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【R语言】百分比表格删除两重新计算百分比

好不容易算好每个样本中检测到微生物百分比含量 发现前面两一个是没有分类类型,另外一个是无法比对到微生物物种上。这两需要删掉,这样每个样本中微生物占比就需要重新计算了。...删除之前,每个样本中微生物占比为 下面我们用两种方法来实现 一、使用apply函数 #读入数据 a <- read.table(file="sample_bacteria_percentage.txt...",sep="\t",header=T,row.names=1) #删除前两 b=a[-(1:2),] #利用apply函数对列做处理,除以每列之和 result <- apply(b,2,function...colSums(result) #数据导出 write.table(result,file="remove_recal_percent1.txt",sep="\t",quote=F) 二、使用前面讲到过☞...R中sweep函数 #读入数据 a=read.table("sample_bacteria_percentage.txt",header=T,sep="\t",row.names=1) #删除前两

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代码加快pandas计算速度

使用pandas,当您运行以下行时: # Standard apply df.apply(func) 得到这个CPU使用率: 标准pandas适用 - 仅使用1个CPU 即使计算机有多个CPU,也只有一个完全专用于您计算...而不是下边这种CPU使用,想要一个简单方法来得到这样东西: 并行Pandas适用 - 使用所有CPU Pandaral·lel 如何帮助解决这个问题?...Pandaral·lel 想法是将pandas计算分布在计算机上所有可用CPU上,以显着提高速度。...并行应用进度条 并配有更复杂情况下使用带有pandas DataFrame df,该数据帧两列column1,column2和功能应用func: # Standard pandas apply df.groupby...(越低越好) 除了df.groupby.col_name.rolling.apply速度仅增加x3.2因子之外,平均速度增加约x4因子,即使用过计算机上核心数。

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基于 Python 和 Pandas

基于 Python 和 Pandas 数据分析(1) Pandas 是 Python 一个模块(module), 我们将用 Python 完成接下来数据分析学习....但是如果你不熟悉, 可以看下我解释: 一个 dataframe 就很像是一个仅有和列组成电子表格. 现在开始, 我们可以使用 Pandas 以光速对数据集进行一系列操作....Pandas 性能非常强大, 非常值得学习. 如果你在使用 excel 或者其他电子表格处理大量计算任务, 那么通常需要1分钟或者1小时去完成某些工作, Pandas 将改变这一切....所以, 大家一般都习惯只输出前5数据: print(df.head()) 输出: High Low Open Close...以上就是对 Pandas 一个简单快速介绍. 在这个整个系列教程中, 我将会带到更多Pandas 基础知识, 还有一些对 dataframe 操作.

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Python-科学计算-pandas-14-df按按列进行转换

系统:Windows 7 语言版本:Anaconda3-4.3.0.1-Windows-x86_64 编辑器:pycharm-community-2016.3.2 pandas:0.19.2 这个系列讲讲...Python科学计算及可视化 今天讲讲pandas模块 将Df按按列进行转换 Part 1:目标 最近在网站开发过程中,需要将后端Df数据,渲染到前端Datatables,前端识别的数据格式有以下特征...- 数据格式为一个列表 - 列表中每一个元素为一个字典,每个字典对应前端表格 - 单个字典键为前端表格列名,字典值为前端表格每列取值 简单来说就是要将一个Df转换为一个列表,该列表有特定格式...list_fields = df_1.to_dict(orient='records'),使用了to_dict函数,其中orient=’records’,简单记忆法则,records表示记录,对应数据库...Part 4:延伸 以上方法将Df按转换,那么是否可以按列进行转换呢?

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PowerBI: 条件格式中百分比计算原理

最近在使用条件格式中图标功能时,发现存在一个百分比名词。...通过查阅资料,发现百分比计算基于如下公式: 其中 Xn代表计算依据字段的当前取值,Xmin 是依据字段最小值,Xmax 是依据字段最大值。...公式分母是整个区间最大变动范围,数学上称之为极差,或全距。 基于上述百分比计算公式,可以理解上图第4货号STY0487对应是半角。...销售金额最大值是63111,最小值是0,所以百分比 = (39337 - 0)/ (63111 - 0)= 62%,对应是半角区间(33% ~ 67%)。...://learn.microsoft.com/zh-cn/power-bi/create-reports/desktop-conditional-table-formatting) [2] 条件格式中百分比计算原理

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pandasloc和iloc_pandas获取指定数据和列

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君 实际操作中我们经常需要寻找数据某行或者某列,这里介绍我在使用Pandas时用到两种方法:iloc和loc。...读取第二值 (2)读取第二值 (3)同时读取某行某列 (4)进行切片操作 ---- loc:通过、列名称或标签来索引 iloc:通过、列索引位置来寻找数据 首先,我们先创建一个...Dataframe,生成数据,用于下面的演示 import pandas as pd import numpy as np # 生成DataFrame data = pd.DataFrame(np.arange...(1)读取第二值 # 索引第二值,标签是“1” data1 = data.loc[1] 结果: 备注: #下面两种语法效果相同 data.loc[1] == data.loc...,"D","E"]] 结果: 2.iloc方法 iloc方法是通过索引、列索引位置[index, columns]来寻找值 (1)读取第二值 # 读取第二值,与loc方法一样 data1

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pandas按列遍历Dataframe几种方式

遍历数据有以下三种方法: 简单对上面三种方法进行说明: iterrows(): 按遍历,将DataFrame每一迭代为(index, Series)对,可以通过row[name]对元素进行访问。...itertuples(): 按遍历,将DataFrame每一迭代为元祖,可以通过row[name]对元素进行访问,比iterrows()效率高。...iteritems():按列遍历,将DataFrame每一列迭代为(列名, Series)对,可以通过row[index]对元素进行访问。...示例数据 import pandas as pd inp = [{‘c1’:10, ‘c2’:100}, {‘c1’:11, ‘c2’:110}, {‘c1’:12, ‘c2’:123}] df =...(index) # 输出每行索引值 1 2 row[‘name’] # 对于每一,通过列名name访问对应元素 for row in df.iterrows(): print(row[‘c1

