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生信分析流程构建的几大流派

导言 构建生信分析流程是生物信息学从业人员必备的技能之一,对该项能力的评估常常是各大公司招录人员的参考项目之一。...图一 高通量测序数据分析项目重现性的要点 其中,使用统一的管道(pipeline)、工作流程(workflow)就是其中最重要的一环。...根据生信信息学数据分析流程(管道、工作流程序)构建的风格和方式,大致有以下几大流派(注1): 脚本语言流 Common Workflow language 语言流 Makefile流 配置文件流 Jupyter...生信分析流程构建的几大流派 | 脚本语言流 脚本语言流的主要是通过简单的脚本语言(如shell,R,Python,Perl)运行各类命令行脚本/程序。...以npm包的形式开发相应的R命令行程序,参见正在开发中的ngsjs包,初期目标是开发、收集200+和数据分析相关的命令行程序。

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    大流量爆发下,房多多的致胜法宝

    这不是房地产走暖,而是实实在在的互联网+房产的创新模式。...在领先行业的基础上,房多多进一步布局基于真实房产交易的互联网金融,打造全方位的房多多金融平台,真正满足买房卖房者、开发商、经纪人等多方用户的需求,获得空前反响。...随着用户数量与日俱增,为保证身处各地的用户快速接入、实现高品质的流畅体验及服务,我们选择了一家多处布点、全网内联的IDC服务商,通过其专业、成熟的服务体系解决网络挑战。...如此一来,房多多后台大量的房源图片、信息都得到了有效的保障,用户访问数据也受到了充足的保护。...作为优质的房产交易平台,房多多始终坚持以客户需求为导向,不断完善客户服务体验;作为可靠的合作伙伴,互联港湾也真正做到五星级服务,强大的云网络体系安全稳定,7*24小时的维护和贴心可靠的服务。

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    胜利花园2.0:大流行时代的园艺

    在大流行时代,人们对在自己的土地或城市阳台上种植、照料和收获水果和蔬菜的兴趣重新抬头。 越来越多的人被困在家里——他们越关心自己的食物供应——园艺就越有吸引力。...事实上,在美国,大流行的留守令始于春季,这吸引了人们尝试种植作物,在某些情况下是第一次。...疾病预防控制中心鼓励户外运动,[和]园艺让你的身体移动时,健身房可能不是一个选择 园艺对家庭活动来说也是一种很好的“生活质量”,这在流感大流行期间也变得很重要。...水产养殖是一种非常适合大流行的园艺技术,允许人们饲养蔬菜和鱼类供食用。 Nelson说:“水培是一种可持续的园艺方法,允许个人或企业全年种植新鲜的鱼和蔬菜。”...虽然这是在大流行期间开始的,但在大流行结束后,人们对园艺的兴趣可能不会减弱,因为许多人已经发现他们热爱植物和生长的世界。 “我认为这一趋势将持续下去,”汉娜说种下一粒种子并收获果实的快感是非常有益的。

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    网络最大流入门

    前言 网络最大流是网络流中最基础也是最重要的部分,后边的许多模型也都是由最大流问题引申而来的 最大流 在研究这个问题之前,让我们先来学习一下前置知识 可行流 设f(u,v)表示边(u,v)的当前容量上限...增广 增广:即增加一条路径上的流量 增加一条路径的流量,即减少这条路径的当前流量上限,即f(u,v)的值 增广是我们求解最大流的基础 最大流 定义:在所有可行流中流量最大的流 那么我们如何求解这个东西呢...以上图为例,如只是无脑增广的话,很可能对SABT这条边进行增广,而增广完这条边后,就再也没有可以增广的路径了,求出的最大流为$3$,下图为增广后的网络流图 ?...这样我们便又有了一条新的增广路SBAT,对这条路径进行增广后我们便可以得到网络最大流为5 考虑一下,为什么这样是对的?...原因很简单,造成我们刚开始做出错误决策的边为AB,最大流本不应经过这里,但是我们却无脑的经过了这里 因为反向边BA的存在,我们又把从A流向B的流量给退了回去。

