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Galaxy 生信平台(二):生产环境部署

这是由于 Python 全局解释器锁(GIL),详细说明可以参考 Galaxy 的高级配置部分文档。 基础 实现 Galaxy 可扩展性的基础就是, 我们需要一个干净的环境!...确保 Galaxy 使用干净的 Python 解释器。$PYTHONPATH 或解释器的 site-packages/ 目录中的冲突可能会导致其他的一些问题。...使用代理服务器 Galaxy 包含了一个独立的 Web 服务器,可以直接向客户端提供所有内容。但是,某些任务(例如提供静态内容)可以负载到更有效地处理这些任务的专用服务器。...此外,Galaxy 的内置 Web 服务器不支持字节范围请求(许多外部显示应用程序所需),但可以将此功能负载到代理服务器。除了释放 GIL 之外,压缩和缓存还可以减少页面加载的时间。...作业处理程序不直接通过 Web 为任何用户请求提供服务。相反,他们会在数据库中查看新作业,并在找到它们后,处理它们的准备,监视,运行和完成。

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搭建自己的本地云平台,QIIME2图形界面玩转16S分析(WSL2+Docker+Galaxy qiime2)

QIIME 2 2021.4 发布(qiime2 支持 galaxy 啦),还把官方的宣传和安装视频转载到过公众号,不过之前没有加字幕,看起来还是有点困难的,重新加了中英文字幕并校对了下。...当然你也可以安装使用 WSL2 中的 Docker 守护进程的桌面管理程序,见这:WSL2 + Docker + xfce4 安装及使用\_笔烽烟的博客-CSDN 博客\_docker wsl2[2]...# 安装Docker sudo apt update curl https://get.docker.com | sh docker -v Docker version 20.10.7, build...不像之前印象中的 galaxy(界面像十几年前的),现在的版本视觉元素有了一些现代化的感觉呢,一些公司的云平台也是基于 galaxy 的吧!...子系统,提升开发效率 (icode9.com): https://www.icode9.com/content-4-1373030.html [2]WSL2 + Docker + xfce4安装及使用_笔烽烟的博客

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【干货】Elasticsearch搜索调优权威指南(33)

全局序列号是一个数据结构,用于在 keyword 类型的属性执行 term 聚合。它们是延迟加载到内存中的,因为 Elasticsearch 不知道哪个属性会用于 term 聚合以及哪个属性不会。...静态配置项 index.store.preload 可以在 config/elasticsearch.yml 中设置: index.store.preload: ["nvd", "dvd"] 也可以在索引创建时针对索引库设置...: curl -XPUT 'ES_HOST:ES_PORT/my_index' -d ‘{ "settings": { "index.store.preload": ["nvd", "dvd...很有必要明确地告诉操作系统,哪些文件应当预加载到内存,这取决于使用 index.store.preload 设置的文件扩展。...如果文件系统缓存大小不足以负担所有数据的话,将大量索引或大量文件的数据预加载到文件系统缓存,将会使检索更慢。

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工具学习|如何使用小工具filestools给图片增加水印

1.1 安装filestools第三方库通过以下命令进行安装:复制代码pip install filestools -U 也可以使用阿里云加速(可能因为同步延迟,暂时无法下载到最新版):ini复制代码pip...1.4「curl请求使用」当我们安装完成filestools后,第二个命令就是curl2py,帮助文档如下:sql复制代码Aion.Liu $ curl2py -husage: curl2py [-h]...[-f FILE] [-o OUT] [-t] [-c]将curl网络请求命令转换成python的requests库请求代码,-f/-t/-o三个参数均没有指定时,结果将保存到剪切板中options:...cURL(bash)后,就可以通过curl2py命令将其转换为python代码。...先在谷歌游览器中复制网络抓到的网络请求cURL(bash):再执行命令将剪切板中curl请求命令转换为python代码(这里借用作者的windows下的方式):也可以直接在python代码中使用:swift

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Elasticsearch Index模块

可以设置index.store.preload来告诉操作系统在打开时将热点索引文件的内容加载到内存中。这个选项接受一个逗号分隔的文件扩展列表:扩展名在列表中的所有文件将在打开时预加载。...但是请注意,这可能会减慢索引的打开速度,因为只有在将数据加载到物理内存之后,索引才会可用。...静态设置的话可以这样设置: index.store.preload: ["nvd","dvd"] 或者在索引创建的时候设置: curl -X PUT"localhost:9200/my_index"-H'Content-Type...也就是说,translog是在Lucene内部处理完以后,确认请求之前写的。...默认每次请求以后就立即同步。如果在同步之前发生崩溃,那么一次同步之后的写操作也是会丢失的。

