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比较(一)利用python绘制条形图

比较(一)利用python绘制条形图 条形图(Barplot)简介 条形图主要用来比较不同类别间数据差异,一条轴表示类别,另一条则表示对应数值度量。...', order=df['day'], ax=ax[1][0] ) ax_sub.set_title('数值排序') # 添加误差线 ax_sub = sns.barplot(...'] non_smoker_df = df[df['smoker']=='No'] # 布局 plt.figure(figsize=(6, 4)) # 非吸烟者条形图 bar1 = sns.barplot...', data=non_smoker_df, color='lightblue') # 吸烟者条形图,底部开始位置设置为非吸烟者total_bill值(即吸烟者条形图在上面) bar2 = sns.barplot...=(1.04, 1),loc='upper left') plt.show() 总结 以上通过seabornbarplot、matplotlibbar和pandasbar快速绘制条形图,并通过修改参数或者辅以其他绘图知识自定义各种各样条形图来适应相关使用场景

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你知道豆瓣电影是怎么评分吗?

在这篇豆瓣电影Top250分析文章中,你并不会得到一个像标题那样确切答案。 但是你可以因此否定很多看似正确答案,比如下面这些: “豆瓣电影Top250是根据评分排序?”...“难道是根据评论数排序?” “那一定是评分和评论数两者一起影响?” 以上想法或许你曾经也想过,但是都不对。 “为什么不对?” “怀疑!那我今天就给你分析一下为什么!” ?...但是现在似乎已经普遍适用,大家都已经认识到:重要因子通常只占少数。 “小一哥,根据帕累托法则,哪个环节最重要?” “数据重要性毋庸置疑!”...“嗷,就是数据必须得干净,不能有错” “不止这些,当你数据存在异常值,你可能还需要借助可视化图表对数据进行异常值检测” “举个例子,你数据中存在年龄字段时候,你不能只认为不是整数就是脏数据。...movie_rank', 'movie_name', 'movie_release_date', 'movie_rating', 'movie_comments_user']].head(5)虽然也不对,但是似乎比前面两种排序靠谱点

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不要怀疑,你基因就是没办法富集到统计学显著通路

经常收到粉丝提问,明明是按照课程视频操作,也是按照代码在处理他自己数据,但是做kegg数据库富集时候,就是返回值为空。 ?...代码如下: #该包gene需要识别ENTREZID,因此需要再次转换 library(org.Hs.eg.db) gene.df<-bitr(gene,fromType="SYMBOL",...toType=c("ENSEMBL","ENTREZID"), OrgDb=org.Hs.eg.db) head(gene.df) genelist=gene.df$ENTREZID...,其实推荐过 为R包写一本书(像Y叔致敬),然后这个同学统计学也烂一塌糊涂!...而且不能理解KEGG富集原理就是超几何分布检验了,也就没办法接受为什么自己给定基因集,在KEGG数据库里面,居然会无法富集到统计学显著通路。

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用 Python 对新冠病毒做数据分析,我们得出哪些结论?

在本文中,我们将简要回顾当前危机,然后深入研究 Kaggle 「Novel Corona Virus 2019 Dataset」。创建了一个 GitHub repo,以供大家发表自己见解。...进一步分析显示,英国、法国和印度等国省份名称都不见了。在这种情况下,我们不能假设或填充任何主列表中缺少值。让我们转到数字列。 data.describe() ?...数据似乎每天都在不同时间更新。我们可以从时间戳中提取日期并将其用于进一步分析。这将有助于我们保持日期一致。...= df_province.melt(id_vars=['Province/State']) sns.barplot( x='Province/State', y='value', hue='variable...结论 分析显示,武汉冠状病毒传播速度惊人。目前,至少 811 人在此次疫情中死亡,超过 7 年前非典爆发时报告 774 人死亡人数。祈祷并希望病毒能尽快得到控制。(编辑注:非最新数据。)

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RNA-seq(9):功能富集分析

个人觉得它upstream regulator analysis还是很不错。分子激活功能等也可以用用。另外一个就是它内置热图功能。高级版没用过,但是知道可以导出一些数据等。...1 按使用方式来说(简单度)有3种 (1)在线版:最主流就是DAVID,各种级别杂志总见其身影,使用非常简单,不再赘述。另外还有Gather,GOrilla,revigo,还有很多很多就不在贴了。...(3)R包:介绍一个就行了,那就是Y叔clusterProfiler,论文中富集功能很多都是用这个包做(还有的用了IPA)。...keggdot.jpeg # Gene Set Enrichment Analysis(GSEA) # 获取按照log2FC大小来排序基因列表 genelist <- sig.gene$log2FoldChange...gsea.jpeg 后记:做完这部分富集分析,接着按流程进入下一部分分析RNA-seq(10):KEGG通路可视化,因为直接用到这部分数据, 参考Y叔包说明,里面写特别详细 还有lxmic简书

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单细胞测序最好教程(十二):你真的做对了细胞比例分析吗?

