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Postgres 源码学习 2—Postgres VFD 机制

操作系统中文件 数据库本质其实就是用来存储数据,所以免不了和文件系统、存储进行交互,万丈高楼平地起,存储一般是一个数据库最底层,Postgres 在存储文件管理方面也有很多设计与抽象。...Postgres VFD 作用 Postgres 数据库在运行过程当中,可能会打开非常多文件,比如数据表对应文件,元数据表文件,以及一些在 SQL 运行时打开临时文件,例如排序、哈希表所需文件...所以有非常大概率超过单个进程打开文件数量限制,为了解决这个问题,Postgres 设计了 VFD(虚拟文件描述符)机制,主要是将实际操作系统文件描述符维护到一个 LRU 缓存中,通过切换打开方式...VFD 基本工作方式 Postgres 主要通过一个进程私有的数组来维护 VFD,名为 VfdCache。...在打开文件时候,会尝试关闭最久未使用文件,将位置留给最新打开文件。 通过这种方式,Postgres 可以打开远超过系统和进程限制文件数量,是一个非常精妙设计。

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Python: 多行字符串差异

在《你真的知道Python字符串是什么吗?》里,我们比较了 Python 多行字符串与Java区别。有小伙伴说这只是语法区别,他觉得并不重要。真是不重要吗?...Python 推崇使用优雅解决方案,而且希望这种方案是唯一。在多行字符串实现,我觉得其它编程语言都得向它好好学学,例如 Ruby。...今天,我给大家分享一篇英语短文,它主要比较了 Ruby 和 Python 在多行字符串实现。这篇文章简洁易读,希望有助于你理解编程语言字符串”是什么。 ---- 原题:Ruby vs....以上就是今天分享,希望对你有帮助。另外,如果你还知道其它编程语言,在字符串实现上有何差异,欢迎在 Python猫 公众号后台与我分享。

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差异分析及功能注释(

前言 前面得到6个发育时期和4个分群,而且还可视化了一些marker基因,那么现在就要对这4群细胞进行差异分析 将对应文章这张图: ?...实际,这个包装函数就是下面这样,我们只需要提供创建好monocle对象和q值即可: function(HSMM=HSMM, qvalue=qvalue){ diff_test_res <-...diff_test_res, qval < 0.05) sig_genes_0.01 <- subset(diff_test_res, qval < 0.01) # 帮我们统计了不同q值得到差异基因数量...上面得到4435个差异基因,我们要知道这些基因在哪个cluster: 作者做法是:先得到了每个差异基因在不同cluster平均表达量,然后找平均表达量最大那个cluster,就认为这个基因属于这个...ROTS可以使用RPKM值;它速度可能会很慢 差异分析重点就在:表达矩阵和分组信息 配置最重要分组信息 library(ROTS) library(plyr) # 使用RPKM矩阵 load('.

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MySQL 5.7 和 8.0 几处细节差异

这一节内容,就不讲这些新特性了,只来聊聊最近在工作学习过程中遇到几处细节差异。...1 int 字段类型差异 比如下面的建表语句,在 5.7 能正常执行: CREATE TABLE `t1` ( `id` int(11) NOT NULL auto_increment, `a` int...NULL, PRIMARY KEY (`id`) ) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4; 2 创建用户和赋权差异 MySQL 5.7,可以直接使用 grant...BNL 算法思想是: 把驱动表数据读入到 join_buffer 中,然后扫描被驱动表,把被驱动表每一行取出来跟 join_buffer 中数据做循环对比,如果满足 join 条件,则返回结果给客户端...hash join 算法思想是: 先把小一点表采用 hash 函数,将连接键存放到内存 hash table 中,然后扫描另外一张表,把另外一张表每一行取出来跟 hash table 中数据做对比

