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使用IGV看序列比对情况

和扩展覆盖率视图 序列比对track:颜色、透明度、插入、缺失和排序 PE序列比对:将reads以pairs形式和颜色来区分,同时可以分为几个屏幕看。...如果某核苷酸与参考序列不同(超过20%reads)时,IGV会标出不同的颜色。 ? 即:A→绿色;C→蓝色;G→橙色;T→红色。 将鼠标悬停在你需要查看的位点处可以看到详细的信息,右键可以复制。 ?...Ctrl+鼠标单击(Mac:command+click)将paired reads用相同的颜色标记其轮廓,每对颜色都是不一样的。注:黑色外框的reads则该reads没有mate。...(注:若这个read没有mapped mate,则这个选项为灰色)。双击窗口顶端的位点栏,即可恢复正常的单屏视图。...默认的颜色标记规则:如图 红色:插入片段大小大于预期值(这里可能有缺失) 蓝色:插入片段大小小于预期值(这里可能存在有插入) 不同颜色显示PE reads中其mate可在其他染色体上找到(此处可能为染色体间重组

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用户行为数据可视化:行为序列

在网站,一段时间内,一个用户从进入网站到离开网站过程中的每一步行为的记录,被我们记做一用户行为序列。 如下图,就是一用户行为序列。 ?...刚才的那条共计12步的用户行为序列,转化为行为序列图,就是这个样子滴↓ (*其中,对每个动作都进行了数字编码&颜色标记,如:动作“search”被编码为“16”,并标记为“透明度为20%的红色”。...是不是瞬间变得非常简单直观~ 如果有100用户行为序列,那么这幅行为序列图是这个样子的↓,大数据尽收眼底,就是这种赶脚哦~ ? 三.那么问题来了,用户行为序列图有啥用呢?...如没有思路,希望通过看图找出一些规律,可以常识根据不同动作类型标颜色,如点击、翻页、输入等;也可以根据不同页面进行标记,如首页动作、结果列表页动作、详情页动作等,也可以根据功能模块进行标记,如查找功能,...但我们希望用户精挑细选,然后快速决策,可见用户并不是按照我们的预期使用产品,里面肯定有一些体验问题,值得我们深入分析。

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用户行为数据可视化——行为序列

在网站,一段时间内,一个用户从进入网站到离开网站过程中的每一步行为的记录,被我们记做一用户行为序列。 如下图,就是一用户行为序列。 这条用户行为包含12个步长,依次进行了搜索、添词、预估等动作。...刚才的那条共计12步的用户行为序列,转化为行为序列图,就是这个样子滴↓ (*其中,对每个动作都进行了数字编码&颜色标记,如:动作“search”被编码为“16”,并标记为“透明度为20%的红色”。...是不是瞬间变得非常简单直观~ 如果有100用户行为序列,那么这幅行为序列图是这个样子的↓,大数据尽收眼底,就是这种赶脚哦~ 三.那么问题来了,用户行为序列图有啥用呢?...如没有思路,希望通过看图找出一些规律,可以常识根据不同动作类型标颜色,如点击、翻页、输入等;也可以根据不同页面进行标记,如首页动作、结果列表页动作、详情页动作等,也可以根据功能模块进行标记,如查找功能,...但我们希望用户精挑细选,然后快速决策,可见用户并不是按照我们的预期使用产品,里面肯定有一些体验问题,值得我们深入分析。 来源:36大数据

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JS实现五子棋(一)目标分析

在实际的设计之前,首先要考虑做的是什么,明确目标,然后试着想象或者画出预期效果,有了一个大致的构思之后再开始设计分析。...我计划初期做web版单机双人对战五子棋,再考虑人机对战,预期效果实现单台电脑上运行,两人轮流落子,先在一直线上连续摆出5颗相同颜色的棋子的一方获胜(不考虑复杂规则,如禁手等)。...除了玩家,还必须有棋子和棋盘,棋子就会有颜色属性,每局开始时会确定所属玩家这一属性;棋盘则具有棋盘尺寸,格子的数量等等,我在这里假设棋盘是一个智能的有生命的棋盘,可以清空棋盘中的棋子、可以在棋盘中绘制一颗棋子等动作等...输赢判定,即当前棋子落下后,如果棋盘上存在一直线上连续5个相同颜色的棋子,即判定执此颜色棋子的一方胜利。...那么规则要如何判定呢,是通过事件绑定,下棋落子即为一个事件,事件触发布局检测,判定胜负,布局检测没有必要检测过多的位置,能够取胜的棋子摆法只有垂直、水平,左上至右下,右下至左上共4线路。 ?