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Pandas基础使用系列---获取和列

前言我们上篇文章简单介绍了如何获取和列数据,今天我们一起来看看两个如何结合起来用。获取指定和指定列数据我们依然使用之前数据。...我们先看看如何通过切片方法获取指定列所有数据info = df.loc[:, ["2021年", "2017年"]]我们注意到,位置我们使用类似python中切片语法。...可以看看上一篇文章内容。同样我们可以利用切片方法获取类似前4列这样数据df.iloc[:, :4]由于我们没有指定名称,所有指标这一列也计算在内了。...接下来我们再看看获取指定指定列数据df.loc[2, "2022年"]是不是很简单,大家要注意是,这里2并不算是所以哦,而是名称,只不过是用了padnas自动帮我创建名称。...通常是建议这样获取,因为从代码可读性上更容易知道我们获取是哪一哪一列。当然我们也可以通过索引和切片方式获取,只是可读性上没有这么好。

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Modin,只需一代码加速你Pandas

❝Ray是基于python并行计算和分布式执行引擎。 Dask是一个高性能并行分析库,帮助Pandas、Numpy处理大规模数据。 ❞ 那Modin有何特别之处呢?...与pandas不同,Modin能使用计算机中所有的CPU内核,让代码并行计算。 当用4个进程而不是一个进程(如pandas)运行相同代码时,所花费时间会显著减少。...append() append在Pandas中用来添加新,我们来看看Modin和Pandas做append操作时速度差异。...如果你已经写好基于pandas脚本,只是想加速运行代码,那么Modin是最佳选择。如果你只是想简单统计或可视化大数据集,可以考虑Vaex。...但Dask对Pandas并没有很好兼容性,没办法像Modin那样,只需改变一代码,就可以轻松使用Pandas处理大数据集。 「Modin vs.

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pandas删除某列有空值_drop

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 0.摘要 dropna()方法,能够找到DataFrame类型数据空值(缺失值),将空值所在/列删除后,将新DataFrame作为返回值返回。...列表,元素为或者列索引。如果axis=0或者‘index’,subset中元素为列索引;如果axis=1或者‘column’,subset中元素为索引。...2.示例 创建DataFrame数据: import numpy as np import pandas as pd a = np.ones((11,10)) for i in range(len(a...:删除第0、5、6、7列都为空 # 设置子集:删除第0、5、6、7列都为空 print(d.dropna(axis='index', how='all', subset=[0,5,6,7]))...设置子集:删除第5、6、7存在空值列 # 设置子集:删除第5、6、7存在空值列 print(d.dropna(axis=1, how='any', subset=[5,6,7])) 原地修改

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对比Excel,Python pandas删除数据框架中

标签:Python与Excel,pandas 对于Excel来说,删除是一项常见任务。本文将学习一些从数据框架中删除技术。...准备数据框架 我们将使用前面系列中用过“用户.xlsx”来演示删除。 图1 注意上面代码中index_col=0?如果我们将该参数留空,则索引将是基于0索引。...使用.drop()方法删除 如果要从数据框架中删除第三(Harry Porter),pandas提供了一个方便方法.drop()来删除。...inplace:告诉pandas是否应该覆盖原始数据框架。 按名称删除 图2 我们跳过了参数axis,这意味着将其保留为默认值0或。因此,我们正在删除索引值为“Harry Porter”。...这次我们将从数据框架中删除带有“Jean Grey”,并将结果赋值到新数据框架。 图6

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使用pandas筛选出指定列值所对应

pandas中怎么样实现类似mysql查找语句功能: select * from table where column_name = some_value; pandas中获取数据有以下几种方法...布尔索引 该方法其实就是找出每一中符合条件真值(true value),如找出列A中所有值等于foo df[df['A'] == 'foo'] # 判断等式是否成立 ?...这个例子需要先找出符合条件所在位置 mask = df['A'] == 'foo' pos = np.flatnonzero(mask) # 返回是array([0, 2, 4, 6, 7])...df.index=df['A'] # 将A列作为DataFrame索引 df.loc['foo', :] # 使用布尔 df.loc[df['A']=='foo'] ?...数据提取不止前面提到情况,第一个答案就给出了以下几种常见情况:1、筛选出列值等于标量,用== df.loc[df['column_name'] == some_value] 2、筛选出列值属于某个范围内

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pandas基础:idxmax方法,如何在数据框架中基于条件获取第一

标签:pandas idxmax()方法可以使一些操作变得非常简单。例如,基于条件获取数据框架中第一。本文介绍如何使用idxmax方法。...什么是pandasidxmax idxmax()方法返回轴上最大值第一次出现索引。 例如,有4名ID为0,1,2,3学生测试分数,由数据框架索引表示。...默认情况下,axis=0: 学生3Math测试分数最高 学生0English测试分数最高 学生3CS测试分数最高 图2 还可以设置axis=1,以找到每个学生得分最高科目。...图3 基于条件在数据框架中获取第一 现在我们知道了,idxmax返回数据框架最大值第一次出现索引。那么,我们可以使用此功能根据特定条件帮助查找数据框架中第一。...例如,假设有SPY股票连续6天股价,我们希望找到在股价超过400美元时第一/日期。 图4 让我们按步骤进行分解,首先对价格进行“筛选”,检查价格是否大于400。此操作结果是布尔索引。

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