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生信学习-Day6-学习R包

(4)arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序 arrange(test, Sepal.Length)#默认从小到大排序 arrange(test, desc(Sepal.Length))...group_by(Species):这一步将数据按照Species列的不同值进行分组,即将数据集分成多个子集,每个子集包含相同Species值的数据。...y = test2:表示要与test2数据框进行semi-join操作,即保留test1中与test2匹配的行。 by = 'x':指定要根据哪个列进行匹配。在这里,使用列x来进行匹配。...结果将是一个新的数据框,其中包含了test1中那些在test2中找到匹配项的行,而不包含在test2中找不到匹配项的行。这种操作通常用于数据集的筛选,以保留与另一个数据集相关的数据。...y = test1:表示要与test1数据框进行anti-join操作,即从test2中删除与test1匹配的行。 by = 'x':指定要根据哪个列进行匹配。在这里,使用列x来进行匹配。

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GPT 大型语言模型可视化教程

现在我们有了这两个列向量,只需将它们相加,就能产生另一个大小为 C = 48 的列向量。 现在,我们对输入序列中的所有标记进行同样的处理,生成一组包含标记值及其位置的向量。...在本指南中,我们将非常熟悉由长度为 C 的 T 列组成的矩阵集合。 层规范 上一节的输入嵌入矩阵是我们第一个变换器模块的输入。 变换器模块的第一步是对该矩阵进行层归一化处理。...现在我们知道了这个过程,让我们对所有列进行运行。 这就是自我关注层头部的流程。自我关注的主要目标是,每一列都希望从其他列中找到相关信息并提取其值,并通过将其查询向量与其他列的键进行比较来实现这一目标。...现在,对于每一列,我们都有了模型分配给词汇表中每个词的概率。 在这个特定的模型中,它已经有效地学习了如何对三个字母进行排序这一问题的所有答案,因此概率在很大程度上倾向于正确答案。...这一列的输出是一系列概率,我们实际上必须从中挑选一个作为序列中的下一个。我们通过 "从分布中采样 "来实现这一点。也就是说,我们随机选择一个标记,并根据其概率进行加权。

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    Pandas数据聚合:groupby与agg

    引言 在数据分析中,数据聚合是一项非常重要的操作。Pandas库提供了强大的groupby和agg功能,使得我们能够轻松地对数据进行分组和聚合计算。...基础概念 groupby 方法 groupby是Pandas中最常用的分组工具之一。它允许我们将DataFrame按照一个或多个列进行分组,从而可以对每个分组执行各种聚合操作。...常见问题 重复值处理:当分组键存在重复值时,默认情况下会根据这些重复值创建新的分组。如果希望去除重复项后再进行分组,可以在groupby之前使用drop_duplicates()。...'].sum() print("按部门分组并计算薪水总和:") print(grouped_salary_sum) 多列聚合 基本用法 多列聚合是指同时对多个列进行分组和聚合计算。...MemoryError: 对于特别大的数据集,在内存中直接进行多列聚合可能导致内存不足。此时可考虑分批次处理或利用数据库等外部存储系统。

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    Power Query 真经 - 第 7 章 - 常用数据转换

    图 7-11 的表将 “Measure” 进行了透视,得到了两列,其好处是后续可以单独对任何一列进行计算,这是合理的。...7.3 拆分列 拆分列,是另一种常用操作(特别是在从 “平面” 文件导入时),是根据某种分隔符或模式将数据点从单个列中拆分出来。...7.4.3 数据排序 在本章中,要探讨的最后一项技术是排序。继续上一节的内容,用户希望按 “State” 列的升序对数据进行排序。...正如看到的,用户在分组前选择的 “Date” 列已经被放到了【分组依据】区域。如果需要,用户也可以在这里更改或添加新的【添加分组】。就现在的目的而言,按年份分组将完全可行。...这个菜单隐藏了【上移】和【下移】字段的功能,以及如果用户需要删除分组或聚合时,也可以使用【删除】功能删除它们。 现在已经配置好了数据分组方式,接下来看看如何对数据进行聚合。