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数据处理神器tidyverse(2)ggplot2

线图适用于绘制时间序列,因此下面我们使用点和线图层绘制平均预期寿命。...如果你想在我们每个大陆的地块上有一单独的线(而不是所有大陆的聚合线),你不需要为每个大陆添加一个单独的层来得到以下图: ? 相反,当您年计算平均预期寿命时,首先按“大陆”分组。...发生这种情况是因为您现在每年都有多个平均预期寿命值,但您没有指定哪些值一起使用。...但您也可以指定其他类型的美学映射,例如使用变量来指定点的颜色。如果希望所有点都是相同的颜色,则可以指定全局点颜色参数(位于aes()函数之外)。...请注意,continent变量本身不指定颜色:这是自动完成的。 您可以通过添加颜色的缩放图层来指定自己想要的颜色

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mysql跨库分页、分表为什么这么难?

用前面的例子验证一下: 原序列:(1,2,3,4,5,6,7,8),需要取出limit 1,2 ,即:(2,3) 2.1 分段法拆成2段 (1 , 2 , 3 , 4) => limit 1,2 =>...limit 3,2 => (4,5) 也符合预期。...pagesize条数据即可(注:offset/n除不尽的话,向下取整了,也就是起始点可能向前多移了,所以有可能开始的第1记录,其实是上1页的最后1记录,要追求精确的话,可以在应用层记录上一页最后1记录的...id,然后跟本次查询结果前1记录对比,如果发现是一样的,开始取数据的位置,就要向后移1位,如果考虑id有重复的话,就要根据情况多移几位) 验证一下看看效果: 场景1(前提:取余法) 原序列:(1,...比如下面这个,奇数、偶数分成2个子序列,但是偶数故意删除了几个(相当于现实业务中,这个分表上的数据被干掉了一部分) 原序列:(1,3,5,6,7,8,9,11),需要取出limit 2,2 ,即:(5

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分表分页跨库分页为什么这么难?

用前面的例子验证一下: 原序列:(1,2,3,4,5,6,7,8),需要取出limit 1,2 ,即:(2,3) 2.1 分段法拆成2段: (1 , 2 , 3 , 4) => limit 1,2...limit 3,2 => (4,5) 也符合预期。...pagesize条数据即可(注:offset/n除不尽的话,向下取整了,也就是起始点可能向前多移了,所以有可能开始的第1记录,其实是上1页的最后1记录,要追求精确的话,可以在应用层记录上一页最后1记录的...id,然后跟本次查询结果前1记录对比,如果发现是一样的,开始取数据的位置,就要向后移1位,如果考虑id有重复的话,就要根据情况多移几位) 验证一下看看效果: 场景1(前提:取余法) 原序列:(1,2,...比如下面这个,奇数、偶数分成2个子序列,但是偶数故意删除了几个(相当于现实业务中,这个分表上的数据被干掉了一部分) 原序列:(1,3,5,6,7,8,9,11),需要取出limit 2,2 ,即:(5

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Nature Reviews Neuroscience:注意在时间维度上的结构

比如“on your marks, get set…”之后紧接着发出“go”信号;指挥家做出手势后交响乐即开始演奏等等。...a被试学会将场景图像与两个间隔(800或2000 ms)相关联,此后占位符(炸弹示意图)将改变颜色。检测任务要求被试在颜色改变后尽快按键,辨别任务要求被试指出占位符的颜色变化。...当光盘又重新出现时,目标引起的P1的幅度会因空间注意而增强,并且这种影响会因时间上的预期而进一步放大。而当空间期望不存在时,时间期望对P1没有影响。在预期期间也观察到时空相互作用。...时间期望的影响开始在人类记忆中得到表征。时间期望可以增强不同时间尺度的记忆信息编码。...在作者最近设计的一个任务中,被试首先编码两个颜色不同的,在1250ms或2500ms后探测两个条形的方向。被试通过关联了解到在80%的trial中,间隔的长度可预测将探测哪个彩条。

