首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

系统比较Seuratscanpy版本之间、软件之间分析差异

SeuratScanpy是实现这种工作流最广泛使用软件,通常被认为是实现类似的单个步骤。下面我们就需要比较一下软件之间、以及不同版本之间数据分析差异。...最后,通过差异表达(DE)分析鉴定cluster特异性marker基因,其中每个基因表达在每个cluster与所有其他cluster之间进行比较,并通过倍比变化p值进行量化。...SeuratScanpy之间选择通常归结为用户编程偏好和他们scRNA-seq数据分析项目的具体要求。...这些估计没有考虑额外成本,包括人工、实验设置后续分析。生物信息学数据分析中一个典型隐含假设是,软件版本之间选择应该对结果解释几乎没有影响。...这些版本之间logFC计算调整后p值没有差异。比较使用默认设置Cell Ranger软件v7Cell Ranger v6生成计数矩阵也揭示了所有DE指标之间差异

16320

数据科学,数据分析机器学习之间差异

机器学习,数据科学和数据分析是未来发展方向。机器学习,数据科学和数据分析不能完全分开,因为它们起源于相同概念,但刚刚应用得不同。它们都是相互配合,你也很容易在它们之间找到重叠。...,如果数据科学是由所有工具资源组成房子,那么数据分析将是一个特定空间。...它通常使用数据洞察力通过连接趋势模式之间点来产生影响,而数据科学更多地只是洞察力。   数据分析进一步分为数据挖掘等分支,包括对数据集进行排序识别关系。数据分析另一个分支是预测分析。...预测分析有助于在市场研究阶段,并使从调查中收集数据在预测中更加可用准确。   总而言之,显然不能在数据分析和数据科学之间划清界限,但数据分析师通常会拥有与经验丰富数据科学家相同知识技能。...它们之间区别在于应用领域。 ? 机器学习 机器可以借助算法和数据集来学习。机器学习基本上包括一组算法,这些算法可以使软件程序从过去经验中学习,从而使其更准确地预测结果。

1.1K20
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

反向代理与正向代理之间差异分析

但你是否了解反向爬虫ip正向爬虫ip之间区别呢?本文将向你分享反向爬虫ip与正向爬虫ip差异分析,帮助你更好地选择适合爬虫ip方式,提升爬虫项目的实际操作价值。 ​...反向爬虫ip是从客户端到服务器爬虫ip。 正向爬虫ip:正向爬虫ip是位于客户端和服务器之间爬虫ip,将客户端请求转发给服务器,隐藏了客户端真实身份。...正向爬虫ip应用场景: 突破封锁:正向爬虫ip可以绕过网络封锁,访问被屏蔽网站资源。 隐藏真实身份:正向爬虫ip可以隐藏客户端真实IP地址身份信息,保护个人隐私。...现在,具体分析一下反向爬虫ip与正向爬虫ip差异 1、请求方向:反向爬虫ip是从客户端到服务器爬虫ip,正向爬虫ip是从服务器到客户端爬虫ip。...无论选择哪种爬虫ip方式,都要根据实际需求和情况进行权衡选择,以提升爬虫项目的实际操作价值。 通过本文分析,相信你已经对反向爬虫ip与正向爬虫ip之间差异有基础认识。

15650

差异分析|DESeq2完成配对样本差异分析

前段时间拿到一个RNA-seq测序数据(病人癌旁样本,共5对)及公司做差异分析结果(1200+差异基因),公司告知用是配对样本DESeq分析。...考虑到平时limmaDESeq2包进行差异分析时没有特别注明是否配对,这配对非配对有啥区别呢? 于是分别尝试使用limmaDESeq2包非配对分析,发现得到差异基因公司差距很大。...可以看到只有67个下调33个上调,火山图不好看,而且根本没法继续做GOKEGG分析。 OK,尝试使用DESeq2包非配对差异分析。...可以看到常规DESeq2分析比limma voom分析多了一些差异基因,但是公司给1200+差异基因还是差远了。...发现差异之后开始了检索求助之旅,查了很多帖子,也求助了一些大神,似乎很少人注意过DESeq2包做配对差异分析

5.8K42

傅立叶分析小波分析之间关系? (通俗讲解)

如上图,最上边是频率始终不变平稳信号。而下边两个则是频率随着时间改变非平稳信号,它们同样包含最上信号相同频率四个成分。 做FFT后,我们发现这三个时域上有巨大差异信号,频谱却非常一致。...知道信号频率随时间变化情况,各个时刻瞬时频率及其幅值——这也就是时频分析。...比如你至少还要知道有一个“尺度函数”存在,它是构造“小波函数”关键,并且是它小波函数一起才构成了小波多分辨率分析,理解了它才有可能利用小波做一些数字信号处理;你还要理解离散小波变换、正交小波变换、...A.作为图像处理方法,多尺度几何分析方法(超小波)比: 对于图像这种二维信号的话,二维小波变换只能沿2个方向进行,对图像中点信息表达还可以,但是对线就比较差。...作为时频分析方法,HHT比: 相比于HHT等时频分析方法,小波依然没脱离海森堡测不准原理束缚,某种尺度下,不能在时间频率上同时具有很高精度;以及小波是非适应性,基函数选定了就不改了。

