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Pandas和SQLite提升超大数据读取速度

作者:Itamar Turner-Trauring 翻译:老齐 与本文相关图书推荐:《跟老齐学Python:数据分析》 ---- 让我们想象,你有一个非常数据集,以至于读入内存之后会导致溢出,但是你想将它一部分用...Pandas进行处理,如果你在某个时间点只是想加载这个数据集一部分,可以使用分块方法。...现在,PandasDataFrame对象中有索引,但是必须要将数据读入内存,然而CSV文件太大了,内存无法容纳,于是,你想到,可以只载入你关注记录。 这就是第一个方法,进行分块。...SQLite将数据保存在独立文件中,你必须管理一个SQLite数据文件,而不是CSV文件了。 SQLite存储数据 下面演示一下如何用Pandas操作SQLite: 1....,从而允许我们使用这些快速搜索数据库。

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pandas更快

pandas为什么 由于底层numpy数组数据结构和C代码,pandas库已经相当快了。然而,默认情况下,所有Python代码都在单个CPU线程上运行,这使得pandas运行。...三个比pandas更快数据分析库 简要介绍以下三个能够快速运行Python库: 1.polars:一个使用Apache Arrow格式内存模型在Rust编程语言中实现快速数据框架库。...2.modin在apply和concat函数中非常快,但在其他函数中非常。值得注意是,在许多测试(merge、filter、groupby等)中,modin比Panda。...3.Datatable在进行简单列计算时并不差,而且速度非常快。 从对更大数据集测试中,还可以看到,在大多数测试中,polars性能始终优于所有其他库。...虽然没有测试这四个库每个方面,但所测试操作在数据分析工作中非常常见。结果表明,polars替换pandas可能会将Python程序速度提高至少2-3倍。

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还在抱怨pandas运行速度?这几个方法会颠覆你看法

我们知道pandas两个主要数据结构:dataframe和series,我们对数据一些操作都是基于这两个数据结构。但在实际使用中,我们可能很多时候会感觉运行一些数据结构操作会异常。...一个操作几秒可能看不出来什么,但是一整个项目中很多个操作加起来会让整个开发工作效率变得很低。有的朋友抱怨pandas简直太慢了,其实对于pandas一些操作也是有一定技巧。...因此,如果正确使用pandas的话,它运行速度应该是非常。 本篇将要介绍几种pandas中常用到方法,对于这些方法使用存在哪些需要注意问题,以及如何对它们进行速度提升。...我们仍然在使用某种形式Python for循环,这意味着每个函数调用都是在Python中完成,理想情况是它可以Pandas内部架构中内置更快语言完成。...这里探讨示例相当简单,但说明了Pandas功能正确应用如何能够大大改进运行时和速度代码可读性。

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pandas又不想改代码怎么办?来试试Modin

之前和大家分享过一篇关于提速pandas文章,主要是在pandas具体操作用法上提出了一些改进,还在抱怨pandas运行速度?...DataFrame分区 分区模式沿着和行分区,因为它在数和支持行数方面给Modin提供了灵活性和可伸缩性。 ? 系统架构 Modin被分成不同层: Pandas API暴露在最顶层。...modin标准架构 在Modin中实现pandas API pandas API是非常,这可能是它具有如此广泛应用原因。 ?...type(df) modin.pandas.dataframe.DataFrame 如果我们head命令打印出前5行,它会像pandas一样呈现HTML表。 df.head() ?...df.groupby pandas groupby编写得非常好,速度非常快。但即便如此,modin仍然胜过pandas

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pandas:apply和transform方法性能比较

方法时,需要记得三点: 1、它只能对每一进行计算,所以在groupby()之后,.transform()之前是要指定要操作,这点也与apply有很大不同。...2、由于是只能对每一计算,所以方法通用性相比apply()就局限了很多,例如只能求最大/最小/均值/方差/分箱等操作 3、transform还有什么呢?...2.6 结论 agg()+python内置方法计算速度最快,其次是transform()+python内置方法。而 transform() 方法+自定义函数 组合方法最慢,需要避免使用!...而下面两图中红框内容可观察发现:python自带stats统计模块在pandas结构中计算也非常,也需要避免使用! ? ? 3....可以看到,在260W数据集上,多进程比单进程计算速度可以提升约17%~61% 。 ?