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生物信息学初识篇——第二章:序列比对(3)

BLASTp 也就是用蛋白质序列搜索蛋白质序列数据库, BLASTn 是用核酸序列搜索核酸序列数据库。 BLASTx 是将核酸序列6链翻译成蛋白质序列后搜索蛋白质序列数据库。...tBLASTx是将核酸序列 6 链翻译成蛋白质序列后搜索核酸序列数据库,核酸数据库中的所有核酸序列也要按 6 链翻译成的蛋白质序列后再被搜索。 ?...代表这些高分匹配片段的线拥有不同颜色和不同的长短。如果把鼠标放到某一线上,可以看到这条匹配片段的具体信息,包括他所在序列的数据库编号,序列的名字,匹配得分,期望值 E 值。...PSI-BLAST 的特色是搜完一遍再搜一遍,且从第二次搜索开始,每次搜索前都利用上一次搜索到的结果创建一个位置特异权重矩阵以扩大本次搜索的范围。如此反复直至没有新的结果产生为止。...因为是第一轮搜索,之前还没有搜索到任何序列,也就是第一轮的搜索过程中没有使用 PSSM,所以这一列都为空。接下来点“go”进行第二轮搜索。“go”左侧的输入框里可以指定列出搜索到的前多少序列

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RayData数据可视化系列课程第二讲 ——常见的数据可视化图表类型

使用场景:当您需要比较单个时间段中的多个变量或时间序列中的单个变量时,最好使用条形图。...图形的画法是:男女人口年龄自然顺序自下而上在纵轴左右画成并列的横条柱,各条柱代表各个年龄组。底端标有一定计算单位或百分比表示的人口数量。 使用场景:需要展示人口情况、人口结构、人口趋势等。...5.png 表示偏离关系 条形图(Bar chart)(实际与预期) 它们比较给定变量的期望值和实际值。 使用场景:需要比较单个变量的预期值和实际值。...上四分位数到最大值之间建立一延伸线,这个延伸线成为“胡须(whisker)”。...下面的示例小时和一周内的时间显示网站的用户。

2.9K41

谷歌Material Design可视化数据设计规范指南

在大数据、后台管理面板、金融等与数据有关的UI设计中,可视化数据设计是必不可少而且非常重要,但这些设计很多设计师没有接触或很少接触到,也不懂可视化数据设计规范,为了设计好看的数据图表,不停的找设计灵感参考...面积图 面积图有多种类型,包括堆叠面积图和层叠面积图: · 堆叠面积图显示多个时间序列(在同一时间段内)堆叠在一起 · 层叠面积图显示多个时间序列(在同一时间段内)重叠在一起 层叠面积图建议不要使用超过两个时间序列...柱状图(条形图)基线 柱状图(条形图)应从为零的基线(y轴上的起始值)开始。从不为零的基线开始可能导致数据被错误地理解。 坐标轴标签 标签的设计应体现图表中最重要的数据。...在此示例中,图表数据从天显示动态切换到周显示。转换期间不会显示所选日期范围之外的数据,从而降低了复杂性。 动画能够体现两个不同图表的相关性。 6....空状态 图表数据为空的情况下,可以提供相关数据的预期。 在合适的情况下,可以展示角色动画创造愉悦和鼓励。 有特色的动画提升了空状态的效果。

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Google数据可视化团队:数据可视化指南(中文版)

