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为什么是AUC不是GSEA来挑选转录因子呢

首先批量计算AUC 如果是单细胞转录组数据里面,每个单细胞都是有一个geneLists,那么就是成千上万个这样的calcAUC分析,非常耗费计算资源和时间,就需要考虑并行处理,我们这里暂时不需要,所以直接...基因集的转录因子富集分析 motifs_AUC <- calcAUC(geneLists, motifRankings, nCores=1) motifs_AUC 可以看到是 24453个motifs的AUC都被计算了..., border="darkred") nes3 <- (3*sd(auc)) + mean(auc) abline(v=nes3, col="red") 可以看到 24453个motifs的AUC看起来满足正态分布...GSEA分析一文就够(单机版+R语言版) GSEA的统计学原理试讲 GSVA或者GSEA各种算法都是可以自定义基因集的 但实际上,绝大部分读者并没有去细看这个统计学原理,也不需要知道gsea分析的nes如何计算...不理解原理并不影响大家使用,知道这个概念,知道如何根据AUC去判断结果就好。

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【Redis】Redis 列表 List 操作 ( 查询操作 | 根据下标获取元素 | 获取列表长度 | 增操作 | 插入 | 删操作 | 移除 | 修改操作 | 设置列表指定索引的 )

文章目录 一、List 列表简介 二、查询操作 1、根据下标获取元素 2、获取指定下标索引的元素 3、获取列表长度 三、增操作 1、插入 2、在指定元素前后插入 四、删操作 1、移除 2、...删除列表指定个数的指定 五、修改操作 1、多列表操作 2、设置列表指定索引的 一、List 列表简介 ---- 在 Redis 中 , 通过 一个 键 Key , 可以 存储多个 , 这些存放在一个...执行 linsert key before/after value newValue 命令 , 可以 在 key 列表 的 value 前面 / 后面 插入新 newValue ; 代码示例 :...移除 : 从左侧移除 : 从 List 列表左侧移除一个 , 如果所有的都被移除 , 则 键 Key 也随之消亡 ; lpop key 从右侧移除 : 从 List 列表右侧移除一个 ,...name age "123" 127.0.0.1:6379> lrange age 0 -1 1) "123" 2) "18" 3) "17" 4) "16" 127.0.0.1:6379> 2、设置列表指定索引的

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html下拉框设置默认_html下拉列表框默认

HTTP 服务默认…… name 的属性必须要相同,必须有一个 value 实现默认选中的属性 :checked=”checked” – 文件输入项(在后期上传时候用到): -下拉…… html>...8.3多行文本输入框 8.4下拉列表框、 在表单中,通过和标记可 以在浏览器中设计一个下拉式的列表或带有滚动 …… > 指定要创建的控件类型 Text 默认,创建一个单行文本输入控件 Password...…… 列表 定义表单中下拉菜单的项目 设置下拉式菜单的默认项目 设置下拉菜单项目的 A 441 HTML 基础篇 HTML 进阶篇 CSS 基础篇 CSS 进阶篇 附录篇 续表 HTML …… 4-5...下拉列表框,节省空间 下拉列表在网页中也常会用到,它可以有效的节省网页空… (复选框 ) 2)....… 这里是固定第一行为表头) 窗口选项——选择拆分——再次选择冻结窗口——完成 如何设置单列下拉菜单: 无关联添加:使用有效性-序列,将要下拉的内容输入框内,中间以…… 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献

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Kotlin for Java Developers 学习笔记

列表 groupBy 按照指定字段将元素分类为若干个列表(例如按照 it.age 分类) associatedBy 会将重复字段删除 zip 将 2 个列表合并为一个列表,其中每一个元素分别由两个列表各自对应位置元素组合...表示返回可以为 null, (() -> Int)?...使用 private set 来将一个成员变量设置为仅允许从内部被修改,不会被外部的访问所修改 interface User { val nickname: String } class FacebookUser...(n + 1).takeIf { it < 7 } } println(numbers.first()) // 3 yield 在 Kotlin不是语言特性、不是关键字,只是一个函数 但它是懒惰的...Exception,不需要明确地检查是不是为 null 这种情况可以在 Java 代码中增加注解 @Nullable、@NonNull 等,这样 Kotlin 就可以强制检查 Nullable 的数据

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Kotlin 程序设计》第十二章 Kotlin的多线程

Kotlin 的设计中的关键特性是协程执行的实现是语言库的一部分, 不是语言的一部分,所以你不必绑定任何特定的编程范式或并发库。 协程实际上是一个轻量级的线程,可以挂起并稍后恢复。...: error("keyword not found") 当你有一个可调用的引用不是 lambda 时,使用也很方便: <div class="sample" markdown="1" data-min-compiler-version...如果该映射是用 withDefault 生成的,这个函数将返回默认不是抛异常。...如果你需要访问新的 API,请使用 kotlin-stdlib-jre7 和 kotlin-stdlib-jre8 maven 构件,不是标准的 kotlin-stdlib。...请注意,核心反射接口(如 KClass)是 Kotlin 标准库 (不是 kotlin-reflect)的一部分,不受移动影响。

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算法:使用二分查询技巧 取中间为啥是l+(r-l)2不是(l+r)2?

1.溢出问题 比如:Java的世界里Int类型最大是: Integer.MAX_VALUE = 2147483647 System.out.println("Integer.MAX_VALUE...r-l)/2或者(l+r)/2计算结果没有区别 在负向横向轴的情况下,l+(r-l)/2或者(l+r)/2计算结果有区别,计算后的结果是以left为边界相加,因为int/2的向下取整问题,导致计算结果的小一些...+ aa); System.out.println("bb = " + bb); 实际运行结果: aa = -4 bb = -5 原因: int类型的取整是向0取整,即使被取整的数绝对变小...右移是向下取整,即使被取整的数值变小 所以对于正数时两者相同,到了负数则变大 小结:在对负数进行右移运算时候,运算计算跟平时大脑运算的结果不一样,所以一般情况下乖乖用/除号,省得考虑不周,出现诡异的...如果满足性质1,则说明numsmid在目标元素的左侧,此时我们将区间左端点(l)移动到mid + 1(因为此时我们可以明确的知道numsmid并不是我们需要的元素) 如果满足性质2,则说明numsmid

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