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MySQL和PostgreSQL在多表连接算法差异

nl join并不能适用所有场景,例如两个表都是很大等值连接,这种场景是hash join所擅长,而且是生产环境中最常见场景。...这也是mysql永远痛。不过据说8.0版本已经将hash join作为一个需求纳入了,我们拭目以待吧。 相比起来,postgresql优化器十分强劲。...,但是在连接表数量很大情况下具有一定优势。...弗洛伊德算法使用矩阵记录节点直接距离,它强大之处在于它经过若干次计算后得到任意两个节点直接最短距离,是真正意义无源最短路径算法,但是它算法复杂度也比较高,是O(n³)。...但是总体mysql优化器相比pg还是有很大差距,pg优化器甚至引入了基因算法,有很多比较学术考量,当得起学术派数据库称号,也希望mysql能够越来越好吧。

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python实现字符串差异对比方法

一 点睛 本篇介绍如何通过difflib模块实现文件内容差异对比。...difflib作为 Python标准库模块,无需安装,作用是对比文本之间差异,且支持输出可读性比较强HTML文档,与Linux下diff命令相似。...我们可以使用difflib对比代码、配置文件差别,在版本控制方面是非常有用。 Python 2.3或更高版本默认自带difflib模块,无需额外安装。...二 两个字符串差异对比 1 点睛 本例通过使用difflib模块实现两个字符串差异对比,然后以版本控制风格进行输出。 2 代码 ———————————————— #!...^ - add string 说明 采用Differ()类对两个字符串进行比较,另外difflib SequenceMatcher()类支持任意类型序列比较,HtmlDiff()类支持将比较结果输出为

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如何在Debian 10使用Postgres,Nginx和Gunicorn设置Django

默认情况下,Postgres使用称为“对等身份验证”身份验证方案进行本地连接。 基本,这意味着如果用户操作系统用户名与有效Postgres用户名匹配,则该用户可以登录而无需进一步身份验证。...在Postgres安装期间,创建了一个名为postgres操作系统用户,以对应postgres PostgreSQL管理用户。 我们需要使用此用户来执行管理任务。...键入以下内容登录交互式Postgres会话: sudo -u postgres psql 您将获得PostgreSQL提示符,我们可以在其中设置我们要求。...您可以将PORT设置保留为空字符串: 〜/ myprojectdir / myproject/ settings.py . . ....如果根目录( gunicorn.sock文件之间任何点权限有限,则会发生这种情况。

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如何在CentOS 7使用Postgres,Nginx和Gunicorn设置Django

在本指南中,我们将演示如何在CentOS 7安装和配置某些组件以支持和服务Django应用程序。我们将设置PostgreSQL数据库,而不是使用默认SQLite数据库。...postgresql-setup initdb 数据库初始化后,我们可以通过输入以下命令来启动PostgreSQL服务: sudo systemctl start postgresql 启动数据库后,我们实际需要调整已填充配置文件中值...要在本地使用Postgres,最好暂时更改为postgres系统用户。...现在输入以下命令: sudo su - postgres 作为postgres用户操作时,您可以直接登录PostgreSQL交互式会话而无需进一步身份验证。...您可以将PORT设置保留为空字符串: DATABASES = { 'default': { 'ENGINE': 'django.db.backends.postgresql_psycopg2

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如何在Debian 8使用Postgres,Nginx和Gunicorn设置Django

在本教程中,我们将演示如何在Debian 8安装和配置某些组件以支持和服务Django应用程序。我们将设置PostgreSQL数据库,而不是使用默认SQLite数据库。...基本,这意味着如果用户操作系统用户名与有效Postgres用户名匹配,则该用户无需进一步身份验证即可登录。...在Postgres安装期间,创建了一个名为postgres操作系统用户,以对应postgresPostgreSQL管理用户。我们需要使用此用户来执行管理任务。...输入以下内容登录交互式Postgres会话: $ sudo -u postgres psql 您将获得一个PostgreSQL提示,我们便可以在其中设置我们要求。...您可以将PORT设置保留为空字符串: ~/myproject/myproject/settings.py . . .

