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RNAseq分析之FastQC

FastQC特定的测序技术无关,因此可以用于查看各种组学的测序数据(包括不限于 WGS、WES、RNAseq、ChIP-seq、BS-Seq等) 3下载安装 如果可以Conda安装,我们一般默认推荐采用...conda安装 ## 首先创建一个RNAseq分析小环境 conda crean -n rnaseq ## 激活小环境 conda activate rnaseq ## 安装软件 conda install...蓝线为理论分布;红线为测量值,二者越接近越好 在这张图中,红色实际分布线条在中间的GC含量区间蓝色理论分布线条较为吻合,表明在这个区间内的GC含量是符合预期的。...最后,“可能来源”列显示了这些序列可能与已知序列的匹配情况,这里都显示为"No Hit",意味着没有找到这些高频序列相匹配的已知来源。...横轴:表示读取序列中的位置 纵轴:检测到接头序列的百分比。

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TensorFlow的环境配置安装教程详解(win10+GeForce GTX1060+CUDA 9.0+cuDNN7.3+tensorflow-gpu 1.12.0+python3.5.5)

下载的CUDA不一定需要匹配,尤其是CUDA9.2,最好使用CUDA9.0,我就在此坑摔的比较惨。...2、下载CUDA以及cuDNN,注意版本对应①查看版本匹配: https://www.tensorflow.org/install/source_windows ?...②cuDNN9.0安装 cuDNN是一个压缩包,解压后的内容如下 ? : 全选并复制所有内容,粘贴到CUDA的安装路径下,默认路径是: ?...后来看到有网友说,推荐列表中只给出CUDA版本号 的第一位,一般使用的都是CUDA9.0或者CUDA10.0,后面版本可能会出现兼容。...)的文章就介绍到这了,更多相关TensorFlow环境配置安装内容请搜索ZaLou.Cn以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持ZaLou.Cn!

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Conda 替换镜像源方法尽头,再也不用到处搜镜像源地址

第一步:查看并还原默认镜像源 # 首先,看一下目前conda源都有哪些内容 conda info # 然后,删除并恢复默认的condaconda config --remove-key channels...中pytorch相关的镜像:先搜索anaconda,搜索到后,点进去 然后进入cloud中,找到你需要的包,点进去,这里以pytorch为例(其他的包方法相同) 到了“pytorch.../ 然后,利用1中的方法,将上面复制的地址(也就是源)添加到conda当中,conda会自动识别系统版本并匹配上。...在conda的设计中,目录'pkgs'是下载、存放缓存,以及提取下载conda包的地方。同时,anaconda一起携带的包也会放在这里。...版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,拥有所有权,承担相关法律责任。

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软件安装-jcvi共线性软件安装

your choicegit clone git://github.com/tanghaibao/jcvi.gitpip install -e .我选用的是第三种的手动安装的方式,先将软件的安装包进行下载...但是当时还是很很多其他的报错,因此我尝试选用conda进行安装,但是由于conda'与我的服务器的环境匹配,因此又重新对conda进行安装。因此建议选用conda进行安装。...conda进行了安装,因此进行网页的查阅,发现是由于conda下载的只能单线程运行,因此博主建议加入 --cpu=1这个参数,后续可以保证基本没有报错。...也输出了以下的一些文件:图片基本上大致可以每个文件翻阅一下,具体的内容,都对两个基因组进行了比较详细的比对内容。...比较建议清晰的阅读唐老师的github上面的内容,对相关的一些东西有一个大致的了解。因为我的主要目的时比较两个基因组的共线性做相关的对应关系,因此,我没有选择画图。

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easyBio — 简化生信上游处理的工具包

环境后,采用conda本地安转 conda create -n easyBio conda activate easyBio # conda包安装 conda install --use-local ....easychangeSRAName 自动重命名SRA文件 easychangeSRAName -l sample_change_info.txt -f ~/easybio_test/ -l #列表文件,包含了原始文件名期望更改后的文件名的匹配信息...-l # 非必须,用于指定匹配列表文件,如果使用数据为多泳道时,自行构建样本和SRA文件对应列表。 -db # 必需参数,用于指定基因参考文件的路径。...-ec # 非必须,用于指定运行 cellranger 时预期的细胞数量。默认值为 3000。 -oi # 非必须,用于指定cellranger的其他输入参数 。默认值为 `空`。...-ec # 非必须,用于指定运行 cellranger 时预期的细胞数量。默认值为 3000。 -oi # 非必须,用于指定cellranger 。默认值为 `空`。

