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如何在Ubuntu 16.04上使用Cassandra和ElasticSearch设置Titan Graph数据库

Titan是一个高度可扩展的开源图形数据库。图形数据库是一种NoSQL数据库,其中所有数据都存储为节点(nodes)和边(edges)。图形数据库适用于高度连接数据的应用程序,其中数据之间的关系是应用程序功能的重要部分,如社交网站。Titan用于存储和查询分布在多台机器上的大量数据。它可以使用各种存储后端,如Apache Cassandra,HBase和BerkeleyDB。在本教程中,您将安装Titan 1.0,然后配置Titan以使用Cassandra和ElasticSearch。Cassandra充当保存底层数据的数据存储区,而ElasticSearch是一个自由文本搜索引擎,可用于在数据库中执行一些复杂的搜索操作。您还将使用Gremlin从数据库创建和查询数据。

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基于Transformer预训练的蛋白语言模型是无监督的蛋白质结构学习器

无监督接触预测 (Unsupervised Contact Prediction) 是在蛋白质结构测定和设计过程中揭示蛋白质物理、结构和功能约束的核心。几十年来,主要的方法是从一组相关序列中推断进化约束。在过去的一年里,蛋白质语言模型已经成为一种潜在的替代方法,但目前性能还没有达到生物信息学中最先进的方法。本文证明了Transformer的注意图 (Attention Map) 能够从无监督语言建模目标中学习蛋白质序列中各个残基之间的接触距离。我们发现,迄今为止已经训练过的最高容量模型已经优于当前最先进的无监督接触预测的工作流程,这表明过去这些繁琐的工作流程可以用端到端模型的单向传递工作流程来代替。

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C#复杂XML反序列化为实体对象两种方式

今天主要讲的是如何把通过接口获取到的Xml数据转换成(反序列化)我们想要的实体对象,当然Xml反序列化和Json反序列化的方式基本上都是大同小异。都是我们事先定义好对应的对应的Xml实体模型,不过Xml是通过XmlSerializer类的相关特性来对实体对象和 XML文档之间进行序列化和反序列化操作的。序列化和反序列化其实都还好,我们可以调用封装好的XmlHelper帮助类即可实现,最关键的是我们该如何去定义这些实体模型(Model)。当你遇到对方接口一下子返回一大串的Xml数据并且里面存在很多不同的Xml节点,你该怎么办一个一个去解析这些节点到模型上去吗?本文我主要讲两种方式,第一种方法是通过手写的方式去定义Xml的实体对象模型类,第二种方法是通过Visual Studio自带的生成Xml实体对象模型类。

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C#复杂XML反序列化为实体对象两种方式

今天主要讲的是如何把通过接口获取到的Xml数据转换成(反序列化)我们想要的实体对象,当然Xml反序列化和Json反序列化的方式基本上都是大同小异。都是我们事先定义好对应的对应的Xml实体模型,不过Xml是通过XmlSerializer类的相关特性来对实体对象和 XML文档之间进行序列化和反序列化操作的。序列化和反序列化其实都还好,我们可以调用封装好的XmlHelper帮助类即可实现,最关键的是我们该如何去定义这些实体模型(Model)。当你遇到对方接口一下子返回一大串的Xml数据并且里面存在很多不同的Xml节点,你该怎么办一个一个去解析这些节点到模型上去吗?本文我主要讲两种方式,第一种方法是通过手写的方式去定义Xml的实体对象模型类,第二种方法是通过Visual Studio自带的生成Xml实体对象模型类。

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