本文的内容最初由Marko Rodriguez和Bobby Norton在Aurelius博客上共同撰写。 webwxgetmsgimg.jpg 点阵是一个有特定且明确结构的图。...但是当点阵变得太大而不能有效地作图并手动枚举时，就可以通过数学技术来确定路径的数量。使用Blueprints的TinkerGraph方法来构造一个点阵并通过Gremlin方法来遍历它。...理论上，Gremlin可以遍历和计数这些路径。但是，这种方法有限制。...确定闭式方程的一种方法是在Google上搜索序列。返回的第一个网站是整数序列在线百科全书。...欧拉计划是数学和编程挑战的集合。问题15：“通过20x20的点阵有多少路线？”
默认情况下，远程连接是无会话的，这意味着在控制台中发送的每一行都被解释为单个请求。可以使用分号作为分隔符在一行上发送多个语句。或者，你可以通过在创建连接时指定会话来建立具有会话的控制台。...注意：如果您希望能够在每台服务器上使用相同的HMAC令牌，则在所有正在运行的JanusGraph服务器上应该是相同的。...基本上，Gremlin Server yaml文件指向特定的图配置文件，这些文件用于实例化它随后将使用的JanusGraph实例。...为了实例化这些Graph实例，Gremlin Server要求在其classpath上提供JanusGraph的相应库和依赖项。...发行版下面启动的，当使用单独的Gremlin Server的测试时，Gremlin控制台是从TinkerPop发行版下启动的。
几十年来，主要的方法是从一组相关序列中推断进化约束。在过去的一年里，蛋白质语言模型已经成为一种潜在的替代方法，但目前性能还没有达到生物信息学中最先进的方法。...潜在的误差来源包括 预滤波的启发式方法失效 相关序列未被检测到 未能找到最佳对齐 替代矩阵和间隙惩罚的次优性，即找不到全局最优解 2.3 评估指标 对于长度为 的蛋白质，我们评估了长度为前 、...形式上，注意力图和残基接触图都可以表示为一个 的方阵。...3.2 Gremlin 对于一组训练序列 ，Gremlin优化了以下伪似然损失： 其中单个位置被掩盖并从其上下文中预测其真实的氨基酸残基，其实就是利用上下文预测中心词，本质上和Word2Vec中的连续词袋模型...仅使用10个训练示例，该模型在所有度量上都优于Gremlin。
ConfiguredGraphFactory是图的一种访问方式，类似于JanusGraphFactory。 这些图的工厂类提供了动态管理托管在服务器上的图的方法。 1....JVM上创建的图引用。...图表引用也将存储在JVM上的图缓存中。 因此，使用graph.graphname属性打开的，在相关JVM上实例化的任何图将从图缓存中检索。 这就是为什么更新配置需要几个步骤来保证正确性的原因。...Graph and Traversal Bindings 使用ConfiguredGraphFactory创建的图形通过“graph.graphname”属性绑定到Gremlin Server上的执行程序上下文...这意味着使用ConfigredGraphFactory创建的图形和遍历绑定将在所有JanusGraph节点上可用，最多延迟20秒。 它还意味着在服务器重新启动后，节点上的binding仍然可以使用。
：在多机器集群并行处理图的系统； VertexProgram：通过消息传递进行通信，用逻辑并行的方式在所有点上执行的代码； MapReduce：并行的分析图中所有的点，对结果进行归约的计算。...一旦实现，Gremlin遍历可以在图数据库（OLTP）和图处理器（OLAP）上执行。然而，Gremlin语言是基于图的领域特定语言，根据点和边来解释图。用户也可以创建自己的领域特定语言。...每个Gremlin遍历由一系列步骤（可能存在嵌套）组成，每一步都在数据流（data stream）上执行一个原子操作。...，可以把包含数千亿个顶点和边的图存储在多机集群上。...，运行Gremlin查询，JanusGraph缓存和事务处理和应用在同一个JVM上； 2.通过提交Gremlin查询，和本地或者远程的JanusGraph实例交互，JanusGraph原生支持Gremlin
每个Gremlin遍历由一系列步骤（可能存在嵌套）组成，每一步都在数据流（data stream）上执行一个原子操作。...4：获取gremlin用户的不同领域的合作者的title和其数量 g.V().has("name","gremlin").as("a")....获取名为“gremlin”的顶点 2. 获取Gremlin购买的产品并保存为以“stash”命名的临时集合 3. 还有谁买了这些产品，并且得到他们买的东西 4....Gremlin是构建基于图的应用程序所必要的，其余一切都交给Gremlin遍历机处理。...命令式的Gremlin遍历告诉遍历者如何在遍历中的每一步进行。 例如，下面的命令遍历首先将遍历器放置在表示Gremlin的顶点处。
