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系统比较Seuratscanpy版本之间、软件之间分析差异

SeuratScanpy是实现这种工作流最广泛使用软件,通常被认为是实现类似的单个步骤。下面我们就需要比较一下软件之间、以及不同版本之间数据分析差异。...SeuratScanpy在默认scnaseq工作流中显示出相当大差异下图显示了使用PBMC 10k数据集与默认设置比较Seurat v5.0.2Scanpy v1.9.5结果,展示了“标准”单细胞...Scree图也显示差异,最明显第一个PC解释方差比例相差0.1。PCA变化都可以通过HVG设置标准化来解决,并相应地调整PCA。接下来,这些软件在SNN图生成上有很大不同。...这些版本之间logFC计算调整后p值没有差异。比较使用默认设置Cell Ranger软件v7Cell Ranger v6生成计数矩阵也揭示了所有DE指标之间差异。...跨Cell Ranger版本分析显示,pipeline所有步骤都存在相当大差异。这些命令之间主要区别在于v7中默认包含基因计数矩阵中内含子计数,而v6中默认排除内含子计数。

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TP5TP6版本之间差异,以及TP6新特性

TP5TP6版本之间差异: ThinkPHP6.0运行环境要求PHP7.1+,不支持5.1无缝升级 ThinkPHP6.0基于精简核心统一用法两大原则在5.1基础上对底层架构做了进一步优化改进.../psr 6 TP6组件独立 ORM 模板引擎 7 TP6中间件改进 TP6开始使用了管道模式来实现中间件,比起之前版本实现更加简洁,有序 8 TP6引入Filesystem TP6新特性: 采用...PHP7强类型(严格模式) 支持更多PSR规范 多应用支持 ORM组件独立 改进中间件机制 更强大和易用查询 全新事件系统 支持容器invoke回调 模板引擎组件独立 内部功能中间件化...SESSION机制改进 缓存及日志支持多通道 引入Filesystem组件 对Swoole以及协程支持改进 对IDE更加友好 统一精简大量用法 ———————————————— 版权声明...原文链接:https://blog.csdn.net/sangkaixin1/article/details/120172522 未经允许不得转载:肥猫博客 » TP5TP6版本之间差异,以及TP6

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这些常用Git命令清单,你都知道吗?

查看信息 # 显示有变更文件git status # 显示当前分支版本历史 $ git log # 显示commit历史,以及每次commit发生变更文件git log --stat...=format:%s # 显示某个commit之后所有变动,其"提交说明"必须符合搜索条件 $ git log [tag] HEAD --grep feature # 显示某个文件版本历史,包括文件改名... blame [file] # 显示暂存区工作区差异git diff # 显示暂存区上一个commit差异git diff --cached [file] # 显示工作区与当前分支最新...commit之间差异git diff HEAD显示两次提交之间差异git diff [first-branch]......git diff HEAD^                                            # 比较与上一个版本差异 git diff HEAD -- .

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【linux命令讲解大全】014.Git:分布式版本控制系统先驱常用命令清单(三)

git blame 文件名:显示文件每一行是在那个版本最后修改。...git whatchanged 文件名:显示某个文件每个版本提交信息:提交日期,提交人员,版本号,提交备注(没有修改细节) 打造自己git命令 git config --global alias.st...之间差异 git diff --cached # 比较IndexHEAD之间差异 git diff HEAD # 比较WorktreeHEAD之间差异 git diff branch #...比较Worktreebranch之间差异 git diff branch1 branch2 # 比较两次分支之间差异 git diff commit commit # 比较两次提交之间差异...git diff master..test # 上面这条命令只显示两个分支间差异 git diff master...test # 你想找出'master'、'test'共有父分支'test

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一份简简单单git命令手册(附带备忘清单)

这个版本配置、存储等信息会被保存到git 文件夹中 # 初始化当前项目 $ git init # 新建一个目录,将其初始化为Git代码库 $ git init [project-name] #...--oneline # 显示所有提交过用户,按提交次数排序 $ git shortlog -sn # 显示指定文件是什么人在什么时间修改过 $ git blame [file] # 显示暂存区工作区差异...$ git diff # 显示暂存区上一个commit差异 $ git diff --cached [file] # 显示工作区与当前分支最新commit之间差异 $ git diff HEAD...# 显示两次提交之间差异 $ git diff [first-branch]......# 比较暂存区版本差异 $ git diff --cached # 仅仅比较统计信息 $ git diff --stat # 显示某次提交元数据内容变化 $ git show [commit

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Git常用命令

Git常用命令 Git是一个开源分布式版本控制系统,用于敏捷高效地处理任何或小或大项目,Git擅长是程序代码版本化管理,对程序源代码进行差异版本管理,代码库占极少空间,可以说Git是目前世界上最先进分布式版本控制系统...git log --follow [file]: 显示某个文件版本历史,包括文件改名。 git log -p [file]: 显示指定文件相关每一次diff。...git blame [file]: 显示指定文件是什么人在什么时间修改过。 git diff: 显示暂存区工作区差异。...git diff --cached [file]: 显示暂存区上一个commit差异git diff HEAD: 显示工作区与当前分支最新commit之间差异。...git diff [first-branch]...[second-branch]: 显示两次提交之间差异

