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geotrellis使用(三十)使用geotrellis读取PostGIS空间数据

JDBC方式我是亲自测试过的,在geotrellis使用(十一)实现空间数据库栅格化以及根据属性字段进行赋值一文中,我详细讲述了如何从PostGIS中读取空间数据并进行栅格化操作;然而我也有极度强迫症,...2.3 创建数据库表与实体类映射 首先要在PostGIS中创建一个数据库(此处假设为test),此数据库要选择空间模板以使该数据库支持空间操作。...,此处q直接获取到的是缓冲区内的城市所有信息,所以将q.result传入db.run后就能获取到缓冲区内的城市的所有信息。...对数据进行空间操作: geotrelis.slick支持将scala的空间操作转换为PostGIS空间函数,如下: def getGeomWKTData { val q = for {...执行上面的函数会打印出如下信息: List(select ST_AsEWKT("geom") from "cities") 表明geotrellis.slick确实将asEWKT操作转换为PostGIS

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PostGIS特性

PostGIS特性 1、PostGIS支持所有的空间数据类型,这些类型包括:点(POINT)、线(LINESTRING)、多边形(POLYGON)、多点 (MULTIPOINT)、多线(MULTILINESTRING...3、PostGIS提供简单的空间分析函数(如Area和Length)同时也提供其他一些具有复杂分析功能的函数,比如Distance。...5、PostGIS提供了一系列的二元谓词(如Contains、Within、Overlaps和Touches)用于检测空间对象之间的空间关系,同时返回布尔值来表征对象之间符合这个关系。...6、PostGIS提供了空间操作符(如Union和Difference)用于空间数据操作。 比如,Union操作符融合多边形之间的边界。...与此对应,空间聚集函数也是执行相同的操作,不过操作的对象是空间数据。

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PostGIS空间数据库简明教程

在我们使用 PostGIS 功能之前,我们需要在 Postgres 中安装扩展:CREATE EXTENSION IF NOT EXISTS postgis;1、空间数据类型PostGIS 支持几种不同类型的...然而,由于可以灵活地存储除颜色之外的任何数值,我们可以利用栅格来存储各种信息——地形高程、人口密度、植被信息或指标等。...4、坐标系标识 - SRIDSRID(spatial reference identifier)是我们需要给每个空间对象赋予属性的重要信息。...它包括有关坐标系的信息、(0, 0) 点在地球上的位置、坐标的分辨率以及地图上的坐标如何与地球上的实际点相对应。...5、结束语本文简要介绍了 PostGIS、它是什么、它支持的一些空间数据类型和操作以及可以利用 PostGIS 解决的一些现实问题。 我们还介绍了空间索引,这是获得最佳性能的第一站。

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POSTGIS 总结

GitHub postgis/postgis PostGreSQL(三)PostGIS PostGreSQL(四)PostGIS-空间数据存储 PostGreSQL(五)PostGIS-常用函数...最重要的只要接触过SQL语言,就可以利用PostGIS的SQL语法便捷的操纵装载着空间信息的数据框(数据表),这些二维表除了被设定了一个特殊的空间地理信息字段(带有空间投影信息、经纬度信息等)之外,与主流数据管理系统所定义的各种字段并无两样...)的实现 1.3 空间函数 空间函数构建于SQL语言中,用于进行空间属性和空间关系的查询,空间函数中的大部分可以被归纳为以下五类: 转换 —— 在geometry(PostGIS中存储空间信息的格式)和外部数据格式之间进行转换的函数...管理 —— 管理关于空间表和PostGIS组织的信息的函数 检索 —— 检索几何图形的属性和空间信息测量的函数 比较 —— 比较两种几何图形的空间关系的函数 生成 —— 基于其他几何图形生成新图形的函数...对几何信息的检查 PostGIS可以检查几何信息的正确性,这主要是通过IsValid函数实现的。