Gremlin是JanusGraph的查询语言，用于从图中检索数据和更新数据。 Gremlin是一种面向路径的语言，它能够简洁地表示复杂的图形遍历和多步操作。...通过Gremlin查询语言在JanusGraph基础上开发的应用程序，用户可以避免被数据库绑定，因为他们的应用程序可以迁移到支持Gremlin的其他图数据库。...本节是Gremlin查询语言的简要概述。 有关Gremlin的更多信息，请参阅以下资源： Complete Gremlin Manual: Gremlin的参考手册。...Practical Gremlin Book: 图数据库和Gremlin查询语言的入门指南。 Gremlin Recipes: Gremlin的最佳实践和常见遍历模式的集合。...Gremlin的其他语言驱动和实现也是可以使用的。 2. 遍历迭代 Gremlin控制台其中的一个特性是它从gremlin>prompt自动迭代所有的查询结果。
Gremlin Console是在JanusGraph包中自带的一个REPL(即交互式的shell)，这跟标准的Gremlin Console有所不同，因为它是JanusGraph预安装和预加载的包。...从起始点，Gremlin路径描述描述了如何通过显示的图结构来遍历图中的其他点。 通过name属性上的唯一索引，可以检索到Saturn顶点，然后可以查到它的所有属性值(即Saturn属性的键值对)。...为了赎罪，Delphi命令Hercules为Eurystheus服务，Eurystheus让他做12年的工人。 上一节中，证明了Saturn的孙子是Hercules。...这也可以使用循环的方式来查询，实际上Hercules是从Saturn在in('father') 路径上循环两次到达的点。...下面将展示更多关于Gods图的Gremlin遍历的例子。
图形数据库适用于高度连接数据的应用程序，其中数据之间的关系是应用程序功能的重要部分，如社交网站。Titan用于存储和查询分布在多台机器上的大量数据。...第2步 - 使用Gremlin查询图表 Gremlin是一种图形遍历语言，用于查询，分析和操作Graph数据库。现在Titan已经设置并启动，您将使用Gremlin创建和查询Titan的节点和边缘。...将其设置为false创建可以存储数据的常规ElasticSearch集群节点。 最后，添加此行，告诉Gremlin Server它将要服务的图形类型。...我们需要将这个新配置文件添加到Gremlin Server。打开Gremlin Server的配置文件。...结论 在Ubuntu 16.04上配置完Titan Graph数据库，有关更多Titan的更多内容，查看官方文档了解更多信息 。
For the JanusGraph Server, JanusGraph 使用 Apache TinkerPop 的Gremlin Server 来服务client的请求。...配置JanusGraph Server是通过位于JanusGraph发行版的./conf/gremlin-server目录中的JanusGraph Server yaml配置文件完成的。...conf 和 conf/gremlin-server下都有 .properties文件 ，conf/gremlin-server下的.properties文件多一个 -server.properties...的路径 Gremlin 在gremlin-server没有启动（gremlin-console自然也无法通过:remote连接）的情况下，gremlin-console也能执行下面的语句 gremlin...org.janusgraph.graphdb.tinkerpop.JanusGraphIoRegistry] } } 这个配置文件可以配置多个host，用逗号隔开 连接一台host上的多实例
