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孟德尔随机化:代码分享(二)

(substitute(exposure)), "_", deparse(substitute(outcome)), ".RData")) 这部分数据就是上一次运行结果,记得命名要规范,是以exposure_outcome.RData...robust 表示该方法是否应使用 robustbase 软件包中 lmrob() 函数进行稳健回归,而不是使用标准线性回归(lm)。...penalized 表示是否应对权重进行惩罚,以降低具有离散比率估计值遗传变异对分析贡献。 weights 在加权回归中使用权重。...如果是 "delta",则方差表达式为 delta 扩展二阶项。二阶项包含了遗传与暴露相关性不确定性--使用简单加权法可以忽略这种不确定性。...接下来就是置信区间和p值计算啦~ if (deparse(substitute(outcome) == "LOAD")) {##这里也要换成自己结局!

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「R」观察R是如何工作

R解释在执行语句时要经过几个步骤。第一步是从语法上解析语句,将其转化为合适函数形式。我们可以查看R解释是如何执行一个给定表达式。...语句可以写为lapply(quote(if (x > 1) "orange" else "apple"),typeof),即忽略as函数,因为R会自动将语言对象强制转换为列表 可以看到if-then语句一些片段没有包含在解析后表达式中...要注意,列表中第一个项目是一个符号。在本例中,该符号指向是if函数。因此,虽然if-then语句语法与函数命令不同,但R语句分析会将表达式翻译为函数命令,再执行表达式。...函数名是第一个项目,剩下项目是函数参数。...> deparse(quote(`[`(x,2))) [1] "x[2]" > deparse(quote(x[2])) [1] "x[2]"

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一文了解成分句法分析

01 定义 维基百科上给定义如下:The constituency-based parse trees of constituency grammars (= phrase structure grammars...句法结构分析是指对输入单词序列(一般为句子)判断其构成是否合乎给定语法,分析出合乎语法句子句法结构。...parser),也简称分析(parser)。...02 基本任务 句法结构分析基本任务主要有三个: 1. 判断输入字符串是否属于某种语言。 2. 消除输入句子中词法和结构等方面的歧义。 3. 分析输入句子内部结构,如成分构成、上下文关系等。...如果一个句子有多种结构表示,句法分析应该分析出该句子最有可能结构。有时人们也把句法结构分析称为语言或句子识别。

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斯坦福大学cs224课程18个完整PPT整理

1 整理了斯坦福大学cs224n,自然语言处理与深度学习课程所有18个PPT完整版,提供下载,供大家学习参考。...在这之前,已经总结了9次课堂笔记,这些课PPT都非常精彩,配有大量图片,言简意赅地解释NLP核心问题,最新动态和展望。...TensorFlow 实战 3层网络求解嵌入词向量,附代码详解 5 高性能,依存句法解析,基于三层神经网络模型 6 你每天都在用:RNN和语言模型 7 从 n-gram 到 RNN 做那些优化改进...2 现将完整18个课程PPT题目列在这里,供大家查阅选择学习,这门课程包括相当全面,包括自然语言处理介绍,词向量,词窗口,神经网络,反向传播,TensorFlow使用介绍,依赖解析,RNN和语言模型...lecture12: Transformer networks and CNN lecture13: Coreference resolution lecture14: Tree Recursive NNs and constituency

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斯坦福NLP课程 | 第18讲 - 句法分析与树形递归神经网络

,做了中文翻译和注释,并制作成了GIF动图!...[the firm that you used to work at]]]] 包含名词短语名词短语,包含名词短语 它是语言结构一个非常强大先验 1.3 Penn Treebank tree [Penn...基于组合原则 使用单词含义和组合他们规则,得到一个句子含义向量 同时学习解析树以及组合向量表示 2.2 Constituency Sentence Parsing [Constituency Sentence...PCFG解析工作有关 Klein and Manning (2003a):手工特征工程 Petrov et al. (2006):分解和合并句法类别的学习算法 词汇化解析(Collins, 2003...; Charniak, 2000):用词汇项描述每个类别 Hall and Klein (2012) 在一个因式解析中结合了几个这样注释方案 CVGs 将这些想法从离散表示扩展到更丰富连续表达 5.3

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总结 | 邹炎炎:语义分析介绍及跨语言信息在语义分析中应用

(依赖关系分析)和 Constituency parsing(成分句法分析)。...Constituency parsing:我们以同样句子为例,这里我们关注不是两个词之间是否存在修饰、依赖关系,而是关注哪些词构成一个短语,一个短语即是一个成分,比如「a telescope」就是一个名词短语...Semantic Parsing 则是指输入一段完整的话,最后输出 semantic representations(MRL)。那 semantic representation 是什么呢?...,可能会有很多种表达,但是语义是一样。不同语言其实有一些共享信息,那这些共享信息是否能帮助我们更好去学 Semantic Parsing 呢?这就是我们 Motivation。...【更多关于使用跨语言信息去学习语义分析 Motivation 讲解,请回看视频 00:32:15 处】 http://www.mooc.ai/open/course/544?

