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Nat. Commun. |一种使用多模态生物数据预测未来病理性tau蛋白积累的可解释的机器学习方法

近日,剑桥大学-加州大学伯克利分校-伯明翰大学联合团队在《Nature Communications》(影响因子IF=14.919)上发表了题为“A robust and interpretable machine learning approach using multimodal biological data to predict future pathological tau accumulation”的论文[1]。该论文提出了一种基于广义矩阵学习向量量化的轨迹建模方法通过结合多模态生物数据来预测病理性tau蛋白积累,根据tau蛋白积累对阿尔兹海默病(AD)患者进行分层,为针对AD早期阶段的临床试验设计提出了一种具有转化影响的精细分层和预测的方法。本文通信作者是剑桥大学的Zoe Kourtzi教授,第一作者是Zoe Kourtzi教授研究组的博士后Joseph Giorgio博士。

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皮质-皮质网络的多尺度交流

大脑网络中的信号在多个拓扑尺度上展开。区域可以通过局部回路交换信息,包括直接邻居和具有相似功能的区域,或者通过全局回路交换信息,包括具有不同功能的远邻居。在这里,我们研究了皮质-皮质网络的组织如何通过参数化调整信号在白质连接体上传输的范围来调节局部和全局通信。我们发现,大脑区域在偏好的沟通尺度上是不同的。通过研究大脑区域在多个尺度上与邻居交流的倾向,我们自然地揭示了它们的功能多样性:单模态区表现出对局部交流的偏好,而多模态区表现出对全球交流的偏好。我们表明,这些偏好表现为区域和尺度特定的结构-功能耦合。即,单模态区域的功能连接出现在小尺度回路的单突触通信中,而跨模态区域的功能连接出现在大尺度回路的多突触通信中。总之,目前的研究结果表明,交流偏好在大脑皮层之间是高度异质性的,形成了结构-功能耦合的区域差异。

02

脑影像中的深度学习研究:前景与挑战

深度学习(DL)在应用于自然图像分析时非常成功。相比之下,将其用于神经影像学数据分析时则存在一些独特的挑战,包括更高的维度、更小的样本量、多种异质模态以及有限的真实标签(ground truth)。在本文中结合神经影像学领域的四个不同且重要的类别讨论了DL方法:分类/预测、动态活动/连接性、多模态融合和解释/可视化。本文重点介绍了这些类别中每一类的最新进展,讨论了将数据特征和模型架构相结合的益处,并依据这些内容提出了在神经影像学数据中使用DL的指南。对于每一个类别,还评估了有希望的应用和需要克服的主要挑战。最后讨论了神经影像学DL临床应用的未来方向。

03

比较脑磁图与高密度脑电图的内在功能连通性

脑磁图(MEG)与基于限带功率包络相关的静息状态功能连接(rsFC)联合使用,可以研究人类大脑内在网络所组成的静息状态网络(RSNs)。然而,目前MEG系统的可用性有限,阻碍了电生理rsFC的临床应用。在这里,我们直接比较了已知的RSNs以及全脑rsFC连接体及其状态动力学,这些数据来源于同时记录的MEG和高密度头皮脑电图(EEG)静息状态数据。通过比较头部边界模型和头部有限元模型的结果,研究了头部模型精度对脑电rsFC估计的影响。结果显示,除额顶叶网络外,MEG和EEG获得的RSN图大部分相似。在连接体水平,与脑电图相比,MEG对额部rsFC的敏感性较低,而对顶枕部rsFC的敏感性较高。这主要是由于脑磁图传感器相对于头皮位置的不均匀性,当考虑相对脑磁图传感器位置时,显著的脑磁图差异消失了。在区分灰质和白质的脑电图中,默认网络是唯一需要高级头部建模的RSN。重要的是,rsFC状态动力学的比较证明了MEG和头皮脑电图之间的较差的对应关系,表明了对瞬态神经功能整合的不同成分的敏感性。因此,这项研究表明,基于人脑连接体的静态rsFC研究可以以类似于MEG的方式在头皮脑电图中进行,为rsFC分析的广泛临床应用开辟了道路。本文发表在NeuroImage杂志。。

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智能识别技术 让计算机看懂世界

互联网发展之初受到网络带宽、数据存储等相关技术的限制,信息传播以单模态形式为主,如文字报道、图像相册等。进入大数据时代,信息传播变得丰富多彩,人们从互联网中同时接受图像、视频、文本等不同模态的信息。例如,当我们在互联网上浏览一篇精彩的新闻报道时,不仅可以看到详细的文字描述,还能看到现场拍摄的照片,甚至还有相关的视频报道。这体现了互联网数据从单模态到多模态的转变。 随着互联网多模态数据的出现和传播,“管不住”和“用不好”两大问题也日益突出。“管不住”是指多模态大数据中隐藏着大量涉恐、涉暴等有害信息,极大地

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Current Biology:手语和口语共享部分概念表征

概念知识是人类认知的基础。然而,它在多大程度上受到语言的影响还不清楚。对语义处理的研究表明,相同的概念以不同的方式呈现(例如,口语单词和图片或文本)会引发相似的神经模式。这表明概念表征是独立于模态的。然而,另一种可能性是,相似性反映了对常见口语表征的检索。事实上,在听口语使用者说话时,文本和口语是相互依存的,而图像是通过视觉和语言的途径来编码的。一项针对语义认知的平行研究表明,双语者在不同的语言中对相同的单词的感知是激活相似的模式的。这表明概念表征是独立于语言的。然而,这只在使用口语的双语者中测试过。如果不同的语言可能唤起不同的概念表示,那么在结构上有很大差异的语言应该是神经分离最明显的。父母使用手语的听人在手语和口语上都是双语的(就是我们常说的平衡双语者),且这两种语言以不同的方式传达(口语是听觉通道,而手语是视觉通道,他们经历的早期过程是不同的,在语言通达上可能也存在一些差异,但目前大部分研究仍旧停留在早期阶段)。

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