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【知识图谱】：科普——万维网、语义网、知识图谱、RDF、RDFS、OWL、SPARQL、RDB2RDF、D2RQ、Protege

Protege ‍1. 知识图谱（KG） 知识图谱是一种用图模型来描述知识和建模世界万物之间的关联关系的技术方法。 知识图谱由节点和边组成。...本体论（Ontology）：本体论（Ontology）一词是从哲学领域引入到了计算机科学领域，用来刻画知识。...包括对局部值域的属性定义，类、属性、个体的等价性，不相交类的定义，基数约束，关于属性特征的描述等。因此W3C提出了OWL语言扩展RDF(S)，作为语义网上表示本体的推荐语言。...Protege The Protege Project offers WebProtege and Protege Desktop, which are free and open source ontology...： https://protege.stanford.edu/ ----

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知识推理

)最基本的元素:概念、关系和个体  2)TBox术语集 (概念术语的公理集合)  3)ABox断言集 (个体的断言集合)  4)TBox和ABox上的推理机制   不同的描述逻辑系统的表示能力与推理机制由于对这四个组成部分的不同选择而不同... 个体   一个领域内的实例   例如,小明: Ming   TBox——泛化的知识   描述概念和关系的知识,被称之为公理 (Axiom)   描述逻辑的公理可以用来定义术语,所以称为Terminological...Box,简称Tbox   ABox——具体个体的信息   ABox包含外延知识 (又称断言 (Assertion)),描述论域中的特定个体  描述逻辑的知识库K ≔ T, A , T即TBox,...且C ⊓ D(x)∉ ∅,则∅ :=∅∪{C ⊓ D(x)};  ∃-规则:若∃R.C x ∊ ∅, 且R(x,y),C(y)∉ ∅,则∅ :=∅∪{R(x,y),C(y)},  其中,y是新加进来的个体...reasoner=ontology.createReasoner();  并用于查询  Query whatDoPeopleKnowAbout=reasoner.createQuery(new Literal

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本体编辑、知识推理与检索

1.环境相关 我的： Java： Eclipse： Protege： Protege-5.2.0 2.项目整体逻辑 如图： 3.用本体编辑工具protege构建基础本体文件 Protege...是一个本体编辑工具，可以将知识的三元组以及各种逻辑通过可视化界面编辑成本体文件，protege还带有一些推理机插件（见下图），pellet、Hermit等，可以利用这些插件对本体文件进行推理。...可见Protege能一条龙解决本体的编辑、推理、查询等问题，但本项目要求用Java调API实现功能。编辑、推理和检索都是在构建好的基础本体文件上进行的，该本体文件就是用protege构建的。...（2） Individuals(实例)是类下面的具体个体，比如下图Country类下面的individual有Ametica等。...初始化本体文件 通过protege构建好的本体文件保存为一个owl文件，接下来要对其进行编辑推理检索，这些工作通过调用OWLAPI和Jena API实现。首先读入owl文件。

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本体入门（二）：OWL 本体构建指南f

本文将介绍如何通过 Protege 构建 OWL 本体，文中使用的软件版本为 mac 上的 protege 5.5.0 桌面版。...与其他基于 Protege 的本体的重要区别在于，原始的 OWL 不遵循唯一命名假设（UNA），即两个不同名称的个体可能表示同一个个体，在 OWL 中，必须要明确指出个体之间是等同的还是不同的，否则其可能相同也可能不同...推理机的功能主要有两个： 推理类的层级结构（一个类是否为另一个类的子类） 测试一个类的稳定性（是否可能存在实例） 在 protege 中的菜单中选择推理机，执行推理。...包含至少一个充要条件的类称为定义类（Defined Class） ? 在 protege 中，右键可以自动将原始类转换为定义类（也可以自己设置充要条件）： ?...附录 C：插件 Protege 支持许多有用的插件，5.5.0 版本下可通过 File -> Check for Plugins 安装和升级插件： ?

