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liftOver转换坐标并保留bed文件所有信息

当我们有一套这样的数据,并且想进行坐标转换的时候: ? unmap 这里会报错: Reading liftover chains Mapping coordinates invalid signed integer: "+" 第四列及后边存在制表符和空格等都会报错 这里我们可以用":"或者其他字符将制表符和空格替换掉,然后运行liftOver: sed -i 's/\t/:/g' human.bed sed -i 's/ /#/g' human.bed liftOver 这样就可以运行liftOver了,最后得到转换过的坐标文件之后,将:和#替换回来即可。

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【愚公系列】2021年12月 Python教学课程 08-基本语法

# 无分隔 对于形如 print(a+“a”+b)的语句,其实是先计算 a+“a”+b 的值,然后通过 print 打印 它。 在文本编辑器中,需 要设置把 Tab 自动转换为 4 个空格,确保不混用 Tab 和空格。在 Pycharm 中:tab 键 被自动转换成 4 个空格的缩进。 那么怎么才是正确的缩进方式呢? 同一行写多条语句: 前面我们说了,Python 一行通常就是一条语句,一条语句通常也不会超过一行。 ('0') File "F:/Python/pycharm/201705/1.py", line 5, in bar return foo(s) * 2 File "F:/Python/pycharm 其实查找错误,排除错误就是这么简单,只是需要你耐心的一行行地查看错误调用栈,根据最后的错误类型,就可以判断错误的发生原因并修改错误,没有想象中的那么复杂。

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    python学习之字符串转换

    配置环境:python 3.6   python编辑器:pycharm 代码如下: #! /usr/bin/env python #-*- coding: utf-8 -*- def strCase(): "字符串大小写转换" print("演示字符串大小写转换") () \t= %s"%(S.lower())) print("小写转换成大写:\tS.upper() \t= %s"%(S.upper())) print("大小写转换:\t\tS.swapcase S.count('s'))) print("字符串替换:\t\tS.replace('Is','is') = %s"%(S.replace('Is','is'))) print("去左右空格 :\t\tS.strip() \t=#%s#"%(S.strip())) print("去左边空格:\t\tS.lstrip() \t=#%s#"%(S.lstrip())) print

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    初学Python:写码时应该缩进使用 tab 还是空格?

    空格不会出现这个问题,因为空格就占一个字符的位置。 众所周知,Tab在ASCII码中,编码是9,而空格是32。 绝对不能混用Tab和空格,那么这里,是不是空格和Tab的区别就显得很大了呢? 这个时候有的童鞋就要说了,我用PyCharm(或者其他IDE)怎么从来都没有出现这样的问题呢? 其实,很多IDE对Tab键做了各种各样的优化,其中有一条就是,将Tab键展开为为空格,也就是说,当你按下Tab的时候,IDE实际上帮你把一个「9」转换成了四个(或者八个)「32」。 同理,对于好纯洁好不做作的编辑器Vim来说,肯定也不会帮你做这样的工作了。 既然Tab在不同的环境下展现不一样,而空格却永远都是一样的。 所以非常建议大家使用空格代替Tab, 另外各个IDE(编辑器)都提供了tab自动转换空格的功能,只要大家设置一下,按下tab键就可以出现4个或者多个空格

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    python笔记day2

    PyCharm用专业版,社区版不支持Django PyCharm使用步骤: 第一步:指定Python解释器 PyCharm本身没有自带解释器,必须指定Python解释器,才能正常运行Python程序 > name.endswith('ck')     True     >>> name.endswith('ck',2,)  -->第二个字符到最后一个字符,以ck结尾     True **将tab转换空格 默认情况下一个tab转换为8个空格 将tab转换空格,然后用strip()函数将所有空格去掉,就可以取到配置文件中的参数 >>> name = 'Carri       ck' -->中间有tab 键     >>> name.expandtabs()     'Carri   ck'     >>> name.expandtabs(1)  -->转换成一个空格     'Carri ck' 查找子串的位置 utf-8和GBK可以通过unicode来相互转换,不可以直接转换 >>> '无'     '\xce\xde'     >>> str1 = '\xce\xde'     >>> print str1

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    Notepad2替代系统自带的记事本Notepad