常见用例包括: 收入和预期寿命 ? 6. 分布 分布类图表显示每个值在数据集中出现的频率。 常见用例包括: 人口分布、收入分布 ? 7. 流程 流程类图表显示了多个状态之间的数据移动。...面积图 面积图有多种类型,包括堆叠面积图和层叠面积图: · 堆叠面积图显示多个时间序列(在同一时间段内)堆叠在一起 · 层叠面积图显示多个时间序列(在同一时间段内)重叠在一起 层叠面积图建议不要使用超过两个时间序列...柱状图(条形图)基线 柱状图(条形图)应从为零的基线(y轴上的起始值)开始。从不为零的基线开始可能导致数据被错误地理解。 ? 坐标轴标签 标签的设计应体现图表中最重要的数据。...在此示例中,图表数据从天显示动态切换到周显示。转换期间不会显示所选日期范围之外的数据,从而降低了复杂性。 ? 动画能够体现两个不同图表的相关性。 6....空状态 图表数据为空的情况下,可以提供相关数据的预期。 在合适的情况下,可以展示角色动画创造愉悦和鼓励。 ? 有特色的动画提升了空状态的效果。

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利用流量保障搜索质量的实践

字段方式生成模板,只需替换掉 value,保留 JSON 骨架即可。...字段和值的方式生成模板 // 仅供说明,非真实业务字段 如上图所示:查询已上架的黑色数据线,搜索条件: { "attribute": "颜色:黑色", "status": true, "...流量计算产出的结果 基于搜索现有流量,通过场景计算,自动生成线上P1场景用例 618 ,P2场景用例 516 ,P3场景用例 58 ,P4场景用例 161 ,总计 1353 。...预期结果池是独立索引,数据量几十万,相比查线上索引,速度快且不易产生慢SQL。 预期结果池里数据的新增和失效 新增数据:用例库新增一场景用例,首次执行会查询线上索引,同时把搜索结果复制到预期结果池。...总数准确:结合预期结果池,对比预期总数与实际总数。用例库新增一场景用例,首次执行会查询线上索引,记录搜索结果总数(预期结果),同时把搜索结果复制到预期结果池。当用例第二次执行,自动路由到预期结果池。

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【CSS】课程网站 网格商品展示 模块制作 ① ( 网格商品展示模块盒子模型测量及样式 | 顶部文本标题盒子测量及样式 | 代码示例 )

; } /* Banner 右侧 课程表 无序列表 距离头部有 10 像素间隔 */ .course-bd ul { /* 10 像素内边距 - 使用外边距会出现塌陷的问题 */ padding-top...: 10px; } /* Banner 右侧 课程表 无序列表 列表项样式 */ .course-bd li { /* 列表项高度是 60 像素, 文字与顶部有 10 像素间隔 这里将列表项设置成...课程表 无序列表 列表项 继续学习 文本样式 */ .course-bd li .span1 { font-size: 16px; color: #4e4e4e; } /* Banner 右侧...课程表 无序列表 列表项 课程内容 文本样式 */ .course-bd li .span2 { font-size: 14px; color: #4e4e4e; } /* Banner 右侧...课程表 无序列表 列表项 正在学习 文本样式 */ .course-bd li p { font-size: 12px; color: #a5a5a5; } /* Banner 右侧 课程表

4.3K40

3.14特别纪念 | π 的第100000000000000···

每个数字都用不同颜色的点表示。内部的灰点似乎在闪烁——这就是实际的亮度效果。 ? πi用于表示第i个π的数字。 对应外圆颜色编码第i位,内圆颜色编码第i+1位。相邻位置的内外圆颜色相同。 ?...下面长宽比排序来展示了10064位数E=-23的路径。 ? 100个最低能量路径|这些是100个64位E= - 23的路径——有更多的能量路径。路径长宽比(宽度/高度)的增加顺序来进行排列。...复数字的π序列中的(d, n)点 费曼点是重复数字的一个特定实例,我称之为(d, n)点。 到达费因曼点的最优路径 下面是我能找到的20最佳路径的列表。它们的范围从E=- 223到E=- 219。...如果将序列划分为多个组,则其影响会更小。 ? ? ? 2015 今年的主题是: π与树状图 ▍第一幅 我们从一个正方形开始,逐步划分它。在每一阶段,π的数字用于确定分区中使用了多少行。...▍第一幅 上面的颜色分配是随机的。对于每种形状,选择给定颜色(透明、白色、黄色、红色、蓝色)的概率是相同的。 形状的颜色选择也会受到相邻形状的颜色的影响。

