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新冠肺炎数据里学到四个数据分析和机器学习知识

第1课:不同数据收集方式会创造出并不真实数据趋势 COVID-19国际报告标准是要求每个国家或地区报告医院每天死亡人数,这样就可以比较出该疾病是如何影响不同国家。...我们来看看英国报道每日数字: ? 英国因COVID-19导致每天死亡人数:每个周日/周一死亡人数都会大幅下降!...这是全球实时数据统计网站worldometers.info提供中国COVID-19新增病例报告比率: ?...每日新增病例 2月12日有一个巨大离群值,中国报告了14108例新增COVID病例,这一天增加量是前一天新增病例好几倍。 如果你盲目地用这些数据建立模型,那么这个离群值会把整个模型结果弄乱。...例如,下面这张地图使用了政府提供统计数据,截至2020年4月8日为止,以伦敦每个区COVID病例数为阴影: ?

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MIT喊你买加湿器了:室内相对湿度40-60%,新冠感染率、死亡率最低!

相对湿度即空气中水汽含量,指空气中水汽压与相同温度下饱和水汽压百分比。 该团队对2020年1月至2020年8月期间,121个国家/地区COVID-19数据和气象测量结果进行了分析。...而当室内相对湿度处于40%-60%「最佳点」期间,该研究中几乎所有地区新冠病例死亡人数都相应减少。...他们收集了2020年1月至2020年8月全球COVID-19数据,包括病例数和报告死亡人数,并确定了至少有50人死亡121个国家,表明这些国家至少发生过一次疫情。...虽然全年室外湿度保持在50%左右,但北半球和南半球国家室内相对湿度在各自较冷时期下降到40%以下,当时这些地区COVID-19病例死亡人数也出现激增。...Bourouiba表示:「我们最初非常怀疑,毕竟COVID-19数据可能受到干扰且不一致。」

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可视化冠状病毒全球态势

免责声明:截至2020年2月28日,所有数据均为最新数据集 可以在Github上找到使用数据集。它由约翰·霍普金斯大学系统科学与工程中心(CSSE)出版。数据每天更新两次。...https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19 探索性数据分析(EDA) 数据源具有三种类型数据:“确认”,“死亡”和“已恢复”,可在三个单独文件中使用。...在观察数据结构时,发现它具有地理数据常见可疑对象(州,国家,纬度,经度)。每行粒度仅在状态之前可用。在检查“状态”列时,看到它缺少值。对此进行调查。 ?...广东省确诊病例数最高,仅次于湖北省。其次是河南省(1272)。 ? ? 从死亡和恢复图可以看出,河南地区死亡和恢复数最大。谷歌快速搜索显示,与广东相比,河南实际上更靠近湖北。...尽管韩国是中国境外感染病例最多国家,但该国病毒死亡率仍然很低。 到目前为止,仅研究了全世界死亡人数。看一下世界各国对抗这种病毒情况。 ?

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钟南山、李兰娟等重磅新论文:新冠致死率1.4%低于SARS;美疾控专家:新冠或类似全球严重流感

患者中位年龄为59岁,老年人和合并症患者(与流感情况相似)发病率和死亡率较高;56%患者为男性。 值得注意是,15岁以下儿童中没有病例。...地址: https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001316 根据需要诊断为肺炎才能定义为确诊病例,目前报告病例死亡率约为2%。...根据钟南山、李兰娟院士等最新论文(解读见下文)“Clinical Characteristics of Coronavirus Disease 2019 in China”,在1099名经实验室确认Covid...-19患者中死亡率为1.4%;这些患者疾病严重程度范围很广。...研究团队从全国30个省、自治区和直辖市552家医院提供病例报告中,分析了1099例确诊新冠肺炎COVID-19患者(报告数据截止至2020年1月29日,临床数据收集截至1月31日)。

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Nat. Mach. Intell. | 华科同济医学院剑桥联手推出新冠预测模型!

文章中作者提出了一个基于XGBoost机器学习模型,可以提前10天以上预测患者死亡率,准确率超过90%,从而实现对COVID-19患者检测、早期干预,并有可能降低死亡率。...1 背景 自2019年12月以来,随着新冠肺炎疫情大爆发,危急病例死亡率逐渐上升,全球各个国家医疗服务都承受了巨大压力,重症监护资源短缺。...在这种情况下,作者回顾性分析了来自中国武汉地区485例患者血液样本,以确定可靠且有意义死亡风险指标,设计了一种基于最新可解释机器学习算法数学建模方法,旨在识别患者死亡最具区别性生物标志物...表1 患病严重情况评估标准 通过使用标准病例报告表收集病历,其中包括流行病学,人口统计学,临床,实验室和死亡率结果信息(表2和补充数据1)。临床结果随访至2020年2月24日。...具体统计结果如下表所示,在随后分析包括375例病例中,有201例从COVID-19中康复并出院,其余174例死亡