    但今天复制的内容中有很多数字和一些我不想要的内容,我想到了正则,发现系统自带的记事本没有,找来一个更强的工具,Word,继续查找替换,发现word中也没有正则,估计是微软认为除了程序员会正则,一般人不会用 不到一会就找到一款用于替代系统notepad的增强版,还可以方便的切换回来,这个软件就是“Notepad2”。 ? 4、空格,制表符彩色显示,并可互相转换 。   5、可以对任意的文本块进行操作,ALT键+鼠标。   6、对括号{}〔〕()可以高亮配对显示,方便查看(仅对英文符号有效)。    10、快速放大、缩小页面,不用设定字体大小。   11、可以指定ESC键最小化Notepad2到系统托盘或者关闭Notepad2。 ?    是时候删除你的记事本了,当然如果你后悔了也可以切换回来,用了一段时间感觉不错。

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    Notepad2替代系统自带的记事本

    ,我想到了正则,发现系统自带的记事本没有,找来一个更强的工具,Word,继续查找替换,发现word中也没有正则,估计是微软认为除了程序员会正则,一般人不会用; 也许你会劝我使用:Notepad++、UltraEdit 不到一会就找到一款用于替代系统notepad的增强版,还可以方便的切换回来,这个软件就是“Notepad2”。 ? Notepad2是一个相当优秀的轻量级文本编辑器,开源软件,具有很多特色功能,如代码高亮、编码转换、行号显示、多步Ctrl+Z等,是不可多得的记事本替代方案。 2、支持ANSI,Unicode,UTF-8等编码互换 3、可以设置无限个书签(9种图标可换)轻松定位 4、空格,制表符彩色显示,并可互相转换 5、可以对任意的文本块进行操作,ALT键+鼠标 6 是时候删除你的记事本了,当然如果你后悔了也可以切换回来,用了一段时间感觉不错。

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    Python升级之路(一) Python 入门

    例如: 其他软件可以随意修改Ruby的类, 一些修改了标准库的扩展也基本上不会在 Ruby 社区引发什么不满 Ruby 对于喜欢尝试语法糖的用户很有吸引力, 语法糖是一种特性, 他并不会改变基本的语言 如果程序可以在2.7运行,可以通过一个名为2to3(Python自带的一个脚本)的转换工具无缝迁移到Python3。 二、运行环境搭建 1. Tkinter编写,最初作者正是Python之父 IDLE 如何使用(How) 点击开始 新建文件 FIle-> new FIle, 然后空白处输入 print("hellow world") 保存为 Python基本格式 缩进风格 恰当的空格,缩进问题 逻辑行首的空白(空格和制表符)用来决定逻辑行的缩进层次,从而用来决定语句的分组。 语句从新行的第一列开始。 异常处理 # 错误1, 首行是空格 print("首行不能有空格") # 错误2, 使用了中文引号 print(“不能使用中文引号”) 4.

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    Git管理源代码

    都会备份成版本,并永久存在 4.git单人操作 git diff HEAD HEAD^ -- XXX.py写了xxx.py就是看本文件不同版本的不同,不指定文件,就是所有文件的不同点(注意--和文件名之间有空格 reflog查看仓库区的版本历史 git reset --hard HEAD^(HEAD~1) 版本号回退版本 git diff 版本1 版本2 -- 文件名比较文件不同版本的区别(注意--和文件名之间有空格 pull下来,但是合并之后的文件里面有提示信息,就是经历修改的,和我自己修改的,以及git自动生成的一些提示信息,当出现冲突的时候,去和经理商量冲突的问题是按自己的解决方案还是经理的解决方案,商量之后,可以提交提交的时候一定不要有一些乱七八糟的提示信息 还有一种情况,就是当公司一个新同事来的时候,新建一个分支,让他在分支上开发所需要的功能,如果功能能用,就将这个分支合并到项目里,如果不能用,或者很糟糕,直接删除即可,不会影响项目的开发. 修改已经commit的注释内容: 1/先切换到想要修改内容的版本 2/然后输入git commit --amend做对应的修改,control + x退出保存 10.dict和json相互转换(记忆)

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    sql解析的一些计划

    主要是Except(也就是类似于not in),Intersect(也就是join,这里目测实现难度会最大),两个子节点 parser的设计: 对于传入的语句将\r\n\t这些都替换为空格 ,设为空格标识符。 表名就是identifier,再就是匹配括号,将括号里面的语句进行处理转换成hive的语句。 其中特别提到的是数据类型的转换,通常来讲是会全部转成string类型,number会转成decimal类型。 会处理oracle的一些特殊表示连接 的方式 analyzer:目前再将sql_parser的数拼接回来,将oracle简写的sql语句变成hive的。

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    运维必须掌握的 Python 宝典:值得每天复习一遍