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大数据【企业级360°全方位用户画像】项目介绍

： 1）、精准营销 2）、个性化推荐 功能模块 整个项目分为如下几个功能模块，具体描述： 画像模块： 个体画像 -> 【微观画像】 依据用户ID：userId，查询用户所用标签...，进行展示 群体画像 -> 【标签查询】 依据多个标签组合（OR、AND）查询用户，属于某个群体，分不同类 1、标签体系 标签体系模块基于本体论建立，包括基础标签和组合标签两个子模块...当Super User登录时会出现新增标 签及其引擎的审核。 3、画像模块 画像模块是对实体（用户/物品）信息全貌可视化的精准还原，包括对个体的全方位还原和群体的 全方位还原。...能够掌握标签的分类和业务背景 标签定义依据 知识工程（本体论）的概念最早由美国斯坦福大学计算机科学家费根鲍姆提出。...基于知识工程的用户定性画像中，核心思想是利用本体对用户画像中的标签进行表示、验证、推理和解释。本体论（Ontology）是哲学上的一个学科，是研究客观事物存在和组成的通用理论。

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从零开始构建一个电影知识图谱，实现KBQA智能问答：本体建模、RDF、D2RQ、SPARQL endpoint与两种交互方式详细教学

首先介绍下我们使用的工具 protégé（点击进入官网下载）: Protégé，又常常简单地拼写为 “Protege”，是一个斯坦福大学开发的本体编辑和知识获取软件。...由于其优秀的设计和众多的插件，Protégé 已成为目前使用最广泛的本体论编辑器之一（来自维基百科）。 打开 protege，看到和下图类似的界面。...我们没有在 protege 中显式地定义互斥关系，读者可以自己定义。 图片 接下来我们切换到 "Object Properties" 页面，我们在此界面创建类之间的关系，即，对象属性。...在右侧窗口中移动元素，可以很直观地观察本体之间的关系。 图片 在这个小节，我们简单地介绍了如何用 protege 自顶向下地构建知识图谱的本体结构。...对于 Protege 更详细的操作和介绍，请参考这篇文档。

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Gene Ontology(GO)简介与使用介绍

三种本体论的内容如下： 1）分子功能本体论 基因产物个体的功能，如与碳水化合物结合或ATP水解酶活性等 2）生物学途径本体论 分子功能的有序组合，达成更广的生物功能，如有丝分裂或嘌呤代谢等 3）细胞组件本体论...第三，发展相关工具，使本体论的标准语言的产生和维持更为便捷。...它一次显示两个本体论，因此可以在不同的水平相应定位。（如组织和细胞类型水平）优点在于可以综合几种本体论，支持的文件格式多，包括GO平板文件、GO RDF和OWL格式等。...也是主要的编辑本体论结构的工具，可以通过点击和拖动术语来修改本体论的从属关系。 2） 文本编辑面板（text editor panel） 修改术语中的内容。...GO包含的大部分为平板格式文件（GO flat file），由每一种本体论中定义的文件为文本文件，而包含本体论和定义两种格式的是OBO格式的平板文件，XML作为可以用于三种本体论和所有定义的文件格式也有提供

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Cell Ontology:解析细胞类型新维度

细胞系本体论 但是细胞本体论并不是一开始就有的，在bulkRNA的时代，细胞生物学家为了描述细胞系及其相互关系的时候有意无意地开始构建细胞系本体论。...这个过程很让我想起我们在构建微生物命名系统以及构建元素周期表时候的场景：从简单到复杂，从个体总体。后来，我们也是基于细胞系本体论在构建细胞本体。在ontobee上面我们可以看到有几种细胞本体： ?...细胞本体论 细胞本体论被设计为cell 类型的结构化控制词汇表。这个本体论是为模型生物和其他生物信息学数据库的使用而构建的，在这些数据库中需要控制细胞类型的词汇表。...为了帮助解决这些问题的第一个，Bioconductor的本体论程序包包括一个函数自由映射，它将搜索本体论术语接近一些目标术语或短语。...在与细胞结构和功能本身相关的概念中，A549是一个个体，可以通过拥有或缺乏细胞本体论所列举的属性来加以表征，但它并不值得纳入该本体论。

