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使用Dask DataFrames 解决Pandas中并行计算问题

如何将20GBCSV文件放入16GBRAM中。 如果你对Pandas有一些经验,并且你知道它最大问题——它不容易扩展。有解决办法吗? 是的-Dask DataFrames。...大多数Dask API与Pandas相同,但是Dask可以在所有CPU内核并行运行。它甚至可以在集群运行,但这是另一个话题。 今天你将看到Dask在处理20GB CSV文件时比Pandas快多少。...让我们对Dask做同样事情。...你可以看到下面的总运行时间: 让我们来比较一下不同点: 这并不是一个显著区别,但Dask总体是一个更好选择,即使是对于单个数据文件。...作者:Dario Radečić 原文地址:https://towardsdatascience.com/dask-dataframes-how-to-run-pandas-in-parallel-with-ease-b8b1f6b2646b

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用于ETLPython数据转换工具详解

从本质讲,Dask扩展了诸如Pandas之类通用接口,供在分布式环境中使用-例如,Dask DataFrame模仿了。...优点 可扩展性— Dask可以在本地计算机上运行并扩展到集群 能够处理内存不足数据集 即使在相同硬件,使用相同功能也可以提高性能(由于并行计算) 最少代码更改即可从Pandas切换 旨在与其他...DataFrames来提高Pandas效率。...优点 可伸缩性— Ray比Modin提供更多 完全相同功能(即使在相同硬件)也可以提高性能 最小代码更改即可从Pandas切换(更改import语句) 提供所有Pandas功能-比Dask更多...优点 可扩展性和对更大数据集支持 就语法而言,Spark DataFrames与Pandas非常相似 通过Spark SQL使用SQL语法进行查询 与其他流行ETL工具兼容,包括Pandas(您实际可以将

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是时候和pd.read_csv(), pd.to_csv()说再见了

尽管我从不赞成一开始就使用 Pandas 创建 CSV(请阅读https://towardsdatascience.com/why-i-stopped-dumping-dataframes-to-a-csv-and-why-you-should-too-c0954c410f8f...因此,在这篇文章中,我们将探索Dask和DataTable,这两个最受数据科学家欢迎类 Pandas 库。...我们将根据 Pandas、Dask 和 Datatable 在以下参数上表现对它们进行排名: 1....但是,当我们超过一百万行时,Dask 性能会变差,生成 Pandas DataFrame 所花费时间要比 Pandas 本身多得多。 3....如果您阅读了我之前帖子(我在上面链接过,或者您可以在https://medium.com/towards-data-science/why-i-stopped-dumping-dataframes-to-a-csv-and-why-you-should-too-c0954c410f8f

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独家 | 是时候和pd.read_csv(), pd.to_csv()说再见了

尽管我从不赞成一开始就使用 Pandas 创建 CSV(请阅读https://towardsdatascience.com/why-i-stopped-dumping-dataframes-to-a-csv-and-why-you-should-too-c0954c410f8f...因此,在这篇文章中,我们将探索Dask和DataTable,这两个最受数据科学家欢迎类 Pandas 库。...我们将根据 Pandas、Dask 和 Datatable 在以下参数上表现对它们进行排名: 1....但是,当我们超过一百万行时,Dask 性能会变差,生成 Pandas DataFrame 所花费时间要比 Pandas 本身多得多。 3....如果您阅读了我之前帖子(我在上面链接过,或者您可以在https://medium.com/towards-data-science/why-i-stopped-dumping-dataframes-to-a-csv-and-why-you-should-too-c0954c410f8f

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谁是PythonRJulia数据处理工具库中最强武器?

Python/R/Julia中数据处理工具多如牛毛「如pandas、spark、DataFrames.jl、polars、dask、dplyr、data.table、datatable等等」,如何根据项目需求挑选趁手武器...7种Python工具 dask pandas datatable cuDF Polars Arrow Modin 2种R工具 data.table dplyr 1种Julia工具...DataFrames.jl 3种其它工具 spark ClickHouse duckdb 评估方法 分别测试以上工具在在0.5GB、5GB、50GB数据量下执行groupby、join效率..., 详细代码,见每个柱子图上方, join性能 比较以下各种需求效率, 详细代码,见每个柱子图上方, ---- 评估结果 groupby 可以看到Python中Polars、R中data.table...、Julia中DataFrame.jl等在groupby时是一个不错选择,性能超越常用pandas,详细, 0.5GB数据 groupby 5GB数据 groupby 50GB数据 groupby

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安利一个Python大数据分析神器!

