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增强版在线LEFSe分析和可视化鉴定标志性基因或物种

LEfSe分析即LDA Effect Size分析,是一种用于发现和解释高维度数据 生物标识(基因、通路和分类单元等)的分析工具,可以进行两个或多个分组的比较,它强调统计意义和生物相关性,能够在之间寻找具有统计学差异的生物标识...根据样本分组的不同可分为两样本Wilcoxon秩和检验和多样本Kruskal-Wallis检验。 基本思想是:若检验假设成立,则两的秩和不应相差太大。通过编秩,用秩次代替原始数据信息来进行检验。...LEFSe在线分析 LEfSe为Python包,现已支持Python3,可从https://github.com/SegataLab/lefse下载安装在本地分析。...输入数据 第一行为标题行,包含样品的分组信息,示例数据样品分为3,KO,OE,WT。 本示例数据没有包括subclass和subject信息。...小圆圈: 图中由内至外辐射的圆圈代表了由门至属的分类级别(里面的那个黄圈圈是界)。 不同分类级别上的每一个小圆圈代表该水平下的一个分类,小圆圈的直径大小代表了相对丰度的大小

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增强版在线LEFSe分析和可视化鉴定标志性基因或物种

LEfSe分析即LDA Effect Size分析,是一种用于发现和解释高维度数据 生物标识(基因、通路和分类单元等)的分析工具,可以进行两个或多个分组的比较,它强调统计意义和生物相关性,能够在之间寻找具有统计学差异的生物标识...根据样本分组的不同可分为两样本Wilcoxon秩和检验和多样本Kruskal-Wallis检验。 基本思想是:若检验假设成立,则两的秩和不应相差太大。通过编秩,用秩次代替原始数据信息来进行检验。...LEFSe在线分析 LEfSe为Python包,现已支持Python3,可从https://github.com/SegataLab/lefse下载安装在本地分析。...输入数据 第一行为标题行,包含样品的分组信息,示例数据样品分为3,KO,OE,WT。 本示例数据没有包括subclass和subject信息。...小圆圈: 图中由内至外辐射的圆圈代表了由门至属的分类级别(里面的那个黄圈圈是界)。 不同分类级别上的每一个小圆圈代表该水平下的一个分类,小圆圈的直径大小代表了相对丰度的大小

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TCP粘包、包与通信协议详解

一方发送的多个报文可能会被合并成一个大的报文进行传输,这就是粘包;也可能发送的一个报文,可能会被拆分成多个小报文,这就是包。...发送方发送数据时,当SO_SNDBUF中的数据量大于MSS时,操作系统会将数据进行拆分,使得每一部分都小于MSS,也形成了包,然后每一部分都加上TCP Header,构成多个完整的TCP报文进行发送,...3.1 定长协议 定长协议:顾名思义,就是指定一个报文的必须具有固定的长度。...例如,发送方希望把”12\r\n34”,当成一个完整的报文,如果是按行拆分,那么就会错误的拆分为2个报文。...3.7 小结 本节通过一些基本的案例,讲解了在TCP编程中,如何通过协议来解决粘包、包问题。在实际开发中,通常我们的协议会更加复杂。

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Netty系列(二):Netty包沾包问题的解决方案

如果一次请求发送的数据量比较大,超过了缓冲区大小,TCP 就会将其拆分为多次发送,这就是包问题,也就是将一个大的包拆分为多个小包进行发送,接收端接收到多个包才能组成一个完整数据。...而TCP是面向字节流,没有边界,操作系统在发送 TCP 数据的时候,底层会有一个缓冲区,通过这个缓冲区来进行优化,例如缓冲区为1024个字节大小,如果一次发送数据量小于1024,则会合并多个数据作为一个数据包发送...如果发生包需等待多个包发送过来之后再找到其中的##@##进行合并。如果发送沾包则找到其中的##@##进行拆分。...将消息分为头部和消息体,头部中保存整个消息的长度,这种情况下接收端只有在读取到足够长度的消息之后,才算是接收到一个完整的消息。 通过自定义协议进行粘包和包的处理。...如果应用层协议没有使用基于长度或者基于分隔符(终结符)划分边界等方式进行处理,则会导致多个消息的粘包和包。

