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python比较两个文件的差异

使用python脚本比较两个文件的差异内容并输出到html文档中,可以通过浏览器打开查看。...fromlines和tolines,用于比较的内容,格式为字符串组成的列表 fromdesc和todesc,可选参数,对应的fromlines,tolines的差异化文件的标题,默认为空字符串 context...显示全文,numlines默认为5, 当context为True时,控制展示上下文的行数,当context为false时,控制不同差异的高亮之间移动时“next”的开始位置 3.使用argparse传入两个需要对比的文件...        return text     except IOError as e:         print("Read file Error:", e)         sys.exit() # 比较两个文件并输出到...,使用格式-f1 filename1 -f2 filename     parser = argparse.ArgumentParser(description="传入两个文件参数")     parser.add_argument

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比较两个vcf文件的多种实现方法

有粉丝邮件求助,给了我两个vcf文件,旧的vcf文件走的是标准的bwa+gatk流程,参考基因组是hg19,新的文件参考基因组是hg38,也是gatk标准流程。...想有比较它们,首先得保证两个vcf文件的参考基因组一致,因为版本不一致,所以需要使用CrossMap等软件进行参考基因组版本转换,然后里使用 SnpSift 软件的 Concordance 命令比较它们...image-20200711195600818 最后看专业的软件进行两个vcf文件比较 这里使用 SnpSift 软件的 Concordance 命令,代码如下: java -Xmx1g -jar...但是可以继续细致的探索 comp.results.txt 文件,拆分染色体后,继续统计上面提到的6种情况发生的频次。那就出一个学徒作业吧,比较两个vcf文件,然后区分染色体绘制韦恩图。...这两个vcf文件可以是不同人的,也可以是同一个人的不同批次测序或者不同数据分析流程拿到的vcf文件

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.NET 下最快比较两个文件内容是否相同

最近项目有个需求,需要比较两个任意大小文件的内容是否相同,要求如下: 项目是.NET Core,所以使用C#进行编写比较方法 文件大小任意,所以不能将文件内容全部读入到内存中进行比较(更专业点说,...需要使用非缓存的比较方式) 不依赖第三方库 越快越好 为了选出最优的解决方案,我搭建了一个简单的命令行工程,准备了两个大小为912MB的文件,并且这两个文件内容完全相同.在本文的最后,你可以看到该工程的...下面我们开始尝试各个比较方法,选出最优的解决方案: 比较两个文件是否完全相同,首先想到的是用哈希算法(如MD5,SHA)算出两个文件的哈希值,然后进行比较....而我们的需求中,两个文件都是不固定的,那么每次都要计算两个文件的哈希值,就不太合适了. 所以,哈希比较这个方案被PASS....试验到此,比较两个900多MB的文件耗时1.5秒左右,读者对于该方法是否满意呢? No!我不满意!我相信通过努力,一定会找到更快的方法的!

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.NET CORE下最快比较两个文件内容是否相同的方法

最近项目有个需求,需要比较两个任意大小文件的内容是否相同,要求如下: 项目是.NET CORE,所以使用C#进行编写比较方法 文件大小任意,所以不能将文件内容全部读入到内存中进行比较(更专业点说,需要使用非缓存的比较方式...) 不依赖第三方库 越快越好 为了选出最优的解决方案,我搭建了一个简单的命令行工程,准备了两个大小为912MB的文件,并且这两个文件内容完全相同.在本文的最后,你可以看到该工程的Main方法的代码....下面我们开始尝试各个比较方法,选出最优的解决方案: 比较两个文件是否完全相同,首先想到的是用哈希算法(如MD5,SHA)算出两个文件的哈希值,然后进行比较....而我们的需求中,两个文件都是不固定的,那么每次都要计算两个文件的哈希值,就不太合适了. 所以,哈希比较这个方案被PASS....试验到此,比较两个900多MB的文件耗时1.5秒左右,读者对于该方法是否满意呢? No!我不满意!我相信通过努力,一定会找到更快的方法的!

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如何比较两个JavaScript对象

两个月以前在公众号发过一个图片消息,标题是 How to compare two objects in JavaScript,有一个关注了我的同事第二天告诉我说看不懂。...如何比较? 说了这么多废话,到底如何比较呢?...===大法好 能想到的第一个方法必然是全等比较,如果obj_1 === obj_2这条表达式返回的结果是 true 的话,则说明两个对象的内存地址相同,即:本就是一个对象。...接下来就要凭借着对 Object 对象的了解,手动比较了。 函数比较 在 JavaScript 中,函数也是对象的一种,所以我们先考虑一下,如果要比较的是两个函数该怎么办。...回忆一下你是如何区分两个函数的。 看函数名,看参数,看函数中的语句。如果我们能把函数转换成所有内容组成的字符串,是不是就很直观了?

