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Conda管理多个版本R, python

image.png Conda是一个非常好用工具,既可以管理packages,也可以管理和下载软件,还可以建立多个虚拟环境来独立运行多个版本软件。...做生信常常用一些包只支持老版本R,一些新开发包又只支持最新R,这里我们用conda建立多个版本R环境。...conda,从终端输入 conda --version #或者 which conda 如果安装了的话,会显示现在所用版本等信息,没有的话,可以下载安装安装好了别忘记配置环境变量。...-n new_env(环境名) 环境查看: conda env list 如需要安装特定版本软件: conda install 软件名=版本号 最新Python安装conda create...-n r36 r=3.6 安装特定版本R conda install -c r r=3.6 #或 conda install r=3.6 conda安装Rpackages https://docs.anaconda.com

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conda安装star-fusion流程内部软件版本不兼容

来管理是一个比较简单解决方案,安装自己conda,每个用户独立操作,安装方法代码如下: # 首先下载文件,20M/S的话需要几秒钟即可 wget https://repo.anaconda.com/..._64.sh # 安装成功后需要更新系统环境变量文件 source ~/.bashrc 使用安装conda安装软件代码如下所示: # trim,star 两个软件即可 conda create...*python_abi* -c conda-forge mamba install -c conda-forge python_abi=2.7 mamba install -c bioconda...但是我git下载了它源代码,发现其压缩包里面的STAR-Fusion命令本来就是可以直接使用,无需conda来管理了。...可以看到, 其实1.9star-fusion这个STAR-Fusion.map_chimeric_reads_to_genes 脚本内容跟前面conda自己配置1.6版本内容不一样: 531

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电脑可以同时安装两个版本jdk_jdk重复安装了怎么办

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 场景:公司项目使用jdk为1.7,最近不是很忙,找到一个爬虫系统学习。该系统使用到了jdk1.8特性,所以I need 俩版本,开整!!! 1 ....准备两个版本jdk我两个jdk路径为: D:\jdk1.7.0_80 D:\Program Files\Java\jdk1.8.0_111 2 ....JAVA_HOME7 = D:\jdk1.7.0_80 JAVA_HOME8 = D:\ProgramFiles\Java\jdk1.8.0_111 此处JAVA_HOME设置即为你更换jdk版本是所要修改地方...查看版本是否更换成功 java -version javac -version 若未成功,请看接下来6 6 ....若java -version和javac -version版本不一致 将%JAVA_HOME%\bin加在PATH变量头,执行java -version和javac -version,版本已然一致。

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安装python坑,你有绕过

其实安装软件时候可以很轻易避免入坑,就看你注意没注意。...第一步首先在python官网下载适合自己电脑python版本(注意x86是32位,x86-64是64位) Python官网:https://www.python.org/ ?...,可以下载和安装其他Python包 td/tk and IDLE安装tkinter开发工具(图形化界面)和IDLE交互界面 Python test suite安装标准库测试套件 py launcher...这些选项可以只选择默认三个选项,如果你要更改python安装路径,可以再下面的Customize install location 中修改。但是如果你选择是默认安装到C盘下,这里是不能改。...开始安装过程,耐心等待就行了。(如果有选项没有选上,可以点击取消重新安装) ? 安装完成,开始你Python之旅吧。 ?

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如何在 Ubuntu 中安装最新 Python 版本

Python 3 最新稳定版本版本 3.11。 在较新 Ubuntu 版本上,预安装Python 3.10 或 Python 3.8,而较旧 Ubuntu 版本则不然。...要从所有主要 Linux 发行版中安装最新版本 Python,请查看本指南: Install 要安装最新 Python 3.11 版本,您可以使用“deadsnakes”团队 PPA,其中包含为...系统中安装特定 Python 版本或多个版本 Python,只需运行以下命令并输入所示 Python 版本号即可。...Python版本是3.10,您也可以使用以下命令检查Python版本。...quit() OR exit() 设置默认版本 如果您在 Ubuntu 系统中安装了多个版本 Python,并且只想将一个版本设置为默认版本,那么您需要执行一些额外步骤,如图所示。

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windows下面使用多版本Python安装指定版本虚拟环境

windows下面使用多版本Python安装指定版本虚拟环境 写在前面 今天博主在搭建一个项目的时候,希望使用最新版Python3.7版本,但是Python3.6版本也要留下,那么问题来了,如何解决这个问题呢...如何在windows下面使用多版本Python安装指定版本虚拟环境呢?这篇文章我就来解决这个问题。...多版本Python使用 去Python官网,下载自己想要版本,我这里不演示Python安装过程,但要说明是你在安装时候不要勾选那个Add pyhton to Path(当然如果你勾选了也没关系,...指定版本虚拟环境搭建 安装virtualenv 关于virtualenv安装,我讲过很多次,这里就不再说明了,你可以点击这里:零基础使用Django2.0.1打造在线教育网站(二):开发环境配置。...这样我们就完成了虚拟环境安装自定义。 虚拟环境指定Python版本命令就是mkvirtualenv -p python路径 虚拟环境名称(注意这个-p是不可以去掉)。

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如何在virtualenv环境中安装指定python版本

如果不指定python版本,则默认使用环境变量中python版本 可使用-p PYTHON_EXE选项在创建虚拟环境时候指定Python版 1 #创建python2.7虚拟环境 2 virtualenv...在开发Python应用程序时候,系统安装Python3只有一个版本:3.4。所有第三方包都会被pip安装Python3site-packages目录下。...首先,我们用pip安装virtualenv: $ pip3 install virtualenv 然后,假定我们要开发一个新项目,需要一套独立Python运行环境,可以这么做: 假如我们当前在flasky...指定python版本 virtualenv -p /usr/local/python3.7/bin/python3.7 venv --python=python2.7 #(python实际安装路径非软连接...未经允许不得转载:肥猫博客 » 如何在virtualenv环境中安装指定python版本

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有可能给超低版本R安装高配包

最近在一个比较古老(其实就是2019年)服务器上面更新以前一个表观调控网页工具,其中需要使用R语言来安装一下必备包 ,比如 ChIPseeker ,麻烦是卡死在了第一步,如下所示 : (chipseq...) -- "Feather Spray" Copyright (C) 2018 The R Foundation for Statistical Computing Platform: x86_64-conda_cos6...可以看到R版本是超级低了,R version 3.5.1 (2018-07-02) ,因为很少更新,而且两年多没有使用它了。...graphics, Matrix, splines, utils Suggests: parallel, survival, MASS Published: 2021-09-23 确实是因为 mgcv 对R版本要求...当然了,一个很直接解决方案就是重置这个conda环境,就会安装最新版R啦。 不过,我比较好奇是,难道3.5版本R已经是基本上不可用了吗?还是说其实是有方法给超低版本R安装高配包?

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python anaconda jupyter_anaconda和pip

包管理与pip使用类似,环境管理则允许用户方便地安装不同版本python可以快速切换。...conda设计理念:conda将几乎所有的工具、第三方包都当做package对待,甚至包括pythonconda自身!...后面我们会看到,安装哪个版本并不本质,因为通过环境管理,我们可以很方便地切换运行时Python版本Conda和pip通常被认为几乎完全相同。...Pip安装Python包,而conda安装包可能包含用任何语言编写软件包。在使用pip之前,必须通过系统包管理器或下载并运行安装程序来安装Python解释器。...而Conda可以直接安装Python包以及Python解释器。 另一个区别是conda能够创建可以包含不同版本Python或其他软件包隔离环境。

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