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为什么是AUC值而不是GSEA来挑选转录因子呢

首先批量计算AUC值 如果是单细胞转录组数据里面,每个单细胞都是有一个geneLists,那么就是成千上万个这样的calcAUC分析,非常耗费计算资源和时间,就需要考虑并行处理,我们这里暂时不需要,所以直接...基因集的转录因子富集分析 motifs_AUC <- calcAUC(geneLists, motifRankings, nCores=1) motifs_AUC 可以看到是 24453个motifs的AUC值都被计算了..., border="darkred") nes3 <- (3*sd(auc)) + mean(auc) abline(v=nes3, col="red") 可以看到 24453个motifs的AUC值看起来满足正态分布...GSEA分析一文就够(单机版+R语言版) GSEA的统计学原理试讲 GSVA或者GSEA各种算法都是可以自定义基因集的 但实际上,绝大部分读者并没有去细看这个统计学原理,也不需要知道gsea分析的nes值如何计算...不理解原理并不影响大家使用,知道这个概念,知道如何根据AUC值去判断结果就好。

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    mysql主库更新后,从库都读到最新值了,主库还有可能读到旧值吗?

    主库更新后,主库都读到最新值了,从库还有可能读到旧值吗? 主库更新后,从库都读到最新值了,主库还有可能读到旧值吗?...当更新一行数据后,立马去读主库,主库的数据肯定是最新值,这点没什么好说的,但如果此时主从延迟过大,这时候读从库,同步可能还没完成,因此读到的就是旧值。...主库更新后,从库都读到最新值了,主库还有可能读到旧值吗? 那另一个问题就来了,如果从库都读到最新值了,那说明主库肯定已经更新完成了,那此时读主库是不是只能读到最新值呢?...如果是读提交或者可重复读,那读到的都是1,读提交只认事务提交后的数据,而可重复读只要线程2的事务内没有执行对A的更新sql语句,那读A的数据就会一直不变。...所以从结论上来说,出现了从库都读到最新值了,主库却读到了旧值的情况。 从库读到最新值主库却读到旧值 好了这道题到这里就结束了。 意不意外?

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    算法:使用二分查询技巧 取中间值为啥是l+(r-l)2而不是(l+r)2?

    1.溢出问题 比如:Java的世界里Int类型最大值是: Integer.MAX_VALUE = 2147483647 System.out.println("Integer.MAX_VALUE...r-l)/2或者(l+r)/2计算结果没有区别 在负向横向轴的情况下,l+(r-l)/2或者(l+r)/2计算结果有区别,计算后的结果是以left为边界相加,因为int/2的向下取整问题,导致计算结果的值小一些...+ aa); System.out.println("bb = " + bb); 实际运行结果: aa = -4 bb = -5 原因: int类型的取整是向0取整,即使被取整的数绝对值变小...而右移是向下取整,即使被取整的数值变小 所以对于正数时两者相同,而到了负数则变大 小结:在对负数进行右移运算时候,运算计算跟平时大脑运算的结果不一样,所以一般情况下乖乖用/除号,省得考虑不周,出现诡异的...如果满足性质1,则说明numsmid在目标元素的左侧,此时我们将区间左端点(l)移动到mid + 1(因为此时我们可以明确的知道numsmid并不是我们需要的元素) 如果满足性质2,则说明numsmid

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    【C++】函数重载 ① ( 函数重载概念 | 函数重载判断标准 - 参数个数 类型 顺序 | 返回值不是函数重载判定标准 )

    参数顺序 或 参数类型 不同 ; 注意 : 只有 函数参数 是 " 函数重载 " 的判断标准 , 函数 的 返回值 不是 " 函数重载 " 的 判断标准 ; 2、函数重载判断标准 " 函数重载 " 满足的条件...( 判断标准 ) : 参数 " 个数 " 不同 参数 " 类型 " 不同 参数 " 顺序 " 不同 只有 函数参数 是 " 函数重载 " 的判断标准 , 函数 的 返回值 不是 " 函数重载 " 的...; return 0; } 执行结果 : 打印整数: 4 打印两个整数: 2 和 3 打印浮点数: 1.5 Press any key to continue . . . 2、代码示例 - 返回值不是函数重载判定标准...只有 函数参数 是 " 函数重载 " 的判断标准 , 函数 的 返回值 不是 " 函数重载 " 的 判断标准 ; 因此 , 如果两个函数 , 参数列表相同 , 返回值不同 , 此时就会在编译时报错 ,...类型返回值 , 函数 2 直接与 函数 1 发生了冲突 , 编译时 , 会报错 ; // 函数2 : 接收一个整数参数 , 返回 int 类型返回值 int fun(int i) { cout <