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杂谈:浅谈工作环境配置

另外就是,由于我工作中主要使用的就是linux系统,基本不涉及windows系统,因此这里的内容主要针对linux系统,在windows系统中可能出现匹配的情况,还烦请读者谅解。 1....1. miniconda的下载安装 miniconda的下载其实也蛮简单的,只要去官网下载相应版本的miniconda然后进行安装就行了。...给出miniconda的官网链接如下: https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html 当然,如果太慢的话也可以从清华源当中进行miniconda的下载:...当然,这部分内容就会很凌乱,算是一个备忘录吧,大家看看也就行了? 1....htop:查看服务器当前进程 & 资源使用情况; export:设置环境变量; cp/mv/rm:复制、剪切&删除文件,其中,对文件夹操作需要加上-r指定; chmod :修改文件权限; grep:字符串匹配

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对不起,看完这篇HTTP,真的可以吊打面试官

* : 匹配标头中未列出的任何内容编码,如果没有列出 Accept-Encoding ,这就是默认值,并不意味着支 持任何算法,只是表示没有偏好 ;q= 采用权重 q 值来表示相对优先级,这点首部字段...缓存过期资源:所有的请求都会直接到达服务器,由服务器来下载资源并返回。...下面是两种常见的案例 对于 GET 和 POST 方法,会结合使用 Range 标头,它可以确保新发送请求的范围上一个请求的资源相同,如果匹配的话,会返回 416 响应。...对于GET 和 HEAD ,仅当服务器没有给定资源匹配的 Etag 时,服务器将返回 200 OK作为响应。对于其他方法,仅当最终现有资源的 Etag 列出的任何值都不匹配时,才会处理请求。...如果 Etag 原始文件匹配,或者自获取以来已对文件进行了修改,则更改为拒绝更新,并显示412 Precondition Failed错误。

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长安杯2022赛题复现详解

咕鸟】三战长安杯,有幸在本科阶段的最后一次长安杯取得了一个新的突破,比起第一年的全国第三,也算是善始善终啦。...至此,随着对【材3】这部分分析结束,前三个材之间的关联分析虚拟货币交易平台的重构就告一段落,【材4】作为独立在外的一个材,虽然前三个材在分析过程中没有实质性的关联,但它是贯穿整个案件剧情最重要的部分...,我们通过对【材4】的分析,就可以将前三个案情背景串联起来,还原整个案情的真相。...材4 解压后会得到一个 npbk 文件,根据【材4】部分题目的描述可以知道这部分题目安卓模拟器有关,那么检索关键字【npbk模拟器】 可以得知这是【夜神模拟器】的备份文件,下载一个夜神模拟器并导入备份...,【灰色信仰】给【老板】发送了勒索邮件(在手机模拟器的 QQ 邮箱里可以看到),同时也修改和删除了网站以及数据库中部分数据,将网站上的 apk 下载内容换成了诈骗 apk(这也可以解释为什么我们在【

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Python学习工具第六期 - GPU加速工具CUDA 的使用 和 Pytorch-GPU 安装的三种方式

下载安装之前,这里再简要介绍几个关键概念 NVIDIA的显卡驱动器CUDA NVIDIA的显卡驱动程序和CUDA完全是两个不同的概念,CUDA是NVIDIA推出的用于自家GPU的并行计算框架,也就是说...注意:cuDNN是一个SDK,是一个专门用于神经网络的加速包,它跟我们的CUDA没有一一对应的关系,即每一个版本的CUDA可能有好几个版本的cuDNN之对应,但一般有一个最新版本的cuDNN版本CUDA...CuDNN支持的算法 卷积操作、相关操作的前向和后向过程 pooling的前向后向过程 softmax的前向后向过程 激活函数的前向后向过程,如(Relu、Sigmoid、Tanh )等 cuDNN的下载安装...,这里请注意自己安装的CUDA、以及torch、torchvision版本匹配,最后创建的Python环境请和下载的一致。...这里注意: 安装Pytorch需要依赖包numpy、future,可以提前安装好,安装torch检测到没有numpy时,会自动帮我们下载安装依赖包numpy、future,不用担心,但是过程缓慢,建议提前安装后