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    MySQL 查询专题

    GROUP BY 创建分组 GROUP BY 语句根据一个或多个列对结果集进行分组。 在分组的列上我们可以使用 COUNT, SUM, AVG,等函数。...❑ GROUP BY子句可以包含任意数目的列,因而可以对分组进行嵌套,更细致地进行数据分组。 ❑ 如果在 GROUP BY 子句中嵌套了分组,数据将在最后指定的分组上进行汇总。...唯一的差别是,WHERE 过滤行,而 HAVING 过滤分组。 HAVING 和 WHERE 的差别 这里有另一种理解方法,WHERE 在数据分组前进行过滤,HAVING 在数据分组后进行过滤。...你可以使用 ASC 或 DESC 关键字来设置查询结果是按升序或降序排列。 默认情况下,它是按升序排列。...下标从 0 开始,当根据不出现在 SELECT 清单中的列进行排序时,不能采用这项技术 如果想在多个列上进行降序排序,必须对每一列指定 DESC 关键字。

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    《DAX进阶指南》-第6章 动态可视化

    首先,列中的值用于填充可视元素,如柱形图中的轴、表视觉对象中的行标签或切片器中的选择项。我们使用术语“标签”来泛指这些元素。其次,模型中的聚合数据(通常采用DAX度量值的形式)提供视觉对象表示的结果。...这些 KPI 可以按订单日期、发票日期或交货日期进行分析,这些日期在fSales表中也可用。此外,董事会还对按产品、国家/地区和零售类型划分的销售额感兴趣。...第二列名为 Sort(排序),它包含整数,从第一行中的1开始,每行增加1。你可以选择用此列来对 Description(说明)列进行排序(通过“按列排序”选项)。...但是,你仍应使用Code列,以避免在有人决定更改描述时必须更改DAX代码。我们的”二次幂”方法支持允许选择两个或多个项目的场景。...第一列包含指示标签类型(国家/地区、零售类型或组)位于行中的指示器,第二列包含三列中的值。第一列可用于选择标签类型。然后,DAX度量值将实现与三个原始表之一的动态关系。

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    遇到复杂业务查询,怎么办?

    image.png 【面试题】利用下拉框选择机构名称、利率档、期限等条件,查询出相应的费用 image.png 对金融产品进行台账管理,基础数据表如黄色框所示(上图左边表格)。...1.制作下拉列表 第1步:A列中的机构名称有很多是重复的,把这一列的值复制到表格空白处,然后删除重复值后,发现这一列的机构名称只有A、B、C共3家。...在Excel表空白的地方,写上A机构、B机构、C机构,用于后面制作下拉列表里的值(下图)。这样做的目的是防止重复值出现在下拉列表里。...同样的道理,如果B列的利率档没有重复值在创作下拉框时可以直接作为数据验证对话框里的来源。 如果有重复值的话,和机构处理的方式一样,在表格空白处写上这一列删除重复值后的利率作为数据验证对话框里的来源。...由于是多条件查询,而INDEX和MATCH均不是数组公式,要同时按下【ctrl+shift+enter】才能显示正确答案。 这又涉及到另一个问题,什么是数组?

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    PostgreSQL 教程

    自然连接 根据连接表中的公共列名称,使用隐式连接条件连接两个或多个表。 第 4 节. 数据分组 主题 描述 GROUP BY 将行分成组并对每个组应用聚合函数。 HAVING 对组应用条件。...第 5 节. 集合运算 主题 描述 UNION 将多个查询的结果集合并为一个结果集。 INTERSECT 组合两个或多个查询的结果集并返回一个结果集,该结果集的行都出现在两个结果集中。...连接删除 根据另一个表中的值删除表中的行。 UPSERT 如果新行已存在于表中,则插入或更新数据。 第 10 节....添加列 向您展示如何向现有表添加一列或多列。 删除列 演示如何删除表的列。 更改列数据类型 向您展示如何更改列的数据。 重命名列 说明如何重命名表中的一列或多列。...外键 展示如何在创建新表时定义外键约束或为现有表添加外键约束。 检查约束 添加逻辑以基于布尔表达式检查值。 唯一约束 确保一列或一组列中的值在整个表中是唯一的。