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    生信分析流程构建的几大流派

    导言 构建生信分析流程是生物信息学从业人员必备的技能之一,对该项能力的评估常常是各大公司招录人员的参考项目之一。...图一 高通量测序数据分析项目重现性的要点 其中,使用统一的管道(pipeline)、工作流程(workflow)就是其中最重要的一环。...根据生信信息学数据分析流程(管道、工作流程序)构建的风格和方式,大致有以下几大流派(注1): 脚本语言流 Common Workflow language 语言流 Makefile流 配置文件流 Jupyter...生信分析流程构建的几大流派 | 脚本语言流 脚本语言流的主要是通过简单的脚本语言(如 shell,R,Python,Perl)运行各类命令行脚本/程序。...以 npm 包的形式开发相应的 R 命令行程序,参见正在开发中的 ngsjs 包,初期目标是开发、收集 200+ 和数据分析相关的命令行程序。

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    大流行对隐私法的影响

    我们所知的生活是在冠状病毒永远消失之前,大流行的后果将体现出许多变化。它将如何影响全球的隐私法?没有人可以肯定,而且直到冠状病毒消失之后我们才知道。...网络犯罪分子长期以来一直在利用互联网,现在COVID-19的传播加快了他们的邪恶工作。 但是,由于我们无法完全控制所有实际发生的网络犯罪,因此无法猜测隐私法能否在大流行中幸免。...到您对此类问题的答案时,您可能已经违反了更多的隐私法。 2018年GDPR的主要目的是保护欧盟居民及其数据。除其他外,欧盟公民可以选择退出数据收集,更改错误的数据并删除其数据(“被遗忘的权利”)。...尽管如此,在2020年冠状病毒大流行期间,生活变得更加复杂。现在,世界各地的人们都在使用Internet来保护自己和亲人。...可能很少有人会非常注意使用条款,隐私权政策或点击协议-当然,甚至很少有人在大流行开始之前就读过。 很难想象欧盟在大流行期间将有足够的资源来执行其GDPR,不幸的是,这只是时代的现实。

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    2019 CCPC 秦皇岛 Escape 最大流

    迷宫中的每个 1×1 的格子要么是障碍,要么为空。...``SW'',``SE'' 4 种,其中: "NW'' 装置会把从格子上方走来的机器人的运动方向变成向左,以及把从格子左方走来的机器人的运动方向变成向上,不允许机器人从格子的右方及下方进入。..."NE'' 装置会把从格子上方走来的机器人的运动方向变成向右,以及把从格子右方走来的机器人的运动方向变成向上,不允许机器人从格子的左方及下方进入。..."SW'' 装置会把从格子下方走来的机器人的运动方向变成向左,以及把从格子左方走来的机器人的运动方向变成向下,不允许机器人从格子的右方及上方进入。..."SE'' 装置会把从格子下方走来的机器人的运动方向变成向右,以及把从格子右方走来的机器人的运动方向变成向下,不允许机器人从格子的左方及上方进入。

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    最大流解决医生排班问题

    每次增广的过程中,都会选择一条从源点到汇点的路径,然后将这条路径上的流量增加到当前的最大流中。随着可行流的不断增加,残留网络中的剩余容量也不断减少,直到找不到增广路径为止。...具体来说,首先根据流网络的最大流容量构建出残存网络,如图4所示。...图5 搜索增广路径更新网络流量 根据我们上面证明过的最大流最小割定理,f是G中的一个最大流当且仅当其对应的残存网络中不包含任何的增广路径,如图6所示,当残存网络中没有增广路径时,就已经找到了一个最大流。...图6 最大流 根据我们找到的最大流可知,与原流网络相比,结点3和结点7之间没有流通过,即A医生不值国庆节第一天的班,如图7所示,最后得出的方案是:A医生值国庆节的第二天班和劳动节的第一天班,B医生值国庆节的第一天班和劳动节的第二天班...,返回从当前节点出发能够到达汇点的最大流量,同时更新相应的网络流。

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    如何应对大流量、高并发??