细胞组成变化 在本章中,我们将详细探讨细胞组成变化分析手段,并阐明清楚为什么不能直接对细胞比例进行分析?分析细胞比例局限性在哪?这会是很有意思一章教程。...,但是B、C两类细胞似乎在病人器官中出现了下降情况,但对应我们真实情况而言,B、C两类细胞在病人与健康人中比例应该是不变。...但其他细胞类型,例如转运扩增(TA)细胞,与对照组相比,沙门氏菌条件下丰度也表现出明显差异,我们必须正确评估这些差异是否具有统计显着性。...基于已有的标记以及层次结构 除了每种细胞类型丰度之外,典型单细胞数据集还以基于树分层排序形式包含有关不同细胞相似性信息。...5.1 层次结构聚类 要使用 tascCODA,我们首先必须定义细胞类型分层排序

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数据分析实战—北京二手房房价分析

=False).to_frame().reset_index() f, [ax1,ax2,ax3] = plt.subplots(3,1,figsize=(20,15)) sns.barplot(x=...使用了pandas网络透视功能 groupby 分组排序。区域特征可视化直接采用 seaborn 完成,颜色使用调色板 palette 参数,颜色渐变,越浅说明越少,反之越多。...但是仔细观察特征分类下有很多不规则命名,比如2室一厅与2房间1卫,还有别墅,没有统一叫法。这样特征肯定是不能作为机器学习模型数据输入,需要使用特征工程进行相应处理。...['Renovation'], ax=ax1) sns.barplot(x='Renovation', y='Price', data=df, ax=ax2) sns.boxplot(x='Renovation...ax1.set_xlabel('是否有电梯') ax1.set_ylabel('数量') sns.barplot(x='Elevator', y='Price', data=df, ax=ax2) ax2

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为R包写一本书(像Y叔致敬)

最近收到粉丝求助,本来是询问富集分析时候,参考代码,为什么pvaluecutoff值和qvaluecutoff值设到0.9,其实是怕大家富集不到结果。...然后Y叔在自己微信公众号中提到“富集不到结果才是正确结果”,采用了更加稳妥和可靠方法来判断富集结果,而粉丝数据在DAVID中能有结果,可在Y叔包里,结果就少了一些,如何决定采取哪个?...最后又讨论到DAVID结果可视化,网上资源少,他只能做成条图,需要给指条方向!...这个时候还是推荐了Y叔clusterProfiler ,就去找了找其官网,的确可视化方法又多了几个: barplot cnetplot dotplot emapplot gseaplot goplot...个人认为,其实 heatplot是最强大,但是呢, 没有cnetplot和emapplot炫酷,而barplot和dotplot就太朴素了。

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Kaggle经典数据分析项目:泰坦尼克号生存预测!

1.2.2 仓位等级(社会等级)与生存率 我们还可以猜测不同仓位乘客应有不同获救率: #draw a bar plot of survival by Pclass sns.barplot(x="Pclass...贵仓位自然有更高生存率 ,不然花这冤枉钱干嘛,生死面前不是人人平等。...这张图表绘制用到了pandas一个方法:cut(),可以用这个方法对数据进行切分,我们得到很显然一个结论,婴儿生存率神他妈高(觉得很大一部分原因是不占空间) 1.2.5 仓位特征是否存在与生存率...成功率最高似乎接近0.82 3.3 Bagging Bagging把很多小分类器放在一起,每个train随机一部分数据,然后把它们最终结果综合起来(多数投票制) from sklearn.ensemble...名字随意啦反正只要不重复就好了~然后将这个结果放入下一个分类器中学习,没有试其他就直接放进了随机森林分类器: %matplotlib inline depth_ = [1, 2, 3, 4, 5,

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【数据挖掘项目】Airbnb新用户民宿预定结果预测

分析:异常年龄较少,且有一定数量缺失值 5.其他特征 train文件中其他特征由于labels较少,我们可以在特征工程中直接进行one hot encoding即可 统一使用柱状图进行统计 def feature_barplot...5.3 signup_flow feature_barplot('signup_flow') ? 5.4 language feature_barplot('language') ?...pd.concat((df, df_ohe), axis = 1) 4.3 整合提取所有特征 我们将对session以及train,test文件中提取特征进行合并 #将对session提取特征整合到一起...X_scaler = StandardScaler() xtrain_new = X_scaler.fit_transform(xtrain_new) 5.2 评分模型:NDGG NDCG是一种衡量排序质量评价指标...k : int """ order = np.argsort(y_score)[::-1] #分数从高到低排序 y_true = np.take(y_true, order[:k

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肿瘤生信科研:绘制突变景观图(mutation landscape)

肿瘤生信科研经常会画突变景观图,或者叫瀑布图,用 maftools 包可以实现简单 Landscape 图,但是当图形比较复杂时,maftools 就不能胜任了,可以用 ComplexHeatmap...实际上,Landscape 图是热图一种:图形由许多方块组成,根据突变类型不同,方块被渲染成不同颜色。...,横坐标是样本,纵坐标上是基因,并且基因和样本是自动重新排序(先对基因按突变频率从高到低排序,然后对样本进行排序)。...remove_empty_rows = TRUE, column_title = column_title, heatmap_legend_param = heatmap_legend_param) 重新排序行和列...,有显示每个基因或每个样本不同变异数量条形图,在景观图左侧是显示每个基因具有变异样本百分比文本注释。

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R语言ggplot2画环状柱形图(circular barplot)简单小例子

,个人感觉非常适合用来展示叶绿体基因组蛋白编码基因dn/ds值,因为不仅能够通过柱状图高低来比较dn/ds值大小,还能够通过环状展示蛋白编码基因在叶绿体基因组上所处位置 A circular barplot...is a barplot where bars are displayed along a circle instead of a line....接下来重复教程 https://www.r-graph-gallery.com/297-circular-barplot-with-groups/ 代码 #准备数据 df<-data.frame(individual...Rplot07.png 标签看起来有些乱,自己没有想到解决办法,模仿教程中解决办法:为参数hjust和angle赋予数据来调控标签位置 df$angle<-96-df$id*6 ggplot(df,...),'cm') p+theme(plot.margin=unit(2,2,2,2),'cm') 欢迎大家关注公众号小明数据分析笔记本 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python

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