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    14个pandas神操作,手把手教你写代码

    Pandas可以实现非常震撼的可视化效果,它对接众多令人赏心悦目的可视化库,可以实现动态数据交互效果。...、处理缺失值、填充默认值、补全格式、处理极端值等; 建立高效的索引; 支持大体量数据; 按一定业务逻辑插入计算后的列、删除列; 灵活方便的数据查询、筛选; 分组聚合数据,可独立指定分组后的各字段计算方式...2、准备数据集 数据集(Data set或dataset),又称为资料集、数据集合或资料集合,是一种由数据组成的集合,可以简单理解成一个Excel表格。在分析处理数据时,我们要先了解数据集。...图6 分组后每列用不同的方法聚合计算 10、数据转换 对数据表进行转置,对类似图6中的数据以A-Q1、E-Q4两点连成的折线为轴对数据进行翻转,效果如图7所示,不过我们这里仅用sum聚合。...df.max() # 返回每一列的最大值 df.min() # 返回每一列的最小值 df.median() # 返回每一列的中位数 df.std() # 返回每一列的标准差 df.var()

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    富集分析:GSEA 分析介绍

    那么,将获得的两组数据进行一定处理后与按先验知识归类的基因集合比对分析,将某个干预和某个生物学功能变化联系起来,这个过程就叫富集分析。 4....表达数据集是测序或芯片获得的表达谱信息、样品分组信息是自己构建的文件、基因数据集是已知功能的基因集合。 表达数据集按表达丰度排列,也就是上图中热图所展示的。...三、关键概念 富集得分 ES,在计算过程中不断加分或减分,因此它是个动态的数值,一般的数据图片中往往不呈现 ES 值,有的话也应该是最大 ES 值。...以 GCT 文件为例,excel 表头以#1.2 为固定格式出现,占据第一行第一列,第二行第一列是基因个数,第二行第二列为样本数,基因 ID 根据测序或芯片平台而有不同,需要在数据分析参数选择界面选择匹配的平台...样品分组信息,是我们自制的一个表,告诉 GSEA 分析软件我的数据集里有多少样本以及是如何分组的,使用 EXCEL 构建,按照下图所示构建即可。

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    Pandas部分应掌握的重要知识点

    5、根据行标签或列标签查看数据 (1)通用方法:因为行标签或列标签通常是字符串,所以需要使用.loc标签索引器。...df.loc[len(df),:]=['Mike','Guarding','M',2000] print("在尾部增加一行之后:") df 3、修改一列数据 修改一列数据仍采用对列进行赋值操作的形式。...df.loc[2,:]=["Rose","Sales","Female",3500] print("修改标签为2的行之后:") df 5、删除一列或多列数据 使用drop函数,并且指定axis=1才能删除列...x['Q1'].mean()>45) & (x['Q2'].mean()>45)) #(2)再对该子集重新进行一次分组汇总统计 flt_df.groupby('team')[['Q1','Q2']]....,本例中lambda函数的形参x代表每个分组 ④ 当组对象存在多列时,filter的过滤条件要求显式的指定某一列 六、处理缺失值 1、Pandas中缺失值的表示 Pandas表示缺失值的一种方法是使用

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    python数据科学系列:pandas入门详细教程

    自然毫无悬念 dataframe:无法访问单个元素,只能返回一列、多列或多行:单值或多值(多个列名组成的列表)访问时按列进行查询,单值访问不存在列名歧义时还可直接用属性符号" ....isin/notin,条件范围查询,即根据特定列值是否存在于指定列表返回相应的结果 where,仍然是执行条件查询,但会返回全部结果,只是将不满足匹配条件的结果赋值为NaN或其他指定值,可用于筛选或屏蔽值...;sort_values是按值排序,如果是dataframe对象,也可通过axis参数设置排序方向是行还是列,同时根据by参数传入指定的行或者列,可传入多行或多列并分别设置升序降序参数,非常灵活。...groupby,类比SQL中的group by功能,即按某一列或多列执行分组。...一般而言,分组的目的是为了后续的聚合统计,所有groupby函数一般不单独使用,而需要级联其他聚合函数共同完成特定需求,例如分组求和、分组求均值等。 ?

