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基于张量分解和关系约束多种类型MicroRNA-疾病预测

作者创新性地将miRNA-disease-type三元组表示为一个张量,引入张量分解方法来预测多种类型miRNA-disease关联,并进一步提出了一种新张量分解方法——关联约束张量分解法(TDRC...从下图1中可以看出,miRNA与疾病关联有多种类型,要研究与miRNA失调有关疾病发病机制,不仅要探究miRNA与疾病相关性而且还需要了解其具体类型。...张量是一个多维数组,三维张量通常用于三联体数据分析,如多关系网络、推荐系统和知识图谱等。...图3 TDRC基于HMDD v2.0对15种流行疾病前20个预测中,在基于HMDD v3.2确认miRNA-disease三元组数量 5 总结 预测多种miRNA-disease关联有助于理解与miRNA...此外,还提出了一种新基于张量分解方法,称为TDRC,它将关系约束引入到张量分解模型中,集成了miRNA-miRNA相似性和疾病相似性。

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合并 Jekyll 多种类型页面

合并 Jekyll 多种类型页面 发布于 2017-10-12 15:48 更新于 2018-08-12...阅读本文,将学到如何用 Jekyll 做多种类型页面,并在首页列表中将这些不同种类页面合并按日期排序。...---- 制作除博客之外新页面类型 Jekyll 不止支持博客(post)页面类型,也可以支持自定义页面类型。当然博客是它唯一内建类型(hard-coded type)。...制作一个合并了博客和其他页面类型页面列表 我希望在首页中混杂我博客和胡思乱想,于是必须将两种不同类型集合合并。...欢迎转载、使用、重新发布,但务必保留文章署名 吕毅 (包含链接: https://walterlv.com ),不得用于商业目的,基于本文修改后作品务必以相同许可发布

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Zuul过滤类型

Zuul是Netflix开源一个高性能API网关,提供了路由、过滤、监控、弹性等功能。其中,Zuul过滤功能是其重要特性之一。...通过Zuul过滤功能,我们可以在请求被路由到目标服务前或者返回给客户端前,对请求和响应进行各种处理。Zuul过滤器是Zuul中用来实现这个功能核心组件。...在本文中,我们将详细介绍Zuul过滤类型、详细文档并给出示例。...Zuul过滤类型Zuul过滤器分为四种类型,分别是:前置过滤器(Pre Filters)路由过滤器(Routing Filters)后置过滤器(Post Filters)错误过滤器(Error Filters...filterOrder(); boolean shouldFilter(); Object run() throws ZuulException;}其中,filterType()方法返回一个字符串,表示过滤类型

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基于Neo4j构建外贸企业关系图谱做企业相似度查询「建议收藏」

目录 一、外贸企业关系图谱构建 1.从Oracle导出数据 2.导入数据到Neo4j 3.Neo4j数据展示 二、用Cypher做企业关联查询 1.多层关系查询 2.基于邻居信息Jaccard...这次外贸企业关系图谱构建用到以前项目中测试库(Oracle)数据,导入成csv格式后,再通过pythonpy2neo导入到neo4j中。...———–由于数据涉及项目的私密信息,暂时就不分享出来了———— 1.从Oracle导出数据 该表在Oracle数据库中部分结构如下: 目前数据库中外贸企业数据约30多万条,经过两轮数据清洗和过滤...2.导入数据到Neo4j Neo4j有自己csv导入工具,还可以通过cypher语句导入csv格式数据,但是这里我使用是pyhonpy2neo库来完成数据导入。...,我们对三种关系企业类型、所在地区、出口国家(type、locate、export)进行加权求和并计算得分,以该得分作为企业相似度评价标准,可以得到最相关企业如下。

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基于用户协同过滤算法VS基于物品协同过滤算法

现有的条件就是以上这么多,至于实际情况不同会有不同衍生,像基于用户协同过滤算法和基于物品协同过滤算法就是一些典型实例。...3.基于用户协同过滤算法vs基于物品协同过滤算法 基于用户协同过滤算法和基于物品协同过滤算法两者区别在哪呢?...首先先解释下”协同过滤”: 所谓协同就是大家一起帮助啦,过滤就是把大家讨论结果告诉你,不然原始信息量太大了。很明显啦,两者区别在于一个是基于用户,一个是基于物品。...顾名思义,“基于用户”就是以用户为中心算法,这种算法强调把和你有相似爱好其他用户物品推荐给你,而“基于物品”算法则强调把和你喜欢物品相似物品推荐给你。...总体来说,都是推荐物品给你,一个推荐桥梁是用户,另一个是物品。 在运用时候要根据实际情况不同,选择是基于基于用户还是基于物品。