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    android学习笔记----SQLite数据库

    github.com/liuchenyang0515/CreateDB3 目录三事务介绍的源码地址:https://github.com/liuchenyang0515/BankTransfer 官方更推荐Room而不是...不同的是,当数据库不可写入的时候(如磁盘空间已满),getReadableDatabase()方法返回的对象将以只读的方式去打开数据库,而getWritableDatabase()方法将抛出异常。    ...0代表的是没有做任何记录,返回的整数int值代表删除了几条数据 */ public int delete(String name) { SQLiteDatabase...table:要更新的表     values:从列名到新列值的映射。NULL是将被转换为NULL的有效值。     whereClause:更新时要应用的可选WHERE子句。...传递NULL将更新所有行。     whereArgs: 您可以在WHERE子句中包括?s,该子句将由WHERE Args的值替换。这些值将被绑定为String。

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    Android训练课程(Android Training) - 构建你的第一个应用

    Target SDK 目标SDK 指示了你测试过的你的应用可以支持的最高版本的安卓系统(仍然是用API级别指定) 当一个新的安卓版本变得可用,你应该测试你的应用在新的安卓版本并且更新这个值去匹配最新的...2.在你的设备上启用USB debugging(USB调试)模式 在很多运行在安卓3.2或者更旧的版本上的设备,你可以在选项设置里找到: 设置>应用程序>开发者 在安卓4.0或者更新一些的版本,他存在于...因为这个引用到一个具体的资源(而不是一个标示符),它不需要使用“加号”。然而,因为你过去还未定义一个字符串资源,你将会首先看到一个编译错误。在下一章节通过定义字符串的方式你将会修复这个错误。...比如,如果你让一个视图的weight是2而另一个是1,总数量是3,那么第一个视图填满2/3的剩余空间,而第二个视图填满仅剩余的部分。...public 具有一个void返回值 具有一个 View作为参数,并且仅仅只有一个阐述(这将是那个被点击的view) 下一步,你将填充这个方法,读取文本框的内容并传递文本到另一个activity.

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    android学习笔记----软键盘换行按键效果测试(imeOptions)

    注意:看到其他的博客上写的都是用的android:singleLine="true"(因为默认是多行模式,而右下角的按键是用于换行的,当设置为单行模式后就没必要换行了) 但是这个方法文档显示已经废弃了...关于singleLine:@deprecated不推荐使用此属性 格式:boolean 将文本约束为单个水平滚动线,而不是让它包裹在多行上,并在按Enter键时提前聚焦而不是插入换行符。...对于不可编辑的文本,默认值为false(多行换行文本模式),但如果为inputType指定任何值,则默认值为true(单行输入字段模式)。...singleLine效果)(如果提供了singleLine和inputType,则inputType标志将覆盖singleLine的值)。...="wrap_content" android:hint="actionPrevious(此时回车光标返回上一项)" android:imeOptions="actionPrevious

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    DataBinding的用法

    BindingAdapter中的方法有一个有趣的功能——可选旧值,什么意思呢?...就是在某些情况下,我们可能想要得到某个属性的旧值,比如我们在修改padding的时候,想要得到修改前的padding值,以防止方法重复调用。...而对于其他一些能与用户产生交互的控件,例如EditText,它不仅可以像TextView一样,随着字段的变化自动更新控件中的内容,还可以实现当用户修改EditText控件的内容时,对应的字段也能自动更新...而Setter方法会在用户编辑EditText中的内容时,被自动调用,我们需要在该方法中对username进行手动更新。...需要注意的是,在对字段进行更新前,需要判断新值和旧值是否相同,因为在更新后,我们会调用notifyPropertyChanged()方法通知观察者数据已经更新。

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    【谷歌官方文档】1.1 建立第一个APP

    可选的布局文件 有很多理由使得我们选择在 XML 中定义界面布局,而不是在运行时动态生成布局。其中最重要的一点是——这可以让你为不同大小的屏幕创建不同的布局文件。...对于字符串 "@string/edit_message" 的值所引用的资源应该定义在单独的文件里,而不是直接使用字符串。因为使用的值是存在的资源,所以不需要使用 + 号。...但在很多情况下,如果给 View 设置了 match_parent 的属性,那么在计算权重时则不是通常的正比,而是反比。也就是说,权重值大的反而占据空间小)。...如果设置宽度为 "wrap_content",系统需要计算这个部件所占用的宽度;而此时的 EditText 因为设置了权重,所以会占据剩余空间;所以,最终导致的结果是:EditText 的宽度成了不起作用的属性...MyActivity.java中添加的sendMessage方法)与在android:onClick属性中提供的方法名字匹配,它们的名字必须一致,特别需要注意的是,这个方法必须满足以下条件: 是public函数 无返回值

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