如何将20GB的CSV文件放入16GB的RAM中。 如果你对Pandas有一些经验,并且你知道它最大的问题——它不容易扩展。有解决办法吗? 是的-Dask DataFrames。...大多数Dask API与Pandas相同,但是Dask可以在所有CPU内核上并行运行。它甚至可以在集群上运行,但这是另一个话题。 今天你将看到Dask在处理20GB CSV文件时比Pandas快多少。...让我们对Dask做同样的事情。...你可以看到下面的总运行时间: 让我们来比较一下不同点: 这并不是一个显著的区别,但Dask总体上是一个更好的选择,即使是对于单个数据文件。...作者:Dario Radečić 原文地址:https://towardsdatascience.com/dask-dataframes-how-to-run-pandas-in-parallel-with-ease-b8b1f6b2646b
本篇介绍 8 个可以替代pandas的库,在加速技巧之上,再次打开速度瓶颈,大大提升数据处理的效率。 1. Dask Dask在大于内存的数据集上提供多核和分布式并行执行。...在Dask中,一个DataFrame是一个大型且并行的DataFrame,由许多较小的 pandas DataFrames组成,沿索引拆分。...这些 pandas DataFrames 可以存在于单个机器上的磁盘中计算远超于内存的计算,或者存在集群中的很多不同机器上完成。...一个 Dask DataFrame 操作会触发所有 Pandas DataFrames 的操作。...Polars Polars是使用 Apache Arrow Columnar Format 作为内存模型在 Rust 中实现的速度极快的 DataFrames 库。
从本质上讲,Dask扩展了诸如Pandas之类的通用接口,供在分布式环境中使用-例如,Dask DataFrame模仿了。...优点 可扩展性— Dask可以在本地计算机上运行并扩展到集群 能够处理内存不足的数据集 即使在相同的硬件上,使用相同的功能也可以提高性能(由于并行计算) 最少的代码更改即可从Pandas切换 旨在与其他...DataFrames来提高Pandas的效率。...优点 可伸缩性— Ray比Modin提供的更多 完全相同的功能(即使在相同的硬件上)也可以提高性能 最小的代码更改即可从Pandas切换(更改import语句) 提供所有Pandas功能-比Dask更多的...优点 可扩展性和对更大数据集的支持 就语法而言,Spark DataFrames与Pandas非常相似 通过Spark SQL使用SQL语法进行查询 与其他流行的ETL工具兼容,包括Pandas(您实际上可以将
尽管我从不赞成一开始就使用 Pandas 创建 CSV(请阅读https://towardsdatascience.com/why-i-stopped-dumping-dataframes-to-a-csv-and-why-you-should-too-c0954c410f8f...因此,在这篇文章中,我们将探索Dask和DataTable,这两个最受数据科学家欢迎的类 Pandas 库。...我们将根据 Pandas、Dask 和 Datatable 在以下参数上的表现对它们进行排名: 1....但是,当我们超过一百万行时,Dask 的性能会变差,生成 Pandas DataFrame 所花费的时间要比 Pandas 本身多得多。 3....如果您阅读了我之前的帖子(我在上面链接过,或者您可以在https://medium.com/towards-data-science/why-i-stopped-dumping-dataframes-to-a-csv-and-why-you-should-too-c0954c410f8f
Python/R/Julia中的数据处理工具多如牛毛「如pandas、spark、DataFrames.jl、polars、dask、dplyr、data.table、datatable等等」,如何根据项目需求挑选趁手的武器...7种Python工具 dask pandas datatable cuDF Polars Arrow Modin 2种R工具 data.table dplyr 1种Julia工具...DataFrames.jl 3种其它工具 spark ClickHouse duckdb 评估方法 分别测试以上工具在在0.5GB、5GB、50GB数据量下执行groupby、join的效率..., 详细代码,见每个柱子图上方, join性能 比较以下各种需求的效率, 详细代码,见每个柱子图上方, ---- 评估结果 groupby 可以看到Python中的Polars、R中的data.table...、Julia中的DataFrame.jl等在groupby时是一个不错的选择,性能超越常用的pandas,详细, 0.5GB数据 groupby 5GB数据 groupby 50GB数据 groupby