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成分句法分析综述(第二版)

介绍 成分句法分析近年来取得了飞速发展,特别是深度学习兴起之后,神经句法分析效果得到了巨大提升。一般来说,句法分析都可以分为编码模型和解码模型两个部分。...缺点也是显而易见,由于预测出序列需要有很强约束,不然不能保证可以还原出一棵完整句法树,所以最终效果也没有前面两种模型理想。...这些转移系统共同点是都包含两个组成成分,一个是栈(stack),用来存放已分析句法结构,另一个是缓存(buffer),用来存放待分析句子。...一元(Unary-X)动作就是将栈顶元素出栈,并且归约为父结点X,这个动作是用来预测一元产生式。最后完成(FINISH)动作用来判断句法分析是否结束。...目前单模型最好结果来自于(KleinK18),他们采用了Transformer作为编码,使其结果得到了大大提升。由此可见,目前成分句法分析领域编码影响要远远大于解码

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首篇NLP图神经网络综述来了! 127页文档让你全面了解这个领域

静态图部分介绍了dependency graph, constituency graph, AMR graph,knowledge graph, topic graph 等图构建方法, 如下图所示: (...a)Depedency and constituency graph (b) AMR graph (c) Knowledge graph (d) Topic graph 动态图部分介绍了依据...在第 5.3 节中,则将讨论用于处理异构图基于GNN方法。 6 基于编码-解码模型图神经网络 这一章节我们讨论GNNs for NLP模型中经典架构:编码-解码。...本节首先介绍了典型 Seq2Seq 模型,然后讨论针对各种 NLP 任务各种基于图编码-解码模型。...下图就是基于图编码-解码模型整体架构示例,其中包含了Graph2Seq和Graph2Tree模型,输入和输出来自JOBS640数据集。下图展示了所有编码-解码结构细节图。

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这种有序神经元,像你熟知循环神经网络吗?

获得树结构一种简单方法是通过监督语法分析。...然而,监督分析也有一些局限性:1)很少有语言具有用于监督分析训练全面注释数据;2)在可用语言数据中,语法规则往往被打破「如推特上表达」;3)在实际运用过程中,语言始终在变化,因此语法规则可能会演变...该模型在语言建模、无监督成分句法分析(unsupervised constituency parsing)、有针对性语法评估(Marvin & Linzen, 2018)及逻辑推理(Bowman 等,...标注「*」模型重点关注改进 RNN 语言模型 softmax 部分。 ? 表 2:在完整 WSJ10 和 WSJ 测试集上评估无标记「parsing F1」结果。...本文语言模型分三层,每层都提供了ˆdt 序列。本文给出了所有层分析性能。RL-SPINN 和 ST-Gumbel 结果在完整 WSJ(Williams 等,2017)上评估。

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自然语言处理全家福:纵览当前NLP中任务、数据、模型与论文

Clark 和 Curran 2007 年提出标准解析模型使用了超过 400 个词汇语类(或超级标记(supertag)),典型解析通常只包含大约 50 个词性标注。 示例: ?...选区解析 选区解析(constituency parsing)目的是从根据词组结构语法来表征其合成结构句子中提取基于选区解析树。 示例: ?...要对比仅在 WSJ 上训练单个模型,参见《Constituency Parsing with a Self-Attentive Encoder》。 ?...对话状态追踪涉及确定在对话每个回合用户在当前对话点目标的完整表征,其包含了一个目标约束、一系列请求机会(requested slot)和用户对话行为。DSTC2 聚焦于餐厅搜索领域。...该数据集包含 28000 多篇短文和近 100000 条问题。模型可基于中学测试(RACE-m)、高中测试(RACE-h)和完整数据集(RACE)使用准确率进行评估。

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【GCN】图神经网络入门(二)

使用了GRUGGNN模型基本传播步骤为: ? 节点 v 首先聚合来自其相邻节点信息,其中 ? 是图邻接矩阵 A 子矩阵,并表示节点 v 与相邻节点连接。...来表示在第 k 个输出步中第 t 传播步骤节点向量,其中 ? 用 ? 值更新。这里 ? 可以是共享权值网络,也可以是单独网络,看目标是否需要两个网络有不同作用。...Child-Sum Tree-LSTM (Dependency Tree-LSTM) 像在标准LSTM单元中一样,每个Tree-LSTM单元(由v索引)都包含输入和输出门,存储单元和隐藏状态。...N-ary Tree-LSTM (Constituency Tree-LSTM) 如果树中每个节点子节点数最多为 K ,并且这些子代可以从 1 到 K 进行排序,则可以应用 N-array Tree-LSTM...补充: Constituency Tree-LSTM是N-ary Tree-LSTM在N=2特例,更为常见(或者说是因为在原论文《Improved Semantic Representations From

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自然语言处理全家福:纵览当前NLP中任务、数据、模型与论文