1.6K90

PostgreSQL MySQL 之间性能差异

导读:在本文中,我们将讨论工作负载分析运行查询,一起了解两个数据库系统在 JSON、索引并发方面的性能差异。 简介 在管理数据库时,性能是一项非常重要而又复杂任务。...MySQLPostgres最新版本略微消除了两个数据库之间性能差异。 在MySQL中使用旧MyISAM 引擎可以非常快速地读取数据。不幸是,在最新版本MySQL中尚不可用。...好消息是,MySQL不断得到改进,以减少大量数据写入之间差异。 甲数据库基准是用于表征比较性能(时间,存储器,或质量)可再现试验框架数据库在这些系统上系统或算法。...JSON查询在Postgres中更快 在本节中,我们将看到PostgreSQLMySQL之间基准测试差异。...- InnoDB多版本- MySQLMVCC 结论 在本文中,我们处理了PostgreSQLMySQL之间一些性能差异

4.8K20

Google 开源 Docker 镜像差异分析工具 container-diff

Google 发布了一个名为 container-diff 开源项目,这是一个分析比较容器镜像工具,可用来分析 Docker 镜像之间差异。...container-diff 可通过几个不同标准来检查镜像,包括: Docker 镜像历史 镜像文件系统 Apt 包管理器 pip 包管理器 npm 包管理器 上述分析可以在单个镜像上执行,也可以在两个镜像上执行以进行比较...该工具可以帮助用户更好地了解他们镜像内部发生了什么变化,并让他们更好地了解镜像包含什么内容。...单个分析: container-diff analyze      [Run default analyzers] container-diff analyze  --type=history...据 Google 介绍,container-diff 还可以提供自动变更日志管理,与持续集成系统集成,并支持 JSON 格式输出,完全可将其作为开发流程一部分。

1.3K10

揭秘AWS,AzureGoogle:云提供商之间差异真的重要吗?

他们之间有一些有趣变化,例如,AWS提供了购买“可转换预留实例”选项,该选项允许在系列、操作系统实例大小之间交换预留。另一方面,Azure在其核心Reserved VM选项中提供了类似的灵活性。...Google Cloud程序在资源方面更灵活一些,因为客户只需选择一些vCPU内存,不必选择特定实例大小类型。 如果您改变主意怎么办?...因此,这种定价结构最适合用于容错应用程序短期流程,如财务建模测试等。虽然在跨云购买使用这些实例类型具体机制上存在差异,但它们折扣方式用例大体类似。 ?...自身因素 此外,人们对云提供商之间差别也有着不同看法。 例如,有些人可能认为Azure有点笨拙,而Google Cloud看起来很流畅,但其性能可能不如AWS。...一些人欣赏AWSAzure企业支持,认为Google Cloud在这方面有所欠缺,但随着Google吸引了更多客户并专注于企业兼容性,这种情况正在发生改变。

1.6K20

3个分组表达量矩阵两两之间差异分析

总是有粉丝询问多个分组两两之间差异分析如何弄这样问题,其实“师傅领进门,修行在个人”,我们讲解了方法并且给予全部学习资源,理论上后续应该是大家各凭本事,做好自己科研。...接下来进行3分组两两之间差异分析 直接使用limma包即可: design <- model.matrix(~0+group) colnames(design) <- gsub("group", ""...这3次差异分析结果都是可以独立取出来了: colnames(efit) # [1] "AVSB" "AVSC" "BVSC" AVSB <- topTreat(efit, coef=1, n=Inf...思考题 难道3个分组,仅仅是有两两组合这样3种形式差异分析吗?...上面的代码大量涉及到R基础知识: 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》 需要把R知识点路线图搞定,如下: 了解常量变量概念 加减乘除等运算(计算器) 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子

2.4K30

代谢组学无非也是差异分析富集分析

Behavior》,链接是:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31675497/ 首先看组间差异组内差异 我们一直强调,看组间差异组内差异主要是3张图,代谢组学转录组都是一样...然后是差异分析 可以使用热图火山图展示形式: ?...可以看到仍然是统计学指标P值变化倍数来进行差异筛选,至于筛选到是转录组数据基因列表,还是我们这个代谢组代谢物列表,不过是表明形式不一样而已!...分析一文就够(单机版+R语言版) 根据分组信息做差异分析- 这个一文不够 差异分析得到结果注释一文就够 代谢组学方法描述 首先保证是从6 to 8-week-old mice 体内通过 FACS AriaII...然后 各自独立去比较 Knock-out Scientific Control差异 : ?

