配套代码和用到的数据都会开源到这个仓库，欢迎大家 Starhttps://github.com/DesertsX/d3-tutorial 前言 前两篇文章「手把手带你上手D3.js数据可视化系列（一）...原本想用书籍（或电影）这类数据集，这样年末大家整理看过的书单（如果大家真的看了很多书的话，doge）时或许就能参照本文代码，以可视化的方式清晰明了地展示看过的书都是什么类型的。...这里只需知道分区数据是从Up主个人主页“投稿”栏下的“视频”处获取的，并且简单地以数量最多的区作为Up主所属分区，不一定很准确，仅作为教程里演示的例子而已。...这里先看下最终效果图， 基础代码 这次的样式和前两篇的略有不同，主要是居中放置 div#chart 元素，并且后续 SVG 画布采取固定宽高方式设置。不过这些都不是很关键，看自己需求怎么设置都行。...fieldCount[d]++ } else { fieldCount[d] = 1 } }) // console.log(fieldCount) 将统计结果的对象格式通过
degPatterns 工具使用基于基因间成对相关性的层次聚类方法，然后切割层次树以生成具有相似表达谱的基因组。该工具以优化集群多样性的方式切割树，使得集群间的可变性 > 集群内的可变性。...在我们开始聚类之前，我们将首先对我们的 rlog 转换归一化计数进行子集化，以仅保留差异表达的基因 (padj < 0.05)。...在我们的例子中，对 7K 基因运行聚类可能需要一些时间，因此出于类演示目的，我们将子集化以仅保留按 p 调整值排序的前 1000 个基因。...class(clusters)我们可以使用名称（簇）查看列表中存储了哪些对象。里面存储了一个数据框。这是主要结果，让我们看一下。第一列包含基因，第二列包含它们所属的簇编号。...# Let's see what is stored in the `df` componenthead(clusters$df)由于我们对第 1 组感兴趣，我们可以过滤数据框以仅保留那些基因：# Extract
degPatterns 工具使用基于基因间成对相关性的层次聚类方法，然后切割层次树以生成具有相似表达谱的基因组。该工具以优化集群多样性的方式切割树，使得集群间的可变性 > 集群内的可变性。...在我们开始聚类之前，我们将首先对我们的 rlog 转换归一化计数进行子集化，以仅保留差异表达的基因 (padj < 0.05)。...在我们的例子中，对 7K 基因运行聚类可能需要一些时间，因此出于类演示目的，我们将子集化以仅保留按 p 调整值排序的前 1000 个基因。...class(clusters) 我们可以使用名称（簇）查看列表中存储了哪些对象。里面存储了一个数据框。这是主要结果，让我们看一下。第一列包含基因，第二列包含它们所属的簇编号。...# Let's see what is stored in the `df` component head(clusters$df) 由于我们对第 1 组感兴趣，我们可以过滤数据框以仅保留那些基因：
它是什么？ 在你看到彭博社最好和最差可视化数据前你不会看到这么多数据：彭博社排名团队分析、组织和可视化的数据都展现给你，并且只包含没有编辑调整或带有观点的透明、基于事实的数据。 数据从哪里来？...这个可视化还包含住房供给、医疗保健、能源生产和人口统计数据等等。 数据从哪里来？...据该网站，“可视化美国当前和历史经济数据和分析，基于经济健康指数State-by-State包含来自美国劳工统计局的最新失业人数（每月更新），以及住房供给、医疗保健、能源生产和人口统计数据等的现状数据。...它是什么？ 这个可视化通过显示美国人花现金的速度增加有多快，来告诉你美国人花现金的方式和地点。因为对美国流行的消费支出可视化感兴趣，Retale创建了Retail in Real Time。...基于彭博社的调查，可视化结果显示了佛罗里达的大学在通过学生审核在请代言人上的花费。 数据从哪里来？ 数据源来自彭博社调查。 11.互联网图 ? 它是什么？
从数据获得信息的最佳方式之一是，通过视觉化方式，快速抓住要点信息。另外，通过视觉化呈现数据，也揭示了令人惊奇的模式和观察结果，是不可能通过简单统计就能显而易见看到的模式和结论。...毋容置疑D3.js是最好的数据可视化工具库。D3.js运行在JavaScript上，并使用HTML，CSS和SVG。D3.js是开源工具，使用数据驱动的方式创建漂亮的网页。D3.js可实现实时交互。...Ember Charts – 顾名思义是一种基于Ember.js框架和使用d3.js的可视化工具。Ember Charts以绘制时间序列图，柱状图，饼图和散点图为主。它非常优易于扩展。...N3-charts是一种基于AngularJS框架的工具。它建立在D3.js之上，帮助您创建简单的互动图表。N3-charts是一种小型化的图表工具，不适用于大型项目。 23.Sigma JS ?...该库使用SVG作为输出方式来生成图形和动画效果，拥有非常完整的图形处理API，可以使得你更加方便的处理图形效果。它还支持渐变和过滤器（灰度、模糊、不透明度等）等效果。