官方:https://dask.org/ Dask支持PandasDataFrame和NumpyArray数据结构,并且既可在本地计算机上运行,也可以扩展到在集群运行。...基本,只要编写一次代码,使用普通Pythonic语法,就可在本地运行或部署到多节点集群。这本身就是一个很牛逼功能了,但这还不是最牛逼。...我觉得Dask最牛逼功能是:它兼容大部分我们已经在用工具,并且只需改动少量代码,就可以利用自己笔记本电脑已有的处理能力并行运行代码。...这些集合类型中每一个都能够使用在RAM和硬盘之间分区数据,以及分布在群集中多个节点数据。...对于原始项目中大部分API,这些接口会自动为我们并行处理较大数据集,实现不是很复杂,对照Daskdoc文档即可一步步完成。

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Spark vs Dask Python生态下计算引擎

本文基于Gurpreet Singh大佬在 Spark+AI SUMMIT 2020 公开课编写 0x00 对于 Python 环境下开发数据科学团队,Dask 为分布式分析指出了非常明确道路,但是事实大家都选择了...Dask 是一个纯 Python 框架,它允许在本地或集群运行相同 Pandas 或 Numpy 代码。...Spark vs Dask 首先先上Dask和Spark架构设计图~ [设计架构] 生态 Dask 对于 Python 生态中 Numpy、Pandas、Scikit-learn等有很好兼容性,并且在...性能 Dask dataframe 基本由许多个 pandas dataframe 组成,他们称为分区。...Spark 中也有Spark-mllib 可以高效执行编写好机器学习算法,而且可以使用在spark worker执行sklearn任务。能兼容 JVM 生态中开源算法包。

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2022年Python顶级自动化特征工程框架⛵

特征:数据中抽取出来对结果预测有用信息。特征工程:使用专业背景知识和技巧处理数据,使得特征能在机器学习算法发挥更好作用过程。...自动化特征工程是很有意义一项技术,它能使数据科学家将更多时间花在机器学习其他环节,从而提高工作效率和效果。...Featuretools 核心是 Deep Feature Synthesis(DFS) ,它实际是一种特征工程方法,它能从单个或多个 DataFrame中构建新特征。...DFS 通过 EntitySet 指定 Feature primitives 创建特征。例如,primitives中mean函数将对变量在聚合时进行均值计算。...图片图片 ② 递归 XGBoost一步SULOV中识别的变量递归地传递给 XGBoost,通过xgboost选择和目标列最相关特征,并组合它们,作为新特征加入,不断迭代这个过程,直到生成所有有效特征

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有比Pandas 更好替代吗?对比Vaex, Dask, PySpark, Modin 和Julia

您可以在GitHub查看完整代码 pandas_alternatives_POC.ipynb —探索dask,spark,vaex和modin julia_POC.ipynb —探索julia...即使在单台PC,也可以利用多个处理核心来加快计算速度。 Dask处理数据框模块方式通常称为DataFrame。...但是dask基本缺少排序选项。那是因为并行排序很特殊。Dask仅提供一种方法,即set_index。按定义索引排序。...Dask对排序几乎没有支持。甚至官方指导都说要运行并行计算,然后将计算出结果(以及更小结果)传递给Pandas。 即使我尝试计算read_csv结果,Dask在我测试数据集也要慢30%左右。...但是要求必须在PC安装Java。 Spark性能 我使用了Dask部分中介绍pySpark进行了相同性能测试,结果相似。 ? 区别在于,spark读取csv一部分可以推断数据架构。

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干货 | 数据分析实战案例——用户行为预测

具体操作就是对每个分区并 行或单独操作(多个机器的话也可以并行),然后再将结果合并,其实从直观也能推出Dask肯定是这么做。...dask数表处理库 import sys # 外部参数获取接口 面对海量数据,跑完一个模块代码就可以加一行gc.collect()来做内存碎片回收,Dask Dataframes与Pandas...Dataframes具有相同API gc.collect() 42 # 加载数据 data = dd.read_csv('UserBehavior_all.csv')# 需要时可以设置blocksize...其实dask使用了一种延迟数 据加载机制,这种延迟机制类似于python迭代器组件,只有当需要使用数据时候才会去真正加载数据。...(图中周五访问量有 升,但成交量出现下降,推测此现象可能与周末活动导致周五推迟成交有关。)

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【Python 数据科学】Dask.array:并行计算利器

1.2 Dask.array概述 Dask.array是Dask提供类似于Numpy数组数据结构,它允许用户在大规模数据集执行Numpy-like操作。...这使得Dask能够优化计算顺序,并在需要时执行计算。 4.2 Dask任务调度器 Dask使用任务调度器来执行计算图中任务。任务调度器负责将任务分发到合适计算节点,并监控任务执行进度。...创建了一个分布式客户端,并将Dask.array计算任务提交到分布式集群执行。...在分布式计算中,Dask会将任务分发到不同工作节点执行,并监控任务执行进度。每个工作节点会执行其分配到任务,并将结果返回给调度器。...)) # 使用分布式集群客户端执行计算 result = arr * 2 result = result.compute() 在这个例子中,我们使用Dask.array在分布式集群执行计算,从而实现了并行计算

