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如何用MEGA构建进化树

年引用量超大的 MEGA软件跟牛逼的苹果手机一样都更新到X了,听说你还不会用,今天小编就先来介绍这个软件的一个小功能-构建进化树。建树之前的两个工作。 ? 序列比对----(1)打开MEGA软件。点击Align→EditBuild Alignment→create a new alignment→OK→DNAProtein;?

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试试MEGA吧!

关于流量限制(对比坚果云的流量计费策略) 国内有坚果云, 同步的流量是需要计费的, 但MEGA官方没有提到同步流量的概念,如图,在下面的截图中我在本地电脑Mega的同步文件夹中, 放了1.18GB的文件 更有趣的是, 虽然https:mega.nz在国内无无法访问,但如果你能安装maga的客户端, 那么你就可以正常使用mega在国内的服务, 而且同步速度超级快~ 或许你现在就缺一个mega的客户端了,如果你网络环境不好 小技巧: mega是自带备份功能的, 也就是,上传到网盘的资源即使本地删除了, 网盘也会有备份, 但这个功能也会导致网盘的空间越来越小, 解决的方法如下图所示: ? 谈谈移动版的Mega iPhone版的Mega, 功能丰富, 界面简洁, 提供了社交功能, 支持加密聊天~ ? 小结 从产品的角度讲, Mega并不是很纯粹的网盘, 提供了很好的加密技术, 但也被一些人滥用, 所以Mega前几年险些被国内封杀 从技术的层面来讲, Mega注重加密, 理念先进, 而且提供了跨平台的客户端支持

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    大量 Mega 帐户的登录信息遭泄露并暴露了用户文件

    据外媒 ZDNet 报道,Mega —— 这家于新西兰成立并提供在线云存储和文件托管服务的公司,目前被发现其平台中有成千上万的帐号凭证信息已在网上被公开发布。 Wardle 提供的数据截图 ZDNet 表示他们已验证这些帐号,确认这些数据来自 Mega,通过联系多位用户,还确定这些电子邮件、密码和一些文件都是在 Mega 上使用的。 虽然 Mega 提供端到端加密,但登录时没有使用双因素身份认证方式,因此攻击者只需使用登录凭据便可登录每个帐户,并抓取帐号中文件的文件名。 Mega 董事长 Stephen Hall 表示,Mega 不能通过检查文件内容来充当审查员的角色,因为它在被上传到 Mega 之前已在用户的设备上被加密,除了在技术上不可行之外,Mega 和其他主要云存储提供商实际上也做不到 这不是 Mega 第一次遇到安全问题。2016年,黑客声称通过利用其服务器中的安全漏洞获取了内部 Mega 文档。黑客还表示获取了与管理帐户关联的七个电子邮件地址。

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    Eagle 自带爬虫功能的图片数据库

    Eagle和Mega乃天作之和! 美中不足的是, Eagle本身不提供在线备份素材的服务, 也就是说, 如果你的电脑挂了, 苦心积累的素材也就丢了... 我曾经也为这个问题想了很多办法, 最终用同步盘Mega彻底解决了这个问题关于Mega,简单来说: Mega的同步速度极快,国内可用, 网盘资料加密存储, 不会被封, 而且支持跨平台! 试试MEGA吧!

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    一批域名结拍!带杠域名近23万结拍

    mega-sena.com以35000美元(超22.7万元)结拍;  trive.com以17999美元(近11.7万元)结拍;  31789.com以14812美元(超96000元)结拍  pranked.com 以13100美元(超85000元)结拍;  descargar.com以12500美元(超81000元)结拍;  域名mega-sena.com虽是组合米,中间还带了一条横岗,但深挖其背后的含义,发现对应了巴西全国性彩票游戏 Mega-Sena,它每周两次开奖时都会在该国掀起热潮。 如此看来,似乎也能理解为何mega-sena.com能拍出小六位的价格了。

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    2018-11-17DobotDemoV2.0解析