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斯坦福发布“防疫公司”模拟器:“照明开关法”或为美国社交隔离最优解

把社会隔离、检疫等各种干预措施做成了程度可平滑调节旋钮,模拟了COVID-19随时间传播曲线,让人可以非常直观地看到不同措施对病例数、死亡人数动态影响,以及与医院负载对比。...特朗普将隔离期限延长至4月30日,基于12种统计模型得出 3月29日,在白宫举行新闻发布会上,美国总统特朗普将美国新冠疫情预测总死亡数据“220万”重复了16次。...IHME负责人Chris Murray:从上周最新模型结果显示,目前总体情况首次出现好转,死亡人数统计相比于上周已经下降了20%,曲线开始逐渐平坦。...从流行病学角度看,这些死亡数据预测都是来自数学预测模型。...团队也使用了SEIR模型,数据调整用以模拟社会隔离措施收紧或放松,以及Covid-19感染可能出现季节性变化(类似流感)。

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如何用深度学习分辨新冠肺炎与流行感冒?五项研究,从初期筛查到重症病危预测

例如,在数据科学竞赛平台Kaggle上面,已经有了一个COVID-19病例数据集,数据每天更新,内容包括患者年龄、患者居住地、何时出现症状、何时暴露、何时进入医院等等。 ?...另外,为了加快数据标注速度,其采用了人机回圈(Human-in-the-loop)优化方法对每个病例进行注解。...并且在对比实验中,其得到专用于呼吸模式分类 BI-AT-GRU模型要优于现有的最新模型。...因而,这一方法具有重要临床意义。 作用:作者创建这一基于3项指标的预后预测模型,能够预测死亡风险,并能够提供从重症病例中识别关键病例临床路径。...该模型能够帮助医生及早发现病患病症并及早干预,从而有效降低死亡率。

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图解新冠病毒:为什么单张图表根本不能说明新冠疫情发展情况?

图表显示了哪个数据? 在知道图表是否显示峰值之前,首先需要知道它显示是什么数据。你查看是总确诊病例?住院总数?总死亡人数?还是每天计数呢?...为了追踪新冠疫情死亡人数,你仍然需要确认一个死亡的人是死于COVID-19,但目前还不清楚这该如何做到。...有些人在死前或死后都没有接受检测,即使看起来他们可能患有这种疾病,COVID-19也不会出现在他们死亡证明上。...随着这种流行病蔓延,一些国家已经改变了统计医院外死亡人数方法,这使得对这种趋势解读更加困难。 医院和政府也有动机少报COVID-19死亡人数,因为死亡人数会使这些机构看起来很糟糕。...假设这些数据收集正确,我们可能会认为这张图表向我们提供了最可靠趋势。如果它达到峰值,即使大多数COVID-19患者从未住院,也表明感染人数已达到峰值。

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诺奖得主关于疫情数据七个问题

钻石公主号每天使用PCR(一种灵敏DNA扩增方法,可检测微小程度病毒)对乘客进行COVID-19检测,最终导致19%感染率(705 / 3,700)。...用sigmoid函数拟合湖北地区新增确诊数和新增死亡数。虽然真实数据有很大波动,这些曲线(红色和黑色实线)还是较好地拟合了湖北新增病例死亡病例真实值。...上图绿线为通过新增病例(红线)来预测死亡数据,黑线为实际死亡数据曲线。可以看到,除了1月15日到1月29日这段时间外,对湖北省预测死亡数据与实际死亡数据几乎一致。...为使非湖北数据规模与湖北数据规模相当,上图黑色实线为非湖北死亡数据乘上20.06后结果,红色实线为非湖北确诊病例乘上4.99后结果。...Analysis of COVID-2019 Data on 3/2/2020” by Michael Levitt, Stanford University, USA 编辑:王建民 DrugAI 长按识别二维码关注我们获取最新消息

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全球疫情实时监控——约翰斯·霍普金斯大学数据大屏实现方案

