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python并行计算之mpi4py的安装与基本使用

在之前的博客中我们介绍过concurrent等python多进程任务的方案,而之所以我们又在考虑MPI等方案来实现python并行计算的原因,其实是将python的计算任务与并行计算的任务调度分层实现。在concurrent和multiprocessing等方案中,我们的python计算任务和调度任务是一体化的,而且还有一个比较大的限制是没办法跨节点操作的,这对于任务与环境的定制化程度要求是比较高的。而MPI的方案在设计初期就考虑到了多节点之间通信的问题,而这种分层式的任务调度解决方案其实在架构上看也更加的合理。做计算的人只要考虑单个进程下的任务如何执行就可以了,至于任务如何并行如何调度,那就是上层的MPI该做的事情了。

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Modules 配置之 Python

近年来得益于其轻量、易学易用、第三方支持依赖库多的特点,Python 语言大量被用于机器学习相关的研究、项目开发。在学术界,有以 Scikit-Learn 为代表的全能机器学习库;在产业界,有以 TensorFlow、PyTorch 为代表的生产级机器学习模型计算框架。(当然,学术界实际上构建大规模深度学习模型时也会用到 PyTorch 等计算框架。)但对于大多数人来说,学习这些库、框架或者借助它们从事某些研究、项目开发时,可能还是在用自己的笔记本、台式机。哪怕是在高校的实验室里,这种事情也是屡见不鲜。因此,有交互界面、相对容易上手的 Anaconda 可能会作为大家管理 Python 环境的首选。

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《Python分布式计算》 第6章 超级计算机群使用Python (Distributed Computing with Python)典型的HPC群任务规划器使用HTCondor运行Python任务

本章,我们学习另一种部署分布式Python应用的的方法。即使用高性能计算机(HPC)群(也叫作超级计算机),它们通常价值数百万美元(或欧元),占地庞大。 真正的HPC群往往位于大学和国家实验室,创业公司和小公司因为资金难以运作。它们都是系统巨大,有上万颗CPU、数千台机器。 经常超算中心的集群规模通常取决于电量供应。使用几兆瓦的HPC系统很常见。例如,我使用过有160000核、7000节点的机群,它的功率是4兆瓦! 想在HPC群运行Python的开发者和科学家可以在本章学到有用的东西。不使用HPC群的读者,

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IOR中文文档

IOR是一个并行的IO基准,可用于测试使用各种接口和访问模式的并行存储系统的性能。接口和访问模式的并行存储系统的性能。IOR资源库还包括mdtest基准,专门测试不同目录结构下存储系统的元数据峰值速率。在不同目录结构下存储系统的元数据峰值速率。这两个基准都使用一个共同的并行 I/O抽象后端,并依靠MPI进行同步。本文档由两部分组成。用户文档包括安装说明(Install),初学者教程(IOR的第一步),以及关于IOR的运行时选项的信息。开发者文档包括用Doxygen生成的代码文档和一些关于与Travis的连续整合的说明。IOR/mdtest用户和开发者文档的许多方面都是不完整的,我们鼓励贡献者 鼓励贡献者直接评论代码或在此基础上扩展文档。

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