    串口不够用可以考虑使用SoftwareSerial 一、连线1、dobot连接电源2、mega 2560板子upload程序DobotDemo.ino3、dobo 的Rx连接mega 2560板子的Tx1 如果usb连着电脑mega板子上面的tx灯会亮,如果mega板子用电源供电,未用usb连着电脑tx灯不会亮??板子上Tx1连接Dobot Rx ? Serialread(){           while(Serial1.available()) {               uint8_t data = Serial1.read();      mega

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    可区分的质量多样性

    然后,我们提出了map - elite via Gradient Arborescence (MEGA),这是一种DQD算法,利用梯度信息有效地探索目标函数和测度函数的联合范围。 在两个QD基准域和StyleGAN的潜在空间搜索结果表明,MEGA算法显著优于先进的QD算法,突出了DQD在梯度信息可用时的高效质量多样性优化的前景。 We then present MAP-Elites via Gradient Arborescence (MEGA), a DQD algorithm that leverages gradient Results in two QD benchmark domains and in searching the latent space of a StyleGAN show that MEGA significantly

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    进化树构建的基本过程(上)

    序列工作就做好啦另:Uniprot数据库(http:www.uniprot.org)也可获取蛋白序列哦,步骤与此类似,自行探索即可2.下载MEGA软件 官网(https:www.megasoftware.net )下载即可,有多种版本可供下载,由于本人电脑上为MEGA-X版本,下面就此版本介绍具体用法。 PART2序列比对做系统进化树之前要做多序列比对,将比对结果提交给MEGA建树。打开MEGA,点击File→Open A FileSession…→找到自己要比对的序列,打开? 由于MEGA的参数都是经过考量的,所以当看不懂时默认就好。运行后下面就是比对完的结果啦!?因为不同序列的碱基、长度不同,所以为了最大的寻找相似碱基而插入空位,其中-------表示序列内插入的空位。 双击刚才建好的.meg文件,文件就直接导入MEGA啦,点击?

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    进化树构建的基本过程(下)

    昨天我们讲解了进化树构建的数据下载以及利用mega进行数据的比对:进化树构建的基本过程(上)。今天我们就来讲解一下如何利用利用mega构建简单的进化树。 可以看出基因名字过长,是因为基因序列导出后,未对基因名做简化处理,大家可以将导出的fasta格式以文本文件打开,将多余字符删除,只保留想要信息即可;当然,忘了处理的,在序列导入MEGA后也可对基因名进行编辑 最后记得将建树结果保存为.nwk格式,这个结果保存很重要哦,下次直接双击就可进入MEGA对其操作。?

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    AI生成的假新闻难以识别,那就用神经网络来对抗吧

    在上下文语境下,Grover-Mega 获得了 8.7 的困惑度。 这里,研究人员考虑了攻击方使用 Grover-Mega 生成器,且有一个未知的 top-p 采样阈值。 结果说明,当只有少量 Grover-Mega 生成器文本时,从其他生成器获得的弱监督文本可以极大提升判别器的表现。 图 5:探索判别 Grover-Mega 生成结果的弱监督。在没有弱监督的情况下,判别器发现了 x 个机器生成的文本(来自 Grover Mega)。 图 6:Grover-Mega 的困惑度,取自每个位置的平均值(以元数据为条件)。研究人员选取了 p=1(随机采样)和 p=0.96 时 Grover-Mega 生成的文本以及人工书写的文本。

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    TBtools基因家族分析详细教程(3)基因家族成员的进化分析1

    新建文件夹进化分析1 包括 1多序列比对与可视化 Mega(Muscle)进行序列比对,JalView进行多序列比对结果的可视化 2进化树构建与可视化 氨基酸替代模型的选择,构建ML进化树(注意比对结果修剪参数 ),进化树美化 3从进化水平分析motif模式 4从进化水平分析domain 5从进化水平分析基因结构变化 6合并分析以上三者 ----1多序列比对与可视化下载Mega 导入42家族序列信息? image.png可以用Mega本身对其进行美化,自行摸索调整参数。导出文件?