霍普金斯大学全球疫情分布图 根据约翰斯·霍普金斯大学最新数据显示,截止北京时间4月7号9时,全球累计报告确诊病例已达 134万+,死亡74000+ 。...”,用于实时可视化和跟踪报告病例。...对于收集到数据都是免费提供,目前这些数据已经开源在Github中:https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19 已有近两万Star。...暗色底图在操作中心或其他带有很多监视器房间中效果更好。 3、数据选择器 该地图使用点符号显示了COVID-19病例,该点大小基于已确认病例数量。...图例为已确认病例分级符号分类 4、设置颜色 许多COVID-19病例地图都将一种颜色(红色)用于已确诊病例,另一种颜色用于恢复期(绿色或其他更积极颜色),而第三种颜色用于死亡(例如白色或黑色)。

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7万病例,迄今最大新冠研究发表:传染性超SARS,医务人员感染超三千

新冠病毒引起疫情仍在肆虐,截止今天上午,全国统计已有新冠肺炎确诊病例超过 72000 人。 ? 如此大量病例数据不仅说明了疫情严重程度,同时也有大量数据亟待整理分析。...新冠肺炎病毒传播能力比非典病毒更强。 数据与方法 这篇论文描述与分析了截至 2020 年 2 月 11 日报告所有中国内地 COVID-19 病例流行病学特征。...该论文表示,自去年 12 月 31 日起,全国各级 CDC 联合开展了 COVID-19 调查,因此研究者可以从病例报告系统中提取所有数据。...不过在分析过程中,所有病例个人身份和其它可识别信息都有去除,以保护个人隐私。 按照规定,关于 COVID-19 所有病例都应该上报系统,且病例纪录非重复。...期间,钟南山院士表示根据现有数学模型和政府采取有力措施,预计在 2 月中下旬出现峰值,4 月左右全国疫情会平稳。 随着人们返回工作岗位,我们仍需积极应对可能出现疫情反弹。

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钟南山团队携手腾讯研发新冠重症AI预测,成果登上Nature子刊

根据临床研究,轻度COVID-19患者通常能够在疾病发生发展到一定程度后,靠机体调节控制逐渐痊愈,但有6.5%患者病情会突然进展为严重疾病,这些重症病例不但需要大量医疗护理资源,死亡率也高达49%。...能否利用大数据和AI技术,做好COVID-19患者病情预测,对于医护工作者和技术人员来说,都是一项挑战。...进入该小程序后,医护人员只需输入患者临床特征,重症早期分诊系统就可以返回患者在5、10和30天内病情发展至危重概率,进而对患者进行早期分诊,对于COVID-19疾病管理具有极高临床和经济价值。...、乳酸脱氢酶、直接胆红素和肌酸激酶,以来自575个医疗中心1590名COVID-19患者病例进行模型训练,进而开发出深度学习生存Cox模型。...大数据及人工智能联合实验室副主任、腾讯医疗副总裁吴文达医生指出,当前新冠肺炎疫情在全球持续蔓延,高效抗疫、降低患者死亡风险,仍是取得抗疫胜利关键,希望大数据、人工智能等新技术,以及腾讯海量用户触达能力

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用Python只需要三分钟即可精美地可视化COVID-19数据

选择数据使结果可视化更具可读性。 在第三步中,我们创建一个汇总列,该汇总列汇总了已确认病例,已恢复病例以及因COVID-19而死亡任何个人病例总数。...在第四步中,我们df对数据框进行数据透视,将案例数作为数据字段在国家/地区之外创建列。这个新数据框称为covid。然后,我们将数据索引设置为日期,并将国家/地区名称分配给列标题。...在第五步中,我们复制数据covid并将其命名为percapita。我们使用一个字典来存储我们所有国家的人口,然后将每个值除以人口,然后将其乘以100,000,以产生每100,000人中有多少病例。...= percapita.max().max()+10, s = "中国、美国、德国、法国、英国和加拿大目前病例、康复和死亡人数", fontsize = 16, alpha = .75) ?...按国家分COVID-19人均病例数 结论: 在本文中,我们学习了如何在Github上使用Matplotlib实现COVID-19数据集生成漂亮数据可视化。

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在中国提供了60亿次服务疫情模块向世界开源

腾讯健康新冠疫情模块国际版以地图和数据统计曲线展现全球疫情统计数据,涵盖新确诊病例、累计确诊病例、治愈数、死亡数等统计维度,也聚合了权威媒体来源动态疫情报道,以H5网页呈现,方便全球民众通过手机获得及时疫情信息...2.页面模块配置化:根据不同渠道来源,前端页面可通过配置实现展示不同模块,灵活和低成本适配渠道 3.数据源多样性支持:数据高扩展性可支持接口自动爬取、手工录入等不同来源数据录入,满足快速变化疫情数据需求...TH_COVID19_National也是继腾讯优图医疗AI深度学习预训练模型MedicalNet后,腾讯在医疗技术领域又一开源贡献。...TH_COVID19_International开源啦!...腾讯工蜂源码系统为开源开发者提供完整、最新腾讯开源项目国内镜像 ?