使用limit()方法对流中的元素进行限制操作，仅保留前3个元素，返回一个新的只包含前3个元素的Stream流collect。...使用Stream流中的limit()方法可以快速地对集合中的元素进行截取操作，仅保留前N个元素。...在这段代码中，集合中包含了5个整数，使用limit(3)方法仅保留了前3个整数，返回一个新的只包含前3个元素的List集合。...运行该示例代码，输出结果为：[1, 2, 3]，即仅包含前3个元素的整数List集合。...如果 n % 2 的结果是 0，就把 n 这个数保留下来，否则就过滤掉。 Count(计数) count()方法可以返回流中的元素数。
该数据集仅包含了评价过20部以上电影的用户评价数据，没有评分的电影数据占所有数据的比重（稀疏度）为94%。...过程与结果分析 (1)确定最佳聚类数 首先，通过比较不同聚类数相应的聚类有效性函数值来选出最佳聚类数cmax。实验结果如图所示。 图中的横坐标为聚类数，纵坐标为相应的4个聚类有效性函数值。...n=1:5:80%########最近邻数 mae(j)=0;%mae为最近邻为n的情况下的最小均方误差 k=0;%计数变量 for t=1:size(udatatest,1)...%D为相似系数矩阵,i为第i个目标用户，n为前n个最相似的用户数,输出为前n个用户的坐标信息 [a,b]=sort(D(i,:),'descend');%a为从高到低排的相似系数 top=b(1:n);...for w=1:size(udata,2) I=topn(CS,q,n);%D为相似系数矩阵,i为第i个目标用户(即为q)，n为前n个最相似的用户数(默认为3),输出为最近邻居用户的前
实际上，该算法分为三个步骤： 过滤：使用过滤函数f将数据点映射到ℝ中。 覆盖：以重叠的间隔覆盖过滤器值。 聚类：对于每个间隔，将聚类算法应用于在该间隔中映射的观测值。...过滤器功能的选择对Mapper结果有很大影响，因为过滤器值远的点没有机会聚在一起。因此，过滤器功能用作接近度的粗略测量。 在上图中，作者使用了height函数，但是原则上任何函数都可以完成这项工作。...但是一些常见的选择是： 轴向投影 PCA 偏心率 密度 熵 2）覆盖 以覆盖所有过滤器值的方式将图像空间划分为重叠的间隔（如果m> 1则为间隔的乘积）。称这种结构为封面。...在上面的示例中，有4个间隔为25％的重叠。 3）聚类 在最后一步中，在封面的每个间隔上连续执行聚类。通过每次通过过滤功能获取间隔的前像，可以在原始空间上进行聚类。...在这一点上，每个聚类代表图的一个节点，并且边缘对应于具有共同观察结果的聚类。 教程：使用Mapper检索圣诞老人 直观地了解Mapper的工作方式的最佳方法是使用它并“播放”其参数。
布隆过滤器需要以下几种输入： m：位阵列的大小 n：预计要插入的元素数量（插入次数） p：误报率 使用以下公式可以确定哈希函数的最佳数量 k： 给定误报率 p 和预计的插入次数 n，位阵列的长度可以通过下式计算...HyperLogLog 计数器可以仅使用 1.5KB 的内存计算出 10 亿个不同的项，同时其精确度为 2％。...由于使用单个计数器时方差非常高，为了获得更好的估计，我们使用哈希值的前几位将数据拆分为 m 个子流。计数器分别由 m 个寄存器维护，其中每个寄存器具有 4 字节的倍数大小的存储空间。...例如，对于m = 4， 使用前两位（00,01,10,11）将元素分成 m 个流，然后将其丢弃。每个寄存器存储包含最大 0k 1 前缀的其余哈希比特。...然后将 m 个寄存器中的值平均起来以获得基数估计。 HyperLogLog 算法使用调和均值（Harmonic mean）来将结果归一化。该算法还可以根据小的值与非常大的值进行调整。