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linux 文件比较

Creating new file" date > $HOME/testing fi else echo "sorry .you do not have a home directory" fi 第一个检查用-e比较来判断用户是否有...如过有,下一个-e比较会检查并判断testing文件是否存在与$home目录中。如果不存在,shell脚本会用单个大于号(输出重定向符号)来用date命令的输出创建一个新文件。...第二次运行这个shell脚本时,他会使用双大于号,这样他就能将date的输出追加到已经存在的文件后面。 '>'表示如果文件不存在 则创建文件,如果文件存在 则清空文件并输出。'...>>'表示 如果文件存在 则追加输出到文件后。 检查文件 -e比较适用于文件和目录。要确定指定的对象是个文件,必须用-f比较: #!...-r比较判断出我没有这个文件的读权限,所以test 命令失败了,而且bash shell 执行了if-then语句的else部分。 检查空文件 #!

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git 使用 VisualStudio 比较分支更改

有时候需要比较两个分支的不同,这时如果提交到 github ,那么默认就可以看到。但是这时因为没有ide的高亮或者其他的功能,看起来觉得不好。...默认的 VisualStudio 比较文件比 github 的用起来好很多,那么如何使用 VisualStudio 作为代码比较? 尝试打开一下 VS ,随意进行对比两个文件。...如果使用的是 Powershell ,那么可以输入 cmd 进入命令行 可以看到对比文件很好用,那么在 git 使用的默认比较分支是git difftool dev release 就可以比较两个分支,...但是如何使用 vs 进行比较?...忽略对比的文件夹 如果在 git 提交中,存在某个文件都是资源,在对比中,不停需要去看这些文件,感觉想把git卸了。但是git那么厉害,是不是有一个方法可以做到,忽略某个文件夹的更改。

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git 使用 VisualStudio 比较分支更改

有时候需要比较两个分支的不同,这时如果提交到 github ,那么默认就可以看到。但是这时因为没有ide的高亮或者其他的功能,看起来觉得不好。...默认的 VisualStudio 比较文件比 github 的用起来好很多,那么如何使用 VisualStudio 作为代码比较? 尝试打开一下 VS ,随意进行对比两个文件。...进入命令行 可以看到对比文件很好用,那么在 git 使用的默认比较分支是git difftool dev release 就可以比较两个分支,但是如何使用 vs 进行比较?...但是git那么厉害,是不是有一个方法可以做到,忽略某个文件夹的更改。是的,下面我来告诉大家如何忽略这个文件夹。...使用 git 输入下面的命令就可以忽略 resource 文件git difftool relase dev -- . ':!resource' 这个命令需要注意,-- . ':!

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git 合并两个仓库

好了还是回到问题,我想把两个git合并 首先用git bash 到我的一个仓库,作为需要合并的仓库 cd 仓库 添加我要合并仓库 # git remote add 仓库 仓库可以是远程仓库 git remote...lindexi git fetch lindexi git merge lindexi/master 解决冲突 git add . git commit -m "合并" git push lindexi...lindexi:ma我有两个仓库,一个是gitbook在写一本UWP入门,一个是放在github的垃圾,这个是我想要开个人网站,但是做的还是不行https://github.com/lindexi/lindexi.github.io...结果发现我需要做html,本来的文件没法直接转过去,但是我又不想使用第三方工具,于是最后我想着自己来写一个,于是就做了winMarkdown,win10软件,不过已经几个月没做 好了还是回到问题,我想把两个...解决冲突 git add . git commit -m "合并" git push lindexi lindexi:master git checkout master git merge lindexi

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git 合并两个仓库

好了还是回到问题,我想把两个git合并 首先用git bash 到我的一个仓库,作为需要合并的仓库 cd 仓库 添加我要合并仓库 # git remote add 仓库 仓库可以是远程仓库 git remote...lindexi:master git 我有两个仓库,一个是gitbook在写一本UWP入门,一个是放在github的垃圾,这个是我想要开个人网站,但是做的还是不行[https://github.com.../lindexi/lindexi.github.io结果发现我需要做html,本来的文件没法直接转过去,但是我又不想使用第三方工具,于是最后我想着自己来写一个,于是就做了winMarkdown,win10...软件,不过已经几个月没做](https://github.com/lindexi/lindexi.github.io结果发现我需要做html,本来的文件没法直接转过去,但是我又不想使用第三方工具,于是最后我想着自己来写一个...,于是就做了winMarkdown,win10软件,不过已经几个月没做 ) 好了还是回到问题,我想把两个git合并 <!

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