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Galaxy Release (v 22.01),新的颜色选择器

现在我们已经用一个新的上传方法取代了这个方法,这个方法将很快在所有的 Galaxy 公众服务器启用。这将使文件上传更加流畅,并且对网络故障和中断更加宽容!作为用户不需要做任何更改。...Python 3.6 正式成为 EOL,Galaxy 不再测试或维护兼容性。这个版本将是最后一个可以在 Paste 或 uWSGI 下运行的 Galaxy 版本。...config/galaxy.yml.sample:galaxy mapping.galaxy.mapping.enable_tool_source_display mapping.galaxy.mapping.galaxy_url_prefix...mapping.galaxy.mapping.tool_evaluation_strategy mapping.galaxy.mapping.tus_upload_store mapping.galaxy.mapping.vault_config_file...config/galaxy.yml.sample:galaxy mapping.galaxy.mapping.check_migrate_tools mapping.galaxy.mapping.enable_openid

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Anki Cozmo(Vector)人工智能机器人玩具部分文档

解决方案:将应用更新到您所有设备(Android,iOS和Amazon Fire)提供的最新版本。 问题:当我将Cozmo放在充电平台上时,Cozmo的屏幕不显示无线密码SSID或PSK。...iOS相关 问题:在iOS设备收到“无互联网”消息。 解决方案:由于Cozmo不使用互联网,因此这是正常预期现象的而不是问题。 问题:在iOS设备收到“安全建议”消息。...请按照此故障排除 ---- 手机应用: 苹果可以直接在App Store中下载,Anki Cozmo(3.0.0 488MB)Anki Vector Robot(1.1.0 68.9MB)。...了解您的设备是否适用于Anki的Cozmo的最简单方法是在Apple App Store、Google Play商店或Amazon Appstore中搜索,查找和下载Cozmo应用程序。...S9+ Galaxy S9 Galaxy S8+ Galaxy S8 Galaxy S7 Edge Galaxy S7 Galaxy S6 Edge Galaxy S6 Galaxy

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Spring Cloud构建微服务架构:分布式配置中心(加密解密)

我们可以从Oracle的官方网站中下载到它,它是一个压缩包,解压后可以看到下面三个文件: README.txt local_policy.jar US_export_policy.jar 我们需要将 local_policy.jar...:对请求的body内容进行解密的端点 可以尝试通过GET请求访问 /encrypt/status端点,我们将得到如下内容: { "description": "No key was installed...注意,这两个端点都是POST请求,加密和解密信息需要通过请求体来发送。...比如,以 curl命令为例,我们可以通过下面的方式调用加密与解密端点: $ curl localhost:7001/encrypt -d didispace 3c70a809bfa24ab88bcb5e1df51cb9e4dd4b8fec88301eb7a18177f1769c849ae9c9f29400c920480be2c99406ae28c7...}/config-server.keystore encrypt.key-store.alias=config-server encrypt.key-store.password=111111 encrypt.key-store.secret

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触类旁通Elasticsearch:管理

用户可以通过hot_threads API请求添加参数,来调整信息收集的过程: curl -XGET '172.16.1.127:9200/_nodes/hot_threads?...当运行查询的时候,ES将字段值加载到内存中并将它们保存在字段数据缓存中,用于之后的请求。由于在内存中构建这样的结构是成本很高的操作,不希望ES对于每次请求都执行这个动作,这样性能的提升才会明显。...它们通过反省某个查询所请求的数据字段,来确定这些数据加载到缓存后是否会使得整体的规模超出缓存的大小限制。...索引级别的限流配置方法类似,不过是使用index.store.throttle.type属性。此外,索引级别的设置也允许值为node,这样的话它也会将限流设置运用在整个节点。...对于节点的限流,使用 indices.store.throttle.max_bytes_per_sec,索引级别的限流使用index.store.throttle.max_bytes_per_sec。

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ElasticSearch教程_Elasticsearch原理

例如,一个包含10亿条文档占用1TB磁盘空间的索引可能不适合在单个节点,或者可能太慢而不能单独处理来自单个节点的搜索请求。...出于这个原因,很重要的一个点是一个副本从来不会被分配到与它复制的原始分片相同节点。也就是说,副本是放到另外的节点的。 它允许扩展搜索量/吞吐量,因为搜索可以在所有副本并行执行。...检查Elasticsearch是否正在运行: curl http://localhost:9200/ The REST API 集群健康 请求curl -X GET "localhost:9200...下面看一下集群的节点列表: 请求curl -X GET "localhost:9200/_cat/nodes?.../1" curl -X DELETE "localhost:9200/customer" 如果我们仔细研究上面的命令,我们实际可以看到如何在Elasticsearch中访问数据的模式。

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