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猫:字符串

>可以通过使用String类提供方法来完成对字符串操作    >String类提供了许多有用方法,如获得字符串长度,对两个字符串进行比较,连接两个字符串及提取一个字符串某一部分 二.字符串长度...=="于equals区别:   (1)"=="判断是两个字符串对象在内存中首地址是否相等,即判断是否是同一个字符串对象   (2)equals判断是两个字符串对象值是否相等  3.字符串忽略大小写...转换字符串英文字母为大写     //返回字符串大写形式 四.字符串连接  连接字符串方法又两种:使用"+"运算符和使用String类concat()方法  1."...,但是它是搜索最后一个出现字符(或字符串位置  3.substring(int index)方法:   该方法用于提取从位置索引开始字符串部分,调用时括号中写是要提取字符串开始位置,方法返回值就是要提取字符串...(1)该方法可以忽略字符串前后空格   (2)在接收用户输入字符串时,一般会调用trim()方法过滤字符串前后多余空格 六.字符串拆分  语法: 字符串.split(String separator

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差异分析,RT-PCR和WB实战(

具体到医学生物科研,生信分析越来越成为科研工作者必备技能。我觉得生信分析大方向可以分为三个:差异分析,功能分析和临床意义探索。...差异分析是所有研究前提,无论是细胞实验、动物模型,还是临床标本,有差异都是必须,而且我们还给差异规定了标准,p<0.05(或者更小)。...目前,很多数据库可以做差异分析,从mRNA、protein到DNA都有。因为蛋白是功能执行者,因此是做差异分析首选。 oncomine数据库总结几乎所有肿瘤数据,mRNA水平研究差异。...全景式观察某基因在所有肿瘤表达情况。比如 ? GEPIA、UALCAN可进一步验证表达差异,数据可视化,简单方便易上手,mRNA水平研究差异。...TIMER数据库对单基因差异分析,尤其是与肿瘤浸润免疫细胞表型相关分析,特别适用,可以做到统筹兼顾,有局部聚焦(oncomine)和全局通览(TIMER)神奇效果。

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Python中字符串介绍(

一章介绍了python中关键字、变量、输入输出、注释、还有数据类型等概念,接下来这篇文章主要介绍python中字符串相关笔记。文章只按照我自己觉得重点知识点去列举,不会列举特别细致点。...字符串索引:字符串里面的每个字母都是有索引,索引也就是每个字符对应位置,那么索引顺序有2种: 正序:从左到右索引默认0开始,最大范围是字符串长度少1 反序:从右到左索引默认-1开始,最大范围是字符串开头...可以使用*号打印重复字符串 a = 'ac' b = 'ad' print(a+b) print(a*3) 字符串值不能被改变,不能直接更改字符串某一字符值 比如,定义了一个字符串,name='...字符串值是不允许进行更改。...那么,为什么对字符串变量重新赋值又不会报错呢?使用name=‘'xxx' 实际是指向了一个新字符串

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零停机迁移 Postgres正确方式

作者 | RIGAS PAPATHANASOPOULOS 译者 | 王强 策划 | 万佳 在这篇博文中,我们会介绍如何在零停机时间前提下,使用 Bucardo 将 Postgres 数据库迁移到一个新实例...我们已成功使用这一流程将我们 Postgres 数据库从 9.5 版迁移到 Amazon RDS 12.5 版,但该流程不只适用于 RDS,也不依赖 AWS 独有的任何内容。...更现实方法是在两个数据库之间设置一个近乎实时双向复制,这样在理想情况下,应用程序可以同时向两者读取和写入,而不会注意到任何差异。...在谷歌搜索“Postgres多主复制”可以找到大量解决方案,每种方案都有自己需要注意优缺点。 我们决定继续使用 Bucardo,因为它开源、速度快,并且提供了简单监控和冲突解决机制。...Bucardo 工作机制 Bucardo 充当两个 Postgres 实例之间中间人。你可以让 Bucardo 在你喜欢任何机器运行,只要它可以访问源数据库和目标数据库即可。

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