数据可视化正在帮助全球公司识别模式，预测结果并提高业务回报。可视化是数据分析的一个重要方面。简而言之，数据可视化以可视格式传达表格或空间数据的结果。图像有能力吸引注意力并清晰地传达想法。...MyHeatMap MyHeatMap是一个以交互方式查看地理数据的免费工具。该工具的免费版本仅提供公共地图，您只能为每个免费地图添加20个数据点。该工具可以使用颜色编码的热图轻松理解数据。...该工具可用于通过邮政编码解释客户人口统计数据等数据。 9. Palladio Palladio是一款免费工具，旨在可视化复杂的历史数据。它具有地图视图，图表视图，列表视图和图库视图等功能。...D3.js D3.js 是一个免费的JavaScript库，可以帮助您使用数据创建图像。该工具使您可以将任意数据连接到文档对象模型（DOM），然后将数据驱动的转换应用于文档。...如果使用得当，数据分析和可视化有能力改变人们的生活方式。
过滤低质量的细胞 质量控制的第一步是过滤低质量的细胞。当细胞检测到的基因数量较少、计数深度较低且线粒体计数较高时，细胞膜可能会破裂，这表明细胞正在死亡。...但是如果仅考虑一个变量可能会造成生物学误差，共同考虑三个 QC 协变量至关重要。例如，线粒体计数相对较高的细胞可能参与呼吸过程，不应被过滤掉。...双细胞由同型（homotypic）与异型（heterotypic）所构成 同型：同型通常被认为是不影响下游分析的，因为其是由一类相同的细胞中的两个所构成，所以这部分细胞不是我们所需要过滤的对象 异型：异型通常是由来自两类不同的细胞所构成的...这样做的最终结果是产生一种背景污染，这种污染表现的不是液滴中所含细胞的表达，而是包含细胞的溶液。...又是什么？
JS堆对象 它既包括由JS程序自身构造的对象实例，也包含由系统程序从addon内调用N-API接口（比如，napi_create_object()）实例化的JS对象。...由此，@Rustacean 需要在addon业务代码中额外实现部分本该由垫片程序完成的“公共服务”功能，包括但不限于： 徒手维护N-API引用计数智能指针，以“锁住”JS堆对象不被JS VM的GC回收...调用N-API程序接口构造可层叠嵌套的作用域【块】 — 缩短JS堆对象的生命周期。 这的确是一次接触底层“自己动手丰衣足食”的机会，但绝对不是什么令人愉快的开发体验。...(napi_reference_unref( , , result // 引用计数减一之后的结果数值 )).unwrap...判断减一后的最新引用计数值是否已经归零。 if *result == 0 { // 当且仅当不再有任何 N-API 引用复本还指向该 JS 堆对象时， // 3.
这些 BAM 文件被转换回 FASTQ 文件，然后通过 Cell Ranger 运行以获得将使用的计数数据。...由于样本是 PBMC，预计包含免疫细胞，例如：B细胞T细胞NK细胞单核细胞巨噬细胞巨核细胞（可能）推荐在质控或分析前，对自己的样本有充分的了解，这对于后续的分析十分有帮助。3....BAM alignment files: 用于可视化映射读取和重新创建FASTQ文件的文件（如果需要）filtered_feature_bc_matrix:包含使用 Cell Ranger 过滤的数据构建计数矩阵所需的所有文件的文件夹...raw_feature_bc_matrix: 包含使用原始未过滤数据构建计数矩阵所需的所有文件的文件夹虽然Cell Ranger 对表达计数执行过滤，但希望执行自己的 QC 和过滤。...因此，为了使数据导入R更有效，可以使用 for循环，它将为给定的每个输入迭代一系列命令，并为每个样本创建 seurat对象。# 仅测试，无法运行。
由于每个步骤固有的变异性，相同细胞的计数深度结果却可能不同。因此，当基于计数数据比较细胞间的基因表达时，任何差异可能仅由采样效应（ sampling effects.）引起。...该方法的变体使用不同的因子或数据集中每个细胞的中位计数深度缩放。CPM 标准化假设数据集中的所有细胞最初包含相同数量的 mRNA 分子，计数深度差异仅由于取样产生。...即使在 QC 步骤中过滤掉这些零计数基因后，单细胞数据集的特征空间也可以有超过 15000 个维度。...换句话说，细胞表达谱所在的生物流形可以用比基因数量少得多的维度来充分描述。降维旨在找出这些维度。 降维方法主要有两个目标：可视化和提取主要变化。可视化是尝试以二维或三维的方式对数据集进行最佳描述。...通常，PCA 通过其前 N 个主成分汇总数据集，其中 N 可以通过肘部启发式（见图 4F）或基于置换测试的 jackstraw 方法（Chung Storey, 2015; Macosko et al,