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    Python 数据处理:Pandas库的使用

    由数组、列表或元组组成的字典 每个序列会变成DataFrame的一列。...: obj['b':'c'] = 5 print(obj) 用一个值或序列对DataFrame进行索引其实就是获取一个或多个列: import pandas as pd data = pd.DataFrame...下表对DataFrame进行了总结: 类型 描述 df[val] 从DataFrame选取单列或一组列;在特殊情况下比较便利:布尔型数组(过滤行)、切片(行切片)、或布尔型DataFrame(根据条件设置值...,为各个值分配平均排名 'min' 使用整个分组的最小排名 'max' 使用整个分组的最大排名 'first' 按值在原始数据中的出现顺序分配排名 'dense' 类似于'min'方法,但是排名总是在组间增加...无论如何,在计算相关系数之前,所有的数据项都会按标签对齐。 ---- 3.2 唯一值、值计数以及成员资格 还有一类方法可以从一维Series的值中抽取信息。

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    数据库系统概念

    :R∪S,在关系R或关系S或两者中的元素的集合,一个元素在并集中只出现一次,R和S是同类型的,对应的属性集(字段列表)相同、属性次序相同、属性名可不同交∩:R∩S,在R和S中都存在的元素的集合,一个元素在交集中只出现一次...:GROUP BY子句,将结果表按一列或者多列值进行分组,值相等的为一组。...一般的,Group By中的项,必须出现在Select子句中分组筛选:HAVING子句,对分组后的结果表,按各组的统计值进行筛选,返回符合条件的元组多表查询查询数据来自多表,查询涉及两个或以上的表,必须将多个表进行连接...:主要用于主表-从表之间信息短缺的处理,左外连接 左表为主表;右外连接 右表为主表嵌套查询:SubQuery子查询:在查询块的Where或Having中含有另一个查询块IN子查询比较的子查询:单值:>、...=等;多值:ANY/SOME/ALL的子查询Exists的子查询集合查询对多个查询的结果集实施集合操作,属性必须相容,其中,ORDER BY只能施加在整个结果集中。

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    SQL语句逻辑执行过程和相关语法详解

    (3).根据联接类型,将保留表的外部行添加到vt2中得到虚拟表vt3。 (4).对vt3执行where条件筛选,得到虚拟表vt4。 (5).执行分组,得到虚拟表vt5。...SQL Server、Oracle和MariaDB、Mysql最大的区别就在于此步,后两者可以引用分组列以外的列。 (6).对vt5执行集合操作cube或者rollup,得到虚拟表vt6。...例如,在分组之后进行SUM汇总,将以"Java"班作为一个汇总对象,以"Python"班作为另一个汇总对象,汇总的将是每个分组的总值,而不是整个表的总值,并且汇总的值是一个标量值,不会为组中的每行都返回这个汇总值...例如,分组后对"Java"班返回了一个汇总值,假如同时要使用sid列和name列,因为这两列没有被聚合或分组,因此只能为这两列的每个值返回一行,也就是说在返回汇总标量值的同时还要求返回"Java"班组中的每一行...假如先执行DISTINCT去重再执行OVER,那么去重后再对具有唯一值的列(或多列)进行开窗就没有任何意义。