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    Python热门文章推荐Top10

    7、Flask Mega 教程第十六章:全文搜索原文链接:https:blog.miguelgrinberg.compostthe-flask-mega-tutorial-part-xvi-full-text-search

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    2018-09-11Ubuntu下安装arduino

    ardunio*4、安装支持sudo apt-get install default-jre5、打开arduino.arduino6、链接arduino板子MEGA2560选择板子ArduinoGenuino Mega or Mega 2560选择端口devttyUSB0参考Ubuntu 16.04 安装 Arduino Software (IDE)方法二:1、打开terminalsudo apt-get install

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    计数计量单位KMGTPEZY【计算机】【天文】

    · 1 Bit = Binary Digit· 8 Bits = 1· 1024 s = 1 Kilo · 1024 Kilo s = 1 Mega · 1024 Mega s = 1 Giga · 1024

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    【目标检测】开源 | 记忆增强的全局-局部聚合用于视频目标检测,在ImageNet VID数据集上表现SOTA

    本文引入了记忆增强型全局-局部聚合(MEGA)网络,这是最先充分考虑全局和局部信息的网络之一。 此外,基于一个新颖而精心设计的LRM (Long Range Memory)模块,本文提出的MEGA可以使关键帧获得比以前任何方法都要多的内容。

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    11.25 VR扫描:VR初创公司获近百万欧元种子融资;Quest 2库存因黑五减少并发货延迟

    今日重点新闻:VR初创公司Condense Reality开发出可改变观众观看现场娱乐和体育节目的方式的技术,目前已筹集超87.5万欧元的种子融资;随着销售旺季的到来,索尼互动娱乐推出全新PS VR“Mega 03索尼互动娱乐推出全新PS VR“Mega Pack”捆绑包据外媒报道,随着销售旺季的来临,索尼互动娱乐(SIE)近日推出了全新PS VR“Mega Pack”捆绑包。 值得一提的是,该全新Mega Pack捆绑包包括了5款游戏的数字版本、PS VR头显、PlayStation Camera以及适用于PS5的PlayStation Camera适配器。

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    伸手党的福音,6 个 Python 练手项目

    The Flask Mega-Tutorial 教程这个教程是《Flask Web开发》作者 Miguel Grinberg 写的 一个 Flask 入门教程,他教你如何从 Hello Wrold 到项目部署实现一个完整的 中文地址:https:github.comluhuisicnuThe-Flask-Mega-Tutorial-zh 英文原文地址:https:blog.miguelgrinberg.compostthe-flask-mega-tutorial-part-i-hello-worldDjango

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    PCR中的引物设计

    然后利用MEGA 7 软件进行序列比对,找到7个转录本的保守区域,关于MEGA 7 软件使用教程和序列比对,可参考:生物信息学初识篇——第三章:分子进化与系统发生,该文章介绍了MEGA 7建系统发育树的过程 序列比对部分是一样的,只是不需要用来建系统发育树,或者自己百度一下MEGA 7做序列比对,教程应该很多,其实做序列比对的工具很多,之前的文章也有介绍,可以参考本公众号的文章:生物信息学初识篇——第二章的内容

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    堆状态分析的利器——gperftools的Heap Profiler

    size) { void *p = create(size); free(p);} int main(void) { const int loop = 4; char* a; unsigned int mega = 1024 * 1024; for (int i = 0; i < loop; i++) { const unsigned int create_size = 1024 * mega; create (create_size); const unsigned int malloc_size = 1024 * mega; a = (char*)malloc(malloc_size); const unsigned int create_destory_size = mega; create_destory(create_destory_size); } for (int i = 0; i < loop; i++

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    随讲单片机与Arduino

    Arduino Mega 2560Arduino Mega 2560是基于ATmega2560的微控制板,有54路数字输入输出端口(其中15个可以作为PWM输出),16路模拟输入端口,4路UART串口, Mega 2560 是Arduino Mega系列的升级版。 Mega 2560与之前的板子(最大)不同在于:它没用FTDI USB-to-serial驱动芯片,而是用ATmega16U2编程作为USB-to-serial传输器(V1版本使用8U2)。 4.设置板卡型号Arduino包括多种版本的主控器,其中比较常见的是Uno、nano、Leonardo以及Mega系列的控制器。 在板子一栏,你需要根据自己选择的主控硬件的固件类型来选择板卡。

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