晚上想起上午时候提示我没有tbl_summary函数，查到是gtsummary包的，习惯性看了下包的功能，这不是也可以绘制三线表？ 惊了，于是有了这篇分享。...1 下载R包，数据 使用内置数据集演示 #install.packages("gtsummary") library(gtsummary) #查看内置数据集 head(trial) ?...可以看到连续型变量使用的是中位数（四分位数），分类变量使用的 个数（比例）。 但是不是缺点什么？ 文献中的表1，是不是会有分组？是不是会有总体描述？是不是会有P值？是不是会有mean(sd) ？...mean} ({sd})") ) %>% add_p(test = list(all_continuous() ~ "t.test")) # 添加P值 就可以根据需求，结合着使用就可以绘制文献中的...HR ， 95%CI ,P value 都有了，，， 3.3 结果合并 甚至你还可以用tbl_merge函数将多个结果合并在一起，，这有点6了啊 # merge tables tbl_merge_ex1
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何使用「bstfun」包的函数来自定义绘制各种图表，此款R包包含众多函数都非常的实用，下面小编来简单介绍几个案例来做展示，希望各位观众老爷能够喜欢，更多详细文档请参考作者官方文档...❞ 官方文档 ❝https://rdrr.io/github/ddsjoberg/bstfun/ ❞ 加载R包 library(tidyverse) devtools::install_github("...MSKCC-Epi-Bio/bstfun") library(bstfun) library(gtsummary) library(patchwork) library(survival) 1....", "p.value")) tbl %>% modify_cols_merge(pattern = "{estimate} ({ci})", rows = !...is.na(estimate)) %>% modify_header(estimate = "HR (95% CI)") %>% as_forest_plot(col_names = c("estimate
[::1]是ip6的localhost等价地址 在当今最新的CI框架中，不推荐使config/config.php下的： base_url为空，推荐是下列格式： config[‘base_url
ChAMP 包提供了完整的分析illumina甲基化芯片的pipeline, 和普通的Bioconductor 包的安装一样，代码只有简单的两行 source("http://bioconductor.org.../biocLite.R") biocLite("ChAMP") 我用的电脑是windows 操作系统，64位的R-3.4.3，安装过程中除了网速较慢，花费一点时间安装之外，并没有出现任何的问题。...dll 文件就是windows操作系统下的动态链接库，在加载R包的过程中，如果这个R包有对应的动态链接库，那么就会加载进来。...解决方案就是设置环境变量R_MAX_NUM_DLLS, 不管是什么操作系统，R语言对应的环境变量都可以在.Renviron文件中进行设置。...ChAMP的功能确实是更加的强大和完整，同时也意味它的依赖包会特别的多，从而出现dll文件达到上限的错误。本文记录的解决方案，适合于任何操作系统，希望可以帮助到大家。
一年前我写了一篇文章，关于在 R 中估计 GARCH(1, 1) 模型参数时遇到的问题。我记录了参数估计的行为（重点是 β ），以及使用 fGarch 计算这些估计值时发现的病态行为。...with R Examples中），所以我非常感谢这个建议。...我将探讨包支持的不同优化程序。我不会像我在第一篇文章中那样画图，这些图只是为了表明存在的问题及其严重性。相反，我将考察由不同优化程序生成的估计器的特性。...多个求解器获得了模型 1 生成序列的“最佳”结果，同时 ω 的 95％ 置信区间（CI）不包含 ω 的真实值，尽管其他的 CI 将包含其真实值。...··· 请记住，我们通过 CI 捕获率来评估“最佳”优化器的表现，该捕获率应该在 95％ 左右。“最佳”优化器显然具有良好的表现，但并不优于所有优化器。这令人失望。
问题 你想知道包里有什么。 方案 在一个新的 R 会话中使用 search() 可以查看默认加载的包。...#> [19] "package:datasets" "package:methods" #> [21] "Autoloads" "package:base" 以下提供的函数能够列出包中的函数和对象...showPackageContents <- function(packageName) { # 获取特定包所有内容的列表 funlist <- objects(packageName)...移除包含箭头 <- 的东西 idx <- grep("<-", funlist) if (length(idx) !...qr.resid qr.solve qr.X quarters quarters.Date quarters.POSIXt quit R_system_version R.home R.Version
