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Nature | 代码值得学习!发现RNA剪接异常产生的新一类“公共新抗原”,公共数据挖掘

将315个NEJ与192个转录组学和蛋白质组学验证的NJ交叉比对后,得到81个NEJ,其中许多编码多个强预测候选物。...我们专注于32个候选NEJ,这些NEJ被预测能强烈结合HLA-A*02:01,因为该等位基因在北美和欧洲人群中具有高流行率,并且能够与其他新抗原研究进行基准比较。...在空间映射样本中检查这32个NEJ的ITH显示,大多数NEJ在肿瘤内高度保守,特别是位于GNAS中的NEJ(NEJGNAS),它编码一个A3丢失两个核苷酸的事件。...Identification of NEJ-reactive TCRs Para_01 接下来,我们试图确定 NEJ 来源的新肽段是否能够驱动 T 细胞反应。...(IVS),以识别对NEJ衍生新抗原有反应的T细胞群的流程概览。

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