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WWW22 | 推荐系统:基于邻域关系对比学习改进图协同过滤

导读 本文利用对比学习缓解推荐系统中数据稀疏问题,并且利用图方法在对比学习中考虑邻域节点之间关系。...本文提出NCL方法,主要从两方面考虑对比关系, 一方面,考虑图结构上用户-用户邻居,商品-商品邻居对比关系 另一方面,从节点表征出发,聚类后,节点与聚类中心构成对比关系 想法还是有点意思,熟悉GNN...一般协同过滤GNN过程可以包括两部分,信息传播和表征聚合,公式如下, \begin{aligned} z_{u}^{(l)} &=f_{\text {propagate }}\left(\left\...方法 NCL总体框架 3.1 结构邻居对比学习 现有的图协同过滤模型主要是通过观察到交互(例如,用户-商品对)来训练,而用户或商品之间潜在关系不能通过从观察到数据中学习来明确地捕获。...交互图 G 是一个二分图,基于 GNN 模型在图上偶数次信息传播自然地聚合了同构结构邻居信息,这便于提取用户或商品内潜在邻居,如u-i-u,可以得到两个相邻用户。

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基于AngularJS过滤与排序

前面了解了AngularJS使用方法,这里就简单写个小程序,实现查询过滤以及排序功能。...本程序中可以了解到:   1 angularjs过滤器   2 ng-repeat使用方法   3 控制器使用   4 数据绑定   程序设计分析   首先,如果要是先查询过滤,就要使用到...AngularJS中 过滤器filter 了。   ...直接在表达式后面使用管道命令符 | ,按照下面的写法就可以达到一个过滤效果: {{ persons | filter:query }}   通过使用filter实现过滤操作,query是查询过滤时输入字符串...相比于其他一些框架,是基于字符串通过DOM节点innerHTML添加到DOM中,AngularJS实现方式加快了模型与视图展现。

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基于DFA敏感词过滤

对于一个给定属于该自动机状态和一个属于该自动机字母表{\displaystyle \Sigma }Σ字符,它都能根据事先给定转移函数转移到下一个状态 DFA算法 DFA((Deterministic...Finite automation))确定性有穷状态自动机: 从一个状态输入一个字符集合能到达下一个确定状态。...以上状态图输入字符类似树形结构,空心状态表示未结束状态(isEnd=false), 蓝色环形状态表示结束状态(isEnd=true)。用HashMap维护这个字典关系....xiqi4145/article/details/84313809 ☆文章版权声明☆ * 网站名称:obaby@mars * 网址:https://h4ck.org.cn/ * 本文标题: 《基于...DFA敏感词过滤》 * 本文链接:https://h4ck.org.cn/2019/11/%e5%9f%ba%e4%ba%8edfa%e7%9a%84%e6%95%8f%e6%84%9f%e8%af

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攻击溯源-手把手教你利用SPADE搭建终端溯源系统

SPADE可以看成一个分布式溯源调查工具,以溯源图形式组织系统日志,溯源攻击过程。该工具支持多种操作系统。SPADE系统支持多种应用,本文只专注其在溯源调查上应用。...图1 SPADE系统架构 数据输入 SPADE支持多种类型数据,针对windows其支持ProcMon工具采集日志,linux系统下支持audit、camflow工具采集日志,同时支持文本数据输入...但是具体Filter原理在其发表论文中并没有特别详细介绍。 存储模块 SPADE内置了neo4j图数据,也支持关系型数据存储,同时也支持前面提到文本格式存储。...Process Monitor一款微软系统监视软件,下载即可用。打开ProcMon自动会采集相关数据,数据量非常大十多分钟就9个G文档。当然该工具功能比较强大可以加一些过滤。...3.3 效果展示 SPADE支持多种输出形式,支持neo4j图数据,关系数据、文本,文本类型有Graphviz、Prov以及JSON。 SPADE安装包里已内置了neo4j图数据。

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基于物品协调过滤算法

基于物品协同过滤(item-based collaborative filtering)算法是目前业界应用最多算法。...基础算法 基于用户协同过滤算法在一些网站(如Digg)中得到了应用,但该算法有一些缺点。...首先,随着网站用户数目越来越大,计算用户兴趣相似度矩阵将越来越困难,其运算时间复杂度和空间复杂度增长和用户数增长近似于平方关系。其次,基于用户协同过滤很难对推荐结果作出解释。...因此,著名电子商务公司亚马逊提出了另一个算法——基于物品协同过滤算法。 基于物品协同过滤算法 (简称ItemCF)给用户推荐那些和他们之前喜欢物品相似的物品。... 流行度 和UserCF(基于用户协同过滤推荐)不同,参数K对ItemCF推荐结果流行度影响也不是完全正相关