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win10安装anaconda3、pycharm和pytorch教程

anaconda的安装 官网下载anaconda 我下载的版本为: 双击安装 注意:下图中博主没有安装anaconda推荐的方式选择安装类型。...设置完安装路径后点击Next 注意:下图中一般默认会选中2的红框中的内容,意思是允许其他程序如PyCharm等能够自动检测到anaconda。...博主要说明的是红框1中的内容,这里是将anaconda添加到系统的环境变量中,博主在第一次安装的过程中没有选择这一项,结果在windows的命令行下直接敲上conda --version显示不是内部命令...另外就是为什么直接用D:\Program\anaconda3\Library\mingw-w64\bin来设置,反而要添加一个PYTHON_HOME的变量,因为PYTHON_HOME是anaconda...博主的cuda版本不适配,所以要选择合适的cuda版本。

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MaskRCNN 何凯明_cnn应用

一、下载项目源码 https://github.com/matterport/Mask_RCNN/releases下载最新版本 Source code (zip):源码压缩包下载。...,详细原因也不太清楚,可能是conda安装时会自动添加相关依赖) (3)如果还是出现一些相关包的功能报错,极大的可能是由于版本问题,最好的方法就是查找该包tensorflow1.3对应的版本,降低该包当前版本...,我的就是keras直接安装,结果安装的最新版本,和tensorflow匹配 最后,无赖降低了版本, 4.ImportError: DLL load failed: 找不到指定的模块。...Interpolation is not defined with bool data type 原因:可能是scikit-image的版本太高,与其他环境匹配,我卸载当前版本后安装了一个低版本的,解决了问题...本站仅提供信息存储空间服务,拥有所有权,承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

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震惊 | HTTP 在疫情期间把我吓得不敢出门了

* : 匹配标头中未列出的任何内容编码,如果没有列出 Accept-Encoding ,这就是默认值,并不意味着支 持任何算法,只是表示没有偏好 ;q= 采用权重 q 值来表示相对优先级,这点首部字段...缓存过期资源:所有的请求都会直接到达服务器,由服务器来下载资源并返回。...下面是两种常见的案例 对于 GET 和 POST 方法,会结合使用 Range 标头,它可以确保新发送请求的范围上一个请求的资源相同,如果匹配的话,会返回 416 响应。...对于GET 和 HEAD ,仅当服务器没有给定资源匹配的 Etag 时,服务器将返回 200 OK作为响应。对于其他方法,仅当最终现有资源的 Etag 列出的任何值都不匹配时,才会处理请求。...如果 Etag 原始文件匹配,或者自获取以来已对文件进行了修改,则更改为拒绝更新,并显示412 Precondition Failed错误。

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HTTP headers

HTTP标头由区分大小写的名称,后跟冒号(:)和值组成。 值之前的空格将被忽略。...实体标头包含有关资源主体的信息,例如其内容长度或MIME类型。...If-Match 使请求成为条件,并且仅在存储的资源给定ETag之一匹配时才应用该方法。 If-None-Match 使请求成为条件,仅在存储的资源任何给定的ETag 匹配时才应用该方法。...这样可以确保特定范围的新片段先前片段的一致性,或者在修改现有文档时实现乐观的并发控制系统。 Vary 确定如何匹配请求标头,以决定是否可以使用缓存的响应,而不是从原始服务器请求新的响应。...If-Range 创建一个条件范围请求,该条件范围请求仅在给定的etag或日期远程资源匹配时才得到满足。用于防止从资源的兼容版本下载两个范围。

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长安杯2021赛题复现详解

,但是我们需要注意的是 user为''(空)的用户可以匹配任意用户名,所以我们在尝试使用命令去连接时,会先被 Host 为 localhost.localdomain User 为 ''(空) 的字段匹配到...请分析,材四-PC的Bitlocker加密分区的解密密钥为 在我们加载取证时会提示检测到BitLocker加密,实际上在我们进行仿真时也可以看到相关提示,但是这并不影响取证进程,我们在正常加载取证后,...标识符: 3BC73D1D-E5B0-4592-B9D6-42D0A306B625 如果以上标识符电脑显示的标识符匹配,则使用以下密钥解锁你的驱动器。...恢复密钥: 511126-518936-161612-135234-698357-082929-144705-622578 如果以上标识符电脑显示的标识符匹配,则该密钥不是解锁你的驱动器的正确密钥...请分析材四-phone,受害者下载恶意APK安装包的地址为 也在伊对的聊天记录中 47. 请分析材四-phone,受害者的微信内部ID号为 在微信的聊天记录里有 48.