Clark 和 Curran 2007 年提出标准解析模型使用了超过 400 个词汇语类(或超级标记(supertag)),典型解析通常只包含大约 50 个词性标注。 示例: ?...选区解析 选区解析(constituency parsing)目的是从根据词组结构语法来表征其合成结构句子中提取基于选区解析树。 示例: ?...要对比仅在 WSJ 上训练单个模型,参见《Constituency Parsing with a Self-Attentive Encoder》。 ?...对话状态追踪涉及确定在对话每个回合用户在当前对话点目标的完整表征,其包含了一个目标约束、一系列请求机会(requested slot)和用户对话行为。DSTC2 聚焦于餐厅搜索领域。...该数据集包含 28000 多篇短文和近 100000 条问题。模型可基于中学测试(RACE-m)、高中测试(RACE-h)和完整数据集(RACE)使用准确率进行评估。

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数据处理基础—数据类型了解一下

书籍翻译 好书籍是人类进步阶梯,但有些人却找不到优秀阶梯,为此我们开设了书籍翻译这个栏目,作为你学习之路指路明灯;分享国内外优秀书籍,弘扬分享精神,做一个知识传播者。...编写程序时习惯将包含多个字母数据称为“字符串”,因此大多数作用于字符数据R函数将数据称为“字符串”,并且通常在其名称中包含“str”或“string”。...Hello\tWorld" paste("Hello", "World", sep= "\n") ## [1] "Hello\nWorld" 单反斜杠或双反斜杠也可用作escape,功能是关闭特殊字符功能或允许引号包含在字符串中...5.3.5 检查类/类型 我们建议您在读取文件后检查数据类型是否正确: x = 1.4 is.numeric(x) ## [1] TRUE is.character(x) ## [1] FALSE is.logical...., deparse.level = 1) ## .Internal(cbind(deparse.level, ...)) ## ## <environment

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华人博士发127页万字长文:自然语言处理中图神经网络从入门到精通

---- 新智元报道 作者:Lingfei Wu, Yu Chen, Kai Shen, Shucheng Li 编辑:好困 【新智元导读】图不但包含数据,也包含数据之间依赖关系,因而图神经网络...图在NLP世界里无处不在,比如用来描述句法信息dependency tree和constituency tree,以及描述语义信息AMR graph。...dependency graph和constituency graph两种静态图构建方式 本文从以往发表文献中,总结出10余种有代表性静态图构建方式,并将其归类为句法信息、语义信息、主题信息等多个维度...首先,根据图节点和边属性是否唯一,将图归类为: 具有单一节点和边属性同构图(homogeneous graph); 具有单一节点属性,但边属性不唯一关系图(multi-relational graph...流程图 编码-解码模型 Encoder-decoder架构可以说是近年来NLP领域中应用最为广泛框架之一。

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NLP领域ImageNet时代到来:词嵌入「已死」,语言模型当立

例如,ImageNet 数据集另一个优点可能是数据质量。ImageNet 创建者尽力确保注释可靠性和一致性。然而,远程监管工作是一个对比,这表明大量弱标记数据通常是足够。...来自 newstest2014 法语到英语翻译(Artetxe et al., 2018,Unsupervised Neural Machine Translation) 选区解析(Constituency...虽然任何数据都包含某些偏差,人类标注可能无意间引入额外信息,而模型也将会利用这些信息。...同时模型还需要理解语义,此外那些最准确模型必须包含世界知识或常识等内容。...有两个主要范式,一是是否将预训练语言模型作为固定特征提取,并将其表征作为特征整合到随机初始化模型(正如 ELMo 所做)中;二是是否微调完整语言模型(如 ULMFiT 所做)。

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JSP基本语法

session 指定JSP页面是否使用HTTPsession会话对象。其属性值是boolean类型,可选值为true和false。...--输出九九乘法表--> 4.注释 1.HTML中注释 HTML中注释不会被显示在网页中,但是在浏览中选择查看网页源代码时还能够看到注释信息...HTML中注释语法格式如下: 2.隐藏注释 在文档中添加HTML注释虽然在浏览中不显示,但是用户可以通过查看源代码看到这些注释信息,所以严格来说,这种注视是不安全。...不过JSP还提供了一种隐藏注释,这种注释不仅在浏览中看不到,而且在查看HTML源代码时也看不到,所以这种注释安全性比较高。...flush属性:可选属性,用于设置是否刷新缓冲区,默认值为false。如果设置为true,则在当前页面输出使用了缓冲区情况下先刷新缓冲区,然后再执行包含文件。

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AI自然语言处理(NLP)领域常用16个术语

词性标注常用4种方法分别为:基于规则、基于统计、基于规则+统计、基于深度学习。 7.成分句法分析 成分句法分析是指对输入单词序列判断其构成是否合乎给定语法,分析出合乎语法句子句法结构。...10.依存句法分析(Constituency-based Parse Trees) 在自然语言处理中,用词与词之间依存关系来描述语言结构框架称为依存语法。...13.自然语言处理工具包(NLT) 在自然语言处理领域,NLT是最常使用一个Python库,包含Python模块,数据集和教程等内容。...14.Transformer Transformer是一个完全基于注意力机制编解码模型,它抛弃了之前其它模型引入注意力机制后仍然保留循环与卷积结构,而采用了自注意力(Self-attention)...简单讲,就是识别自然文本中实体边界和类别。

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