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服务粒度的艺术 - 简化架构与避免服务泛滥

前些时间小组有个需求上线牵扯9个应用(小组当时维护了26个服务,由于团队系统业务属性特征基于高可用、高性能原则拆分,有些是合理的,有些不是很合理的),同时上周OpsReview的一个微服务滥用典范案例(...当服务数量过多时,即使是小的变更也可能需要协调多个服务,从而增加了工作量。 2、团队协作难度:在服务泛滥的环境中,团队成员可能需要跨多个服务进行协作,比如本次需求上线牵扯9个应用。...我们需要使用【拆分因素】和【合并因素】来客观综合分析利弊,从而形成还是不服务的充分合理解释。 1、拆分因素 粒度拆分因素解决的是什么时候应该将服务拆分为更小部分。...为服务拆分为更小的部分提供了指导和依据。...具有原子操作的单独服务具有更好的安全访问控制 如果服务之间需要频繁同步数据以保持一致性,这可能表明它们应该被集成合并为单个服务。

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在组织内推广OpenTelemetry?

供应商中立: 由于 OpenTelemetry 具有供应商中立性,可以同时轻松地向多个后端发送遥测数据。这让我们可以同时试用不同可观测性供应商,比较选择最合适的。...找出关键的高价值交易 接下来需要更深入地分析,找到关键的业务交易。...Java、.NET、Python、JavaScript 和 PHP 目前都已支持自动 Instrumentation,Go 也提供了自动 Instrumentation ,方式稍有不同。...幸运的是,Java 和 Python 等语言提供了限制自动 instrumentation 范围的方式。...它可以从多个数据源收集和处理数据,再导出到首选的后端分析。如果要切换后端,通过简单更新收集器的 YAML 配置,可以同时发送数据到多个后端进行比较选取。选择后端之后,只需在收集器中更改 YAML。

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2022版Netty面试题小总结

数据从发送方到接收方需要经过操作系统的缓冲区,而造成粘包和包的主要原因就在这个缓冲区上。粘包可以理解为缓冲区数据堆积,导致多个请求数据粘在一起,而包可以理解为发送的数据大于缓冲区,进行拆分处理。...详细来说,造成粘包和包的原因主要有以下三个: 应用程序 write 写入的字节大小大于套接口发送缓冲区大小; 进行 MSS 大小的 TCP 分段; 以太网帧的 payload 大于 MTU 进行 IP...对于粘包的问题,代码比较繁琐,Netty 提供了 4 种解码器来解决,分别如下: 固定长度的包器(FixedLengthFrameDecoder),每个应用层数据包的都拆分成都是固定长度的大小; 行包器...按照应用层数据包的大小包。这个包器,有一个要求,就是应用层协议中包含数据包的长度。 6、Netty 零拷贝体现在哪里?...缺点:需要依赖于工具生成代码、支持的语言相对较少,官方只支持Java 、C++ 、python。适用场景:对性能要求高的RPC调用、具有良好的跨防火墙的访问属性、适合应用层对象的持久化。

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排序算法最强总结及其代码实现(PythonJava)

稳定性定义: 假定在待排序的记录序列中,存在多个具有相同的关键字的记录,若经过排序,这些记录的相对次序保持不变,即在原序列中,r[i]=r[j],且r[i]在r[j]之前,而在排序后的序列中,r[i]仍在...再如,快速排序原本是不稳定的排序方法,若待排序记录中只有一具有相同关键码的记录,而选择的轴值恰好是这组相同关键码中的一个,此时的快速排序就是稳定的。...} a[j] = temp; } gap = gap / 2; } } 归并排序(递归合并) 思路:拆到单个数字...可以再二分,直至分解出的小组只含有一个元素时为止,此时认为该小组内部已有序。然后合并排序相邻二个小组即可。 ?...OK现在最大的元素已经归位,需要将堆的大小减1即n–,然后再将h[1]和h[ n]交换,并将h[1]向下调整。如此反复,直到堆的大小变成1为止。此时数组h中的数就已经是排序好的了。