    ,然后编写相应的说明文字;为了保证代码的可读性,注释和代码之间 至少要有 两个空格。 使用 list 函数可以把元组转换成列表 list(元组) 使用 tuple 函数可以把列表转换成元组 tuple(列表) 4.4.3 字典(dict) dict(字典) 是 除列表以外 Python 建议使用空格 在 Python 开发中,Tab 和空格不要混用! —— 不会对 字节码 进行处理,才会生成 CPU 能够识别的 机器码。

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    python GUI库图形界面开发之PyQt5开发环境配置与基础使用

    PyQt5安装 在cmd下输入 pip install PyQt5 完成PyQt5安装,安装qt designer,可以使用pip安装 pip install PyQt5-tools 安装完成后 配置PyCharm 配置PyCharm是为了在Pycharm里面实现打开qt designer,然后生成qt文件,然后将qt文件转换成python语言的软件文件。 打开Pycharm,按下图操作 ? Qt界面 转换成 py代码。 新建窗口之后,可以左边列表直接拖拉空间到窗口上 ? 可以看到上图是有2个控件的,在这里另存为该文件 ? 保存文件之后,关闭qt designer,在pycharm里看到刚保存ui文件,选中文件点击右键,选择PyUIC来转换成py代码 ? ?

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    Python入门篇基础语法

    python 一般用 四个空格 就是 tab 来缩进。在 pycharm 中 tab 自动回转成4个空格。 正确的缩进方式: 所有的普通语句,顶左开始编写,不需要缩进。 变量与常量 变量与常量的定义 变量与常量都是容器 无论是变量还是常量,在创建时都会在内存中开辟一块空间,用于保存它的值 变量与常量的区别 变量是程序运行过程中,值可以发生改变的量 常量是程序运行过程中,值不会发现变化的量 在内存中创建了一个 ‘amy’ 的字符串对象 2.在内存中创建了一个名为 a 的变量,并把它指向‘amy’ 小贴士: 函数: id() 查看变量指向 内存地址 常量 常量就是不变的量,或者说在程序运行过程中不会改变的量 小贴士: 1.input输入返回的都是字符串 2.将int强制转换字符类型 str() 3.str.isdigit():判断字符串是否全部为数字组成 print() 方法用于打印输出,最常见的一个函数。 a,b=b,a来转换 作业3 作业4 也可以使用: print('1*2', '3*4', sep = '\n') ​

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    python中tab键是什么意思

    空格不会出现这个问题,因为空格就占一个字符的位置。 众所周知,Tab在ASCII码中,编码是9,而空格是32。 绝对不能混用Tab和空格,那么这里,是不是空格和Tab的区别就显得很大了呢? 这个时候有的童鞋就要说了,我用PyCharm(或者其他IDE)怎么从来都没有出现这样的问题呢? 其实,很多IDE对Tab键做了各种各样的优化,其中有一条就是,将Tab键展开为为空格,也就是说,当你按下Tab的时候,IDE实际上帮你把一个「9」转换成了四个(或者八个)「32」。 同理,对于好纯洁好不做作的编辑器Vim来说,肯定也不会帮你做这样的工作了。 既然Tab在不同的环境下展现不一样,而空格却永远都是一样的。 所以非常建议大家使用空格代替Tab, 另外各个IDE(编辑器)都提供了tab自动转换空格的功能,只要大家设置一下,按下tab键就可以出现4个或者多个空格

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    使用Ctex中遇到的一些问题

    将电脑系统日期往前调整,比如2006年等等,第一次编译通过后会发现该按钮即可使用,再将时间调整回来即可 2.我通篇采用的是英文标点,但是显得很挤,怎么自动在英文标点后加上一个空格? 使用CCT&Latex进行编译,然后使用dvi2pdf进行编译即可,亲测有效,如果有更好的方法,请强势安利给我! 3.将图片存成eps的几种方法? 注意其中的 -c 参数,默认 -g 是进行无彩色转换,所以如果你想要转换成彩色的,需要使用该选项。 其中的-t 参数是用来指定输入文件的类型,也可以不设置,程序会根据输入文件后缀自动识别。 具体命令如下: bmeps -c example.jpg example.eps 使用这种方法转换得到的eps分辨率较高,推荐采用该方法。 另可参考《jpg/png格式图片转eps格式的方法总结》