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思考: 现有 图像分割算法 的缺陷

设计缺陷 人们在关注图像中的生命个体（尤其是人）的时候，关注点 往往 只是目标的脸和手脚 。这部分区域虽小，却给观者提供了对目标个体进行联想的绝大部分信息。...对均匀权重的像素点阵 进行的 无差别意义上的 pixel-level segment。...高举 pixel-level segment 的大旗，其实行的是 基于像素点阵无差别 这一 默认前提 的 pixel-level segment 。...蓝色实例的个体，由于他的双手（可视为与本实例主体区域相连的狭长区域）伸入了其他实例的主体区域，结果就被算法回归到其他实例身上去了。...经过全新标记法得到的标记数据却是一个三维矩阵（增加的第三维是该像素点的关注度权重值）。

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什么？DevOps 已经是哲学啦？

以下部分并非详尽无遗；而是通过检查相关分支：认识论和本体论对 DevOps 哲学和核心哲学原则的学术认可。...3.2 本体论 韦氏词典定义中本体论的词汇表示如下，“形而上学的一个分支，与存在的本质和关系有关”（本体论，n. d.）。...要让企业中的不同系统接受 DevOps，领导者和员工需要做出重大的承诺和努力。个体和集体都需要在文化上采用持续改进等 DevOps 原则，这会强制形成持续学习的环境。...为了本文的范围和简洁考虑，本节描述了DevOps如何通过减少高效、有质量保证的产出（如产品/服务）进入市场所需的时间这一重要特征来增加个体企业的财富。...本文通过认识论和本体论的分支，在信念、知识和真理的分类下，涵盖了哲学领域的 DevOps。

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药物和靶点相关数据库

1.BindingDB 这是一个公共收录实验测定的蛋白质-配体的结合亲 和力的数据库。 （1）实验测定的结合亲和力； （2）侧重测定候选药物靶点蛋白与小分子或 类药分子等配体的相互作用亲和力。...（1）全面的药物的化学、药理和医药相关的 数据；（2）详细的药物靶点的序列、结构和通路信 息。...6 219 个靶点，195 770 个化合物，282个药物—靶点相关的通路，6532 个药 物—靶点相关的本体论，63 个细胞色素。 5.TDR 。...（1）包含心血管、肺、癌症等疾病、通路、 代谢等药动学和药物基因组学数据； （2）提供不同个体对药物的反应的遗传变异 数据。...9.STITCH 检索已知的和预测的化 合物与蛋白质相互作用 关系的数据库。

2.8K30

大数据独角兽Palantir之核心技术探秘

，不过是在多源、异构、多模态条件下的全文索引和搜索，里面涵盖了复杂的动态本体论，以及对现实对象和实体的转换、映射和关联等操作，相比互联网搜索引擎的索引技术，进行了深度扩展。...如何对现实世界进行本体设计和实现是Palantir最为基础的核心技术，先看看什么叫本体论：“Ontology（本体论）一词是由17世纪的德国经院学者郭克兰纽（Goclenius，1547-1628）首先提出...在古希腊罗马哲学中，本体论的研究主要是探究世界的本原或基质。各派哲学家力图把世界的存在归结为某种物质的、精神的实体或某个抽象原则。...巴门尼德提出了唯一不变的本原“存在”，使关于存在的研究成为这一时期的主题。亚里士多德认为哲学研究的主要对象是实体，而实体或本体的问题是关于本质、共相和个体事物的问题。...他认为研究实体或本体的哲学是高于其他一切科学的第一哲学。从此，本体论的研究转入探讨本质与现象、共相与殊相、一般与个别等的关系。本体论(ontology)是哲学概念，它是研究存在的本质的哲学问题。

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【推荐阅读】大数据独角兽Palantir之核心技术探秘

如何对现实世界进行本体设计和实现是Palantir最为基础的核心技术，先看看什么叫本体论：“Ontology（本体论）一词是由17世纪的德国经院学者郭克兰纽（Goclenius，1547-1628）首先提出...在古希腊罗马哲学中，本体论的研究主要是探究世界的本原或基质。各派哲学家力图把世界的存在归结为某种物质的、精神的实体或某个抽象原则。...巴门尼德提出了唯一不变的本原“存在”，使关于存在的研究成为这一时期的主题。亚里士多德认为哲学研究的主要对象是实体，而实体或本体的问题是关于本质、共相和个体事物的问题。...他认为研究实体或本体的哲学是高于其他一切科学的第一哲学。 从此，本体论的研究转入探讨本质与现象、共相与殊相、一般与个别等的关系。本体论(ontology)是哲学概念，它是研究存在的本质的哲学问题。...5．Palantir大数据计算：多维关联挖掘与全链因果分析视图 基于本体论设计的海量数据融合和关联索引，是大数据计算的基础。