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数据科学原理与技巧 三、处理表格数据

我们将提出一个问题,将问题分解为大体步骤,然后使用pandas DataFrame将每个步骤转换为 Python 代码。...索引、切片和排序 让我们使用pandas来回答以下问题: 2016 年五个最受欢迎婴儿名字是? 拆分问题 我们可以将这个问题分解成以下更简单表格操作: 分割出 2016 年行。...总结 我们现在有了数据集中每个性别和年份最受欢迎婴儿名称,并学会了在pandas中表达以下操作: 操作 pandas 分组 df.groupby(label) 多分组 df.groupby([label1..., label2]) 分组和聚合 df.groupby(label).agg(func) 透视 pd.pivot_table() 应用、字符串和绘图 在本节中,我们将回答这个问题: 我们可以名字最后一个字母来预测婴儿性别吗...通过在pandas文档中查看绘图,我们了解到pandas将DataFrame一行中绘制为一组条形,并将每显示为不同颜色条形。 这意味着letter_dist表透视版本将具有正确格式。

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Pandas速查手册中文版

对于数据科学家,无论是数据分析还是数据挖掘来说,Pandas是一个非常重要Python包。...它不仅提供了很多方法,使得数据处理非常简单,同时在数据处理速度上也做了很多优化,使得和Python内置方法相比时有了很大优势。 如果你想学习Pandas,建议先看两个网站。...df.dropna(axis=1):删除所有包含空值 df.dropna(axis=1,thresh=n):删除所有小于n个非空值行 df.fillna(x):x替换DataFrame对象中所有的空值...,后按col2降序排列数据 df.groupby(col):返回一个按col进行分组Groupby对象 df.groupby([col1,col2]):返回一个按多进行分组Groupby对象 df.groupby...col1进行分组,并计算col2和col3最大值数据透视表 df.groupby(col1).agg(np.mean):返回按col1分组所有均值 data.apply(np.mean):对

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Pandas图鉴(三):DataFrames

Pandas 给 NumPy 数组带来两个关键特性是: 异质类型 —— 每一都允许有自己类型 索引 —— 提高指定查询速度 事实证明,这些功能足以使Pandas成为Excel和数据库强大竞争者...Polars[2]是Pandas最近转世(Rust编写,因此速度更快,它不再使用NumPy引擎,但语法却非常相似,所以学习 Pandas 后对学习 Polars 帮助非常大。...drop删除行速度出奇,如果原始标签不是唯一,就会导致错综复杂bug。...通常最少定制功能会产生最好性能。因此,按照速度递增顺序: 通过g.apply()实现多范围自定义函数 通过g.agg()实现单列范围自定义函数(支持Cython或Numba加速)。...在上面的例子中,所有的值都是存在,但它不是必须: 对数值进行分组,然后对结果进行透视做法非常普遍,以至于groupby和pivot已经被捆绑在一起,成为一个专门函数(和一个相应DataFrame

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一行代码将Pandas加速4倍

作者:George Seif 编译:ronghuaiyang 导读 虽然Pandas功能非常强大,但是对于大数据集来说,确实是很慢。...Pandas是处理 Python 数据首选库。它易于使用,并且在处理不同类型和大小数据时非常灵活。它有大量函数,使得操纵数据变得轻而易举。 ?...随着时间推移,各种Python包流行程度 但是有一个缺点:对于较大数据集来说,panda“”。 默认情况下,panda 使用单个 CPU 内核作为单个进程执行其函数。...可以*.mean()取每一平均值,groupby对数据进行分组,drop_duplicates()*删除所有重复项,或者使用其他任何内置 pandas 函数。...这是一个应用 Modin 绝佳机会,因为我们要多次重复一个非常简单操作。