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基于近邻协同过滤算法

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 这节课我们来学习K近邻在推荐系统中应用,你将完成本课程第一个实战项目:基于KNN电影推荐系统!...为了使你能够顺利地完成实战内容,我们先了解一下推荐系统中基础知识。 基于近邻用户协同过滤 假定有一个场景:某个周日下午,你感觉很无聊,然后从电脑上打开了一个视频网站,想看下最近有什么好看电影。...然而你发现网站上热门电影基本都看过,其他电影又太多,不知道该看什么。...这种思想其实就是基于近邻用户协同过滤算法(简称UserCF):给用户 A 推荐和他有着相似观影兴趣用户 B 喜欢观看电影。...基于近邻用户协同过滤算法很容易给出推荐理由是: 发布者:全栈程序员栈长,转载请注明出处:https://javaforall.cn/147446.html原文链接:https://javaforall.cn

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基于协同过滤推荐系统

本文介绍了一种较基础推荐算法,协同过滤Collaborative Filtering。基于用户购买历史商品推荐--物品协同过滤基于用户相似用户购买物品推荐--用户协同过滤。...KV,key-value存储(RDBMS,关系型数据库)。KV更适合做缓存,访问速度快。...Item cf 基于物品协同过滤 1. 原理 ? 此系统中存在: 用户 A B C D 商品 a b c d 用户A购买过a、b、d;用户B购买过b、c、e。...如果用户消费了物品i和物品j,如果消费时间间隔越近,那么这次“同现”权重应该越大,间隔越远权重越小。在分子上除以间隔时间,惩罚时间间隔影响。 User CF 基于用户协同过滤推荐算法 原理 ?...可以给新用户推荐行为物品相识物品。 推荐系统可解释性 UserCf,基于相似用户推荐,很难说明相识用户喜好 。 ItemCF,基于用户点击过物品进行推荐,解释性好。

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在Amesp中提取多种类型电子积分

在自己写量化程序或者验证量化方法时候,需要使用到各种类型电子积分。电子积分计算比较复杂,程序编写门槛很高。...而调用其他程序(如PySCF)时候也需要读懂程序接口,这种方式也不是很方便,门槛也高。...本文将介绍使用Amesp很方便地计算并提取多种类型电子积分,帮助读者验证自己方法以及对标自己程序结果。 Amesp支持多种类型、不同中心单、双电子积分。...三中心和四中心积分需要在>ope模块中写out 4,此时上述双中心积分也会同时输出,其中四中心电子排斥积分输出例子为: 默认输出绝对值大于10^(-10)电子积分,改变阈值可以使用>scf模块中...在使用posthf(如MP2、CCSD)时候,也会输出相应MO下四中心电子排斥积分,默认是冻芯,可以使用>posthf中fc off关键词关闭冻芯。

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手把手教你用neo4j搭建简单关联图谱(基于家有儿女中的人物关系

本文跟大家一起用neo4j一步步搭建简单关联图谱,让大家快速熟悉neo4j语法。为便于理解,关系数据采用家有儿女中的人物关系。...2 创建人物节点 create (n:Person {name:'夏东海'}) return n create是创建操作,n是节点名,Person是标签,代表节点类型,花括号中存放节点属性。...该语句表示创建一个标签为Person节点,该节点有一个name属性,属性值是夏东海。 加了return n就会在neo4j中显示创建好该节点图,不加只创建点,不展示图。 ?...至此,基于家有儿女中人物关系关联图谱已经建好,接下来讲一讲查询。...neo4j创建关联图谱基本语句就是上面这些啦,大家入门愉快。

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面向对象编程:对象之间关系类型

面向对象编程中基本关系类型是, 协作 聚合 继承 让我们更详细地研究它们。 协作 协作关系有时被称为“使用”关系。当一个对象使用另一个不相关对象来完成一个操作时,两个对象被称为协作。...聚合 组合关系有时被称为“Has a”关系。在这种关系中,对象可以由一个或多个对象以其属性形式组成。...但是,曾经由Order类组成Customer类在没有它情况下仍然存在。相反,OrderItem类不能。 Order和OrderItem类之间共享关系类型称为组合关系。...继承 继承本身就是一个需要讨论大话题。在这里,我们不讨论不同类型继承以及如何在代码中实现它。我们只讨论继承作为一种关系。 继承有时被称为“is”关系。在这种关系中,一个类继承另一个类成员。...鉴于此,产品所有者现在希望在应用程序中添加一个新特性,以监视具有高需求产品类型。从新需求中,很明显,我们必须创建产品类类型。这些子类型将表示现实世界中特定产品类别, 如下图所示。 ?

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