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技术时代的人心识别：从可能向现实的跨越丨上海交通大学教授博士生导师李侠

如果他的说法成立的话，我们只要通过一定的设备探测个体大脑的状态也就相当于知道了个体内心的真实想法，因为两者之间是严格同一的。但是这种类型-类型同一论面临的主要困境是有关现象属性的反对意见。...按照英国哲学家辛西娅·麦克唐纳（Cynthia Macdonald）的观点：“当将同一看作是存在于个人的心理事件和他的身体的物理事件之间的关系，就给予了心理现象和物理现象相同的本体论地位……尽管一个人将他的疼痛定位于他的膝盖上...这就为我们识别人心提供了本体论基础；其二，从心理现象到物理现象不是简单的还原关系，这期间存在很多我们尚未认识到的机制，这也是目前人心识别仍处于初级阶段的原因所在。...如果能够把每个个体的认知框架明确下来，再辅以针对特定个人的参数，那么，输入的信息经过认知框架的加工，我们就可以大体知道每个个体的具体心理内容表征与偏好，这才是真正意义上的人心识别的目的所在。...【17】意识在本体论上不能还原为物理现象，这才是人心识别最难以处理的问题，即便如此，我们仍坚定地相信：来自身体与大脑状态的信息决定了人心的内容，我们不相信脱离肉体的意识与思维的存在。

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回答薛定谔问题: 生命是什么？自由能公式

这篇综述的目的是将这些进展与称为变分神经行为学的生物系统元理论本体论进行综合，该本体论将FEP与丁伯根的四个研究问题相结合，以解释跨空间和时间尺度的生物系统。...发挥作用的自由能最小化动力学是通过不同个体生物和物种中不同种类的机制实现的，作为它们进化的表型和生物行为模式以及它们所居住的生态位和所考察的尺度之间耦合的函数。...马尔可夫毯的概念允许我们定义生命系统的形式本体论。马尔可夫链在空间和时间尺度上嵌套在马尔可夫链中。...幸运的是，时间尺度的重要性在生物学中早就被认识到了，尤其是在丁伯根之后 [69] 提出了他的生物学解释的四个关键层次(即适应、系统发育、个体发育和机制)。...这些模型都诉诸于一种科学元理论(即变分神经行为学)，该理论将智人定义为整个进化过程中的每个个体(表型)，以及过去存在或现在存在的每个个体(即我们的物种)，这些个体反过来可能会改变我们的进化过程和我们特有的适应小生境

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大数据热潮的分析与审视

毕达哥拉斯学派所持“数即万物”的思想，以及创立基于数的自然哲学，实际上是把数看作了世界万物的本源。之后形成的柏拉图主义、唯名论等，也将数提升到本体论的高度。...反思：数据本体论与应用局限 关于数的本体论思想，即“一切事物的性质都可以被归结为数的规定，数的规定性比物理属性更加普遍”〔14〕15，从古希腊毕达哥拉斯学派将数视为万物本原开始绵延千年，对后世有着很大影响...譬如，社会学研究常用的调查研究方法，虽然在大规模量化分析方面很有优势，但由于个体主观可能存在偏差，有些甚至出于利益目的伪造数据，由此带来的是数据本身客观性的缺失，进而使它的上层建筑，即通过大数据分析产出结果的客观性遭到质疑...面对如火如荼的大数据，我们应该冷静透视热潮背后的本质，以全面客观的辩证视角重新审视数据本体论及其应用局限、数据的准确性和客观性等问题。...大数据的本体论探讨[J]. 自然辩证法通讯,2014(06):115-121+128. 〔2〕刘红,胡新和. 数据革命:从数到大数据的历史考察[J].

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