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常用 Git 命令总结

系统级配置文件:在 Git 安装目录下(Mac 系统下安装目录在 /usr/local/git etc 文件夹中 gitconfig。 git diff 用于显示提交工作树等之间更改。...此命令比较是工作目录中当前文件暂存区域快照之间差异,也就是修改之后还没有暂存起来变化内容。...# 比较当前文件暂存区中文件差异显示没有暂存起来更改 $ git diff # 比较暂存区中文件上次提交时差异 $ git diff --cached $ git diff -...-staged # 比较当前文件上次提交时差异 $ git diff HEAD # 查看从指定版本之后改动内容 $ git diff # 比较两个分支之间差异...# 初始化本地仓库,在当前目录下生成 .git 文件夹 $ git init git log 显示提交记录。

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Git Cheat 2

git log [tag] HEAD --grep feature # 显示某个文件版本历史,包括文件改名 git log --follow [file] git whatchanged [file...] # 显示指定文件相关每一次diff git log -p [file] # 显示指定文件是什么人在什么时间修改过 git blame [file] # 显示暂存区工作区差异 git diff...# 显示暂存区上一个commit差异 git diff --cached [file] # 显示工作区与当前分支最新commit之间差异 git diff HEAD # 显示两次提交之间差异...diff # 只显示两个分支间差异,如果你想找出‘master’,‘test’共有 父分支'test'分支之间差异,你用3个‘.'...git diff master..test # 显示你当前索引上次提交间差异;这些内容在不带"-a"参数运行 "git commit"命令时就会被提交。

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Git命令大全

# 查看本地仓库状态 $ git status # 以简短模式查看本地仓库状态 # 会显示两列,第一列是文件状态,第二列是对应文件 # 文件状态:A 新增,M 修改,D 删除,??...$ git merge git diff比较版本之间差异 # 比较当前文件暂存区中文件差异显示没有暂存起来更改 $ git diff # 比较暂存区中文件上次提交时差异...$ git diff --cached $ git diff --staged # 比较当前文件上次提交时差异 $ git diff HEAD # 查看从指定版本之后改动内容 $ git...diff # 比较两个分支之间差异 $ git diff # 查看两个分支分开后各自改动内容 $ git diff ......> --delete git log显示提交记录 # 打印所有的提交记录 $ git log # 打印从第一次提交到指定提交记录 $ git log

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在场景中使用Git

/hello.git] 2、本地新建Git工程 现在打算将本地工程,放到Git仓库进行托管了,并且远程Git仓库已经创建了该项目的工程 #本地初始化工程,会生成一个.git文件 git init...reset --hard [sha1值] 7、删除文件 保留副本操作 git rm --cache [文件名] 还原操作 git reset HEAD [文件名] 直接文件删除 git...git checkout -b [本地分支名] origin/[远程分支名] 9、Tag使用 我们在开发时候,可能存在线上发布了一个版本,需要给这个版本代码打上一个标签,到时候可以方便回退到这个版本...git commit -m "v1.1" # bill分支合并到当前分支【分支名】 git merge [bill] 10、关于代码比较 # 显示暂存区工作区差异 $ git diff # 显示暂存区上一个...commit差异文件名】 $ git diff --cached [hell.txt] # 显示工作区与当前分支最新commit之间差异 $ git diff HEAD # 显示两次提交之间差异

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git入门

$ git init Initialized empty Git repository in E:/GitResp/.git/ addcommit命令 git只能管理暂存区本地库中文件。...master) $ git log --oneline 7e328f8 (HEAD -> master) 修改了demo.md中内容 6df164a 这是我写第一文件 Demo.md $ git...这是我写第一文件 Demo.md HEAD@{1}为由当前版本回退到该版本需要回退一个版本。...使用diff命令后,发现暂存区工作区中改文件差异为:先删除了aaaaa这一行,再增加aaaaabbb这一行,这是由于git是按行为单位来管理数据。...,若不加文件名则比较多个文件之间差异 git diff [文件名] 比较暂存区与本地库某个版本之间文件差异 git diff [历史版本] [文件名] 分支 版本控制过程中,使用多条线同时推进多个任务

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最全Git常用命令速查-2021版

七、查看信息 # 显示有变更文件 $ git status # 显示当前分支版本历史 $ git log # 显示commit历史,以及每次commit发生变更文件 $ git log --stat...=format:%s # 显示某个commit之后所有变动,其"提交说明"必须符合搜索条件 $ git log [tag] HEAD --grep feature # 显示某个文件版本历史,包括文件改名...[file] # 显示暂存区工作区差异 $ git diff # 显示暂存区上一个commit差异 $ git diff --cached [file] # 显示工作区与当前分支最新commit...之间差异 $ git diff HEAD # 显示两次提交之间差异 $ git diff [first-branch]......九、撤销 # 撤销工作目录中所有未提交文件修改内容 $ git reset --hard HEAD # 撤销指定未提交文件修改内容 $ git checkout HEAD #

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git:指令备忘录

将所有删除工作提交暂存区 git rm _file 从版本库中删除文件 git reset _file 从暂存区恢复到工作文件 git reset –hard _hash 恢复哈希值所对应目标时间点...git reset origin/HEAD 恢复最后一次提交状态 git revert HEAD 恢复最后一次提交状态 git diff _file 比较当前文件暂存区文件差异 git diff..._id1 _id2 比较两次提交之间差异 git diff _branch1 _branch2 在两个分支之间比较 git log 查看提交记录 git log –graph 图表形式查看分支 git...log –pretty=short 只显示提交信息第一git log _file 查看某文件每次提交记录 git branch -d 删除分支 git check _branch 切换分支 git...origin 删除origin git remote rm _repository 删除远程仓库 git blame _file 得到某文件每一行详细修改信息:包括SHA串,日期作者 ----

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