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16S流程知多少

lotus ? LotuS工作流程 一个引用量刚刚突破一百的流程,难得的是还在继续更新中,同样的先进的去噪代替聚类,哪天也测试下效果。...sdm[2]是LotuS的一部分,但可以单独用于多路分解或仅用于质量过滤器序列(例如,也用于装配体等)。包括几个质量过滤测试,并且可以基于累积的错误率或低于阈值的质量窗口来截断序列。...LOTUS的优势 使用安装脚本轻松安装和更新流程,无需修改系统变量。一个命令执行流程。 快:〜2分钟(454);MiSeq配对末端约45分钟(每个运行一个完整的音序器)。...更多:与其他流程相比,您可以从序列中检索多达19%的读数。...LOTUS自发布以来的发展 highmem模式,适用于小型数据集,速度快100%,适用于大型数据集,速度快1000% 从集群直接映射到OTU成员资格 减少sdm IO和更可靠的格式转换 使用概率过滤器进行更严格的质量过滤

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    Spring Boot从零入门6_Swagger2生成生产环境中REST API文档

    Swagger Core(开源):用于生成Swagger API规范的示例和服务器集成,可轻松访问REST API,结合Swagger UI,让生成的文档更漂亮。...被注解的类内部包含有一个或多个被@Bean注解的方法,这些方法将会被AnnotationConfigApplicationContext类进行扫描,并用于构建Bean定义,初始化对象。...从swagger-ui页面看到的内容有一部无关的内容,或者是如何明显表现跟项目相关的内容呢?下面章节详细讲解Swagger的各种配置,能够应用到实际生产环境中去。...这些都是通过注解去实现的,接下来我们讲述常用的注解及作用: @Api : 将这个注解添加到控制器类上,则可以给控制器添加描述类信息: 相关可设置参数有: value:用作承载资源的API声明的“路径”,...设置参数有: name:属性名称,需与JavaBean内保持一致 value:属性值 notes:说明 dataType:数据类型 required:是否必须 readOnly:是否只读,默认为false

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    Git 中文参考(一)

    如果给定的 ref 不存在,则不是错误,而是表示不应打印​​任何注释。 此设置默认为“refs/notes/commits”,它可以被GIT_NOTES_REF环境变量覆盖。...可以设置为always,false(或never)或auto(或true),在这种情况下,只有在错误输出到达终端时才使用颜色。如果未设置,则使用color.ui的值(默认为auto)。...可以设置为always,false(或never)或auto(或true),在这种情况下,颜色仅在错误输出到达终端时使用。如果未设置,则使用color.ui的值(默认为auto)。....mergeStrategy 在将注释合并到 refs / notes /中时选择哪种合并策略。这会覆盖更一般的“notes.mergeStrategy”。...在获取方面,格式错误的对象将在存储库中保持未引用状态。 由于fetch.fsckObjects实现的非隔离性质,不能依赖于像receive.fsckObjects那样保持对象存储区清洁。

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    SpringBoot 实战 | 集成 Swagger2 构建强大的 RESTful API 文档

    .build(); } } 第三步,配置被注解的 Controller 类,编写各个接口的请求参数,返回结果,接口描述等等,代码如下: package com.nasus.controller;...; } } 第四步,启动项目,访问 http://localhost:8080/swagger-ui.html 地址,结果如下图: ?...Controller的作用 @ApiParam:单个参数描述 @ApiModel:用对象来接收参数 @ApiProperty:用对象接收参数时,描述对象的一个字段 @ApiIgnore:使用该注解忽略这个...API @ApiError :发生错误返回的信息 注意事项 @ApiImplicitParam 注解下的 paramType 属性,会影响接口的测试,如果设置的属性跟spring 的注解对应不上,会获取不到参数...,例如 paramType=path ,函数内却使用@RequestParam 注解,这样,可能会获取不到传递进来的参数,需按照上面进行对应,将 @RequestParam 注解改为 @PathVariable

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    NumPy 1.26 中文官方指南(四)

    该对象可能正在引用另一个对象的内存,因此拥有对象可能是a.base.base.base...。一些作家错误地声称测试base决定数组是否是视图。...更改随机变量流 PyArray_ConvertToCommonType 中的标量提升 Fasttake 和 fastputmask slots 被废弃并设置为 NULL np.ediff1d...将can_cast的第一个参数从from重命名为from_。 当传递错误类型时,isnat会引发TypeError。 当传递错误类型时,dtype....构建系统更改 兼容性说明 错误类型更改 元组对象数据类型 DeprecationWarning 转为 error 将 FutureWarning 更改为已更改的行为...多项式类不再是基于模板的。 更多 GIL 释放。 对更复杂的基类的 MaskedArray 支持。 C-API。 弃用。 序列重复的非整数标量。

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    springboot04、swagger配置

    swagger配置 前言: springboot的swagger配置与SSM稍微有些不同,SSM对2.9.0以上的兼容性很差,但是springboot就可以使用2.9.0以上的包了,其实区别不算太大,除了能对对象直接操作外就是页面更清爽了...目录 1、pom依赖 2、swagger配置文件 3、接口api写法 4、启动效果:【http://127.0.0.1:8088/swagger-ui.html】 5、使用方法 ​编辑 6、可能出现的异常总结...swagger的配置文件 需要注意的是:【com.item.controller】这里需要改成自己的包位置。....build(); } } 3、接口api写法 我写了一套的注释方法,一目了然 package com.item.controller; import com.item.model.Users...】 这里为了看着方便,我将服务路径改为了【/】 # 服务路径 server.servlet.context-path=/ 5、使用方法 POST的也类似 6、可能出现的异常总结: 1、SwaggerConfig

