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RStuido Server 选择不同 R 版本conda不同 R 版本

头脑风暴 我有一个设想: 用root权限,新建一个环境R4.1,然后在里面安装R4.1 在R4.1中安装那几个 将RstudioR版本设置新建环境R4.1 我顾虑: 不确定我用root新建环境...在conda环境中安装R 「R4.1.0」 if (!...其它人用Rstudio-server安装R 因为现在Rstudio-server用conda环境中R4.1,它会在conda环境中有一个library,普通用户没有写入权限,安装R时会在自己路径下自动新建一个...如果安装出错,就进入conda环境,安装即可,绝对可以成功。 特别好使! 10....总结 1,conda新建环境安装R4.1.0,因为是全新环境,可以安装任何都不会报错,如果报错了,就分开安装,然后再安装,一般都能解决问题。

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conda使用-管理不同版本py

当需要管理多种版本python pip 会比较麻烦 pip安装升级换代也繁琐,anaconda就是来解决这一难题工具 Anaconda Anaconda是一个用于科学计算Python发行版...,支持 Linux, Mac, Windows系统,提供了包管理与环境管理功能,可以很方便地解决多版本python并存、切换以及各种第三方安装问题。...py 例如chuangjianpy3.5版本 起名叫 py35 conda create --name py35 python=3.5 ?...安装py3.5 |激活环境(指定系统默认版本py) linux mac :source activate py35 (py35是刚起名,不是填python版本) windows: activate...image.png 安装 py 安装 virtualenv conda install virtualenv 查看 已经安装列表 conda list 查看 指定环境下py conda

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惊艳 | RStuido server选择不同R版本conda不同R版本

头脑风暴 我有一个设想: 用root权限,新建一个环境R4.1,然后在里面安装R4.1 在R4.1中安装那几个 将RstudioR版本设置新建环境R4.1 我顾虑: 不确定我用root新建环境...在conda环境中安装R 「R4.1.0」 if (!...其它人用Rstudio-server安装R 因为现在Rstudio-server用conda环境中R4.1,它会在conda环境中有一个library,普通用户没有写入权限,安装R时会在自己路径下自动新建一个...如果安装出错,就进入conda环境,安装即可,绝对可以成功。 特别好使! 10....总结 1,conda新建环境安装R4.1.0,因为是全新环境,可以安装任何都不会报错,如果报错了,就分开安装,然后再安装,一般都能解决问题。

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Linux 中如何切换相同程序不同版本

alt 是一个命令行工具,可以让你在类 Unix 系统中切换相同程序不同版本。该工具简单易用,是 Rust 语言编写自由、开源软件。 安装 安装 alt 工具十分简单。...使用 alt 工具在 Linux 系统中切换相同程序不同版本 如我之前所述,alt 只影响当前目录。换句话说,当你进行版本切换时,只在当前目录生效,而不是整个系统范围。 下面举例说明。...从上面的截图中可以看出,我有两个版本 PHP:在 myproject 目录下,使用版本 PHP 5.6;在 myproject 外其它目录,使用版本 PHP 7.2。...如果你希望在不同软件版本下测试你应用,那么 alt 是你不错选择。...--config java $ sudo update-alternatives --config javac 总结 以上所述是小编给大家介绍Linux 中如何切换相同程序不同版本,希望对大家有所帮助

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Conda管理多个版本R, python

做生信常常用一些只支持老版本R,一些新开发又只支持最新R,这里我们用conda建立多个版本R环境。...conda,从终端输入 conda --version #或者 which conda 如果安装了的话,会显示现在所用版本等信息,没有的话,可以下载安装安装好了别忘记配置环境变量。...-n new_env(环境名) 环境查看: conda env list 如需要安装特定版本软件: conda install 软件名=版本号 最新Python安装conda create...py37 #或者 source activate py37 退出环境: conda deactivate #或者 source deactivate py37 创建不同版本R环境: conda create...安装conda list 删除已安装软件或者conda remove -n 环境名 软件名 #卸载指定软件: conda remove 软件名 更新某个软件: conda update

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Python数据科学利器

—— 海森堡《物理学和哲学》 Anaconda Anaconda是一个python科学计算发行版,其附带了一大批常用数据科学,不用再使用pip安装数据科学,再也不用为各种数据科学版本和依赖冲突发愁了...conda conda和pip类似,conda专注数据科学,且不仅仅用于安装python,而pippython量身定制,应用更广泛。...metapackage render server skeleton verify 上面每个命令已经说很详细了,常用命令如下: 搜索conda search package_name...还可以安装指定版本,如 conda install pandas=0.24.2 卸载conda remove package_name 更新conda update package_name...更新所有conda update --all 列出当前已安装conda list 列出当前存在虚拟环境: conda env list Install 对于不同操作系统下载不同环境

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conda安装star-fusion流程内部软件版本不兼容

来管理是一个比较简单解决方案,安装自己conda,每个用户独立操作,安装方法代码如下: # 首先下载文件,20M/S的话需要几秒钟即可 wget https://repo.anaconda.com/..._64.sh # 安装成功后需要更新系统环境变量文件 source ~/.bashrc 使用安装conda安装软件代码如下所示: # trim,star 两个软件即可 conda create...*python_abi* -c conda-forge mamba install -c conda-forge python_abi=2.7 mamba install -c bioconda...但是我git下载了它源代码,发现其压缩里面的STAR-Fusion命令本来就是可以直接使用,无需conda来管理了。...可以看到, 其实1.9star-fusion这个STAR-Fusion.map_chimeric_reads_to_genes 脚本内容跟前面conda自己配置1.6版本内容不一样: 531

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pycharm安装anaconda虚拟环境_简单编译器

纯净python也有创建虚拟环境功能,但是anaconda好处是可以指定python版本,而纯净python虚拟环境依赖python安装环境。...] python=版本号(如3.6,3.7等) 2、激活虚拟环境 conda activate [环境名称] 3、查看已有虚拟环境 conda info --env 4、删除虚拟环境 conda remove...安装第三方库建议用pip而不建议使用condaconda极其依赖代理,而windows版本anaconda本身存在代理问题,conda可以正常使用,当使用pip时则会报代理异常错。...有一个特点,如果你在某个环境中已经安装过了某一个第三方库,再安装时它会从cache中直接安装,无需重新下载,但是指定版本安装时如果版本与cache中不同,仍然会重新安装。...中指定anaconda虚拟环境 以下操作以windows例,linuxanaconda和windows稍稍有些不同 创建项目时使用anaconda虚拟环境编译器 1、在创建新项目时选择Previously

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python引入相同不同(模块)文件夹下py文件

目录 一、引入同级目录模块类 1、项目结构 2、引入规则 3、配置环境 二、引入不同级目录模块类 1、项目结构 2、引入规则 3、案例代码 一、引入同级目录模块类 1、项目结构 2、引入规则 从SyncMysqlMongo...中引入MongoDBUtil.py和MySQLUtil.py中两个类(这里类名和文件名一致) 语法:form 文件名 import 类名 from MongoDBUtil import MongoDBUtil...from MySQLUtil import MySQLUtil 3、配置环境 引入之后虽然可以执行,但是在pycharm中即使是目录也不会默认当前目录在环境变量中 需要手动配置,右击目录 -> Mark...Directory as -> Sources Root,配置之后编译器就不会提升报错了 二、引入不同级目录模块类 1、项目结构 2、引入规则 ## 将上级目录加入python系统路径 sys.path.append...(r'..') ## from 名.文件名 import 类名 from MongoDB.MongoDBUtil import MongoDBUtil 3、案例代码 #-*- encoding: utf

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