这与标准Gremlin Server实现允许访问图形的方式有所不同。 传统上，用户通过gremlin-server.yaml文件进行相应配置，在服务器启动时创建与图形的绑定。...} 然后，你将使用以下方式访问Gremlin Server上的图：String graph1将根据其对应的属性文件绑定到服务器上打开的图形，对于graph2也是如此。...的遍历引用，最多20秒滞后以使绑定生效在群集中的任何节点上。...这允许你在JanusGraph集群中的每个节点上通过字符串绑定访问动态创建的图形及其遍历引用。...这将允许在远程图形引用的情况下在本地运行gremlin查询。 传统上，通过发送字符串脚本表示来运行对远程Gremlin服务的查询，这些表示在远程服务上处理并且响应被序列化并发回。
Hadoop 2和 Tinkerpop 3.2.3，采用 Gremlin 图查询语言； Neo4j：Neo4j 使用「图」这种最通用的数据结构来对数据进行建模，使得 Neo4j 的数据模型在表达能力上非常强...每个Gremlin遍历由一系列步骤（可能存在嵌套）组成，每一步都在数据流（data stream）上执行一个原子操作。...切断后，该边会在起始 Vertex 上和目的 Vertex 上各存储一次（多浪费了空间）。...，修改完成后再写回，效率较低； 对边的属性过滤，将数据取回客户端，在客户端进行过滤，增加了网络传输的消耗； 一言以蔽之，目前基于 NoSQL的图数据库，都可以视为只是在分布式 NoSQL 上封装了一层逻辑的图...Gremlin 查询示例 关于 Gremlin的语法和例子，请参考我之前写的 Gremlin 图查询概述 这一篇文章。
此代码将选项卡上的文本行分割以创建包含两个userID值的列表。...要执行此脚本，请将其复制到Titan安装目录根目录下的文件中。请注意，该脚本将在文件系统上生成Titan数据库。开始Gremlin 。...即使是100万条边的规模，复杂性也仅仅来自批量加载脚本。本节中的加载脚本提供了一个良好的框架，我们可以在其上实现更加复杂的加载。 1000万 [gremlin-to-the-7.png?...w=112&h=150] 加载数千万条边的方法与上一节没有太大区别。Gremlin脚本仍然是最直接的加载方法，但是需要考虑一些差异。...在数百万和数千万条边的规模上，我们通常需要Gremlin脚本和REPL来批量加载活动。对于那些刚刚开始使用TinkerPop和Titan的人来说，需要掌握最基本的堆栈知识。
图查询语言·介绍图片图查询语言 GremlinGremlin 是 Apache ThinkerPop 框架下的图遍历语言。Gremlin 可以是声明性的也可以是命令性的。...IDvidid(n)vid边 IDeidid(r)无插入addcreateinsert删除dropdeletedelete / drop更新属性setPropertysetupdate我们可以看到大体上对点和边的叫法类似...其他的术语基本都非常直观。图查询语言·语法篇了解过 Gremlin、Cypher、nGQL 中常见的术语之后，我们来看看使用这 3 个图查询语言过程中会需要了解的常规语法。...，只不过 nGQL 中多了 UPDATE 关键词来标识操作，Gremlin 的操作和上文提到的查看点类似，只不过增加了变更 property 值操作。...)边的 CRUD说完边类型应该进入到边的常规操作部分了插入指定边类型的边可以看到和点的使用语法类似，只不过在 Cypher 和 nGQL 中分别使用 -[]-> 和 -> 来表示关系，而 Gremlin
Tourist 打开gremlin-console，我们可以通过groovy语言对图进行curd操作，也可以使用gremlin语法进行遍历 $ bin/gremlin.sh \,,,...gremlin server: httpserver/websocket server接收标准的gremlin dsl语法，自身相当于一个计算节点，完成图的遍历，或者操作DML语言，操作底层OLTP图库...gremlin traversal language: 图的查询遍历语言及语言解释实现，类似sqlparser provider strategies:vendor可自定义的策略，如对某些遍历步骤可优化...Traverser: 代表了在当前遍历过程中数据流的一个状态，维护了到当前对象的引用 限于篇幅，更多内容查阅org.apache.tinkerpop.gremlin.process.traversal包对应的源码...众所周知搜索引擎使用全文搜索的技术，本质上是term->document倒排索引，如下query ”XX明星的老婆的弟弟的舅舅的儿子叫什么“ 使用全文搜索方式完全丧失了答案的正确性，使用图数据库轻而易举能得到正确答案