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检测、量化、追踪新冠病毒,基于深度学习自动CT图像分析有多靠谱?

01 引言 冠状病毒感染迅速传播,对数十亿人生命产生了巨大影响,根据目前已有数据分析,死亡率在3.4%左右。 人们对当前诊断标准在疾病最初表现时敏感性提出了质疑。...他们标准是通过串行RT-PCR测试最终确认COVID-19感染诊断。 非对称胸部CT检测COVID-19感染敏感性为98%,该论文中显示了病例CT特征是显示出弥漫性或焦玻璃混浊。...02 方法 本文提出系统具有输入胸部CT图像并标记怀疑具有COVID-19病例功能。此外,对于分类为阳性病例,系统会输出肺部异常定位图和测量值。图1显示了开发系统框图。 ?...该系统由几个组件组成,并在两个不同级别上分析CT病例:子系统A:使用现有的SOTA算法对结核和焦浊情况病例体积进行3D分析,而子系统B:对每个切片,用最新开发2D分析来检测和定位更大范围弥漫性混浊...由于毛玻璃混浊(GGO)在最近研究中已经成为COVID-19关键特征之一,因此作者假设现有软件可以检测出病例中较小尺寸病灶。 ?

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Nature:What scientists have learnt from COVID lockdowns

摘要 这篇是9月份nature上最新论文。对于如何权衡lockdown成本和收益,综合评估lockdown影响,这篇论文给出了一个比较客观结论。...评估之困难 要在疾病传播率或死亡率等措施上来评估,lockdown政策严格国家是否比宽松国家表现更好,非常不简单:执法、政府援助水平、对官方政策遵守因地区而异——文化背景和许多其他因素不同,包括人口密度...到2020年10月,全民戴口罩已经普及;学校和公共场所要求保持距离;医院知道如何最好地治疗 COVID-19,仅因改善治疗条件,死亡率就就下降了20%。 这些变化减少了各国从lockdown中受益。...但那些在第一次疫情传播时行动较晚国家,此次也只能面对病例数依然很高情况(见下图)。 图表显示二次传播时每日病例数, 以及首次命令居家时每日病例数。...当然,未来威胁也可能与 COVID-19 传播方式完全不同。假如下一次大流行是由主要影响幼儿病毒引起,那么道德判断可能会截然不同。

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Wolfram技术分析新冠COVID-19最新流行病数据

按国家或地区估算新型冠状病毒(COVID-19,前身为2019-nCoV)感染病例估计数(此数据已于2020年4月25日导入并计算出来)。 按国家或地区估算的确诊COVID-19感染趋势。...数据基于WHO、美国CDC、ECDC、中国CDC(CCDC)、NHC和DXY。 香港特别行政区、澳门特别行政区和台湾省数据与中国大陆数据是分开。...请注意,源数据集由Johns Hopkins CSSE每天编译,已知有时会与其他源中数字不一致。 点击“阅读原文”了解最新数据并下载源笔记本。 示例: 检索资源: ? 检索默认内容: ?...最新更新日期: ? 检索五个受影响最大国家数据: ? 通过最新确诊病例对国家进行着色: ? 通过最新确诊病例为美国着色: ? 检索五个受影响最大美国州数据: ?...通过最新确诊病例为伊利诺伊州着色: ? 为中国地区的确诊病例创建气泡图: ? 绘制过去几天在中国地区确诊病例估计图: ? ? 绘制过去几天在中国和中国境外估计病例: ? ?

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嘿,你知道新冠疫情现在什么样了吗?

这才发现自己已经很久没注意过疫情数据了,就去Googe搜了一下第一张图标题,很快找到了数据来源。 就是——Our World in Data ?...数据网站 简单试用了一会,我发现它是我目前用过最好COVID-19疫情数据网站! 说一下它优点吧! 数据详细、指标丰富 比如确诊病例死亡病例、新增病例与累计病例、除了筛选国家还可筛选大洲。...人数还可以选择按照人口比例显示,也就是每百万人口多少人患病等等、、、 展现方法丰富多样 折线图、地图、表格多种形式展现,其中折线图又分为线形图和LOG两种(人民日报每天发南丁格尔图就是log转化后数据...另外还提供筛选指标后数据直接下载,亲测好用。 ? 以前我们在国内疫情爆发时,写过一下相关文章,数据源大部分都是丁香园之类数据接口。...现在大家如果想直接获取国际数据,可以直接去他们github上下载: https://github.com/owid/covid-19-data ? github更新也是很及时

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