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深度学习系列(一)常见的卷积类型

Python代码: import torch import torch.nn as nn import torch.nn.functional as F x = torch.randn(10, 16,...2、Deconvolution(transposed Convolutions)反卷积(转置卷积) 反卷积就是卷积的逆过程,其在提出后被使用,后来并不常用,反卷积就是将卷积的输出重新还原为原来大小其...通过分为不同的,每个都负责一部分传统 2D 卷积的工作,显著减少了整个操作步骤。如下所示,过滤器分成了 3 。...下图中,第一个分组卷积 GConv1 后所得到的特征映射在进入到第二个分组卷积之前,先将每个中的通道拆分为几个小组,然后再混合这些小组,不仅特征信息可以进行随机流通,模型可以获得更好的特征表示。...空洞卷积常被用以低成本地增加输出单元上的感受野,同时还不需要增加卷积核大小,当多个空洞卷积一个接一个堆叠在一起时,这种方式是非常有效的。

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JPG 与 JPEG:这些图像文件格式有什么区别?

JPEG 首字母缩略词代表联合图像专家——文件类型以帮助创建 JPEG 交换格式 (JIF) 标准的小组委员会命名。它于 1992 年由国际标准化组织 (ISO) 首次发布。...2000 年,JPEG 小组发布了另一种图像文件格式,称为 JPEG 2000(其文件扩展名为 JPG2 和 JPF)。它原本是 JPEG 的继任者,远没有那么受欢迎。...由 PNG 开发在 JPEG 发布四年后开发,PNG 支持无损数据压缩和透明度。因此,如果必须保留图像质量并且文件大小不是问题,则经常使用 PNG。...一个好的经验法则是将 JPEG 保存到照片中,并将 PNG 保存为具有透明度的图像和非摄影图像。...Python入门进阶:68 个 Python 内置函数详解 Java比优化的Rust程序更快 看大牛是如何一次性把RPC远程过程调用,Dubbo架构进阶给讲清的 Redis 源码分析 I/O 模型详解

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独家 | 9个可以显著优化代码的Python内置装饰器

@lru_cache:利用缓存提速程序 使用@lru_cache装饰器是提速Python函数简易的方法。...此装饰器将函数的结果放入缓存,供后续具有相同参数的函数调用,无需再次执行具有相同参数的函数。 对于那些算力成本高昂或常用相同参数函数的调用特别有用。...静态方法通常用于执行一相关任务的实用程序类中,如数学计算。通过将相关函数组织成类的静态方法,使代码变得更加有组织、更容易理解。...@dataclass:用更少的代码定义专用类 @dataclass装饰器(在Python3.7中引入)可以自动为一个类生成几种专用的方法,如__init__、__repr__、__eq__、__lt__...能够利用业余时间加入到THU 数据派平台的翻译志愿者小组,希望能和大家一起交流分享,共同进步 翻译招募信息 工作内容:需要一颗细致的心,将选取好的外文文章翻译成流畅的中文。

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独家|OpenCV 1.1 Mat - 基本图像容器(附链接)

写在前边 让读者朋友们较为系统地了解和学习OpenCV官方教程,数据派THU翻译联合研究部共同推出OpenCV官方教程翻译系列。由于所列章节较多,教程将被分为多篇文章持续更新发布。...例如,为了创建一个图像的感兴趣区域(ROI),你只需要创建一个具有行列边界的新MAT 对象头: 那么问题来了 - 如果像素矩阵可以属于多个MAT 对象, 那么当它不需要再次被使用时,由谁来负责清空?...在三元色彩空间(如RGB 色彩空间),可以表示出1600万种颜色。...按照以下约定,构造出多个定义: 例如,CV_8UC3是指:使用的是8位长的unsigned char数据类型,每个像素具有三个通道,可以预定义多达四个通道。...能够利用业余时间加入到THU 数据派平台的翻译志愿者小组,希望能和大家一起交流分享,共同进步 翻译招募信息 工作内容:需要一颗细致的心,将选取好的外文文章翻译成流畅的中文。