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空间信息空间转录组中的运用

大量空间分析技术和软件的出现使得空间分析成为可能。 然而,当拿到空间数据(如10 X Visium)的时候,没有受到空间数据分析训练生物学家,往往不能很好地利用空间信息。...最近的空间转录组的文章,大部分空间信息只是作为X-Y的画板——在上面画基因表达量或者分组信息空间信息的地位简化到可视化工具TSNE和UMAP之列,这不免令人惋惜。 ?...但是,获得细胞的位置这一事实,对生物信息的丰富至少提供了以下可能: 可以在传统的细胞分析中明确地纳入空间信息。...上的信息,都可以画到真实空间中。...坦率地说,有了空间信息的肿瘤微环境才是正宗的肿瘤微环境。如细胞间通信这种带有明显空间特征的生物信息,肯定需要新的算法来重新评估。

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一篇文章带你玩转PostGIS空间数据库

空间函数主要分为五类: 转换 —— 在geometry(PostGIS中存储空间信息的格式)和外部数据格式之间进行转换的函数 管理 —— 管理关于空间表和PostGIS组织的信息的函数 检索 ——...检索几何图形的属性和空间信息测量的函数 比较 —— 比较两种几何图形的空间关系的函数 生成 —— 基于其他几何图形生成新图形的函数 二、PostGIS快速入门 1.postGIS是什么 其实您应该猜到了...自行下载安装postGreSQL、postGIS 导入数据文件shape file 一个shapfile必须有的文件: .shp —— 存储地理要素的几何信息 .shx —— 存储要素几何图形的索引信息....dbf —— 存储地理要素的属性信息(非几何信息) 可选文件包括: .prj —— 存储空间参考信息,即地理坐标系统信息和投影坐标系统信息。...但是PostGIS支持所有几何图形类型额外的维度,对于每个坐标,另外还能支持用于表示高度信息的"Z"维度以及用于添加额外附加信息的"M"维度(通常为时间、道路英里或距离信息)。

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postgis常用函数介绍(一)

概述: 在进行地理信息系统开发的过程中,常用的空间数据库有esri的sde,postgres的postgis以及mySQL的mysql gis等等,在本文,给大家介绍的是有关postgis的一些常用函数的意思以及使用...:http://pan.baidu.com/s/1c0fPfpe 先安装postgres,在安装postgres的空间扩展,软件安装好之后就开始了解下postgres的常用函数吧。...wkt简介: WKT(Well-known text)是一种文本标记语言,用于表示矢量几何对象、空间参照系统及空间参照系统之间的转换。...注意: 图中数据库lzugis是一个空间数据库,找到框架->public,展开public之后如下图: ?...通常,我们通过此函数将前台操作完的数据提交到后台,进行入库或者别的空间相关的操作,比如缓冲区分析,距离计算等。

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空间数据平台——厂区空间信息化管理

之前我们已经谈过了商业、园区的空间运营和数据管理,今天再来聊一聊工业领域。...3、空间资产利用率低 空间资产分类杂乱,位置分散,因缺乏空间管理可视化,空间资产规划和使用的时候,利用率难以把控。...蜂鸟视图空间数据平台1、资产管理 将生产区、仓储区以及管理区重点可移动设备资产与室内高精度定位系统的标签进行绑定,从而集成到空间位置平台。...图片3、人员管理 人员检索:根据部门、姓名等信息项进行全部人员的查询,显示人员的在岗与工作状态; 人员定位:地图上显示人员实时位置,能够在地图上进行人员信息查看; 人员信息:根据平台人员详细信息进行展示...,提供实时信息、轨迹信息、统计信息的入口。