6.5K20

拟时序分析就是差异分析细节剖析

副标题: 所有的大样本量差异分析都可以转为拟时序分析 两个分组差异分析仅仅是上下调吗?...很多小伙伴在后台表示对单细胞数据分析里面的拟时序分析不理解,恰好最近看到了一个超级清晰明了展现拟时序分析作用文献,分享给大家。...它完美的展现了差异分析为什么不够,为什么拟时序分析就是差异分析细节剖析。...而且作者在自己ccRCC单细胞矩阵里面以及一个公共数据集HCC里面,都展现了类似的差异分析,并且筛选共有基因: 差异基因及其交集 这样差异分析,尽管说做了交集,但是仍然是很多细节丢掉了,得到仅仅是上下调这样属性...拟时序差异基因表达量图 最后这个图,看起来有技术含量!

2.4K30

Python 3.10 Python 3.9 之间差异

Python 作为一编程语言,有许多用例吸引了 IT 行业学习者专家。在基本层面上,Python 可以用作编程语言来练习数据结构算法或开发简单项目或游戏。...自动化正在接管 IT 行业大部分领域,而 Python 作为用于自动化数据分析或数据科学任务首选语言处于领先地位。...Python 库是一种巨大资源,可用于许多关键代码编写,例如: 基于正则表达式代码 字符串处理 互联网协议,如 HTTP、FTP、SMTP、XML-RPC、POP、IMAP 统一码 文件系统计算文件之间差异...CGI编程 数学建模 数据库查询 数据分析 数据可视化 自动化代码 所有这些功能都可以在许多 Unix、Linux、macOS Windows 系统上执行。...分析 Python 3.9 V/s Python 3.10 差异 多年来,Python 进行了大量升级,并且在新版本中添加了许多功能。在这里,让我们关注 Python 添加两个最新版本。

2.9K20

大数据、数据分析、数据统计、数据挖掘、OLAP之间差异

在大数据领域里,经常会看到例如数据挖掘、OLAP、数据分析等等专业词汇。如果仅仅从字面上,比较难描述每个词汇意义区别。...今天,我们就来通过一些大数据在高校应用例子,来为大家说明白—数据挖掘、大数据、OLAP、数据统计之间差异。...从数据本身复杂程度、以及对数据进行处理复杂度深度来看,可以把数据分析分为以下4个层次:数据统计,OLAP,数据挖掘,大数据。...[图片] 总结 从数据分析角度来看,目前绝大多数学校数据应用产品都还处在数据统计报表分析阶段,能够实现有效OLAP分析与数据挖掘还很少,而能够达到大数据应用阶段非常少,至少还没有用过有效大数据集...[图片] 点评: 我们不需要纠结所谓“专业名词”,作为一个数据分析师,我们目标是帮助业务更好发展、减少决策风险、提取重要信息,所以业务套路理解才是我们立足之本,数据分析毕竟是我们达成某种目标的工具

1.6K00

kafka consumer assign subscribe模式差异分析

,发现flink使用了kafka consumer一个比较底层一点assign接口而不是之前比较常用subscirbe,于是研究下二者之间差异。...与subscirbe方法不同,assign方法由用户直接手动consumer实例消费哪些具体分区,根据api上述描述,assignconsumer不会拥有kafkagroup management机制...assign方法不能subscribe方法同时使用。 然后看一下具体实现源码: <!...poll方法调用情况下不同实现 上述两种模式初始化consumer在fetch数据时候调用是同样poll方法,每次poll会调用pollOnce方法内 <!...所以正如api文档描述,assignconsumer不会拥有kafkagroup management机制,也就是当group内消费者数量变化时候不会有reblance行为发生。 <!

2.5K10

Google Mock(Gmock)简单使用源码分析——源码分析

源码分析         通过《Google Mock(Gmock)简单使用源码分析——简单使用》中例子,我们发现被mock相关方法在mock类中已经被重新实现了,否则它们也不会按照我们期待行为执行...我们通过阅读源码,来分析整个过程实现逻辑。...2中函数是使用gmock函数名联合组装成新函数名,它返回了一个被参数筛选函数对象。EXPECT_CALLON_CALL宏中就是调用了它。...一般来说gmock##Method中参数约束是针对各自参数,而With则是关注于参数之间关系。我们看下这两处约束是怎么工作。        ...设定约束         我们主要分析下Times、WillOnceWillRepeatedly这几个常见约束。

4.1K20

缓存使用中Redis,Memcached共性差异分析

要明白各自使用场景,就要先知道他们共同点差异点。 共同点: 1.Memcached与Redis都属于内存内、键值数据存储方案,都是nosql数据库中杰出代表。...2.几乎所有主流程序设计语言都有支持memcachedredis客户端库,上手容易,门槛极低。...(没有身份验证也是能够在高负载下表现优良一个原因,当然如果别人知道了端口ip,后果很严重,这也是目前redis最大安全隐患,许多知名互联网项目目前都未进行身份验证) 重要来了,差异点: 1.Memcached...redis2.1.3之后版本里,可以多次对key使用expire命令,更新keyexpire time。...所以通过以上分析,虽然Redis与Memcached都是作为两款非常优秀而且久经考验缓存解决方案,各有优劣。

42220
领券