执行bin / gremlin.sh（Unix / Linux）或bin / gremlin.bat（Windows）来启动控制台，然后使用已存在的配置文件调用factory方法来打开JanusGraph...配置JanusGraph Server是通过位于JanusGraph安装包中的./conf/gremlin-server目录下的JanusGraph Server yaml配置文件来完成的。...在上面的例子中，它将图绑定到conf / janusgraph-berkeleyje.properties上的JanusGraph配置。...GLOBAL：始终从群集配置中读取这些选项，并且不能在实例的基础上覆盖这些选项。 GLOBAL_OFFLINE：与GLOBAL一样，但更改这些选项需要重新启动群集以确保整个群集中的值相同。...例如，要更改JanusGraph集群上的默认缓存行为： mgmt = graph.openManagement() mgmt.get('cache.db-cache') // Prints the current
这篇文章只讨论查询模式上的差异，并且对每一种的查询给出相应的例子，学习学习基本的语法、做做对比即可。...效率问题以及问题产生的根本需要还是再开一篇来讲好了，这篇文章还是将内容限定在对于同样的问题，数据应该如何存储与查询上。...2.3 Gremlin Gremlin是由Groovy实现的图查询语言，查询过程就是图遍历的过程。...也许很好，考虑到只能在Neo4j上使用，并且社区版的Neo4j只能跑在单机上，以及有无数号称速度超过Neo4j的图数据库已经出现了，个人不太想学。...你要是觉得写查询不累、构造查询不麻烦，其实都行的。抽象到像SPARQL/Gremlin这种级别的查询上还是需要一些工作的，本身未必很难，但是得做。
各自的特点： Cypher：只能在 Neo4j 上使用，但是社区版的Neo4j 只能跑在单机上，用 Gremlin 和 SPARQL 可以很容易地从某个数据库转到另外一个，但Cypher就不要想了。...SQL/ElasticSearch：当然也可以自己构造查询，但是人工把输入抽象到像 SPARQL/Gremlin 这种级别的查询上还是需要一些工作的，本身未必很难，但是得做。...图数据库 下面是一些流行的图数据库及其发展趋势，数据来源于：https://db-engines.com/en/ 。DB-Engines创办于2012年10月，是目前世界上最具权威数据库排行榜。 ?...Neo4j创建的图是用顶点和边构建一个有向图，其查询语言cypher已经成为事实上的标准。 Neo4j 分为社区版和企业版，社区版只能工作在单机上，社区版免费 ，企业版收费 。...AWS和微软这两个竞争对手在云数据库的处理方法上截然不同的。
. 4.2.1 JanusGraphFactory 4.2.1.1 Gremlin Console JanusGraph中的Gremlin命令行工具可以方便的启动JanusGraph并和其交互....这个长时间运行的程序就是JanusGraph Server JanusGraph Server使用Gremlin Server(Apache TinkerPop stack) 处理客户端的请求..../conf/gremlin-server目录下的yaml文件....插件启用了JanusGraph Gremlin插件, 这个插件能够自动导入JanusGraph的类, 远端提交的脚本可以参考这些类....如下步骤: 集群仅留一个实例 连接到该实例上 确保全部业务都关闭 确保没有新的业务被启动 打开管理API 修改配置参数 调用commit方法, commit方法会自动将实例停止 重启全部实例 查看全部配置参数
（数据的结构、操作和约束）: RDF 图模型和属性图模型 数据模型特性 数据模型特性 RDF 图模型 属性图模型 结构 标准化程度 数学模型 表达力 边属性表达 概念层本体定义 串行化格式 已由 W3C...水平表的每行记录存储知识图谱中一个主语的所有谓语 和宾语。实际上, 水平表相当于知识图谱的邻接表。水平表的列数是知识图谱中不同谓语的数量, 行数是知识图 谱中不同主语的数量。...实际上，水平表就是属性表的一种极端情况，即水平表是将所有主语划归为一类，因此属性表中的空值问题得到很大的缓解。...4.1.3 分布式图数据库：JanusGraph JanusGraph 是在原有 Titan 系统基础上继续开发的开源分布式图数据库。...它是世界上能够托管具有数百亿个顶点（节点）和数万亿条边（关系）的图形的最佳解决方案，具有毫秒级延迟。
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