官方:https://dask.org/ Dask支持Pandas的DataFrame和NumpyArray的数据结构,并且既可在本地计算机上运行,也可以扩展到在集群上运行。...基本上,只要编写一次代码,使用普通的Pythonic语法,就可在本地运行或部署到多节点集群上。这本身就是一个很牛逼的功能了,但这还不是最牛逼的。...我觉得Dask的最牛逼的功能是:它兼容大部分我们已经在用的工具,并且只需改动少量的代码,就可以利用自己笔记本电脑上已有的处理能力并行运行代码。...这些集合类型中的每一个都能够使用在RAM和硬盘之间分区的数据,以及分布在群集中多个节点上的数据。...对于原始项目中的大部分API,这些接口会自动为我们并行处理较大的数据集,实现上不是很复杂,对照Dask的doc文档即可一步步完成。
本文基于Gurpreet Singh大佬在 Spark+AI SUMMIT 2020 的公开课编写 0x00 对于 Python 环境下开发的数据科学团队,Dask 为分布式分析指出了非常明确的道路,但是事实上大家都选择了...Dask 是一个纯 Python 框架,它允许在本地或集群上运行相同的 Pandas 或 Numpy 代码。...Spark vs Dask 首先先上Dask和Spark的架构设计图~ [设计架构] 生态 Dask 对于 Python 生态中的 Numpy、Pandas、Scikit-learn等有很好的兼容性,并且在...性能 Dask 中的 dataframe 基本上由许多个 pandas 的 dataframe 组成,他们称为分区。...Spark 中也有Spark-mllib 可以高效的执行编写好的机器学习算法,而且可以使用在spark worker上执行sklearn的任务。能兼容 JVM 生态中开源的算法包。
特征:数据中抽取出来的对结果预测有用的信息。特征工程:使用专业背景知识和技巧处理数据,使得特征能在机器学习算法上发挥更好的作用的过程。...自动化特征工程是很有意义的一项技术,它能使数据科学家将更多时间花在机器学习的其他环节上,从而提高工作效率和效果。...Featuretools 的核心是 Deep Feature Synthesis(DFS) ,它实际上是一种特征工程方法,它能从单个或多个 DataFrame中构建新的特征。...DFS 通过 EntitySet 上指定的 Feature primitives 创建特征。例如,primitives中的mean函数将对变量在聚合时进行均值计算。...图片图片 ② 递归 XGBoost上一步SULOV中识别的变量递归地传递给 XGBoost,通过xgboost选择和目标列最相关的特征,并组合它们,作为新的特征加入,不断迭代这个过程,直到生成所有有效特征
1 问题 在进行数学计算时很多时候我们都要进行因式分解,如何利用python对1000以内的数字进行因式分解呢?...2 方法 1.首先利用while循环判断数字是否大于1 2.用append()把最小因数添加到数组中 3.返回数组,把列表的每一个元素用*连接起来 代码清单 1 x = input("请输入一个小于1000...的整数:") x = eval(x) t = x i = 2 result = [] while True: if t == 1: break if t % i == 0:...,运用了while循环判断,append添加因数至数组的方法等,通过实验,证明该方法是有效的。...本文代码具有较好可读性和可使用性,但在高时间性能和健壮性上仍有欠缺,未来可以尝试其他的方法改善此问题。
Spark SQL支持两种RDDs转换为DataFrames的方式 使用反射获取RDD内的Schema 当已知类的Schema的时候,使用这种基于反射的方法会让代码更加简洁而且效果也很好。...通过编程接口指定Schema 通过Spark SQL的接口创建RDD的Schema,这种方式会让代码比较冗长。 ...这种方法的好处是,在运行时才知道数据的列以及列的类型的情况下,可以动态生成Schema。...,编程创建DataFrame分为三步: 从原来的RDD创建一个Row格式的RDD....val rowRDD = personRDD.map(p => Row(p(0).toInt, p(1).trim, p(2).toInt)) //将schema信息应用到rowRDD上