    常用的高并发处理的思路与手段 从服务端视角看高并发 服务端处理请求需要耗费服务端的资源,比如能同时开启的进程数、能同时运行的线程数、网络连接数、cpu、I/O、内存等等,由于服务端资源是有限的,那么服务端能同时处理的请求也是有限的...高并发问题的本质就是:资源的有限性 高并发带来的问题 服务端的处理和响应会越来越慢,甚至会丢弃部分请求不予处理,更严重的会导致服务端崩溃。...2)从服务端看 增加资源供给,比如:更大的网络带宽,使用更高配置的服务器,使用高性能的Web服务器,使用高性能的数据库 请求分流,比如:使用集群,分布式的系统架构 应用优化,比如:使用更高效的编程语言...,优化处理业务逻辑的算法,优化访问数据库的SQL 基本原则:分而治之,并提高单个请求的处理速度 高并发处理的基本手段 1)客户端发出请求层面,常见的手段有: 尽量利用浏览器的缓存功能,减少访问服务端,比如...服务器上部署的应用规模 对Web服务器进行集群 4)Web应用层面,常见的手段有: 动态内容静态化 Java开发优化 优化处理业务逻辑的算法 合理高效的利用缓存 优化访问数据库的Sql,可以考虑利用存储过程等数据库的能力

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    sdfsdfsd_dsd cd

    1)—为DataSnap系统服务程序添加描述 这几天一直在研究Delphi 2010的DataSnap,感觉功能真是很强大,现在足有理由证明Delphi7该下岗了。...DataSnap有三种服务模式,其中Service Application方式建立的windows服务没有描述,描述部分是空的,感觉总是欠缺点什么。...,无需此步骤 分发的客户端软件只需一个文件:你的客户端程序 服务器和客户端无需Midas.dll,也不需要注册regsvr32 Midas.dll,看来Delphi2010的datasnap抛弃使用COM...(3)—DataSnap服务器如何得到客户端的IP和端口 作为一个服务器软件,必须做到对客户端强有力的控制,想要控制,就必须得到客户端的网络基本信息,比如客户端IP和端口。...在delphi2010中的datasnap服务器如何获得客户端ip,的确花了我点时间,奇怪为什么这个功能不做的更人性化点呢,功能总是藏着掖着。还得让程序员像寻宝一样摸索,浪费时间。

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    图论--网络流最大流问题

    在介绍最大流问题的解决方法之前,先介绍几个概念. 网络:网络是一个有向带权图,包含一个源点和一个汇点,没有反向平行边。...网络最大流:在满足容量约束和流量守恒的前提下,在流网络中找到一个净输出最大的网络流。...最大流定理:如果残留网络上找不到增广路径,则当前流为最大流;反之,如果当前流不为最大流,则一定有增广路径。...这样的话,求解最大流就只需要在残余网络中寻找增广路,直到不存在可以从s流向t 的增广路,此时即为最大流。求解最大流问题的高效算法有 dinic,sap和isap。...当前的实流网络就是最大流网络,返回最大流值maxflow。 队头元素new 出队,在残余网络中检查new 的所有邻接结点i。

