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    基因的可变剪切_如何确认发现了可变剪切

    有些基因的前体mRNA(pre-mRNA)通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点)产生不同的mRNA剪接异构体,这一过程称为可变剪接(或者选择性剪切)(Alternative Splicing)。 常见的可变剪切可以分成6类: 1、外显子跳跃(Exon Skipping) 2、内含子保留(Intron Retention) 3、5’端可变剪接(Alternative 5′ splice Site) 4、3’端可变剪接(Alternative 3′ splice Site) 5、最后一个外显子可变剪接(Alternative Last Exon) 6、第一个外显子可变剪接(Alternative 可变剪切预测软件 使用Cufflinks软件,与基因原有的剪接模型进行比较,对Mapped Data中的跨内含子Reads,进行新可变剪接事件(Alternative Splicing Events)预测

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