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【漫画】七种最常见的排序算法(动图版)

插入排序有一种优化的算法,可以进行半插入。...递归的底部情形,是数列的大小是零或一,也就是永远都已经被排序好了。虽然一直递归下去,但是这个算法总会结束,因为在每次的迭代(iteration)中,它至少会把一个元素摆到它最后的位置去。...步骤 将元素分为n列,并对每列进行插入排序。 将n列元素按行进行合并。 重复步骤1-2,其中元素的列数为上次的一半。 动画演示 ? ? python代码实现如下: ?...如果这两个数组内部数据是有序的(转向步骤2-4);如果无序,则对数组进行二分,直至分解出的小组只有一个元素,此时认为该小组内部有序。...二叉堆具有以下性质: 父节点的键值总是大于或等于(小于或等于)任何一个子节点的键值。 每个节点的左右子树都是一个二叉堆(都是最大堆或最小堆)。

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FinOps-公有云资源管理

资源目录具有全局一致性的特点,方便管理者基于此关系结构,对企业内多个应用服务所对应的各种资源进行高效的规划、构建和管理。...标签是最为灵活的轻量级资源管理方案,同资源目录及资源不同的是,标签不会受到账号体系的限制。 标签分为系统标签及用户自定义标签。...其次是分型服务场景(如OSS、CDN等),分型云服务的分账维度往往不是账单中定义的实例维度,而是更细的分项维度。...账号资源标签作用域公有云资源账号下的资源集合一个账号可以包含多个资源一个账号可以包含多个标签云资源一个账号对应关联多个云资源一个资源实例仅支持关联一个资源云资源与标签的关系为多对多管理复杂度简单中高财务分账账号维度支持以资源组方式分账...资源和资源标签本质上都是在配置资源的映射关系,标签更为灵活。资源和资源的关系是一对一的,而资源标签和资源的关系则是多对多的,对于一些PaaS级服务来说,资源管理的方式略显灵活度不足。

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Selenium3元素定位详解与封装

从元素分类的角度而言,元素定位可以分为单个元素定位和多个元素定位,那么也就是从单个元素的方法有8种,多个元素的定位方法也是有8种,总共就16种方法。.../Versions/3.7/lib/python3.7/site-packages/selenium/webdriver/remote/webelement.py", line 522, in send_keys...'value': keys_to_typing(value)}) File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/lib/python3.7..._parent.execute(command, params) File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/lib/python3.7...还是看官方的警告代码来分析,根据警告官方更加推荐我们使用(by=By.TAG_NAME, value=name)这种方式来解决,这也是在我开头部分说的,不管元素有多少个方法,我们只可以分为两个,主要就是单个元素定位和多个元素定位的方法

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集成模型Xgboost!机器学习最热研究方向入门,附学习路线图

01 集成学习 集成学习的基本思想是把多个学习器通过一定方法进行组合,以达到最终效果的提升。...02 XGBoost XGBoost(Extreme Gradient Boosting)由华盛顿大学的陈天奇博士提出,开始作为分布式(深度)机器学习研究社区(DMLC)小组的研究项目之一。...虽然这些年神经网络(尤其是深度神经网络)变得越来越流行,XGBoost仍旧在训练样本有限、训练时间短、调参知识缺乏的场景下具有独特的优势。...相比深度神经网络,XGBoost能够更好地处理表格数据,并具有更强的可解释性,另外具有易于调参、输入数据不变性等优势。...通过源码编译安装 虽然通过pip安装XGBoost虽然方便,其安装的XGBoost可能并非最新版本。源码编译安装XGBoost主要分为两个步骤:① 通过C++代码构建共享库;② 安装相应语言包。

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