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    【Python】.tsp文件的读取

    最近做课程作业,需求解TSP问题(旅行商问题),数据集格式均是.tsp格式的,下面就用pandas来进行数据的加载,并转换成列表形式。 具体步骤 1、查看源数据 在pycharm中可以打开tsp文件,可以发现,所有数据集格式都一致,从第七行开始是具体数据,第一列是标号,第二列是城市的x坐标,第三列是城市y坐标。 /TSP问题测试数据集/att48.tsp', sep=" ", skiprows=6, header=None) 这里选用了三个参数: sep为空格,即不同列数据以空格形式分隔; skiprows city = np.array(df[0][0:len(df)-2]) 这里用到的是numpy的array,通过tolist,可以将其转换成列表。 np.array(df[2][0:len(df)-2]) city_location = list(zip(city_x, city_y)) 注:直接用zip打印出的是对象的地址信息,需在外套一层list转换

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    JavaScript 入门(2)

    型); (2)未定义值(undefined型); (3)转义字符; 根据个人的开发经验中,只需要记忆\n、\'、\"这3个就已经够初学者走很远了,其他的转义字符我们完全没必要去记忆,到时候需要的时候再回来查表就行了 其中,parseInt()可以将字符串转换为整型数据;parseFloat()可以将字符串转换为浮点型数据。 语法: parseInt() //将字符串型转换为整型 parseFloat() //将字符串型转换为浮点型 2、数值型转换为字符串型 在JavaScript中,将数值型数据(整型或浮点型)转换为字符串 某些代码,如函数体内的代码,不会被立即执行,只有当所在的函数被其他程序调用时,该代码才会被执行。 2、区分大小写 JavaScript是严格区分大小写的。 另外,JavaScript会忽略多余的空格,用户可以向脚本添加空格,来提高代码的可读性,说白了就是让代码“漂亮点”,读得舒服一点。

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    python入门教程NO.2 用python做个自我介绍

    * 1 print(a) #输出结果为:hhh print(b) #输出结果为:f 字符串的拼接 使用(+)操作符拼接 我们发现上面的字符串加法把两个单词拼到一起后非常不好看,那我们可以在他们中间加个空格来隔开他们 hellologic' print(' '.join(str)) # 输出结果为:h e l l o l o g i c # ''.join()的两个单引号''里面可以是空字符,也可以是任意其他字符,我们这里是空格 注意:这里的name为字符串类型,birthday为整数类型 我们先来学三种常用的转换类型: int:转换为整型 float:转换为浮点数 str:转换为字符串 那么上面的代码,我们可以这样修改: name 请用python做一个自我介绍 经过上面的学习,相信你已经可以用python完成一个简单的自我介绍了,请自己在pycharm上测试一下吧! 请使用变量赋值、字符串拼接、数据类型转换来完成本次作业哦~~ 完成作业的朋友可以在评论区贴出你们的答案~ 扫码_搜索联合传播样式-标准色版_wps图片.jpg

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    Python|MitmProxy代理抓包工具实践难点

    照此方法不过我的手机(小米手机)并不会出现证书下载界面,而会出现另一个界面; ? 参考了另外几篇博客后,我选择了一种解决方案。 read_cookie.py中以os模块的system去启动cmd命令,然后cmd以mitmproxy启动write_cookie.py脚本获取数据,然后将数据保存到所创建的cookie.text文件中;然后main.py 在原博客的代码中有一个get_params方法,其中的str_to_dict()函数方法需要手动写入,但原文描述有点不清楚;将str数据类型转换为dict类型,否则会出现utils无str_to_dict 操作方法:在pycharm操作上,我们只需按住ctrl键,然后用鼠标左键点击utils模块即可写入函数方法; ? 写入的函数方法: ? 原博客中的格式 原博客中的空格以及一些符号存在不规范以及运行代码的格式不对,以及爬取链接等链接格式均存在大大小小的错误;修改后的原文代码: ? ? ? ?

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    Python 条件控制 — if语句

    Python 中代码的缩进为一个 tab 键,或者 4 个空格 —— 建议使用空格 符合 PEP8 规范。 PyCharm 中使用 tab 键缩进会自动转换成 4 个空格。 单个 if 判断 #! # 要求两门成绩 >= 60 分就算合格 if python_score >= 60 and c_score >= 60: print("考试通过") else: print("再接厉 is_employee = True # 如果不是本公司员工 if not is_employee: print("非本公司员工不允许入内") if 嵌套 if 的嵌套 就是:在之前条件满足的前提下,增加额外的判断 player == computer: print('心有灵犀一点通,平局') else: print('电脑赢了, 不行我要和你决战到天亮') 注意 input() 返回的是字符串,记得转换

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