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一行代码将Pandas加速4倍

作者:George Seif 编译:ronghuaiyang 导读 虽然Pandas功能非常强大,但是对于大数据集来说,确实是很慢。...Pandas是处理 Python 数据首选库。它易于使用,并且在处理不同类型和大小数据时非常灵活。它有大量函数,使得操纵数据变得轻而易举。 ?...随着时间推移,各种Python包流行程度 但是有一个缺点:对于较大数据集来说,panda“”。 默认情况下,panda 使用单个 CPU 内核作为单个进程执行其函数。...可以*.mean()取每一平均值,groupby对数据进行分组,drop_duplicates()*删除所有重复项,或者使用其他任何内置 pandas 函数。...这是一个应用 Modin 绝佳机会,因为我们要多次重复一个非常简单操作。

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利用 Python 实现 Excel 办公常用操作!

本文主要是pandas,绘图库是plotly,实现Excel常用功能有: Python和Excel交互 vlookup函数 数据透视表 绘图 以后如果发掘了更多Excel功能,会回来继续更新和补充...如图所示为某单位所有员工基本信息数据源表,在“2010年3月员工请假统计表”工作表中,当在A输入员工工号时,如何实现对应员工姓名、身份证号、部门、职务、入职日期等信息自动录入?...pivot_table参数index/ columns/ values和Excel里参数是对应上(当然,我这话说了等于没说,数据透视表里不就是行//值吗还能有啥。。)...但是我个人还是更喜欢groupby,因为它运算速度非常快。我在打kaggle比赛时候,有一张表是贷款人行为信息,大概有2700万行,groupby算了几个聚合函数,几秒钟就完成了。...不过pandas官方文档说了,groupby之后用apply速度非常,aggregate内部做过优化,所以很快,apply是没有优化,所以建议有问题先想想别的方法,实在不行时候再用apply。

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pandas基础:使用Python pandas Groupby函数汇总数据,获得对数据更好地理解

标签:Python与Excel, pandas 在Python中,pandas groupby()函数提供了一种方便方法,可以按照我们想要任何方式汇总数据。...跟踪信用卡消费简单工具 现在几乎每个人都有信用卡,使用非常方便,只需轻触或轻扫即可完成交易。然而,在每个付款期结束时,你有没有想过“我到底把这些钱花在哪里了?”。...parse_dates参数,pandas可能会认为该是文本数据。...“Fee手续费/Interest利息费”类别看起来可疑,也想看看是否可以减少一些“Entertainment娱乐”费用,所以我们将这些费用分解为每月数字。...现在,你已经基本了解了如何使用pandas groupby函数汇总数据。下面讨论当使用该函数时,后台是怎么运作

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媲美Pandas?PythonDatatable包怎么

【导读】工具包 datatable 功能特征与 Pandas 非常类似,但更侧重于速度以及对大数据支持。...前言 data.table 是 R 中一个非常通用和高性能包,使用简单、方便而且速度快,在 R 语言社区非常受欢迎,每个月下载量超过 40 万,有近 650 个 CRAN 和 Bioconductor...整个文件共包含226万行和145数据,数据量规模非常适合演示 datatable 包功能。...▌删除行/ 下面展示如何删除 member_id 这一数据: del datatable_df[:, 'member_id'] ▌分组 (GroupBy) 与 Pandas 类似,datatable...▌过滤行 在 datatable 中,过滤行语法与GroupBy语法非常相似。下面就来展示如何过滤掉 loan_amnt 中大于 funding_amnt 值,如下所示。

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媲美Pandas?PythonDatatable包怎么

作者 | Parul Pandey 译者 | linstancy 责编 | Jane 【导读】工具包 datatable 功能特征与 Pandas 非常类似,但更侧重于速度以及对大数据支持。...前言 data.table 是 R 中一个非常通用和高性能包,使用简单、方便而且速度快,在 R 语言社区非常受欢迎,每个月下载量超过 40 万,有近 650 个 CRAN 和 Bioconductor...整个文件共包含226万行和145数据,数据量规模非常适合演示 datatable 包功能。...▌删除行/ 下面展示如何删除 member_id 这一数据: del datatable_df[:, 'member_id'] ▌分组 (GroupBy) 与 Pandas 类似,datatable...▌过滤行 在 datatable 中,过滤行语法与GroupBy语法非常相似。下面就来展示如何过滤掉 loan_amnt 中大于 funding_amnt 值,如下所示。