，运行如下命令安装：install.packages("包的名字")1.2 创建Seurat对象对于之前从CellRanger得到的比对结果，读取sample/outs/filtered_feature_bc_matrix...2.3 数据过滤subset函数用于取子集，subset(x, subset, select, drop = FALSE, …)，x表示操作对象，subset表示所取子集的逻辑值pbmc <- subset...每个细胞的功能计数除以该细胞的总计数，再乘以scale.factor。没有应用log转换。对于每百万计数(CPM)设置规模。...refinement；3使用SLM算法；4使用Leiden算法（注：4需要额外安装插件）n.start: 随机开始的数量，默认是10random.seed: 随机数种子，默认是05.4查看前5个细胞的聚类....1 = 5, ident.2 = c(2, 3), min.pct = 0.25)head(cluster5.markers, n = 5)# 与所有其他亚群相比，找到每个亚群的标记，仅报告阳性细胞pbmc.markers
这些 BAM 文件被转换回 FASTQ 文件，然后通过 Cell Ranger 运行以获得将使用的计数数据。...由于样本是 PBMC，预计包含免疫细胞，例如： B细胞 T细胞 NK细胞 单核细胞 巨噬细胞 巨核细胞（可能） 推荐在质控或分析前，对自己的样本有充分的了解，这对于后续的分析十分有帮助。 3....BAM alignment files: 用于可视化映射读取和重新创建FASTQ文件的文件（如果需要） **filtered_feature_bc_matrix:**包含使用 Cell Ranger 过滤的数据构建计数矩阵所需的所有文件的文件夹...raw_feature_bc_matrix: 包含使用原始未过滤数据构建计数矩阵所需的所有文件的文件夹 虽然 Cell Ranger 对表达计数执行过滤，但希望执行自己的 QC 和过滤。...因此，为了使数据导入R更有效，可以使用 for循环，它将为给定的每个输入迭代一系列命令，并为每个样本创建 seurat 对象。 # 仅测试，无法运行。
合并分片结果 db.collection.find().explain(verbose) explain(）输出一个以文档形式展现的执行计划，可以包括统计信息(可选...MongoDB运行查询优化器对当前的查询进行评估并选择一个最佳的查询计划 executionStats模式 mongoDB运行查询优化器对当前的查询进行评估并选择一个最佳的查询计划进行执行...对于那些被拒绝的执行计划，不返回其统计信息 allPlansExecution模式 该模式是前2种模式的更细化，即会包括上述2种模式的所有信息...即按照最佳的执行计划执行以及列出统计信息，而且还会列出一些候选的执行计划 如果有多个查询计划 ，executionStats信息包括这些执行计划的部分统计信息...//解析查询，即过滤条件是什么 "age" : { //此处为age=26
近段时间，又有不少人认为「数据」才是那些当前最佳的闭源模型的关键，不管是 LLM、VLM 还是扩散模型。...当计算预算少时（更少重复），在 QQT 权衡下质量优先，如图 1 中低计算量下的激进过滤（E）的最佳性能所示。...至于基础的未过滤数据池，他们选用了近期的数据整编基准 Datacomp 的「中等」规模版本。该数据池包含 128M 样本。他们使用了 18 个不同的下游任务，评估的是模型的零样本性能。...在 32M 计算规模时，高度激进的过滤策略（根据 CLIP 分数仅保留前 10-20%）得到的结果最好，而最不激进的保留前 40% 的过滤方法表现最差。...数据过滤的扩展律 该团队首先用数学方式定义了效用（utility）。 他们的做法不是估计 n 的样本在训练结束时的损失，而是考虑一个样本在训练阶段的任意时间点的瞬时效用。
Stream流是什么？...执行中间操作：对数据进行处理 执行终止操作：返回最终的结果 生成Stream流 生成Stream流的方式有三种，分别是 List sourceList = Arrays.asList...下面的方法均是无状态操作 方法 说明 map() 将已有元素转换为另一个对象类型，一对一逻辑 filter() 按照条件过滤符号要求的元素 peek() 对Stream流中的每个元素进行逐个遍历处理 unodered...下面方法是有状态操作 方法 说明 distinct() 对stream中所有元素进行去重 sorted() 结果排序 limit(n) 仅保留集合前面指定个数的元素 skip(n) 跳过集合前面指定个数的元素...个数据 List collect = stream1.limit(3).collect(Collectors.toList()); //skip:跳过前n个数据 List
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