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视频 | 学习Linux进行GTF解析

Linux下命令的一些突发事故 1.2.5 了解和操作你的文件 1.2.6 小结和练习 1.3 Linux终端常用快捷操作 1.4 Linux下的标准输入、输出、重定向、管道 1.5 Linux文件内容操作...Linux下的查找命令 - 文件哪里跑 1.6.1 命令/可执行程序查找 - 定位脚本的位置 1.6.2 locate普通文件快速定位 1.6.3 find让文件无处可逃 find 1.6.4 按文件内容查找...2.4.14 如何提速Conda 2.4.15 下载提速 2.4.16 使用conda-pack直接从已经安装好的地方拷贝一份 (同一操作系统) 2.5 Docker安装 2.5.1 Docker能做什么...BioMart数据下载 5.3 如何获取目标基因的转录因子(下)——Linux命令获取目标基因TF 5.3.1 1. 基础回顾 5.3.2 2. 文件格式处理 5.3.3 3....6.14 给定一个BAM文件,怎么计算有多少基因组区域被测到了?平均测序深度是多少? 6.15 如何使用bedtools的其它工具或其它Linux命令实现bedtools jaccard子功能?

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pycharm安装anaconda虚拟环境_简单编译器

] python=版本号(如3.6,3.7等) 2、激活虚拟环境 conda activate [环境的名称] 3、查看已有虚拟环境 conda info --env 4、删除虚拟环境 conda remove...安装第三方库建议用pip而建议使用condaconda极其依赖代理,而windows版本的anaconda本身存在代理问题,conda可以正常使用,当使用pip时则会报代理异常的错。...https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/ anaconda有一个特点,如果你在某个环境中已经安装过了某一个第三方库,再安装时它会从cache中直接安装,无需重新下载...,但是指定版本安装时如果版本cache中不同,仍然会重新安装。...Environment>Existing environment 4、一般来说,Pycharm能够自动检测到你电脑中新的Anaconda虚拟环境,但是就算没有检测到也没关系。

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网站安全维护团队公司解决防护方案

企业网络蓝军工作内容主要包括渗透测试和红蓝对抗(Red Teaming),这两种方式所使用的技术基本相同,但是侧重点不同。...合规管理员 负责安全相关管理制度、管理流程的制定,监督实施情况,修改和改进相关的制度和流程 负责合规性迎准备工作,包括联络、迎工作推动,迎结果汇报等所有相关工作 负责外部安全相关单位联络 负责安全意识培训...这种情况可能有几种原因,其一是token生成的算法的缺陷,使得攻击者能够猜测到其他用户的token;其二是token后续处理的方法的缺陷,使得攻击者能够获得其他用户的token。 6.1.1.3....输入处理 很多对Web应用的攻击都涉及到提交未预期的输入,它导致了该应用程序设计者没有料到的行为。因此,对于应用程序安全性防护的一个关键的要求是它必须以一个安全的方式处理用户的输入。...白名单 白名单包含一系列的字符串、模式或一套标准来匹配符合要求的输入。这种检查机制允许匹配白名单的数据,阻止之外的任何数据。这种方式相对比较有效,但需要比较好的设计。 6.1.2.3.

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AI实现视频换脸

faceswap介绍Faceswap 使用深度学习算法和人脸识别技术,可以将一个人的面部表情、眼睛、嘴巴等特征从一张照片或视频中提取出来,并将其另一个人的面部特征进行匹配。...配置学习地址: conda安装简明教程(基于miniconda和Windows)下载下载地址:Latest Miniconda installer links by Python version国内镜像地址...--depth 1#注意:深度设置,如果设置会文件过大,下载速度很慢#然后进去 conda faceswap环境#如果有 ·chcp 65001· 执行提示,则执行。...注意检查GPU工作情况,有可能出现GPU工作的现象。如果工作可以根据提示,找对应的问题。在下方的错误异常解决可能有对应的方案。...错误: python环境处理# https://github.com/deepfakes/faceswap/tree/v2.10.0如果下载错误分支,会提示python版本不匹配,需要的python版本回贴出来

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