1.1K20

52个数据可视化图表鉴赏

1.弧线图 弧线图是一种图形绘制样式,其中图形的顶点沿欧几里德平面中的一线放置,边在以该线为边界的两个半平面之一中绘制为半圆,或绘制为半圆序列形成的平滑曲线。...通常,刻度上的较低值从中心开始,随着每个圆的增大而增大。但是,负值也可以显示在圆型柱状图上,法是从任何一个外圆(从中心圆)开始零位,并将其内的所有圆用于负值。...跨度图只将读者的注意力集中在极值上,没有给出最小值和最大值之间的值或平均值或数据分布的信息。 46.迷你图 迷你图是一种非常小的折线图,通常没有轴或坐标。...曲线图从螺旋的中心开始向外延伸。缓和曲线图用途广泛,可以使用沿缓和曲线路径显示的、线或点。螺旋图是显示大型数据集的理想方法,通常用于显示较长时间段内的趋势。这使得螺旋图非常适合显示周期性图案。...标签通常是单个单词,每个标签的重要性用字体大小或颜色表示。这种格式对于快速识别最突出的术语和字母顺序定位术语以确定其相对突出程度非常有用。当用作网站导航辅助工具时,术语会超链接到与标记关联的项目。

5.7K21

干货 :搞定高质量数据可视化的20建议

因此本文列出如下20优化建议,希望能够帮助你实现更好的数据可视化。...所以,从零基线开始作图,可以确保得到一个更准确的数据表示。...线形图,左边几乎是平的,右边则很好地描述了趋势 05 使用折线图时要考虑到数据的时间序列 折线图是由线条连接的一系列“标记”组成的,通常用于形象地显示数据在时间间隔(一个特定的时间序列)内的变化趋势。...你可以把多出来的几个最小的区块统一归入“其他”区块里 两个饼图,一个由许多区块组成,另一个将小片区块都归入“其他”类别中 09 直接在图表上贴标签 如果没有适当的标签,无论你的图表有多好,它都不会有意义...由于颜色和背景色对比度低,写在图表内部的标签很难识别 11 对饼图的区块大小进行排序以增强可读性 在使用饼图时,有几种常用的方式: 把最大的一个区块放在12点的位置,然后把其余的区块顺时针方向降序排列

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3.14的艺术:π的第100000000000000···

下面长宽比排序来展示了10064位数E=-23的路径。  100个最低能量路径|这些是100个64位E= - 23的路径——有更多的能量路径。路径长宽比(宽度/高度)的增加顺序来进行排列。...复数字的π序列中的(d, n)点 费曼点是重复数字的一个特定实例,我称之为(d, n)点。 到达费因曼点的最优路径 下面是我能找到的20最佳路径的列表。它们的范围从E=- 223到E=- 219。...如果将序列划分为多个组,则其影响会更小。 2015 今年的主题是: π与树状图 ▍第一幅 我们从一个正方形开始,逐步划分它。在每一阶段,π的数字用于确定分区中使用了多少行。...下一个数字的分支从前一个数字的分支的末端开始从左到右的顺序增长。这个过程将继续,直到所有树的数字都用完为止。 大家看上图,第一棵树直到下一个9,生长到314159。...花的颜色由下一棵树的第一个数字和当前树的倒数第二个数字决定。如果当前树只有一个数字,则使用该数字。 树叶从左到右的顺序放置在树枝的顶端。

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让数据图表发挥更大的价值 | 20实用建议

因此本文列出如下20优化建议,希望能够帮助你实现更好的数据可视化。 01....所以,从零基线开始作图,可以确保得到一个更准确的数据表示。 两个垂直条形图,一个基线起始点为0,一个基线起始点为375 04....使用折线图时要考虑到数据的时间序列 折线图是由线条连接的一系列“标记”组成的,通常用于形象地显示数据在时间间隔(一个特定的时间序列)内的变化趋势。...直接在图表上贴标签 如果没有适当的标签,无论你的图表有多好,它都不会有意义。 直接在图表上贴标签对所有浏览者都有很大帮助。 而对照图例需要把数值和相应的区域一一对应上,会耗费浏览者更多时间和精力。...对饼图的区块大小进行排序以增强可读性 在使用饼图时,有几种常用的方式: 把最大的一个区块放在12点的位置,然后把其余的区块顺时针方向降序排列。

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