lpSolve 包和运输问题 运输问题(transportation problem) 属于线性规划问题，可以根据模型按照线性规划的方式求解，但由于其特殊性，用常规的线性规划来求解并不是最有效的方法。...造纸厂到客户之间的单位运价如表所示，确定总运费最少的调运方案。 解：总产量等于总销量，都为48 个单位，这是一个产销平衡的运输问题。R代码及运行结果如下: ?...lpSolve 包和指派问题 指派问题(assignment problem) 属于0 - 1 整数规划，是一种特殊的整数规划问题。...R中，lpSolve包提供了函数lp.assign() 来求解标准指派问题，其用法如下： lp.assign(cost.mat,direction = "min", presolve = 0, compute.sens...在实际应用中，常会遇到各种非标准形式的指派问题，有时不能直接调用函数，处理方法是将它们化为标准形式(胡运权, 2007)，然后再通过标准方法求解。
尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法，但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的...如果没有，则会将主题对象存储在编译后的包的字节码中，而该字节码可能与安装的ggplot2不一致！...<- function() { mpg_drv_summary() + default_theme() } 测试ggplot2输出 我们建议使用vdiffr[5]测试ggplot2的输出，这是一个管理可视化测试案例的工具
下面的例子摘自慕课网：闭包-慕课网 闭包 在函数内部定义的函数和外部定义的函数是一样的，只是他们无法被外部访问： def g(): print 'g()...'...return g 像这种内层函数引用了外层函数的变量（参数也算变量），然后返回内层函数的情况，称为闭包（Closure）。...闭包的特点是返回的函数还引用了外层函数的局部变量，所以，要正确使用闭包，就要确保引用的局部变量在函数返回后不能变。...): def f(i): def g(): return i * i return g r...= f(i) fs.append(r) return fs f1, f2, f3 = count() print f1(), f2(), f3()
还是在演示普通数据文件迁移的时候还是碰到了一些意料之外的问题，从当时的情况来看感觉还是比较诡异的，所以马上切换到另外一套环境去试验就没有任何问题了。...对于这个问题事后进行了分析，发现还是一些简单常规的错误，自己还是对一些细节没有掌握好， 本来对于普通数据文件的迁移流程是很简单的，在数据库open状态就可以迁移， 基本步骤如下： alter tablespace...，果断放弃这个环境，切换到10g的环境，老老实实的做了一遍文件的迁移，这次就没有任何问题了。...从整个过程来看，唯一的不同之处就在于出问题的那个环境我使用了offline immediate选项 从官方查看offline的这几个选项，可以看到还是有很大的不同，默认使用的是normal选项。...这是一个很简单很基础的问题，但是在特定时间里可能就没有意识到，看来还是需要不断巩固，多做练习：）
一直以来，Oracle的发展是如火如荼，依然非常成熟，无论是行业的人员和资料的丰富程度。对于数据库的体系结构的内容，下面这张图我估计很多DBA都快看吐了，每次一提起体系结构，总是会看到这张图。...而看着10年前的图，发现依旧能讲出不少的东西，很多技术的改变都是添砖加瓦，而动地基之类的改动，那就相当难了，从12c的体系结构可以看出，Oracle真是下了血本了，根深蒂固的基础架构都要动，而且这个架构貌似以前还是在...我想说的是，技术的发展，我们都是其中的分子或者分母，如果说ROWID这个概念有什么可值得深挖的，估计想想都不大可能。...DBMS_ROWID是不会披露这些信息的，毫无疑问，这些内容是肯定被加密的。 我们有什么其他的办法来解读呢。首先一种说法是ROWID是根据base64来编码的。...，而在这个测试中如果结合ROWNUM其实也就更有意思了。
这是一般做基因差异表达分析在使用t检验或者其他统计检验中常出现的一个问题。...，我们需要解决的就是这个问题。...为什么出现这问题？如果解决？以下是我的回答： 数据是恒量是无法做t检验的，因为计算公式分母为0（不懂的看下统计量t的计算公式，一般标准差/标准误为分母，所以恒量是不能算的）。...，如果一样，则输出原始的结果，再筛选其中差异大的基因 。...，如果出问题，返回相应的NA，这样我们可以算完后再检查数据。
这是《Bioconductor 中的 R 包安装教程》的第二篇，完整的文章可以点击阅读原文查阅。...安装新版本的 Bioconductor R 包 Bioconductor 是与特定版本的 R 绑定的，正常来说当 Bioconductor 的包都来自同一版本时，它们的效果最佳。...以 DiffBind 包为例，DiffBind==3.4.0 是基于 Bioconductor==3.14（对应 R-4.1）开发的；我们在 Bioconductor==3.13（对应 R-4.0）中执行...源码方式安装 如果想要在 Bioconductor==3.13（对应 R-4.0）中安装 DiffBind==3.4.0，可以直接通过源码包的方式安装： > packageurl <- "http://...，我这里用的是清华大学的，第二行，设定 install.packages 从 CRAN 和 Bioconductor 中搜索包，其实你还可以让它支持比如 R-Forge 以及各种第三方的仓库。