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多快好省地使用pandas分析大型数据集

Python大数据分析 1 简介 pandas虽然是个非常流行数据分析利器,但很多朋友在使用pandas处理较大规模数据集时候经常会反映pandas运算“”,且内存开销“大”。...图1 本文就将以真实数据集和运存16G普通笔记本电脑为例,演示如何运用一系列策略实现多快好省地pandas分析大型数据集。...54.6%,这是个很大进步,按照这个方法我们尝试着读入全量数据并查看其info()信息: 图5 可以看到随着我们对数据精度优化,数据集所占内存有了非常可观降低,使得我们开展进一步数据分析更加顺畅...「只读取需要」 如果我们分析过程并不需要用到原数据集中所有,那么就没必要全读进来,利用usecols参数来指定需要读入字段名称: raw = pd.read_csv('train.csv',....groupby(['app', 'os']) .agg({'ip': 'count'}) .compute() # 激活计算图 ) 并且dask会非常智能地调度系统资源,使得我们可以轻松跑满所有

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Python和Excel完美结合:常用操作汇总(案例详析)

python做数据分析,离不开著名pandas包,经过了很多版本迭代优化,pandas现在生态圈已经相当完整了,官网还给出了它和其他分析工具对比: 本文主要也是pandas,绘图库是...,并同时算出利润 通过Excel数据透视表操作最终实现了下面这样效果: python实现:对于这样分组任务,首先想到就是pandasgroupby,代码写起来也简单,思路就是把刚才Excel...pivot_table参数index/ columns/ values和Excel里参数是对应上(当然,我这话说了等于没说,数据透视表里不就是行//值吗还能有啥。)...但是我个人还是更喜欢groupby,因为它运算速度非常快。我在打kaggle比赛时候,有一张表是贷款人行为信息,大概有2700万行,groupby算了几个聚合函数,几秒钟就完成了。...不过pandas官方文档说了,groupby之后用apply速度非常,aggregate内部做过优化,所以很快,apply是没有优化,所以建议有问题先想想别的方法,实在不行时候再用apply。

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开发ETL为什么很多人R不用Python

打破R印象,ETL效率显著优于Python,堪比spark,clickhouse 2....测试数据长这样: 废话不多说,先看部分结果截图吧。 上图截取是复杂groupby问题中对于5G与50G数据各ETL工具用时情况,项目运行服务器内存为128G,核数40。...1.读取 data.table用时89秒,内存峰值消耗7G modin.pandas用时58秒,内存峰值消耗25G 本测试所用是modin[ray],似乎modin.pandas一直有内存管理问题,...(id4, id5)] modin用时174秒,由于modin暂不支持多groupby,实际上还是pandasgroupby x.groupby([‘id4’,‘id5’]).agg({‘v3...’: [‘median’,‘std’]}) UserWarning: DataFrame.groupby_on_multiple_columns defaulting to pandas implementation

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【技巧】Pandas常见性能优化方法

Pandas在使用上有一些技巧和需要注意地方,如果你没有合适使用,那么Pandas可能运行速度非常。本文将整理一些Pandas使用技巧,主要是用来节约内存和提高代码速度。...建议1:尽可能避免读取原始csv,使用hdf、feather或h5py格式文件加快文件读取; 在某些定长字符数据读取情况下,read_csv读取速度比codecs.readlines很多倍。...3 apply、transform和agg时尽量使用内置函数 在很多情况下会遇到groupby之后做一些统计值计算,而如果内置函数写法会快很多。 ?...在阿里云安全赛中我是joblib库写并行特征提取,比单核特征提取快60倍。 建议4:如果能并行就并行,第三方库或者自己手写多核计算。...Pandas官方也写了一篇性能优化文章,非常值得阅读: https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/user_guide/enhancingperf.html

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