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用线裁剪面之-PostGIS版本

但地理数据处理,是一个广阔的世界,除此之外,亦有很多优秀的软件可供我们使用,或者你可以写些代码来进行数据的处理与分析,今天主要介绍空间数据库——PostGIS。 ?...PostGIS可以做什么 可能有很多人(包括我)都会觉得,数据库嘛,不就是存数据的嘛,怎么还跟数据处理扯上关系了?...直到有一天,单位的小哥哥看我处理数据,我们在交流中我发现,原来PostGIS有这么多的函数,有这么多的功能,竟然这么强大。...从空间分析运算,到属性处理,PostGIS都有相关的函数,并且在数据库中的这些运算,非常的高效。...我这几天测试过,将一张有近2万条点数据的空间表的XY信息提取到字段,使用pg,只需要300ms左右,可以说,是非常的高效了。 操作示例 测试数据 前两天有朋友在群里闻到一个问题,如何用线裁剪面?

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PostgreSQL与PostGIS的基础入门

1.2 PostGIS概述 PostGIS作为新一代空间数据存储标准模型,将空间地理信息数据结构规范为关系型数据库可以承载的sp模式(simple features),这样,使得之前门槛颇高的gis空间数据存储模式变得通俗易懂...最重要的只要接触过SQL语言,就可以利用PostGIS的SQL语法便捷的操纵装载着空间信息的数据框(数据表),这些二维表除了被设定了一个特殊的空间地理信息字段(带有空间投影信息、经纬度信息等)之外,与主流数据管理系统所定义的各种字段并无两样...PostGIS安装不仅依赖于PostgreSQL,还依赖于很多插件: GEOS几何对象库 GDAL栅格功能 LibXML2 LIBJSON PostGIS的特点如下: PostGIS支持所有的空间数据类型...PostGIS提供了一系列的二元谓词(如Contains、Within、Overlaps和Touches)用于检测空间对象之间的空间关系,同时返回布尔值来表征对象之间符合这个关系。...PostGIS提供了空间操作符(如Union和Difference)用于空间数据操作。

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单细胞空间突变信息分析导论

10X空间转录组数据中研究并可视化体细胞突变单细胞、空间、外显子解析TP53突变重构肺腺癌细胞图谱单细胞、空间、外显子分析方法更新单细胞、空间、外显子多组学分析探讨多组学(单细胞、空间转录+蛋白、外显子...、甲基化)揭示神经母细胞瘤异质性图谱2024空间转录组分析方向和文献分享单细胞、空间、外显子多组学分析揭示了早期肺腺癌(LUAD)发展过程中上皮细胞的状态和转录组特征系统整理10X单细胞空间数据中可检测到的有害突变位点...这里大家就可以看到,单细胞空间数据,对于在范围内的突变是可以检测到了,单细胞空间的转录组信息如果能添加突变信息,自然文章会发的高一点。...,KRAS这个基因的突变,包括Q22E、G12T、G13V、G13S、G13H、L19F、G12D等突变都在单细胞数据的检测范围之内,那么做结肠癌的单细胞数据,这些突变信息就可以考虑进去,相当于单细胞数据多了...BARCODE -O $OUT_DIR -R $REGION_VCF -p 10 --minMAF 0.1 --minCOUNT 20 --gzip其中BAM是单细胞BAM文件,BARCODE是细胞Barcode信息

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PostGIS导入导出ESRI Shapefile数据

PostGIS作为PostgreSQL数据库的空间扩展,提供了对空间数据管理的支持。...对于空间矢量数据,PostGIS提供了Geometry和Geography俩种类型用于空间对象的存储,Geometry使用笛卡尔坐标系,而Geography使用球面坐标系(默认是WGS84坐标系)。...对于空间栅格数据,则提供了Raster类型。...-U postgres -W 首先说明的是shp2pgsql的参数(具体参数使用shp2pgsql --help进行查看): -s指定空间参考系,PostGIS的参考系和EPSG代码是一样的,比如...EPSG:4326表示WGS84地理坐标系 -I指定在新建的关系表的空间对象的那一列建立空间索引 然后,双引号引起来的是Shapefile的文件名称(也可以加上扩展名.shp) 最后是关系表的全名

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