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    ChemNet: 蛋白-小分子复合物构象系综生成

    逆羟醛缩合酶的预组织性预测、活性及设计 此外,作者还前瞻性地测试了ChemNet在指导蛋白质设计中的使用,以深度学习生成的NTF2样折叠为骨架进行了一轮全新的逆醛缩酶设计。...NTF2样折叠此前成功地生成出高活性的新型荧光素酶。设计的步骤包括:NTF2样折叠骨架生成;识别潜在催化活性位点;理论酶(theozyme)安装;打分筛选酶设计;实验验证。...理论酶设计 首先作者使用RoseTTAFold joint inpainting(RFjoint2)生成大量NTF2样折叠骨架,接下来需要将理论酶“安装”到骨架的合适位置。...然后将频繁出现在不同骨架中的理论酶与骨架位置的组合应用到10000个NTF2样骨架中,用LigandMPNN在有底物的条件下生成剩余的骨架序列。

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