1.文档编写目的 ---- 继上一章如何在Redhat中配置R环境后，我们知道对于多数企业来说是没有外网环境的，在离线环境下如何安装R的包，能否搭建R的私有源对R的包进行管理。...本文档主要讲述如何在Redhat中安装R的包及搭建R的私有源。...搭建需要注意，PACKAGES文件中记录了所有包的描述信息，且每个包只有一个版本。...（如果是自己制作的R包，同理在PACKAGES末尾添加包的描述信息也是可行的，未做验证有兴趣的朋友可以验证下告诉Fayson）。...4.配置R使用私有源 ---- 1.在$R_HOME/ lib64/R/etc目录下增加配置文件Rprofile.site 在Rprofile.site文件中增加如下内容： [root@ip-172-31
在之前的章节中见到讨论过oracle中的半连接 http://blog.itpub.net/23718752/viewspace-1334483/ 与半连接相对应的是反连接，简而言之半连接就是查询条件中的...在asktom中，tom也对大家关心的in,exists,not in, not exists的问题进行了大量的佐证和解释。...因为问题是在2001年左右提出来的，当时还是oracle 8的时代，帖子也沉里许久，在2013年的时候，tom在自己的博客中做了全新的解释，说大家都在讨论十几年前的东西了。...传统RBO中的in,exists鲜明的对比在CBO中也都做了统一的优化处理，使得我们能够更加专注于程序的逻辑实现。...如果emp中的deptno为空，就设定一个不存在的deptno值。
一、通过install.packages安装 步骤： 1、在R中先装rJava包 install.packages(“rJava”) 2、没有装JDK的要到这里去下载： http://www.Oracle.com...如果您的电脑或者目前正在使用的R版本实在无法通过install.packages的在线方式安装Rwordseg包。...当然不用苦恼，有更便捷的方式，就是直接下载Rwordseg的zip包，在R中加载zip包进行离线安装，只需几秒钟即可。...方法：在程序包中选择(install packages from local files)，离线安装zip包即可。 ? 我将Rwordseg的压缩包上传至了资源中，大家可以下载进行离线安装。...毕竟我也是因为这个问题苦恼纠结了蛮久过来的，把经验分享给大家，祝大家都愉快安装成功！
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 在使用pytorch的双向LSTM的过程中，我的大脑中蒙生出了一个疑问。...我们可以看出最后一维的维度值为100，是设置隐藏层大小的两倍。 第二条输出则是我们的隐藏层维度大小，分别是左右两向，批次大小，隐藏层大小。...第三条输出是（第一条数据）从左往右第一个词所对应的表示向量的值，为“序列从左往右第一个隐藏层状态输出”和“序列从右往左最后一个隐藏层状态输出”的拼接。...第四条输出是（第一条数据）从左往右最后一个词所对应的表示向量的值，为“序列从左往右最后一个隐藏层状态输出”和“序列从右往左第一个隐藏层状态输出”的拼接。...第五条输出是隐藏层输出，为“序列从左往右最后一个隐藏层状态输出”和“序列从右往左最后一个隐藏层状态输出”的拼接。
在R语言中绘制表格的包我们介绍了非常多，除了专门绘制基线资料表的compareGroups/tableone/table1，还介绍了绘制普通表格的gt，以及扩展包gtExtra。...gtsummary包是专门用来画表格的，高度自定义的多种选项，快速绘制发表级表格。可用于总结汇总数据集、多种模型等。 快速绘制描述性统计表格、基线资料表(例如医学期刊常见的表1！) 。...自动识别常见的回归模型，如逻辑回归和Cox比例风险回归，会在表格中自动填充适当的列标题(即优势比和风险比)。 高度自定义的表格。字体字号、增加P值，合并单元格等，通通支持自定义。...联合broom/gt/labelled等R包，可以直接生成发表级的结果，配合rmarkdown，可自定输出到Word、PDF、HTML等多种文件中。...这么多画表格的包，这个很强，比gt强不少！
本次展示shiny的功能有： 1、读取本地数据； 2、交互展示数据（view） 3、动态交互作图（自动读取上传数据的列名） 体验网址：https://yanshenli.shinyapps.io...x = input$variableNames_x, title = "ggplot") } }) } shinyApp(ui, server) 一个完整的shiny...， 在ui中通过*input调整数值参数、上传数据等，并将数据传递给server进行相应计算； 然后，Server对数据进行计算、绘图，并将计算结果（图片、表格等）返回给ui 最后，通过ui中的*output...来展示server计算返回的结果（图片、表格等）
前言 SpringBoot微服务已成为业界主流，从开发到部署都非常省时省力，但是最近小明开发时遇到一个问题：在代码中读取资源文件(比如word文档、导出模版等)，本地开发时可以正常读取 ，但是，当我们打成...jar包发布到服务器后，再次执行程序时就会抛出找不到文件的异常。...背景 这个问题是在一次使用freemarker模版引擎导出word报告时发现的。...docx文档本身其实是一个压缩的zip文件，将其解压过后就会发现它有自己的目录结构。 问题 这个docx文档所在目录如下图所示： ?...解决 虽然我们不能用常规操作文件的方法来读取jar包中的资源文件docxTemplate.docx，但可以通过Class类的getResourceAsStream()方法，即通过流的方式来获取 ：
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