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    Git 中文参考(四)

    默认情况下,仅在启用日志输出时显示颜色(通过color.diff,color.ui或--color,并且如果我们要去终端,则尊重前者的auto设置)。...如果未指定此选项,并且未设置配置变量diff.wsErrorHighlight,则仅突出显示new行中的空白错误。空白错误用color.diff.whitespace着色。...默认情况下,仅在启用日志输出时显示颜色(通过color.diff,color.ui或--color,并且如果我们要去终端,则尊重前者的auto设置)。...如果未指定此选项,并且未设置配置变量diff.wsErrorHighlight,则仅突出显示new行中的空白错误。空白错误用color.diff.whitespace着色。...可以通过--no-notes选项禁用此设置,由GIT_NOTES_DISPLAY_REF环境变量覆盖,并由--notes=<ref>选项覆盖。

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    历经14天自定义3个注解解决项目的3个Swagger难题

    --2.x.x版本的swagger-bootstrap-ui引用包方式如下 1.9.x和2.x.x选择一个包引用就行--> com.github.xiaoymin...,参数错误,id错误等); 4、当接口接收的参数为json字符串的时候,在Swagger的UI中不能显示JSON字符串中具体的参数(与前端交接会出现问题,前端会不知道他要传递给你什么); 本文要解决的问题也是对于缺点的弥补...;//原始对象中不存在的对象属性的类型,基本类型例如:String等,非必填 String noVlaueExplains()[] default {};//自定义变量的参数说明 非必填 } 12345678910111213141516171819202122...;//原始对象中不存在的对象属性的类型,基本类型例如:String等,非必填 String noVlaueExplains()[] default {};//自定义变量的参数说明 非必填 } 12345678910111213141516171819202122...); //根据变量的类型,变量的名字,变量将要在的类 创建一个变量 CtField ctField = null; try

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    NumPy 1.26 中文文档(五十三)

    API 参考文档直接从代码中的docstrings生成,当构建文档时。尽管我们对用户公开的每个函数和类都有大致完整的参考文档,但是一些函数缺乏使用示例。...完成文档化过程需要三个步骤: 1.编写注释块 尽管目前仍未设置要遵循的注释样式,但由于与当前现有的非索引注释块的相似之处,Javadoc 比其他注释更受欢迎。 注意 请参阅“代码文档化”。...,logspace 和 geomspace的起始和停止数组 CI 扩展了其他服务 变更 比较 ufuncs 现在将引发错误,而不是返回未实现 对于非数值数组,positive现在将引发弃用警告...keepdims 关键字参数传递给用户类方法 bitwise_and 的身份变化 当未屏蔽的无效值出现时,ma.median 会发出警告并返回 nan assert_almost_equal...更多 GIL 释放 支持对更复杂基类的 MaskedArray C-API 已废弃项 重复序列的非整数标量 select输入项废弃 rank函数 对象数组的相等比较

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    NumPy 1.26 中文文档(五十九)

    (gh-14981) 将空的类数组对象转换为 NumPy 数组 具有len(obj) == 0的对象,其实现“类数组”接口,指实现obj.__array__(),obj....“howto”更改为链接到新的故障排除… NumPy 1.18.3 版本说明 原文:numpy.org/doc/1.26/release/1.18.3-notes.html 此版本包含了各种错误...现在默认行为已更改为附加-这是大多数情况下预期的行为。为了保留旧的(覆盖)行为,将NPY_DISTUTILS_APPEND_FLAGS环境变量设置为 0。...现在默认行为已更改为追加 - 这在大多数情况下是预期的行为。为保留旧的(覆盖)行为,将NPY_DISTUTILS_APPEND_FLAGS环境变量设置为 0。...现在默认行为已更改为追加 - 这在大多数情况下是预期行为。为了保留旧的(覆盖)行为,请将NPY_DISTUTILS_APPEND_FLAGS环境变量设置为 0。

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    springboot (九) Swagger2实现Restful API

    package com.liming.swagger; import com.liming.model.User; import com.liming.repository.UserRepository...; } } 启动项目,访问http://localhost:8888/swagger-ui.html,可以看到如下图 为了方便大家学习观看,我分别用了几种不同的方法写, 1.删除用户,代码如下...@Api:用在请求的类上,表示对类的说明 tags="说明该类的作用,可以在UI界面上看到的注解" value="该参数没什么意义,在UI界面上也看到,所以不需要配置" 示例: @Api...form",dataType="Integer") }) @ApiResponses:用在请求的方法上,表示一组响应 @ApiResponse:用在@ApiResponses中,一般用于表达一个错误的响应信息...(value = "错误信息") private String message; } POST请求传入对象 示例: @ApiOperation(value="保存用户", notes="保存用户

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    Spring Boot(九)Swagger2自动生成接口文档和Mock模拟数据

    更多版本请访问: springfox-swagger2:http://mvnrepository.com/artifact/io.springfox/springfox-swagger2 springfox-swagger-ui...:http://mvnrepository.com/artifact/io.springfox/springfox-swagger-ui 2.2 注册Swagger 在源码的根目录也就是Appliction.java...3.1 @Api 类注释 @Api:用来描述类的,属性如下: tags 描述类的用途 value 对显示而言没有任何用途可以不用设置 代码示例: @Api(tags = "文章接口") 3.2 @...获取所有文章", notes = "查询分页数据") 效果如下图: ?...3.4 @ApiModel 实体对象描述 @ApiModel:实体类名描述,属性如下: description 类描述 @ApiModelProperty:字段描述,属性如下: value 字段描述 示例如下

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