以直接在编辑器中检査代码差异，添加文件并进行提交，或者从云端检出所托管的代码到编辑器 云端一体：保持和云端打通，在编辑器中即实现创建/导入项目、云编译、自定义Loader，以及模块管理等操作。...如果需要更多功能，可通过安装扩展实现添加新的语言、主题、调试器、连接到其他服务等，得益于Vscode优秀的插件管理功能，使用扩展程序在单独的进程中运行，它们不会降低编辑器的性能。...文本编辑器的常见选择是Sublime text，这是一种跨平台的基于GUI的文本编辑器。Sublime Text允许在文件和项目之间无缝地转换，可以将注意力更多的集中在代码上。...虽然Sublime Text和Atom是在本地系统中工作的很好的选择，但是您可能觉得有必要使用一个非gui的基于终端的文本编辑器。当远程登录到服务器并直接更新服务器上的文件时，可能需要使用这样的工具。...Bit分别对每个组件进行版本控制，当您准备共享它时，它将在一个独立的环境中构建和测试，以确保正在共享真正可重用的、没有耦合到项目的组件。
这样，在用户进行编辑时仅需要重新 tokenize 行的一小部分，而不需要扫描整个文件内容。 比如： ? 还有一种情况是当前行的输入会影响到后面（甚至是前面）的行，这时会用到结束状态： ?...我们都知道，当开发者使用编辑器时，大部分时间就是，写新代码，改旧代码，写新代码，改旧代码，…… 说到底还是对 text 进行编辑。...但是这种方式存在一些问题： 无法打开大文件，因为把所有内容读入数组中可能导致内存不足。 即使文件不大，但是行数太多也无法打开。例如，一个用户无法打开一个 35 MB 的文件。...知乎上也有相关的讨论，atom 开发的下一代编辑器（莫非已经定义 atom 为上一代编辑器了吗）。大概就是一种“大号废了，开小号重练”的感觉。...这也是目前很多 nosql 数据库追求的方式（另一种是传统的符合 ACID 特性的数据库系统，放弃了A(可用性)，这种系统称为强一致性）。
当你识别常见问题（例如使用Node.js内置变量中的__dirname）时，Visual Studio Code将为你提供这些功能。...Brackets扩展也是用JavaScript编写的，还可以调用Node.js模块。与大多数在选项卡中显示打开文件的编辑器不同的是，Brackets具有显示在文件树上方的工作文件列表。...Atom是Chromium浏览器的一个特殊的存在，它被设计成一个文本编辑器而不是一个Web浏览器; 每个Atom窗口本质上都是一个本地呈现的网页。 当Atom不自动更新时，性能是非常好的。...它具有一些非常棒的功能，例如模糊搜索、快速项目搜索和替换、多个光标和选择、多个窗格、代码段、代码折叠以及导入TextMate语法和主题的功能。...Vim作为JavaScript编辑器，它的vim-plug readme文件中的建议是相当好的。
通过前文iOS开发之使用Git的基本使用(一)的学习，相信大家对如何将iOS项目通过Git传到GitHub账户上有了一个基本的了解，其过程是相对繁琐和容易出错的。...一、两个软件 Visual Studio Code（以下简称vscode）—— 免费的代码编辑器 用过Atom的同学对上手它可以说是零门槛，因为之前用Atom (GitHub专门为程序员推出的一个跨平台文本编辑器...(一)中，我们将所有的文件都传输到了GitHub上，但是很多时候，我们既要把某些文件放到Git的管理范围中，又不能提交它们，怎么办？...这时候可以在Git管理的根目录下创建一个特殊的.gitignore文件，然后把要忽略的东西填进去，这时候Git就会自动忽略这些文件。那么如何在.gitignore文件中填写需要忽略的文件？...隐藏文件.png 打开Sourcetree并将项目文件夹拖动其中，点击创建后会显示一个项目 ? 拖入项目.png 双击项目进入主窗口，此时显示的文件尚未有版本信息，所以前面有个？
是一个适用于 JavaScript 和相关技术的集成开发环境 CL->CLion是一款智能的 C 和 C++ 编辑器，也是一款跨平台的 IDE工具 DG->DataGrip是一个数据库管理工具，基本上支持市面上所以数据库环境的连接...它基于 TypeScript + React 进行编码，实现了包含资源管理器、编辑器、调试、Git 面板、搜索面板等核心功能模块，开发者只要基于我们的起步项目进行简单配置，便可以快速地搭建属于自己的本地或云端...四、Atom Atom 是由 GitHub 的程序员们打造的称为“属于21世纪”的代码编辑器。...针对来自不同平台的小程序，IDE中增加了兼容性检查的工具，直接导入已有的代码包就可以明确了解小程序需要修改的特性与位置。...与此同时，它还支持「「小程序一键转换成 APP」」，可以将已有小程序代码导出为 IOS 与 Android 中可用的工程文件，由于导出的工程文件已经集成了 FinClip SDK ，所以直接拥有小程序的运行能力
前言 如今，Visual Studio Code无疑是最流行的轻量级代码编辑器。它确实从其他代码编辑器那借鉴了很多，最主要是从Sublime和Atom那里。...这里有一些： JavaScript Atom Grammar（它用Atom编辑器里的JavaScript语法高亮替换VS Code原来的。）...Babel JavaScript（支持ES201X、React、FlowType以及GraphQL的语法高亮。） DotENV（支持.env文件语法高亮，在你使用Node时会非常有用。）...它的规则在.eslintrc.json里配置。） JSHint（基于JSHint的代码检测插件。在项目跟目录下使用.jshintrc文件作为其配置。）...这里有一些工具，能极大地减少你开发时的这种重复流程，而不是每次都手动刷新浏览器： 1. Debugger for Chrome（在编辑器中打断点，让你轻松地在Chrome里调试JavaScript。
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