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    一文掌握GSEA,超详细教程

    另外GO富集是定性的分析,GSEA考虑到了表达或其它度量水平的值的影响。另外,对于时间序列数据或样品有定量属性时,GSEA的优势会更明显,不需要每个分组分别进行富集,直接对整体进行处理。...从前文中我们了解到GSEA分析的目的是要判断S集基因(基于先验知识的基因注释信息,某个关注的基因集合)中的基因是随机分布还是聚集在排序好的L基因集的顶部或底部(这便是富集分析)。...与表达矩阵的样品列按位置一一对应,名字相同的代表样品属于同一组。如果是样本分组信息,上图中的0和1也可以对应的写成NGT和DMT,更直观。...Chip platform: 表达数据集为芯片数据时才需要,目的是对ID进行注释转换,如果已经转换好了就不需要了。应该也适用于其它需要转换ID的情况,不过事先转换最方便。...加工一下已有数据,添加一列high取值都为0.1,设置高度,黄色部分的数据就是用来绘制基因位置分布条带图的;绿色部分用来绘制动态的ES评分曲线。 ?

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    Vuebnb:一个用vue.js和Laravel构建的全栈应用

    在这篇文章中,我会把它如何工作做一个高层次的概述,好让你了解如何从零开始参与建设一个Vue/Laravel构建的全栈应用。...让我们做一个简短的概述: 模态窗口 在列表页面的模态窗口,目的是让用户看房屋的照片获得更好的感觉。 模式窗口很难实现,因为它们不在页面元素的层次结构中,因此也很难与它们进行通信。...一个CSS的转换 transform: translate(..)用于将图像移动到另一侧,而转换则提供滑动效果。我用vue.js绑定的translate以便用左,右箭头控制值。...通过Laravel的验证接口来验证相关API调用。 在后端和前端之间共享数据 全栈应用程序的关键考虑之一是如何在后端和前端之间进行数据通信,所以我花了相当多的时间来处理这本书中的问题。...例如,有一列数据是从Laravel到内页的,Vue.js通过使用刀片视图来实现,可以很容易地使用模板变量向页面头部注入数据。这个数据可以在Vue应用程序中就初始化。

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    MySQL数据库:分区Partition

    (4)Key分区:类似于按照HASH分区,区别在于Key分区只支持计算一列或多列,且key分区的哈希函数是由 MySQL 服务器提供。...4、MySQL分区类型: 根据所使用的不同分区规则,可以分成几大分区类型: 序号 分区类型 说明 使用频率 1 RANGE 分区 按照连续的区间范围进行分区 较多 2 LIST 分区 按照给定的集合中的值进行选择分区...分区,区别在于LIST分区是基于列值匹配一个离散值集合中的某个值来进行选择。...HASH分区主要用来确保数据在预先确定数目的分区中平均分布。在RANGE和LIST分区中,必须明确指定一个给定的列值或列值集合应该保存在哪个分区中。...(4)Key分区: 类似于按HASH分区,区别在于KEY分区只支持计算一列或多列,且MySQL服务器提供其自身的哈希函数。必须有一列或多列包含整数值。

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    一文掌握GSEA通路富集分析,超详细教程!

    另外GO富集是定性的分析,GSEA考虑到了表达或其它度量水平的值的影响。另外,对于时间序列数据或样品有定量属性时,GSEA的优势会更明显,不需要每个分组分别进行富集,直接对整体进行处理。...从前文中我们了解到GSEA分析的目的是要判断S集基因(基于先验知识的基因注释信息,某个关注的基因集合)中的基因是随机分布还是聚集在排序好的L基因集的顶部或底部(这便是富集分析)。...与表达矩阵的样品列按位置一一对应,名字相同的代表样品属于同一组。如果是样本分组信息,上图中的0和1也可以对应的写成NGT和DMT,更直观。...Chip platform: 表达数据集为芯片数据时才需要,目的是对ID进行注释转换,如果已经转换好了就不需要了。应该也适用于其它需要转换ID的情况,不过事先转换最方便。...加工一下已有数据,添加一列high取值都为0.1,设置高度,黄色部分的数据就是用来绘制基因位置分布条带图的;绿色部分用来绘制动态的ES评分曲线。

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