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仅需添加一行代码,即可让Pandas加速四倍 | Pandas on Ray

这是一个很大瓶颈,特别是对体量更大DataFrames,资源缺失更加突出。 理论上来讲,并行计算就如同在所有可用CPU内核中不同数据点中计算一样简单。...Modin可以切割DataFrame横列和纵列,任何形状DataFrames都能平行处理。 假如拿到是很有多列但只有几行DataFrame。...在并行处理时,Modin会从Dask或者Ray工具中任选一个来处理繁杂数据,这两个工具都是PythonAPI平行运算库,在运行Modin时候可以任选一个。目前为止,Ray应该最为安全且最稳定。...Dask后端还处在测试阶段。 至此,理论说够多了。接下来聊聊代码和速度基准点。 基准测试Modin速度 pip是安装Modin最简单方法。...如果想用Modin来运行一个尚未加速函数,它还是会默认在Pandas中运行,来保证没有任何代码错误。 在默认设置下,Modin会使用机器所有能用CPU。

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开发ETL为什么很多人用R不用Python

对比python中datatable、pandas、dask、cuDF、modin,R中data.table以及spark、clickhouse 3....目前已有研究 H2O团队一直在运行这个测试项目, 其中: Python用到了:(py)datatable, pandas, dask, cuDF(moding.pandas在下文作者亲自测试了下); R...: data.table, dplyr; julia: DataFrames.jl; clickhouse; spark 测试内容有groupby、join、sort等。...测试数据长这样: 废话不多说,先看部分结果截图吧。 上图截取是复杂groupby问题中对于5G与50G数据各ETL工具用时情况,项目运行服务器内存为128G,核数40。...(id4, id5)] modin用时174秒,由于modin暂不支持多列groupby,实际还是用pandasgroupby x.groupby([‘id4’,‘id5’]).agg({‘v3

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并行计算框架Polars、Dask数据处理性能对比

下面是每个库运行五次结果: Polars Dask 2、中等数据集 我们使用1.1 Gb数据集,这种类型数据集是GB级别,虽然可以完整加载到内存中,但是数据体量要比小数据集大很多。...Polars Dask 3、大数据集 我们使用一个8gb数据集,这样大数据集可能一次性加载不到内存中,需要框架处理。...由于polar和Dask都是使用惰性运行,所以下面展示了完整ETL结果(平均运行5次)。 Polars在小型数据集和中型数据集测试中都取得了胜利。...但是,Dask在大型数据集平均时间性能为26秒。 这可能和Dask并行计算优化有关,因为官方文档说“Dask任务运行速度比Spark ETL查询快三倍,并且使用更少CPU资源”。...上面是测试使用电脑配置,Dask在计算时占用CPU更多,可以说并行性能更好。 作者:Luís Oliveira

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什么是Python中Dask,它如何帮助你进行数据分析?

事实Dask创建者Matthew Rocklin先生确认Dask最初是为了并行化Pandas和NumPy而创建,尽管它现在提供了比一般并行系统更多好处。...Dask数据帧非常适合用于缩放pandas工作流和启用时间序列应用程序。此外,Dask阵列还为生物医学应用和机器学习算法提供多维数据分析。...可扩展性 Dask如此受欢迎原因是它使Python中分析具有可扩展性。 这个工具神奇之处在于它只需要最少代码更改。该工具在具有1000多个核弹性集群运行!...这就是为什么运行在10tb公司可以选择这个工具作为首选原因。 Dask还允许您为数据数组构建管道,稍后可以将其传输到相关计算资源。...熟悉API:这个工具不仅允许开发人员通过最小代码重写来扩展工作流,而且还可以很好地与这些工具甚至它们API集成。 向外扩展集群:Dask计算出如何分解大型计算并有效地将它们路由到分布式硬件

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一行代码将Pandas加速4倍

自然,这是一个很大瓶颈,特别是对于较大 DataFrames,计算时就会表现出资源缺乏。 理论,并行计算就像在每个可用 CPU 核不同数据点应用计算一样简单。...在这种情况下,“分区管理器”将以它能找到最优方式执行分区和分配到 CPU 核。它是非常灵活。 为了在执行并行处理时完成大量繁重工作,Modin 可以使用 Dask 或 Ray。...它们都是使用 Python api 并行计算库,你可以选择一个或另一个在运行时与 Modin 一起使用。Ray 目前是最安全一个,因为它更稳定 —— Dask 后端是实验性。...连接多个 DataFrames 是 panda 中一个常见操作 — 我们可能有几个或多个包含数据 CSV 文件,然后必须一次读取一个并连接它们。...在有些情况下,panda 实际比 Modin 更快,即使在这个有 5,992,097(近 600 万)行大数据集也是如此。下表显示了我进行一些实验中 panda 与 Modin 运行时间。

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