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    大流感:最致命瘟疫的史诗

    这两本是之前有朋友在评论里推荐的: 《牧羊少年奇幻之旅》 《大流感:最致命瘟疫的史诗》 画外音:坚持一件事很难,但读书,真的有用。 《牧羊少年奇幻之旅》 小时候,有人问我们的梦想是什么?...15分钟,扫码听书《牧羊少年奇幻之旅》 《大流感:最致命瘟疫的史诗》 由历史学家约翰·M·巴里带来的全面回顾1918年大流感的这本书,被美国科学院评为2005年度最佳科学/医学类图书。...在以冷静客观的笔调描述了大流感的社会图景,以深入浅出的逻辑解释了病毒与人类之间的战争关系之后,《大流感:最致命瘟疫的史诗》中更加宝贵的对瘟疫留给人类的遗产进行了深刻反思,展现出了理性的光辉。...所以1918年大流感的最后一条教训,即那些身居要职的权威人士必须降低可能离间整个社会的恐慌,可谓知易行难。 这是流感,仅仅只是流感。...让我们一起通过《大流感:最致命瘟疫的史诗》来反思如何应对病毒。 15分钟,扫码听书《大流感,最致命瘟疫的史诗》 不知不觉,坚持读书3年了,希望我们一起,养成自律的习惯。

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    网络最大流算法—EK算法

    前言 EK算法是求网络最大流的最基础的算法,也是比较好理解的一种算法,利用它可以解决绝大多数最大流问题。...但是受到时间复杂度的限制,这种算法常常有TLE的风险 思想 还记得我们在介绍最大流的时候提到的求解思路么? 对一张网络流图,每次找出它的最小的残量(能增广的量),对其进行增广。...因为DFS的搜索顺序的原因,所以某些毒瘤出题人会构造数据卡你,具体怎么卡应该比较简单,不过为了防止大家成为这种人我就不说啦(#^.^#) 所以我们选用BFS 在对图进行遍历的时候,记录下能进行增广的最大值...int A[MAXN];//S到该节点的最小流量 inline int EK() { int ans=0;//最大流 while(true)//不停的找增广路 {...在BFS的时候,由于反向弧的存在,最坏情况为 总的时间复杂度为 后记 EK算法到这里就结束了。 不过loj那道题怎么才能过掉呢? 这就要用到我们接下来要讲的其他算法

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    大流量网站怎么优化

    所以你有挺高的概率不需要从更底层的回答这个问题,比如多线程和多进程的取舍,或者使用异步和非阻塞等等。。。不过老高还是建议你去了解一下C10K这个概念!...如果怕面试官问到TCP/IP,比如TCP是怎么链接的,那么请深入阅读鸟哥的私房菜或者看看老高的鸟哥的私房菜学习笔记 -- 网络速查补补。...解牛 (下面是老高的简单总结,希望大家一起补充) 为了更好的理解,我们在此加一个图,既然是服务器的优化,我们就不需要操心浏览器的事情,所以我们主要考虑链路和服务器内部的优化。...使用新的协议 这方面可以关注google的SPDY协议,或者最近很火的HTTP2.0草案。 CDN CDN技术可以减少源服务器的压力,将内容有组织的分发到各个节点,起到了一定的加速作用。...但是弊端就是可能会产生内容更新的问题。 解决办法可以是设定一个合理的更新时间,为静态文件加上版本控制等。。。 针对另一个问题 如何科学的更新服务器的资源,请参考 大公司里怎样开发和部署前端代码?

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    Delphi XE5中的新增内容

    通过FireDAC 企业数据库连接、DataSnap n层中间件、以及通过MBaas提供者访问基于云端的RESTful web服务,迅速连接您的应用到内部部署或云端中的企业数据库和服务。...、多设备的应用 用FireMonkey创建Windows 和Mac OS X 桌面应用 DataSnap移动连接器 LiveBindings (非可视化的) FastReport报表工具 Delphi...XE 用DataSnap进行扩展的多层开发 额外的附带工具 (CodeSite Express、IP*Works、Beyond Compare Differ) 针对Azure和Amazon 的云计算支持...LiveBindings (非可视化的) FastReport报表工具 Delphi XE 用DataSnap进行扩展的多层开发 额外的附带工具 (CodeSite Express...项目管理 重要的DataSnap 升级 泛型和匿名方法 在Embarcadero doc wiki上查看Delphi XE5 中更多新增内容。

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