您可以在GitHub上查看完整的代码 pandas_alternatives_POC.ipynb —探索dask,spark,vaex和modin julia_POC.ipynb —探索julia...即使在单台PC上,也可以利用多个处理核心来加快计算速度。 Dask处理数据框的模块方式通常称为DataFrame。...但是dask基本上缺少排序选项。那是因为并行排序很特殊。Dask仅提供一种方法,即set_index。按定义索引排序。...Dask对排序几乎没有支持。甚至官方的指导都说要运行并行计算,然后将计算出的结果(以及更小的结果)传递给Pandas。 即使我尝试计算read_csv结果,Dask在我的测试数据集上也要慢30%左右。...但是要求必须在PC上安装Java。 Spark性能 我使用了Dask部分中介绍的pySpark进行了相同的性能测试,结果相似。 ? 区别在于,spark读取csv的一部分可以推断数据的架构。
具体操作就是对每个分区并 行或单独操作(多个机器的话也可以并行),然后再将结果合并,其实从直观上也能推出Dask肯定是这么做的。...dask中的数表处理库 import sys # 外部参数获取接口 面对海量数据,跑完一个模块的代码就可以加一行gc.collect()来做内存碎片回收,Dask Dataframes与Pandas...Dataframes具有相同的API gc.collect() 42 # 加载数据 data = dd.read_csv('UserBehavior_all.csv')# 需要时可以设置blocksize...其实dask使用了一种延迟数 据加载机制,这种延迟机制类似于python的迭代器组件,只有当需要使用数据的时候才会去真正加载数据。...(图中周五访问量有上 升,但成交量出现下降,推测此现象可能与周末活动导致周五推迟成交有关。)
1.2 Dask.array概述 Dask.array是Dask提供的类似于Numpy的数组数据结构,它允许用户在大规模数据集上执行Numpy-like的操作。...这使得Dask能够优化计算顺序,并在需要时执行计算。 4.2 Dask任务调度器 Dask使用任务调度器来执行计算图中的任务。任务调度器负责将任务分发到合适的计算节点上,并监控任务的执行进度。...创建了一个分布式客户端,并将Dask.array的计算任务提交到分布式集群上执行。...在分布式计算中,Dask会将任务分发到不同的工作节点上执行,并监控任务的执行进度。每个工作节点会执行其分配到的任务,并将结果返回给调度器。...)) # 使用分布式集群上的客户端执行计算 result = arr * 2 result = result.compute() 在这个例子中,我们使用Dask.array在分布式集群上执行计算,从而实现了并行计算
这是一个很大的瓶颈,特别是对体量更大的DataFrames,资源的缺失更加突出。 理论上来讲,并行计算就如同在所有可用CPU内核中的不同数据点中计算一样简单。...Modin可以切割DataFrame的横列和纵列,任何形状的DataFrames都能平行处理。 假如拿到的是很有多列但只有几行的DataFrame。...在并行处理时,Modin会从Dask或者Ray工具中任选一个来处理繁杂的数据,这两个工具都是PythonAPI的平行运算库,在运行Modin的时候可以任选一个。目前为止,Ray应该最为安全且最稳定。...Dask后端还处在测试阶段。 至此,理论说的够多了。接下来聊聊代码和速度基准点。 基准测试Modin的速度 pip是安装Modin最简单的方法。...如果想用Modin来运行一个尚未加速的函数,它还是会默认在Pandas中运行,来保证没有任何代码错误。 在默认设置下,Modin会使用机器上所有能用的CPU。
对比python中的datatable、pandas、dask、cuDF、modin,R中data.table以及spark、clickhouse 3....目前已有研究 H2O团队一直在运行这个测试项目, 其中: Python用到了:(py)datatable, pandas, dask, cuDF(moding.pandas在下文作者亲自测试了下); R...: data.table, dplyr; julia: DataFrames.jl; clickhouse; spark 测试内容有groupby、join、sort等。...测试数据长这样: 废话不多说,先看部分结果的截图吧。 上图截取的是复杂的groupby问题中对于5G与50G数据各ETL工具的用时情况,项目运行服务器的内存为128G,核数40。...(id4, id5)] modin用时174秒,由于modin暂不支持多列的groupby,实际上还是用的pandas的groupby x.groupby([‘id4’,‘id5’]).agg({‘v3
GitHub:https://github.com/vaexio/vaex 3 Vaex vs Dask、Pandas、Spark Vaex与Dask不同,但与Dask DataFrames相似,后者是在...这意味着Dask继承了Pandas issues,比如数据必须完全装载到RAM中才能处理的要求,但Vaex并非如此。...Vaex不生成DataFrame副本,所以它可以在内存较少的机器上处理更大的DataFrame。 Vaex和Dask都使用延迟处理。...正则表达式是CPU密集型的,这意味着大部分时间花在操作上,而不是花在它们周围的所有bookkeeping上。...在我们的电脑上,两者都需要大约85秒。 我们需要将CSV转换为HDF5,才能看到Vaex的优点。 事实上,Vaex只受可用磁盘空间的限制。
下面是每个库运行五次的结果: Polars Dask 2、中等数据集 我们使用1.1 Gb的数据集,这种类型的数据集是GB级别,虽然可以完整的加载到内存中,但是数据体量要比小数据集大很多。...Polars Dask 3、大数据集 我们使用一个8gb的数据集,这样大的数据集可能一次性加载不到内存中,需要框架的处理。...由于polar和Dask都是使用惰性运行的,所以下面展示了完整ETL的结果(平均运行5次)。 Polars在小型数据集和中型数据集的测试中都取得了胜利。...但是,Dask在大型数据集上的平均时间性能为26秒。 这可能和Dask的并行计算优化有关,因为官方的文档说“Dask任务的运行速度比Spark ETL查询快三倍,并且使用更少的CPU资源”。...上面是测试使用的电脑配置,Dask在计算时占用的CPU更多,可以说并行性能更好。 作者:Luís Oliveira
事实上,Dask的创建者Matthew Rocklin先生确认Dask最初是为了并行化Pandas和NumPy而创建的,尽管它现在提供了比一般的并行系统更多的好处。...Dask的数据帧非常适合用于缩放pandas工作流和启用时间序列的应用程序。此外,Dask阵列还为生物医学应用和机器学习算法提供多维数据分析。...可扩展性 Dask如此受欢迎的原因是它使Python中的分析具有可扩展性。 这个工具的神奇之处在于它只需要最少的代码更改。该工具在具有1000多个核的弹性集群上运行!...这就是为什么运行在10tb上的公司可以选择这个工具作为首选的原因。 Dask还允许您为数据数组构建管道,稍后可以将其传输到相关的计算资源。...熟悉的API:这个工具不仅允许开发人员通过最小的代码重写来扩展工作流,而且还可以很好地与这些工具甚至它们的API集成。 向外扩展集群:Dask计算出如何分解大型计算并有效地将它们路由到分布式硬件上。
自然,这是一个很大的瓶颈,特别是对于较大的 DataFrames,计算时就会表现出资源的缺乏。 理论上,并行计算就像在每个可用的 CPU 核上的不同数据点上应用计算一样简单。...在这种情况下,“分区管理器”将以它能找到的最优方式执行分区和分配到 CPU 核上。它是非常灵活的。 为了在执行并行处理时完成大量繁重的工作,Modin 可以使用 Dask 或 Ray。...它们都是使用 Python api 的并行计算库,你可以选择一个或另一个在运行时与 Modin 一起使用。Ray 目前是最安全的一个,因为它更稳定 —— Dask 后端是实验性的。...连接多个 DataFrames 是 panda 中的一个常见操作 — 我们可能有几个或多个包含数据的 CSV 文件,然后必须一次读取一个并连接它们。...在有些情况下,panda 实际上比 Modin 更快,即使在这个有 5,992,097(近 600 万)行的大数据集上也是如此。下表显示了我进行的一些实验中 panda 与 Modin 的运行时间。
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